BGIOSGA024394

From RiceWiki
Revision as of 16:52, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA024394

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024394, complete gene.

LocusTag

OS07G0435400

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024394-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024394-PA

Length

6763

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:13105920..13112682

Sequence Coding Region

13112593..13112682,13112365..13112463,13112111..13112265,13111407..13111524,13110808..13110909
,13110102..13110261,13109845..13109953,13109662..13109764,13109386..13109536
,13109087..13109219,13108896..13109002,13108738..13108808,13108589..13108649
,13107807..13108034,13107552..13107636,13106440..13106618,13105920..13106005

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:13105920..13112682 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:13105920..13112682 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGCACAGCGACGGCGACCACGGTAGCGACCTCTCCGCCGACGATTCCCCGTGGAGCGAGGGGAGCTGGTCCGACGACGATGACGAGGGATCGCTATCCTTCGAGGACAGCGGCGAAGGCTCCGACGCCGACTCCGACGAACCGGATGCCCCGGCGGTGGAGGAGAGCGACTCTTCTGAGGACGAGGTGGCGCCACGGAATACGATAGGAGATGTGCCGTTGGAATGGTACAAGAACGAGGAGCACATCGGCTATGACATCACTGGTAGTAAGATCAAGAAGCGGGATAGGGAGGGCCGAATTGAGGCCTACCTCAGGAATGCTGATGATGCTAAGAATTGGAGAAAGATCTATGACGAGTATAATGATGAAGAGGTGCAGATTACCAAGGAAGAGGCTAAGATAATTAGTAGATTGCTGAAGGGAAAGACTCCACACACAAATGTGGATCCATATCCAGATTATGTTGATTGGTTTGAATATGATGGTAAAGGCCATCCACTTTCTAGTGCTCCGGAGCCAAAGAGGCGATTTGTACCCTCGAAGTGGGAACAGAAGAAGGTTGTTAAACTTGTTAGAGCCATTCGTAAAGGATGGATAAAGTTTGATAAGCCAAAGGAGGAACCTAACTTTTATCTCTTGTGGGGAGATGAAACTGATACAGCAGACAATAAGCGGCAAGGCCTGAGCTACATTCCTGCACCCAAACCAAATTTGCCAGGTCATGAAGAGTCATATAATCCTTCTGTTGAATACATTCCAACACAAGAGGAGATAGATTCATATCAGCTTATGTATGAGGAGGACAGGCCAAAGTTTATTCCACGAAAATTTGATTGTCTTAGAAGTGTACCTGCATATGAGAAGGCACTTAGGGAAGGCTTTGATCGGTGTCTAGATCTTTATCTCTGCCCTAGAACACGCAAGAAGCGTATAAACATTGATCCTGAGTCACTCAAGCCAAAGTTACCCAGTAAAAAGGATTTGAGGCCATACCCAAGAACATGTTACCTTGAGTTCAAGGGGCATAATGGTCCAGTGAAGTCTCTTTCAGTTGAAGCAACTGGGCAATGGATAGCATCTGGTTCATCTGATGGAACAATTCGTGTTTGGGAGGTTGAAACTGGTCGCTGCATTAAGGTTTGGAATGTTGGTGGTGTTGTTCACCGTATTGCCTGGAATCCTTCACCTGATAGACACATTCTTGCTGCTGTTGTAGACCATGATCTGCTGCTTCTTAATGCTGAGGTTGGGGATGAAGACGCTCAAATGAAGACAAAAGGGCTCCTCCAAATCGAGGAACTGGCTCAGGAAGAGGATAATGGTGATAAGAAACCAGCTGTCAAGTGGGTCAAGCATGAAAAATTTGATGGAATCATGTTGATTCATCATAAGGCTGTGTCAACTGTAGAGTGGCATTTCAAGGGAGACTATTTCACCACAGTTGTGCCAAGTGGTGATTCAAGAGCTGTACTGTTGCATCAGCTCTCTAAGAAGCATTCGCATCATCCTTTCCGTAAATTGCCAGGCCTTCCTATTGCAGCAGTGTTTCATCCAAGTCAAAAGATGTTCTTTGTGGCCACTAAGAAATTTGTTCAGGTTTATGATCTCCAGAAGGCACAGTTAGTCAAGAAGTTGGAGTCAGGTGTTCGTGAGATTTCCTCCATCTCGATACATCCTGGTGGTGATAATGTTATCGTGGGCAGCAAAGATGGTAAATTGTGTTGGTTCGATACTGATCTATCCACGCGACCATACAAGACATTAAAGAACCACTCGAAGGATATCACTAATGTTACTTTTCACCGGAAATATCCTCTTTTTGCCTCATCCTCAGAGGATTGTACGGCCTATGTATTCCATGGAATGGTCTATTCAGATCTTAACCAAAACCCACTTATTGTACCATTGGAAATTCTTCGTGGTCATTCAAGTTCAGATGGAAGAGGAGTTCTGGATTGCAAATTCCACCCAAGACAGCCTTGGTTGTTCACTGCTGGTGCTGACTCTGTCGTTAGGCTTTATTGCGACTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGHSDGDHGSDLSADDSPWSEGSWSDDDDEGSLSFEDSGEGSDADSDEPDAPAVEESDSSEDEVAPRNTIGDVPLEWYKNEEHIGYDITGSKIKKRDREGRIEAYLRNADDAKNWRKIYDEYNDEEVQITKEEAKIISRLLKGKTPHTNVDPYPDYVDWFEYDGKGHPLSSAPEPKRRFVPSKWEQKKVVKLVRAIRKGWIKFDKPKEEPNFYLLWGDETDTADNKRQGLSYIPAPKPNLPGHEESYNPSVEYIPTQEEIDSYQLMYEEDRPKFIPRKFDCLRSVPAYEKALREGFDRCLDLYLCPRTRKKRINIDPESLKPKLPSKKDLRPYPRTCYLEFKGHNGPVKSLSVEATGQWIASGSSDGTIRVWEVETGRCIKVWNVGGVVHRIAWNPSPDRHILAAVVDHDLLLLNAEVGDEDAQMKTKGLLQIEELAQEEDNGDKKPAVKWVKHEKFDGIMLIHHKAVSTVEWHFKGDYFTTVVPSGDSRAVLLHQLSKKHSHHPFRKLPGLPIAAVFHPSQKMFFVATKKFVQVYDLQKAQLVKKLESGVREISSISIHPGGDNVIVGSKDGKLCWFDTDLSTRPYKTLKNHSKDITNVTFHRKYPLFASSSEDCTAYVFHGMVYSDLNQNPLIVPLEILRGHSSSDGRGVLDCKFHPRQPWLFTAGADSVVRLYCD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..90#220..318#418..572#1159..1276#1774..1875#2422..2581#2730..2838#2919..3021#3147..3297#3464..3596#3681..3787#3875..3945#4034..4094#4649..4876#5047..5131#6065..6243#6678..6763#ATGGGGCACAGCGACGGCGACCACGGTAGCGACCTCTCCGCCGACGATTCCCCGTGGAGCGAGGGGAGCTGGTCCGACGACGATGACGAGGTGCGGCTCTCCTCTTCGAAGGATTTCGACCTTTTTCACCCAATTGTTTGTGGCGTGCTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGGTTTGTGAGTAAGCGTTGATGGTTCATCTCCGGTTGTTCGAGCTGCAGGGATCGCTATCCTTCGAGGACAGCGGCGAAGGCTCCGACGCCGACTCCGACGAACCGGATGCCCCGGCGGTGGAGGAGAGCGACTCTTCTGAGGACGAGGTGAGACCCATCTGCTGTTTGATGTAAAACATCGCCCGTTTAATTATTTCAGGTTTTAATTCATTAACGATTCCGCAATTTCGTGTTCTCTTGTTGCAGGTGGCGCCACGGAATACGATAGGAGATGTGCCGTTGGAATGGTACAAGAACGAGGAGCACATCGGCTATGACATCACTGGTAGTAAGATCAAGAAGCGGGATAGGGAGGGCCGAATTGAGGCCTACCTCAGGAATGCTGATGATGCTAAGAATTGGTGAGTTGCTGCTAGAACTTTGGTTGGTGTAGTTTCAGTAGCTGATGCAGCCAAAAAAACTTTGGTCCGATGAACATAGGATTGGATTAGTCATCCATAACACTACAATTTCTATTTTGCTACATAAGCATCACAACAAAAAGGATGAATGAGTAAATGATGAGGCTGGTAGGATGCTTCATTGCTTCCCTATTTACTGCTTTTTCATTTCCAGTAGGATGCCCTCATTAAGTCTTTTGATTGTCCGAGTCTTGTCATACTCAAAACATGCTAGCTTAAGCTCAATCATGATTTCAGGTAAGAAGGTGCAGCCACATGCGTATTAACATTCATTTTGAATATTTCGTTGCATAACATTTTGTAAAGATGTCGTCGGGTCCAGATGGTAATCTTGTTTTGGCCAATAAAGTGAAAGGTTCTTGATAACCATTACAATTAAAATGTCCATATTTTCCTTGTCGCTCCATTGATTGGAAAATGCATTTTGCATGCACTATTGCTTTGCACATCATCTAATGCTAGCTTAATTGGCTATTAATCTACTTATGAATTTAATTTATCCTCATTGCTTTTTTCCGATTTGTAGGAGAAAGATCTATGACGAGTATAATGATGAAGAGGTGCAGATTACCAAGGAAGAGGCTAAGATAATTAGTAGATTGCTGAAGGGAAAGACTCCACACACAAATGTGGATCCATATCCAGTACGTGCAATAACACATATATTATGCATTTGTATTTAATGCTAAAGTTCATAGCTATAGTAAATGCTTATCGGTAGGGGGCAATGTTGTCTTAATGGGTATGCAATTATGCATGCTGCTATGCTTATGTATTTTATGATAAACATTACTAAAAAAGAATTCCCAACATGTGGCATACATATCTGTACCAATTTAAACTGATATTTTTGCCATTACAAAAATATTAATCTACATTTACTATGCAAAATTCAATGGGGGTTACCTGCATACATCTAGATAGATAGTGTTTCCTCAAGGTTTTTATGGTTCTGGTGATGTATTGAGAGGTAGAGGTATCTCCTAGTGTCTACAAGTCTCAGTAGAGCTATACTTTATGATTAACACTACGAGATACATGTACCTTCCAATACCTCTTAAGGAATGTAAAAAAGTCCTCCAACTATTTATGATTATAATGTGTGTTGCTCGAAAATGGGCTGACTAATGCCTTATTTTAGGATTATGTTGATTGGTTTGAATATGATGGTAAAGGCCATCCACTTTCTAGTGCTCCGGAGCCAAAGAGGCGATTTGTACCCTCGAAGTGGGAACAGAAGAAGGTATGTTCCTTGTAATGCCCCTATTTGTTTAGTTATGTTTTTCAAGATATAAATAACTGTGTAGATGTTTATTACCGAGTTCAACTTGATTAAAAGACAAGATAGATGAATGCATATTCTATATGGAATAATTTATTTTCTTTTTGCTAGAGTGAAATGAATGCTGGCAGGTTACAAATATCTTTTTTAGTGAATCAAATTCATGAATACAGGACAATGAGGTGTTTCTTGTTTTCTTTTATTATGTTTGCTCTATTGCACTATCTTCTGTTTCAGCATTTGGTATTCTAAATGAGTGCACATTGCAGTTAGTCTTTAATGATGCTACATGCACTCTTATTCCATTGTGAAGATATTGTTTTCGGTTAAAATTGAATAAGCCATACCAAATGCCTCAATTGTCCATAAGAATTTTTTGTTAACTTCCGTCTGAAATACATTCGAATTTTTAGTGCATGCTGTCATGTTTCTGGCACGCTATTGAACTATTAAACAGTTGGCATTGCCATTGAGATAGCCTTGTAGCTCATGTGGTCTTTTGTGCAGGTTGTTAAACTTGTTAGAGCCATTCGTAAAGGATGGATAAAGTTTGATAAGCCAAAGGAGGAACCTAACTTTTATCTCTTGTGGGGAGATGAAACTGATACAGCAGACAATAAGCGGCAAGGCCTGAGCTACATTCCTGCACCCAAACCAAATTTGCCAGGTACCATGCTACAATTGCGTAATCAGCCACAAAATGTTTGGACATGAACATTTCCGTGCCAGCAAAGTTATTTAGTGCAGTTGTGCTGAGCACTCATTATATTTAAACTTATATCCATTCTTATAATGGCGTTAATTTGCATATTCAGGTCATGAAGAGTCATATAATCCTTCTGTTGAATACATTCCAACACAAGAGGAGATAGATTCATATCAGCTTATGTATGAGGAGGACAGGCCAAAGTTTATTCCACGAAAGTATGATATCTACATTGTTATTTTAGTTCTCTTATGTATGTCTTAAATGTATTTAATATTTTATCTGTTGGTTTTGTCAGATTTGATTGTCTTAGAAGTGTACCTGCATATGAGAAGGCACTTAGGGAAGGCTTTGATCGGTGTCTAGATCTTTATCTCTGCCCTAGAACACGCAAGAAGCGTGTAAGTAGAAACCTCTTTTCATGAGGACATGTGGTTCATTTTTTACTTTTCCTCCATTTATCAATTTGGACCATTCTTTTTTTTTGTCATTTTCTAGTACGTGATGATTAATTTATAATCTGCAGATAAACATTGATCCTGAGTCACTCAAGCCAAAGTTACCCAGTAAAAAGGATTTGAGGCCATACCCAAGAACATGTTACCTTGAGTTCAAGGGGCATAATGGTCCAGTGAAGTCTCTTTCAGTTGAAGCAACTGGGCAATGGATAGCATCTGGTACTATATTCATTTTCTATGAGCCACATGCATATATACGTGCAGAATATTCTAATGATTCAGGTGTTAGAAGATCTGGCATTAACCAATGCACAAGATTTGAAGGATTAGGTCCTTTGACATCCATGATTGCACGAGTTTATTGTAACAGTTACTTCTAATGTAGGTTCATCTGATGGAACAATTCGTGTTTGGGAGGTTGAAACTGGTCGCTGCATTAAGGTTTGGAATGTTGGTGGTGTTGTTCACCGTATTGCCTGGAATCCTTCACCTGATAGACACATTCTTGCTGCTGTTGTGTAAGCTCATGCTGTCCCCTTTGATGCTTTTCCTTTCTTTGACCTTTATGTATTCTAAATTCCAATCTTCCATCTTTGAAACAGAGACCATGATCTGCTGCTTCTTAATGCTGAGGTTGGGGATGAAGACGCTCAAATGAAGACAAAAGGGCTCCTCCAAATCGAGGAACTGGCTCAGGAAGAGGATAATGGTAAGATAAACTCAACCAAGCAATTCTGCTAATGTTTACAGACTCATTCACTGTTTCTGAATTCTTCATACTATTTCTATATTGTAGGTGATAAGAAACCAGCTGTCAAGTGGGTCAAGCATGAAAAATTTGATGGAATCATGTTGATTCATCATAAGGTAACCGGGTAGTATTACTTAAAATATGACTTCCTTTTAAGTTAGCAGCTTGTCTTTCTCCTTGCTTACCATCTACTTTATTGATCAGGCTGTGTCAACTGTAGAGTGGCATTTCAAGGGAGACTATTTCACCACAGTTGTGCCAAGTGATATCCTTTATAAAGCATGCAATCTTGTTTTGTTTTATTGCAAGTGCACCTTGGCAGAATAACAAATATTAAAAACATACTTTTTCTAATTCAGTCTTCCCACTACCAATCAGAGAACTGATGACACTAGTTATGGAAGTACCTTTTTGTGACCTTTTAAAGTCAACAAGAAGAACCTTTAACCACTAATTTAATTGCTATATACCGGAAAGTTACGAAGTGTAATATACTAATATGATTTTTTGTGATTTTTTGTCTTATCAAGAACTTACTCTTTACATTTTTGTATAACCATGCTAGACATTCAAAACAATAACTTCGGTAAAAACAAATATGGTTTGATTGCATGCATTCTTGATAGTGATTATTTGCTGGCTGGATGGAGTACTATCAGTTACAGTCTACAGCAAAGGTCCCATGTAAATTAGCTATGTTCTTTGTTCAGGTAGGGGCATGTGCTTTCTATTCTTTTGCATGTCCCCATATAATGCATAATTATAGACATGCATCTTCATTATGATTTTATTCAAGTGTATTCCTTAATTCCTGCTTACGTGATTCAAGAGCTGTACTGTTGCATCAGCTCTCTAAGAAGCATTCGCATCATCCTTTCCGTAAATTGCCAGGCCTTCCTATTGCAGCAGTGTTTCATCCAAGTCAAAAGATGTTCTTTGTGGCCACTAAGAAATTTGTTCAGGTTTATGATCTCCAGAAGGCACAGTTAGTCAAGAAGTTGGAGTCAGGTGTTCGTGAGATTTCCTCCATCTCGATACATCCTGGTGGTAAGTTATATGTTAGCTGTATGTTAATTAACTAACTGCTAGATATTTGGGGCAAGAGTTGCTTCACATTGCATTGTCCTAAGCAATAAATCACTTGTTTATATCAGTATTATTGCATTACTATTGAGTTGATTGGTGCAGTGATGATCTTTTATAATTCTTTCATTTAGGTGATAATGTTATCGTGGGCAGCAAAGATGGTAAATTGTGTTGGTTCGATACTGATCTATCCACGCGACCATACAAGACATTAAAGTATGATTCTTATCTTATCTTTAAACATCTTTTCTTTTAGGAAATCTATAGTTTTTTTTAAAAAAAATGTTTTCTGTGATGTCTTACAAAGGTAAGCATCATGCCAAGCGAATTTGCTCTTTGCTCAGAAGGAATGCTGTCAATTCTGTTTGAGGTTCATGCAAAAGCTGATTTATTTCCTACTAAAAAGAAGCTGAAATTCAATGTTGTTTCCATTACTTTTATCATTACTTATTGTCCTATCATTGTTTGCTGAGTTTTTTTTTCTGCTAACTTAACATTGATGTTGTGTATTTCAAAGTGTTGTTATGTATCAAATACTTGAATATGGACAGCATGGGTCACATGTTTTTGCTGTGTGGTGCCATTCTTTCCAGGAAAATATTCCGGGATGAAAACAAGTTCTCTGCAGTCTTAAAAAATTTCACACTAATTATAAATTTATCATAATTTTGAGTATTTATTAAATTTGAAATGTAAAAGGTTAAAAGCAATGAAACATTGGTGCCTTCTCTTAATTCTAAACCTAGCGTAAATAAGCATAGCCTATGCCCTATGCATTTCCAAACATGGTGCATAAGGTTCTGCTCCAATGAATTATGCTTTGATTTGGATTAAAAGGGATAGCTCTGACTAGATTTTAATAATTCTAAGGATTCTCTGAGAGGAGAGCTACTAGTTAGTGCTCAGGAATGTCTTCCCTTGTTCCATCTTACTCATTTACACCTTACATAATTCATATTTTTTCAAAAAGATTTTCCAGTTAGTCAAAGGATTGGCTATTATTGTTTGTCATCCAACTATGACTCTTCTCTTTTTCATGGTTCAGATCACCTTTTTTTTTTACTGGGAGATCGCATTATTATGCCCTATGATCTTTTGAACTCCGATATTTCTATTTTGTGCTGTTGTAACTCATTTGCTTAATTTCAGGAACCACTCGAAGGATATCACTAATGTTACTTTTCACCGGAAATATCCTCTTTTTGCCTCATCCTCAGAGGATTGTACGGCCTATGTATTCCATGGAATGGTCTATTCAGATCTTAACCAAAACCCACTTATTGTACCATTGGAAATTCTTCGTGGTCATTCAAGTTCAGATGGAAGAGGTACATATATATCTAGTGTCTTTTTTAATTTGCATCCTCTAACATGTCCTTTTTCCTGTACACATTTCTTTACATACATGCATTATTAGCTTTTTGTTGATAAAATGTACTAACCACATATATTCCTAAATAATTAAGTCAATACTGAGTTGAGTTGATCGAGTAATCTTAGAACTGTGTGGATGCATTGCTGCAAATTGAAGATACTGGTTGAAATATTTTATTTGTTCTCTCCTTTTTGCCTTTTGGGAAGAAGTTTCTTCTTGTTGTTTCTTCTAATTATTAGTGATATCTTTACTGCATTAGTTTAAAATTCTTTGAAGGATGCCAATAATGTTTAACTCATTTGCTTGCTTTATTGTTGCACTTCAAAATTCTTCAAGTAATTTTGGGCACAATATCTAATCATCAGTTGTGCCTTTGTTGGTGTGCAGGAGTTCTGGATTGCAAATTCCACCCAAGACAGCCTTGGTTGTTCACTGCTGGTGCTGACTCTGTCGTTAGGCTTTATTGCGACTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024394