Os06g0184400
| Gene Name |
Os06g0184400 |
|---|---|
| Description |
SMAD/FHA domain containing protein |
| Version |
NM_001063528.1 GI:115466787 GeneID:4340328 |
| Length |
3199 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0184400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:4223545..4226743 |
| Sequence Coding Region |
4223545..4223617,4224668..4225371,4225768..4225989,4226084..4226743 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:4223545..4226743 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcgctgttccggcggctgttccaccggcggccgccacaggggctcgtggagatctccgacaacattttcgtgtttaaccactgcttctccacggatttctttgaagaagatgagctgaaaccgtacatcggaggcatcttgaaacagctaattggccgctattccattgactcattcatggtgttcaattttgagggaagcaagaaggacaaccaaattgcctgcattttctcggactttgatatgagtgtgatgggttacccacgaaactatgagggatgccccttgctcaccatggagatgattcaccatttcgtgaggtctagtgaaagttggctctcattaggccaggacaacttcttgcttatacattcagaacaggggggatggccagtccttgctttcgcattggcagccctactgctttacctccgaagatataataatgagaggaaagcattggaaatggtctacaaacaggcaccacctgggctagtagagcacttctcaccactgaacccggctccttctcagatgagatacttgaagtatgtgtcaagacggcacatgtcaccagaacaatggcctccagctgatagaatgataaatttgaattgtgtaatcatcagaggggtgccaaattttgatggaaaaggaggatgtagaccaatattgcagatttatggtccagatccttttgctcctaatgacaaaagtactaaagttctcttttcaaccccaaagacaagtgattctgtccagctctacacacaggaagattctgagataatcaagtttaatgcccggtgtcctgttcaaggagatgttgtcatggagtgcattagcctggatgaaaactttgaacatgaagtgatggtgttcagggtcatgtttaacatggcttttattgaagacaacctattgctacttgatagggaccagattgacattctgtgggacacaaaactccggtttcctgtagatttcagagttgaggttatattttcggagatggacacaatcacatcgcttaactcatctcaattatcaagtgaggataaggaaaacttttctagggttgaagatgcattcagtcatctggattggtcaaccaaaagcgatgacgtgacaactaatgcaacagaacagaatgggtctaacaatgagcatgatggctttgatgcagtatctcttcaggaaacagaaaacagcaattccacatctgaacatagcttgctaggaaccagatctgtccaggttattcagatggaaacagaacataaccattcttctgcgccaacgttcgacattgtcaaagatccggttgctgatacacattccttgccagaaacttactcacttgcactagaatctcaagagcacaaactctttgaagattcatctccaagggagctaccaaaattggataccaccaagaacaaccccaactccgacctgccttcggcgaattcacgagactcagaagctgctggtgatgctgctgttgctgaatggtcagacaccaacacggacacgttcctgtcagatacaccttcaagcagctctccatcaagcccgcagaagttcgatgaagattccatggaggctggaattgttgagatccagacacaaacagcagaacctcaaagatgttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLFRRLFHRRPPQGLVEISDNIFVFNHCFSTDFFEEDELKPYI GGILKQLIGRYSIDSFMVFNFEGSKKDNQIACIFSDFDMSVMGYPRNYEGCPLLTMEM IHHFVRSSESWLSLGQDNFLLIHSEQGGWPVLAFALAALLLYLRRYNNERKALEMVYK QAPPGLVEHFSPLNPAPSQMRYLKYVSRRHMSPEQWPPADRMINLNCVIIRGVPNFDG KGGCRPILQIYGPDPFAPNDKSTKVLFSTPKTSDSVQLYTQEDSEIIKFNARCPVQGD VVMECISLDENFEHEVMVFRVMFNMAFIEDNLLLLDRDQIDILWDTKLRFPVDFRVEV IFSEMDTITSLNSSQLSSEDKENFSRVEDAFSHLDWSTKSDDVTTNATEQNGSNNEHD GFDAVSLQETENSNSTSEHSLLGTRSVQVIQMETEHNHSSAPTFDIVKDPVADTHSLP ETYSLALESQEHKLFEDSSPRELPKLDTTKNNPNSDLPSANSRDSEAAGDAAVAEWSD