BGIOSGA027224

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA027224

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027224, complete gene.

LocusTag

OsI_28711

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA027224-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA027224-PA

Length

10087

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:13786376..13796462

Sequence Coding Region

13796358..13796462,13792694..13792814,13791341..13791406,13789614..13789735,13788607..13788708
,13788495..13788528,13788296..13788374,13788060..13788210,13787743..13787973
,13787268..13787540,13787049..13787162,13786376..13786441

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:13786376..13796462 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGTTCCTGCTCGGCGCCTTCCTCGGGCTGGTGCTCGGCGTCGCCGTTGTCATGGCGTTCGCGCGCCTCGAGAACACCCGCGCTGAGCAGCGCCGCGAGCTGGCTGCATCAGAACTGATAAAAACTTCTGTGGAGCCTATTTTTGAGCAGTACAAGTCATTCATTTTGTCCTCACTCCATTTCTCAAAGTTGACACTTGGAACAGTTGCCCCTCAGTTTACAGATCTCTCCAGAACAGAACCTAAACTACCTGTTCCAATTGTTACTTGTGAGAGTGCTCTTTGGAGAGGAGTTTCAATTTTGGATAGTGATAGTTCTGGTATCACTATGGAGCTTGAGTTGCAATGGGATGGCAATCCAAATATAGTACTGGACATTCAAACAACACTTGGAATCTCACTTCCTGTGCAGGTGAAAAATATTGGATTCACAGGAGTACTTCGCTTAGTTTTTAAGCCTCTGGTTGCAGAACTGCCTTGCTTTGGAGCTGTTTGCTGTTCTTTGAGAGAGAAGAGCAAGGTCGATTTTACCCTCAAGGTTATTGGTGGAACGATACGTGATACCATTGAGGATCAGTTGACATGGCCTAATCGCATAGTTGTACCTATTGTGCCTGGAGATTATAGTGACTTGGAGCTGAAACCAATTGGACTATTAGAAGTAAAACTTGTGGAAGCTAGGGACTTGACGAACAAGGATCTTGTGGGGAAGTCTGACCCTTTTGCTGTGTTATACATTCGGCCATTGCAAGATAAAATGAAGAAAAGCAAAACAATAAATAATGATTTGAACCCCATCTGGAATGAGCACTACGAATTTGTGGTCGAGGACACATCTACCCAGCGCTTGACTGTGAAAATTTATGATGATGAAGGACTCCAGGCATCTGAGCTTATTGGCTGTGCTAGAGTGGACTTGTCTGATCTTCAGCCTGGAAAAGTCAAAGAAGTTTGGTTGGACCTTGTCAAGGACCTGGAAATCCAGCGGGATAAGAAACGTCGCGGGCAGGTACACCTGGAGCTCCTGTATTACCCTTTTGGTAAACAGGAAGGGGTTTCCAATCCTTTTGCAGATCAGATTCAGTTAACTTCTTTGGAGAAGGTCCTCAAGACTGAGTCTAACGGATTTGATGTTAACCAGAGGAAAAATGTTATTATGAGAGGAGTCCTATCAGTAACTGTTATCTCAGCAGAGGACTTGCCACCAATGGATGTGATGGGCAAGGCTGACCCATTTGTAGTCCTGTACCTGAAGAAGGGAGAAACCAAAAAGAAGACAAGGGTTGTAACTGAGACACTGAATCCAATATGGAATCAGACGTTTGATTTTGTTGTTGAAGATGCCTTGCATGATTTACTCATGGTGGAAGTATGGGATCATGATACGTTTGGAAAGGATTACATAGGGAGATGCATCTTGACACTCTACGAGAGTAATACTCGAAGGCGAGTTTCAGGATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAFLLGAFLGLVLGVAVVMAFARLENTRAEQRRELAASELIKTSVEPIFEQYKSFILSSLHFSKLTLGTVAPQFTDLSRTEPKLPVPIVTCESALWRGVSILDSDSSGITMELELQWDGNPNIVLDIQTTLGISLPVQVKNIGFTGVLRLVFKPLVAELPCFGAVCCSLREKSKVDFTLKVIGGTIRDTIEDQLTWPNRIVVPIVPGDYSDLELKPIGLLEVKLVEARDLTNKDLVGKSDPFAVLYIRPLQDKMKKSKTINNDLNPIWNEHYEFVVEDTSTQRLTVKIYDDEGLQASELIGCARVDLSDLQPGKVKEVWLDLVKDLEIQRDKKRRGQVHLELLYYPFGKQEGVSNPFADQIQLTSLEKVLKTESNGFDVNQRKNVIMRGVLSVTVISAEDLPPMDVMGKADPFVVLYLKKGETKKKTRVVTETLNPIWNQTFDFVVEDALHDLLMVEVWDHDTFGKDYIGRCILTLYESNTRRRVSG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..105#3649..3769#5057..5122#6728..6849#7755..7856#7935..7968#8089..8167#8253..8403#8490..8720#8923..9195#9301..9414#10022..10087#ATGGCGTTCCTGCTCGGCGCCTTCCTCGGGCTGGTGCTCGGCGTCGCCGTTGTCATGGCGTTCGCGCGCCTCGAGAACACCCGCGCTGAGCAGCGCCGCGAGCTGGTACGTACGTGTCGCGAAATGAAATCCTCCCAATTCATTTCCTGTTCGTGCCGGGGTAGCGCATTGATTCGACCCAGTCCGATACCCGCCGCGGGTGGGTGTCGGTAGTGATTGGGAGCTGGTACTGGTGGTGAATTGCGAATTTGCGAGAGGTGTTGGTTTTCGGAGAGGAGCGTGGAGGGGGAAGTTGCTGGCGGTGCCAAACTGTGAGCAGACTGGTTTGGAACGCCGTATGCCGCCGTAATTGCTAGGATTTTTATCCTAATCTTCCTCCTTGCCACCAACTGTGTATGTTATGCAATACGTGGGCCGTGGGCATGATGGAATCGGCAGTAATGATCATTAGAGAATTTATTAGATAGTGCTTAATATGGCATTATACCGAGTAATGATTGTTTGCAAGATGTCGTTGATCTTGCTTCCGTGTGAGTTGAGGTGATTAGTTTTGACCAGGCCACCCGATCATGCGGGTCAATTTAATTACTGTGATTTGATATTGTTTTAGTTTGGTTTATCTGAGTGGAGAAAGGACATGATGCTTAATTTTGGAAAATTATTGTGTAGGCCACCCCGGATTTTCCTAATATCATCCGCCATGTGGCATACTCAAACTTGCCCCTTTAGTTTGTTTTGGGTTAGTTTATTATTGAAACAGTTCATTTGAAAGTAGTAAGATTGAAATCTCATGAGTAAAATGACCACTGAGTAAGTATCACAACTTATAATAGTCAAACACACCATCTTCAAAGGCTGACATGTTGGTTCTGTTTCTCAACTTCTTACTATTCTAGTATTTTTATAGAGTAGTTTCTCAATGGTAGTGTATCTCAGTGAACCTCCTCAATTGTGCTGTACATGGATAACAATGCTGCATATTGTGTGTCAGTGTTCACCAACCTAGATAGTTCTTTAAAGCTCAATCCTCGTTGGTGCCTTCATAGCCATATGTTCTGTTGCAATTGCAAAACAATGGAATAAACCTGTAATTGGTTTAATTCTTATGAGTTCTGAACCTCTGCAATTATTCATTTCTGAAGTTGCTATTGCTATGATCAACATGCACTAATAGTATGTACAGATAAACCAGGAAATTAAATCATCTGAATTTTTTTAATGTATCTGTCATAGTGAGTTTTGACAGTATCTTCTGATCTATTTAGTGTAGTATCTGCATGAGTATATGAAATTTCTAACTGATAAGGTCATAAAATGTGCATTATTCTAATCATATATAGTTCTTGGATGGTACATCCATATGGTTGTTTGTCATTTATTTGCAGATAAGTGTCATTTTTGGCTCATGCACACATATTAGGTGTACTTCTATTAATAAATGTCCAGTTGGCATTGTGGTGGATTATGATAGTCTGATTTGGTTCAATGGCTTCTAGACATTGGTGTTTGAAAAACTGTTTCTATACATTGGTGTTTGGTAACCATAATATTATTGCATTTTGAAAATTTGGAACATCCAAGAGAGACATGACAGCTAGATCATATATTTTTGTCTAACCTTAATTTAATTCATAAAAAAGTCTATAATGAATATAAGCTCTAATTTTCACAAAATCTTAAAAACAAGCACTGCACAGAAAAAACAAACTAAGCATAAGTCCTTACATTCACAGTTCGTAAAGCCCAACTGGGTGTCACCATGGTGAGATCACCTGTCAACTGGTTAGCATGGCTGGCTTCATGAGGTTTTGTCTGAGAATTCCATCCATTCCACATATTTCTAGTATTGTCCTATATTACCATATAATTGCCTTACACTAACTGCAATTAAGAACTTCAATCATCATCCATTAGAGATCCAAAATAAAATTTGCGGATAATGGTCGTACACCCAAAATTTCTTTATCTCACCCCTTGCAAAAATTACATTGCCAGCACTACAAGCCATAGTTCCATCCCATCTCATTTCTGAGCGACATGACTTGGTGACACCACCTCCCCTTATCTGCAATTGTTGCTGTTCTCTCTCTTTCTAATGCATCTCCACTATGTGAAATCATTGATGTTTCCCTTCCTATTCGGCTTCCCACGTCTCTATTCAATATCATGCTTGAGTTTGTCACTTCTTCTTGAATTCCTGTTGGTTTATCACGCATAATGGCCATACATGTGTATCTGTTTGAGTTTTCACCAAATATGGCAAAGTAGCAGCCGCACGAGGCCACTACGTGGAGGATCCATCAGCATTTGCTGGCTGTGCCTCCAACTCCAAGGGTGTCAACGGATTTCATCAACAGCGGGTATAACTTGCTTAGTTGTTTGCAATCTTGACCAGTTCCTCTGACTAGAAGCTGCCACATGGCCCACATCATTGAGTGCTCCATCTCCATCTTCCTCAATTCAACAAAATACAGAAATGATCTTACCTACTATAATTGTTCTCTGTTGCACCAATTTGCTCAGATCAATCATTACAATAAATTTTTGGCAGCATTGCATCCGTTTTCCACTGGTTTTTAAAATATTACATTGTCCTTAAAACATCTTATAAGTTATAAGCAATTGGTTTTCCATGCCACGGAAATTGTCATTTGATGTAATACTATTTTAATATCTTCTTTCATTTGTCATTAGATGCATTTTCTATCATGCTTCTGCTATCTCCCATTTTCTTTCCACTCTGATTTGCTCGTTTATTTGTTGATACACCAAAGATGGATTTACTGCAATGCTATGTTGTTTGCCCATTCCCAATACATACTTCTCTGCTTCCAAACAAAATAGAGTATACGGATGTTATAATCCATGTTTTCTTATGCTGGCTTTTGTCACCCTTTCTTGCCCTCATTAATTCTTCCCAATCAAGGAAATAATTAAACATTATAATTCTTTCTTCATTAAACAATTATCGTGTCCAGTTTCAGTAACTGTTGTTATAATCAGATAAATCATTCGGACTAGTAAAATCAGCTAATCGTTTGGACTAGTAAAATCAATGTTCTGGTTGATTGGTTATCTTGTTCTTTATCTTTTCGCTGACATTATCGAACACTTTTTTGTTACAATACCTTCTTAGATTACATTGTAAGAGGATATAAGGACGGAATGATTATTTTTCTTCTCATGGTTGATCTTTCCATATGTGTTCTATGTCTCTTGACACCTAATTTTTACCTGTTTCTGCAGGCTGCTACTGTTTCATCCTTCTCAAAGTTGACTGTAGAAGATTTAAGGAAACTAATTCCTCTTGAGTTATATCCATCATGGGTGTCTTTCACTCAAAAGCAAAAGTTGAGTATTTCTTTATCTTTGCTTATGTTTTGATGTTGTTGATGTCGAGGATTTGTTTGTGCTAACACTTTATTAATTTTAATTAGTACAGCTTAAATGGCTGAATCAAGAATTGGTAAAAATCTGGCCATTTGTCAATGAGGTGATAATATTTCTTCCATTATTTTAGTACTCCGTCATTGTGATGCAAGATGTTTACTTACTGTTCTCCTCGTATGAATACTAGTACAATCAATGTGTTGCTTTATCCATGATTAGTGATGGTTACTTAGGAAGACAATGTTACTTTTGTTGTAGGCTGCATCAGAACTGATAAAAACTTCTGTGGAGCCTATTTTTGAGCAGTACAAGTCATTCATTTTGTCCTCACTCCATTTCTCAAAGTTGACACTTGGAACAGTTGCCCCTCAGTTTACAGGTAGGTCATCTTTAGAGACTTCTGGGTGTTCTTATAGTTATATTGCTTGATCATGCTTTTCTTTTCAGACTCAAGTATTGCTATATTCTATGGTTTCCGATATAAGCCATTTTTAGGGTACATTAACAACAGTAGCCAATGTTCGCGTGTGAAATTCTTTTCCAGAATGATTTGCATATTGAGTTTATATAATTCTGGAAAATGTGTACTTAACTCTTGAAGTATTGTGGTTGGTCTACTTAACCTCTTGTAGTATGGAACTGGATATTCTCTTTGTTTCTTTGACTAAAAACAACAGGAGAGACCCCTAAAAGTTGATATATTAATAATATGGGGCAATTGCAAATTTACTACCTTTCAAATCGTTATTGCAAGCTTATTCTCTTTGTTTCTTTGACTAAAAACAACAGGAGAGACCCCTAAAAGTTGATATATTAATAATATGGGGCAATTGCAAATTTACTACCTTTCAAATCGTTATTGCAAGCTTGCCATTAGAAAATTGCAAAAATGTCACCAGAACTGTCATTCGAATGGCATTGTTGCAAAATATAAAAAAAAACTAGTGGAAAACTTGCAAATGCCCCTATAATATATAGAGTATTTACAAGGATGGTTTGGGGGAATTTACCAAGCCTAAACTAGTGATTGCCAAGATGGTCTTGTCTGTTTCCTTCATTCTCTATATATGTAGAGTGGTATCTTCGTTAAAGCAGTGTTTCCAGGCTGTAAAGTTTATCTGATGTTGAAAATCATACCATTCTGTTGACACCAGATGCCCCAAGTAGCTATGCCACCACTTCAATAAGGAAAGGTTGCACAAATTCATTCCTAGCCGTAATGACCTTGTTCATGAATTTCATTTTCTCATTCCTAGATTATGCCAGCTTGAGTTCACAAATGGACAAGTGGAAAAGAGATGTAAGTTGTCTCCAGTGAAGCATAGCTGATCTACTAGCAATAATAACCAGATAAGCATTTAAGACTTTCATAGAACATTTGATATCCCAGATAATTGCCAGTGGCAGTGGCAGTTGAATATGCATGAAATTTATAGCATAGACCTTCGTCTGCTTTACCGACCATT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External Link(s)

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