Os09g0131400

From RiceWiki
Revision as of 07:17, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os09g0131400| Description = Hypothetical protein| Version = NM_001069159.1 GI:115478057 GeneID:4346453| Length = 8457 bp| Definition = Oryza sa...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os09g0131400

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001069159.1 GI:115478057 GeneID:4346453

Length

8457 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0131400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:2343492..2351948

Sequence Coding Region

2351390..2351698

Expression

GEO Profiles:Os09g0131400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:2343492..2351948 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008402:2343492..2351948 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgaaggggatggtggtgatggagcgcgaggtccgggtcacgctccgaggagatcgcctcggccaggtaccccgctgtgaagcccggccggagccgcgcgacccacgccgcgaactgctcgtccggcggcgcgcggacgggggactcggcctccaccacgtccgcgggcactcctgcttcttctcctccagatacgccataggagctgaagcgacggaggctgcgagagaagcggcgggcggtggcggcgaggagtgccatggcggtcgggctcgcctgctccggccgaggcgcttctggagtatataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MKGMVVMEREVRVTLRGDRLGQVPRCEARPEPRDPRRELLVRRR ADGGLGLHHVRGHSCFFSSRYAIGAEATEAAREAAGGGGEECHGGRARLLRPRRFWSI </aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>251..559#gtctttccctcaccctctccctcccctctcgtgccatcgccgcctccgcctccgcctcccatcgcctccccctccgcctcccctcgcgtcgcctccccctccgcctcccctgcgccgtcaccatcgccatccccgtcccctcgcgccgccgcctccacctcctcctccgccgccgatggccaagccctcaaggtcgccggatctgatggcagcgagttcgtggtcggcgaatccggtgatctaacggctgatgaaggggatggtggtgatggagcgcgaggtccgggtcacgctccgaggagatcgcctcggccaggtaccccgctgtgaagcccggccggagccgcgcgacccacgccgcgaactgctcgtccggcggcgcgcggacgggggactcggcctccaccacgtccgcgggcactcctgcttcttctcctccagatacgccataggagctgaagcgacggaggctgcgagagaagcggcgggcggtggcggcgaggagtgccatggcggtcgggctcgcctgctccggccgaggcgcttctggagtatataaatcacctcctgccatgtaagtttacaatatatttatggtgtttttactaggagtggtactgtagtacaaccttccaagcaaatcgaaatgcagagattgtaggaggaaggattcttgccctgatcgatgcaagttcagaaatgtagtactccatgcagaattattttgtcagatcagttaaatgatgtgcacattttggctatgcatgagtaattcagctcaatgccaatctcatgagaaaaataagcagcatactaaccattgatctgccaagataagtgagaatgactgaaacagctttccctttgcagtttgcagtagcagcaatctgaatgaatattgcaaatccaagacttgatgaccacttttgctgatcagacaagaagaacggccaagaaacattgtttggactacgccccatggcagattggcagatggagaatttacgcatatgcaaatcctgcaatttctgcataaattgtaagtgtaattcacgagcttttgatgaagcctgcattccatttcttctagcttggcatatgcactatgcaggactgcgtggttcagagattttgcattgcacagggcccgagaaggctgcatcatctcgtctatagctaataagcatgttttcttcccttcgttcatagttagatttgagtgaaaaagggtgtccttttgatggtctgctcatagaaaactttgcttgcaatgtgtgagctcaaggtgccttctctccattgttgagaggtaaggaggaagggagcttgctcaattcgatttcccaggagggagatggggagcttgccagataagtgggtgtgtgtgtgtagcactacgatgaagctgctcatatatagctaggcagcagctatatattgcctgaccaacagaattcagagaacctctatttcatctgaagttgatgtcttgtgagcacaattcaatcctgaagaagaacatgaacctgcttcagagcacaataaagggatgagattggtgaatctgaatggtctgaggttctagaattaatccttccaccaataagaaatactgattatttagtattatcatgacttcgtactttaatcatgttagattatatattactagaatgccagtggtagcccgtttgttaccaagcaaagatttatttttcagctttctgcatgaggggggacatcagtaacttcgaacagacacccctgcatgttaagtatgattttgatgtccaatttgtgtaaagttgtgctcctttacctgaatacgcttggaaattcgcttgatgtagataatgatgcctgagctgtgtggctgcagatgctcccagctgcaatctctttagttaattacctaaatgacctgtgctttcaggtaagtgtctgcagtcaactgaaatatttggctagcatgtaactcttgttttgctaattatcagtaagagctcacataacttttctttgctttactaatctgtttcataataccttccatatttgattactatgtggtagtaattatttttttgatcattgtcaatacaactacataaatataagggattttgggtggatgtgacaatgaaatatatatattactaatcaatttttaaatgcagatgtaccagacacctcctccaacactgaagtagagctatcagctcatcgcccttctaataccaccagatcaggtaaatctaacctctatttctatctaaattagttaatttcttgacagggcatcataaaaaacaaacagctacagataataaagacaaaaagaatgcaacctcctataatactattactaaaattttatcataccaatatcctgtatttacatctatttatgctgatgcaacctaacatctcgtagaatttacacacctatctattagcttaaaattctcctcaactatctctctcttcaactttcagcctatgttttttaaacatcactctacttaaagataaacgtgccaaataatacatacaaaagacattgtccaccaacaacaaaacctattcacatcatagcttcaatgatatgcattctaataatgactatcaacatctaaaaacattagatagcgtcggctagggaggctgaagcccaccgagatggcacaggtgctgggaggtacagaggcaacttcttttctttgatttctctggttaatttatgtttttttctaattgagaataggcgatagatagattagtgatttgtaataatccaaatccataatttttatttgtctaatagcacacataatcgattatcttggcacataatcgattaagatttctgcttggttgcttttgtatctataaattaatatgctccatagattggtgatttactgatgtgattcatttctttatagtttaccatataaaatgcattaacttttttagtcagtaaagcttccattacctagaaaaaactttggaaagcatgcaggttgcagcctcacgtttgcttataacaggtcgcttgtgcatattccgatttgagattgcactcattaatgagaggttttgttctcttcttgttgttgtgggttgcttatgcactgtgccacaggtgctgggagatacaggtacaatgtcacttgttcttttcttttcattttgtcttgatccaatttcttgacctcttgaccttattgctcgagcagcatagtcatctgagcaactccggctctttgccggtttgcgcccgtcaagatcttcgaggacgacatgcatcttgccatctctgtttgcttcacatcttccagtaagtgtaggacttaaaatccatgggcatttttttcacttcccagtcataacatacatgtcataatgttaagcactaattgatttagttataaactatgtttgtgattacgctagcaggtccgattgctcaatggaaaatatttttttcacagatagacaagttatatttctattcaaaaatcacttattttggtatcaatgactagcgtaaccaactcagatgatctttttgttgtaatgcagcatgttcagcatggatggtcacttagctccatggcctgagcttgtcaagttacacagaaagtatgggattttgttgttcatcgatgatgttagtgtttttatctcccctgaaatacatttttttcctgggctattggtaatcaagttatgttgcaattttccttttcaaggcacacagaaaacttgtttgtggtaacgatggtggtggtttttaacacttttcagcacggcttcattctcactacaaatagaaaaatggcttgatgtcgagtaagagttgataatagattacttttctagaccctttgaactaatcttaaatttgtccgccatattatgtaatgattcttgctcgagcttctccatatattcctaaaaaaacataaataagacccttttatatgtttcactctcactgaatcacttggaatcaatgttcttagatggtatcgtttttgcacaaattttttaaggtgttacttcataaggtatattttgtcttatgtgctgctcatgaaattttccctcttattttctaatgttttcttttattttaatgatgaggtatccccagccccaggagatgttgaatgtattcatgggaagctgggccttttgtctttttagaaatcgatctagacaccaataaacatgaccttttagtatggcaactgctttttatatcactaacacattcacatattttaatgatgaggttttcgttgctttctggtttcagcagaaccaagagctagcatgatctacagctcaattcagcacatgagtgcacttatgatctatatggttaccaatggtagacaatatatactttccatggtttaggttccattaaaatcaatttaagttttgaattatggggtattgtcaatacaaggttgcatgtttctgaagtcatttcccacagactatactcatgtccatgtgcttttgtacatgagataatttggaaattggaatgcatggttggatgcatatgcagttatttggtactggttgtggtgttttttttcgatagcatgttatgactgcaattttggggttatccttgcaggctattcctgatgttccagcgtttcccaattgaatagaaaggaactaaggaaggcgtaaaaagatgaatgcggtactatcttttatttattgtcatcccttccactcttccagaattaatacttccaataatttgcatttctaacacatctcctttcacacacgttggatatgtgactaccatatgctttcctggcttcttgaccagatgtataaaagaaagtaggtcctatgtcaatatcttcctactttctttgtgtgtttgtggcggggggggggggtctccagactttaattactttacttacagcatattaagagatgtgcttcaatgcgttcaataaacaaatcaatcttcatattctgaatcatccaatttttaacttctactgtttggtaggtttctctattcgcatgttcaatactcaatcttgaacccttatacattgctttcatttatctgatgacatttacatataaatctctgttaatagcattgtcatttaatgctagcagctctgcattattcattttcatttgccacttgtgatgttcacctcgaggaaatcatttataacatgattttaattggtgtggaagcaaacaaagcatactgctagattatagtataaacttgtgaaagatatatttcctttgccttgtttatatcctaatagattaattgtgtttagagaaatacctgagctgaaaatgctatcgagattatggctaaaagaatttgattttggtagaatatataagagggaacaaaaaaatattcatttcacaaaagtcgtgtgtgtgcatgtatctgcgcataggcattttttttagcaaaaatactatatggtgattcttttacaaattgtcaatccattgttccatctgtgtaatgggactatctttttccctatggataatcatggcaaattcatagttgaagcgatgaaaacagatctacatgtaactagccatttgaaagtataacatatcaattttgctgaacgagttaaaaatgaacttttgttactggagtatccttggatttttgtgaagtaatcgacataaaagataattcctaccaaatttatttagcttttgcaactagccattaaaaaatgtgccaagaataaactgcaaaacacaatcctatgttgtgtcattttgagcatgtgcaaaccaacaattgtactcaccgatatcctttgttgataacattcactttccttagatggttggttgagattgtaccttcagcttcagtattgttcgtcttaaggaaactaccgactaaacggggaatcacacagcaccatccaacattaggtcaatctgggagtccccaatatgtcatttcaaattgttcagctactctatgtgagcagaaatgcaggttgtccgatacagatgaaccatgaaatcctattgattgaattgcacagttgcttgatttgctttgtatatgtactggttatgcattttgttctcatataagtaatgttgagtgccaaccccagtttgtagaaatacaaatataaaatgtatcccagtgatatttccactttgaatcgtttataatttggaccacatgattgttctatacaactttttagttgttatttgttgcatgcttacaatatctaatactggaaagaaaaaatattaaaattgctaaggacaaaagaaattacatacaagttacattcttttcttgtttcttaaattgtagtaccatatcacttatcttaagtaaaaccatgttctgttgccacttattaacattttttttcaaaaagaatccattaacaaaaccatggtatttcttcaccgtttgtaattacatatataaaaaagttaatattttgcatggagctgttgaatgaatatttccttgatgtttaagattcttaaaactatgtagatccgagtggcaattttcactttggaggtatgcaactgatcctctcattctattattttttacattatacaagggtctatccctataaagcttattctacagacttgtctacattatgcttgaatggaaaattcatctagcctgcaactcctacaatatctaccatacagatcttggttatagtcatacacttctgctagacctaaaaactcatgggacaatatgtaatctgtattgcattggaatattggaattatttcttaccgctaacttaattcatacactagctaaatgtaagataattggaattatttcttaccgctttgatctaatagaggaagtatcagcgtaaccatttaagtaaaacaatctttttaccccaaatgataggttgatcccaactctattagttgcttatattcacaacatttccttccattgcaatatttctttatatacaatttggtttaaattaatattttcatctatatttgtcatgttttgcttatcagtgccctcacacgcctgttgatatatgatatattatatagtttttgttatgtagacatcacatggtttcaattagattacaaccatatttgaattatcaagatatttgctttgcatgatctacaatgtattttagctttgaaacagctgccagtatcattgttttctatttgcaattagaatattggcagaataatatggccacttcaaattttcacttagttctattgcttgacagaattaatgtggtttggttgggttggtccaattgaaagggttgctgtcattctgctctgtttactggtgacgcattggcttggaaattaagtcttcagccagcttttgcgcaaaacaatttagaataatttttgcttgctataattttatttgtttgtaaaaaattgtgtcaaaaaaatgtcacagaattgctagctattttgcagttctaactaggctagatgactctattgtagttttgaactgacatactgaagtttttcgtctcagtcattctgtgatcccaaacaaaatcagcatgatgtgtctcagtatgctacccattgtttccagcactggctttccgtggcaatagaaggtatgatatatgaaaatgaaatagttaatttcctaggtttggaagctcatgagttaaactttatgtgatctcaaacaatataatggtttttcttaggtctggaaaatatggtaatgaaattttcattggctgttatatgcaattttggttatctattccttgtgaagcacgttgatgagaataataaaagtataagttggtcaagctaaaaaagggatttttttttttactgaagtttctcaaatctttcaaggaaagacaaatcttgaggataacctgccattccttccagtgcgtcttaagtttaagagttggaagacaaatcaatatcagagtatgggaccatgttgcttgcagccaccgatcaattgtgcctaaattaaatctgaaggtggttagttgattgtacaaaacagtttgtttttctgattgatgttatggtatgcttgctaaaatgtcatggttccttcattccataactactcaaaccttccgctgatattaaattaaatgtatttctctcatatgtgcctgcaggattatcaagaagaaaatataaattctaagaggcatacttatattatcgcagctgctctatattaccagaaatgttagccgctagctttagattatctgtgcaagttggctttctcttccattgattctattgattgtattgcataggtgcttcatctgctttgattctgtaccggatatgagttctcagatcagtaatgtcgagttctatatgaatatagcaccagcccaagtttgc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0131400, RefSeq:Os09g0131400