TNTDTFLSDTPSSSSPSSPQKFDEDSMEAGIVEIQTQTAEPQRC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..73#1124..1827#2224..2445#2540..3199#atgtcgctgttccggcggctgttccaccggcggccgccacaggggctcgtggagatctccgacaacattttcggttcgtgtttttttttatttcccacttcagtactccataattacggtataattttgtttttttttgttttactgcgttctcttcgtgtaagcaataccatgttagcaagcatgaatctaccacgcgcttaatttttttatttacgttttgttccgtttttactgaagctgctttaactttctggagagaaaaaaaatcgtatgagcaaaatgtggtcaggtttgggggagagataatgacagctgggggggggggggtcagggattggtatcagtgggttcggttcgtgtattgacttggcaatgtcgcgcgagttgttgcacccgaccacaataggaacgcgggaattgaccggcttagctggttatcacgacgctgtcatttcttctctgaacgatgacgtactcatttagatgggattcagctctgaacttgtgcagtttttaccacacaatgtttgctggagtagcttttctggccacaaattgaagtttggaattctttggagtatatgatgctccttctgataatgttcagaaggaattttggattagctcaaatcagatgcacatgagttctgttctgtgaaaatgatgagcactatagatgggtgaacaactggacattagaggttgaattgtcatgcttgtggtaaattgatatattcacagacaaacaagatgcagttacatgattttcttgttgtttccaaaaaggaacctgtcatggtttgtgaacctgttgtgtgacatggcttcttgatcttctgatgaggctgaccatccaaaactactccattttctgttagtgttagttacccacttgtgtggctgacaacataccatccacattttgtattcttgaaaatggattgatgtttcattcgtaaggctgaaatgttcctatcactattgctgttggaaatgtccacctactcctattggacatggtttgaatctttatgataactatactgtttatagtagaattgatattgctcccagtttcacctttcttatgctgactactggttacttctttacttttcagtgtttaaccactgcttctccacggatttctttgaagaagatgagctgaaaccgtacatcggaggcatcttgaaacagctaattggccgctattccattgactcattcatggtgttcaattttgagggaagcaagaaggacaaccaaattgcctgcattttctcggactttgatatgagtgtgatgggttacccacgaaactatgagggatgccccttgctcaccatggagatgattcaccatttcgtgaggtctagtgaaagttggctctcattaggccaggacaacttcttgcttatacattcagaacaggggggatggccagtccttgctttcgcattggcagccctactgctttacctccgaagatataataatgagaggaaagcattggaaatggtctacaaacaggcaccacctgggctagtagagcacttctcaccactgaacccggctccttctcagatgagatacttgaagtatgtgtcaagacggcacatgtcaccagaacaatggcctccagctgatagaatgataaatttgaattgtgtaatcatcagaggggtgccaaattttgatggaaaaggaggatgtagaccaatattgcagatttatggtccagatccttttgctcctaatgacaaaagtactaaagttctcttttcaaccccaaagacaagtgattctgtccagctctacacacaggtatacttttgttatatttactaatttatcatgaataatataacctttattacagtaagcttgtgatgtttgttcatgatgtgttggttcaatagttcaacattcaacaaagtcagtgatcaactatcgaaatacctgaaagtgtagtcagatcacctggggagatcaccggtttacaagtttaattgtttcgttatctgctagtgctgtgtttttttcatctgtcgtatcattcttttctctactagcttgtctggaatccattttactagttcatatgtctatcgaacagctttaaatttgagctggagacttttatttgttatcaaagtaagaagtatttaagctttaattgctggataggagaacattgacatgtttgtgtttgtaattcaggaagattctgagataatcaagtttaatgcccggtgtcctgttcaaggagatgttgtcatggagtgcattagcctggatgaaaactttgaacatgaagtgatggtgttcagggtcatgtttaacatggcttttattgaagacaacctattgctacttgatagggaccagattgacattctgtgggacacaaaactccggtttcctgtagatttcagagttgaggtaccacttaactcatgcatcttgtacacatttttcacctgcacattccaccttcatatgtagttatgtactcgtcttgccttgattatcataggttatattttcggagatggacacaatcacatcgcttaactcatctcaattatcaagtgaggataaggaaaacttttctagggttgaagatgcattcagtcatctggattggtcaaccaaaagcgatgacgtgacaactaatgcaacagaacagaatgggtctaacaatgagcatgatggctttgatgcagtatctcttcaggaaacagaaaacagcaattccacatctgaacatagcttgctaggaaccagatctgtccaggttattcagatggaaacagaacataaccattcttctgcgccaacgttcgacattgtcaaagatccggttgctgatacacattccttgccagaaacttactcacttgcactagaatctcaagagcacaaactctttgaagattcatctccaagggagctaccaaaattggataccaccaagaacaaccccaactccgacctgccttcggcgaattcacgagactcagaagctgctggtgatgctgctgttgctgaatggtcagacaccaacacggacacgttcctgtcagatacaccttcaagcagctctccatcaagcccgcagaagttcgatgaagattccatggaggctggaattgttgagatccagacacaaacagcagaacctcaaagatgttga</dnaseqindica> |
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