Os06g0140000
| Gene Name |
Os06g0140000 |
|---|---|
| Description |
Leucine rich repeat, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001187663.1 GI:297724456 GeneID:9271649 |
| Length |
2886 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0140000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:2094929..2097814 |
| Sequence Coding Region |
2094929..2097814 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:2094929..2097814 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcgccttgcactgatttctttgttgcccctgttgctggtggcctccaaaatcacagcagcagcagcatgcattggaaaggaaagagatgcactattcgacttgaaggccaccctgagagaccctggaggcatgctgtcctcttgggtaggtctaaattgttgcaactggtatggcgtgacttgcaacaacaggactggacatattatcaagctcaacctcgcaaactataatatcagcaaggaggatgctctaacaggtgacatcagtccatcattggttcatttaactcatttgatgtacctcaatcttcgttcgaatgattttggaggtgcaagaatccctgcgttcataggatctctgaagaacctgaggcatcttgacttgtcctttgctaatttcggtgggaaaattccccctcagcttggaaacttatctaagctgaattacctggatattagctttccttataacaactttagcagctttacttccagtagctctgttgacaatcttctttgggtctctcagctttcttcactggtttaccttgacatgtcattgtggaacctttctgtggcttcagattggctgcagtctttgaacatgcttgcttccctcaaagtgcttcgtttgtctggtaccaatcttccacccactaatcaaaattctctatcccagtctaacttcacagttctcaatgaaattgatctatcaggcaacaacttcagctctagattcccgaattggttggcaagcatatacactctgtcattaattaatttggactattgtgagctgcatggctcaattcctgaatctgtgggaaatttaactgcccttaataccctttacttggctgacaacagtttgattggagcaattccaatatctaagttgtgtaacttgcagatccttgatttgtcgaacaacaaccttataggtgatattgctgatttggggaaggcaatgacccgctgcatgaagggactatctatgatcaaattggggaataataatctatctggaagtctatccgggtggattggatccttcccaaacctcttctcagtcgatctcagcaaaaactcactatcaggtcatgtacataccaatatcagtcagctcacagagttaattgaactggacctttctcacaattcactcgaagatgtcttgtctgaacaacacctaacaaatctaactaagctaaaaaagctagatttatcttacaattccttgagaatttctgtgggagcaaattggttaccaccctttcaactttatgaactccttttaggttcttccccactacaatcacaagtcccgcagtggcttcaaacacaagttggaatgcagacattagatttgcacagaacggggactctaggtcaattgcctgattggctttggacgtcattgacctctctcattaacttggatctctctgacaatctgcttactggcatgctaccagcatccctggttcatatgaagtcactgcagttcttggggctcagctcgaaccaattggaaggtcagattcctgatatgccagaaagtctagacctgctagatctctccaacaactctttatctggatcattgcccaatagtgtgggagggaacaagacacgttacattttattgtcaagcaatcgtctaaatagaagcatacctgcgtacttttgcaacatgccatggttgtcagcaatagacctatcaaacaacagcttatcaggcgagctacctaattgttggaagaacagcacagaactatttttggtggatttctcgtacaacaacctggaaggacacataccttcaagtcttggctctcttacttttcttggttccctgcatttgaacaacaataggctatctgggttgttgccttcctctctaagttcatgcgggcttctggttttccttgatattggagataataatttggagggttccatacctgaatggataggagataacatgcaatacctcatgattcttcgtttgcgatcaaatcgtttcactggaagcatcccgtctgaattgtcacagcttcaaggtcttcaagtgttggatcttgccaataacaagctgtcagggcccctgccacaaggtattggaaattttagtgaaatggcttcacagaggtcaagacatattataccgatgcagatttctggtgatagttttggtggatctctctatcacaatgagagtctatacattaccatcaaaggagaagaaagattgtattctaagatcctttatctgatgaagagcattgacctttctaacaattatctaacaggtggaattcctgctgaagttggagatcttgtagggctcaaaaacctgaatctctcgaaaaatctcctgagtggtcatattccagagacaattggtaatatgagttcattggagtcgcttgatctctcatggaaccgactgtcaggcataattcctgaaagcatgacatcactgcacttgttgagccacctgaacatgtcctacaacaatctgtccgggatggtaccccagggctctcagcttcaaacccttggtgatgaagatccatacatctatgctggcaacaagtatctctgcatccatcttgcttctggcagctgttttgaacagaaagataaccatgttgatcaagcagagcataatgatgtccatgatatctggctgtatatattttcaggattgggcttcggagtaggattttcttctgtgtggtggcttcttgtgtgcagcaaggcagtgggcaagaggtatttccagttcgtcgactccacatgtgagaaagttattcactggatgatcctactggagaagaaggtgaataagaaaacagtgggaaaaagttcggtattgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRLALISLLPLLLVASKITAAAACIGKERDALFDLKATLRDPGG MLSSWVGLNCCNWYGVTCNNRTGHIIKLNLANYNISKEDALTGDISPSLVHLTHLMYL NLRSNDFGGARIPAFIGSLKNLRHLDLSFANFGGKIPPQLGNLSKLNYLDISFPYNNF SSFTSSSSVDNLLWVSQLSSLVYLDMSLWNLSVASDWLQSLNMLASLKVLRLSGTNLP PTNQNSLSQSNFTVLNEIDLSGNNFSSRFPNWLASIYTLSLINLDYCELHGSIPESVG NLTALNTLYLADNSLIGAIPISKLCNLQILDLSNNNLIGDIADLGKAMTRCMKGLSMI KLGNNNLSGSLSGWIGSFPNLFSVDLSKNSLSGHVHTNISQLTELIELDLSHNSLEDV LSEQHLTNLTKLKKLDLSYNSLRISVGANWLPPFQLYELLLGSSPLQSQVPQWLQTQV GMQTLDLHRTGTLGQLPDWLWTSLTSLINLDLSDNLLTGMLPASLVHMKSLQFLGLSS NQLEGQIPDMPESLDLLDLSNNSLSGSLPNSVGGNKTRYILLSSNRLNRSIPAYFCNM PWLSAIDLSNNSLSGELPNCWKNSTELFLVDFSYNNLEGHIPSSLGSLTFLGSLHLNN NRLSGLLPSSLSSCGLLVFLDIGDNNLEGSIPEWIGDNMQYLMILRLRSNRFTGSIPS ELSQLQGLQVLDLANNKLSGPLPQGIGNFSEMASQRSRHIIPMQISGDSFGGSLYHNE SLYITIKGEERLYSKILYLMKSIDLSNNYLTGGIPAEVGDLVGLKNLNLSKNLLSGHI PETIGNMSSLESLDLSWNRLSGIIPESMTSLHLLSHLNMSYNNLSGMVPQGSQLQTLG DEDPYIYAGNKYLCIHLASGSCFEQKDNHVDQAEHNDVHDIWLYIFSGLGFGVGFSSV WWLLVCSKAVGKRYFQFVDSTCEKVIHWMILLEKKVNKKTVGKSSVL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..2886#atgcgccttgcactgatttctttgttgcccctgttgctggtggcctccaaaatcacagcagcagcagcatgcattggaaaggaaagagatgcactattcgacttgaaggccaccctgagagaccctggaggcatgctgtcctcttgggtaggtctaaattgttgcaactggtatggcgtgacttgcaacaacaggactggacatattatcaagctcaacctcgcaaactataatatcagcaaggaggatgctctaacaggtgacatcagtccatcattggttcatttaactcatttgatgtacctcaatcttcgttcgaatgattttggaggtgcaagaatccctgcgttcataggatctctgaagaacctgaggcatcttgacttgtcctttgctaatttcggtgggaaaattccccctcagcttggaaacttatctaagctgaattacctggatattagctttccttataacaactttagcagctttacttccagtagctctgttgacaatcttctttgggtctctcagctttcttcactggtttaccttgacatgtcattgtggaacctttctgtggcttcagattggctgcagtctttgaacatgcttgcttccctcaaagtgcttcgtttgtctggtaccaatcttccacccactaatcaaaattctctatcccagtctaacttcacagttctcaatgaaattgatctatcaggcaacaacttcagctctagattcccgaattggttggcaagcatatacactctgtcattaattaatttggactattgtgagctgcatggctcaattcctgaatctgtgggaaatttaactgcccttaataccctttacttggctgacaacagtttgattggagcaattccaatatctaagttgtgtaacttgcagatccttgatttgtcgaacaacaaccttataggtgatattgctgatttggggaaggcaatgacccgctgcatgaagggactatctatgatcaaattggggaataataatctatctggaagtctatccgggtggattggatccttcccaaacctcttctcagtcgatctcagcaaaaactcactatcaggtcatgtacataccaatatcagtcagctcacagagttaattgaactggacctttctcacaattcactcgaagatgtcttgtctgaacaacacctaacaaatctaactaagctaaaaaagctagatttatcttacaattccttgagaatttctgtgggagcaaattggttaccaccctttcaactttatgaactccttttaggttcttccccactacaatcacaagtcccgcagtggcttcaaacacaagttggaatgcagacattagatttgcacagaacggggactctaggtcaattgcctgattggctttggacgtcattgacctctctcattaacttggatctctctgacaatctgcttactggcatgctaccagcatccctggttcatatgaagtcactgcagttcttggggctcagctcgaaccaattggaaggtcagattcctgatatgccagaaagtctagacctgctagatctctccaacaactctttatctggatcattgcccaatagtgtgggagggaacaagacacgttacattttattgtcaagcaatcgtctaaatagaagcatacctgcgtacttttgcaacatgccatggttgtcagcaatagacctatcaaacaacagcttatcaggcgagctacctaattgttggaagaacagcacagaactatttttggtggatttctcgtacaacaacctggaaggacacataccttcaagtcttggctctcttacttttcttggttccctgcatttgaacaacaataggctatctgggttgttgccttcctctctaagttcatgcgggcttctggttttccttgatattggagataataatttggagggttccatacctgaatggataggagataacatgcaatacctcatgattcttcgtttgcgatcaaatcgtttcactggaagcatcccgtctgaattgtcacagcttcaaggtcttcaagtgttggatcttgccaataacaagctgtcagggcccctgccacaaggtattggaaattttagtgaaatggcttcacagaggtcaagacatattataccgatgcagatttctggtgatagttttggtggatctctctatcacaatgagagtctatacattaccatcaaaggagaagaaagattgtattctaagatcctttatctgatgaagagcattgacctttctaacaattatctaacaggtggaattcctgctgaagttggagatcttgtagggctcaaaaacctgaatctctcgaaaaatctcctgagtggtcatattccagagacaattggtaatatgagttcattggagtcgcttgatctctcatggaaccgactgtcaggcataattcctgaaagcatgacatcactgcacttgttgagccacctgaacatgtcctacaacaatctgtccgggatggtaccccagggctctcagcttcaaacccttggtgatgaagatccatacatctatgctggcaacaagtatctctgcatccatcttgcttctggcagctgttttgaacagaaagataaccatgttgatcaagcagagcataatgatgtccatgatatctggctgtatatattttcaggattgggcttcggagtaggattttcttctgtgtggtggcttcttgtgtgcagcaaggcagtgggcaagaggtatttccagttcgtcgactccacatgtgagaaagttattcactggatgatcctactggagaagaaggtgaataagaaaacagtgggaaaaagttcggtattgtga</dnaseqindica> |
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