BGIOSGA027564
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027564 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027564, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0054L03.41 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027564-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027564-PA |
| Length |
10091 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:4684128..4694218 |
| Sequence Coding Region |
4694103..4694218,4692887..4693604),complement(4692276..4692473,4688398..4689065),complement(4687509..4687953 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:4684128..4694218 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:4684128..4694218 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGTGGCGCCGCCGCGGCTGCTCTGGCGGTGGCAGGGGTCGTCGCCGTGGCTGTCCTCTCCCTTCCGCTGCACCCGCTACTTGTCGCGCCCGGCCTTCGCCGCAGGAGGAAGGCAAGATTATTCTCCTAGTTCTGGCATGGGGGTTAGCAAAACCGGTGCTTTCAGGCTGGGATTGCATGGCAACTTAAATGTACAAATTAGCGTGCAAGAATGGGTTGATGAAACCAAGAGGATATTTTTCCTCAGGACCACCAACAATGTCAGGAACAACATCACTAATGGCACTACTCCTCTGCGGGTTGGAAATCTGCGTCATGATCCCTCAGAAGATATCAGGAGTTCAAACTATCCTTCCTTGTATAATCAAAGAGAAAGAGGGCCATCTAATTCAATTGTAAATAGACATGTCGATACAGATTTGGCTAAGCATCGTGTGATGTATCAGTCAGCACATGCTGTGCCTGCCCCATTCAGTGTCGCTAATAATGATATCAAACCACTGAACATGCTTGATGGCTCCAACGAGGATATTCCTTGGCATGATTCCGTTACGGTGGAATCTTATCTGCCTAAAGTTTCCAAGTCAGAGACAACTTTGGTGGTTGATAAAGCTATCCCAGACAAAAAGGAGCACAAACGCATTACAAGGAGAGTGACGCCAAATATCCCGGACAAAGCTTCCTTGTCCACTGAGTCAAAAAATGCACGGAAGTTGCTTGCTACCATCTATGACAAAGTTTTGGTTGTCGACAATGTTGAGTCAGCTAGGAGTGTTGTTAAACTGCTTACTACAAAGTACAAAGGCTTTATTCATGCATGTGACACGGAGGTGGCAAATATTGATGTCAAAGAAGAGACACCAGTTGGTCACGGAGAAGTAATATGCTTTAGCATCTGTTCAGGAAATTCTGATGGGGAGGCTGATTTTGGAAATGGCAAAACATGCATATGGGTGGATGTGCTAGATGGTGGAAGGGATGTTCTAATGGAGTTTGCTCCTTTCTTTGAGGACCCATCTATCAAAAAGGTTTGGCATAACTATAGTTTTGATAACCATGTCATTGAGAACTGTGGAATCAAGGTTGCTGGATTTCATGCTGATACAATGCATCTTGCACGCCTGTGGGATTCTTCCAGGAGAGCTGATGGTGGATATTCACTTGAAGGACTAACAAATGATCACAGAATCATGAATGCTGTTCTAAAGGACATACATAAAACTGGGAAGGTGTCAATGAAAACTATTTTTGGTCGGAAAAAGGTTAGAAAAAATGGATCTGAAGGGAAAACCATATCTATCGAGCCAGTCGAAAAGTTACAAAGGGAGGATAGAGAGTTGTGGATTTGCTATTCCTCACTAGATTCAATGAGTACATTGAAGCTTTATGAAAGCTTGAAAAACAAGCTTGAAGCAAAGGAATGGATTTTCGATGGTTGTCCTAGAGGAACAATGTATGATTTCTACGAAGAGTATTGGCGTCCCTTTGGTGCTCTTCTTGTAAAGATGGAAACAGAGGGAATGCTTGTTGACCGTGCATACCTTTCGGAGATTGAGAAAACTGCTGTTGTTGAACGAAAATTAGCAGCGGATAAGTTTCGGAAATGGGCATCTAAGCATTGTCCTGATGCCAAGTACATGAATGTGAATAGTGATAATCAAATTCGCCAACTTTTCTTTGGTGGCATCAAAAATAGAAATAAGCCTGGTGAAACTTGGCCACAAAGTAAAACTTTTAAAGTGCCAAATGATGAAAGCATAGCTACAGAGGGCAAGAAGACTTCAAAGTCTCGCACTATCAAACTTTTCACTATTGTGGAAGATCTTAAACTTTTCACTACAGAGGGCAAGAAGACTACAAAGACTGGCTGGCTTAAAGTCCGTGGGGACGTTTTATGGAGTTTGGCTGGTAAAATACCCACAGATCATATATATAAAATTGATGATGGCCAAGAGTTTGATGAAGATGGGAGCAGTGTGGAACTTCCTGAGCAGGATATAGAAAACACTTCCCCATATGGAACTGCATATGAAGCGTTTGGTGGAGGAAAGAAGGGAAGGGAAGCATGTCATGCCATTGCTGCTCTATGTGAAGCCTTTTCTATTGACAAGTTGATATCCGGCTTCATTATTCCATTGCAGGGAGATCGTATATCATGTAAGGAAGGGCGCATTCACTGTTCGTTAAATATCAATACTGAAACAGGACGCTTGTCAGCAAGAACACCAAACTTGCAGAATCAACCTGCTCTTGAAAAGGATAGGTACAAGATTCGCCAAGCTTTTGTCGCAGCTCCAGGGAACACTCTTATTGTTGCTGATTATGGCCAACTGGAACTGAGGATCTTGGCGCATCTTACTAATTGTAAAAGCATGCTGGAAGCTTTCAAGGCTGGTGGTGACTTTCATTCTAGGACAGCCATGAATATGTACCAGCATGTTCGTGATGCTGTTGAAGAAAAGAAAGTTCTGCTTGAATGGCATCCTCAACCAGGTCAAGACAAACCCCCAGTGCCATTATTGAAGGATACTTTTGGCGCTGAGAGGAGGAAGGCCAAAATGCTCAATTTCTCCATTGCATATGGGAAGACTGCTGTTGGTCTATCTCAGGATTGGAATGTTGAAGTTAGGGAAGCAAGGGATACACTCAAACTTTGGTATAGGGATAGAAAGGAAGTTTCAGCTTGGCAAAAGAAGCAGAAAGCCCTTGCGCTTGAGAAGTGCGAAGTCTACACTTTGCTCGGGCGATCACGCCAATTTCCTAATATGACTCATGCGGGTCCTGGTCAAAAGGGTCACGTCGAGCGTGCTGCTATAAATGCACCAGGGCAGGGCAGTGCAGCAGATGTTGCTATGTGTGCAATGCTTGAGATAGAAAGAAACGCTCGCCTTAAGGAGCTTGGTTGGAGACTCCTATTGCAGGTGCATGATGAAGTGATCTTGGAAGGGCCTACAGAATCTGCCGAGGAGGCCAAGTCCATCGTTGTGGAGTGCATGTCCAAGCCTTTCTATGGAACCAACATCCTCAAGGTCGACCTAGCTGTCGACGCCAAGTACGCGAAGAGCTGGTATGCTGCCAAGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVAPPRLLWRWQGSSPWLSSPFRCTRYLSRPAFAAGGRQDYSPSSGMGVSKTGAFRLGLHGNLNVQISVQEWVDETKRIFFLRTTNNVRNNITNGTTPLRVGNLRHDPSEDIRSSNYPSLYNQRERGPSNSIVNRHVDTDLAKHRVMYQSAHAVPAPFSVANNDIKPLNMLDGSNEDIPWHDSVTVESYLPKVSKSETTLVVDKAIPDKKEHKRITRRVTPNIPDKASLSTESKNARKLLATIYDKVLVVDNVESARSVVKLLTTKYKGFIHACDTEVANIDVKEETPVGHGEVICFSICSGNSDGEADFGNGKTCIWVDVLDGGRDVLMEFAPFFEDPSIKKVWHNYSFDNHVIENCGIKVAGFHADTMHLARLWDSSRRADGGYSLEGLTNDHRIMNAVLKDIHKTGKVSMKTIFGRKKVRKNGSEGKTISIEPVEKLQREDRELWICYSSLDSMSTLKLYESLKNKLEAKEWIFDGCPRGTMYDFYEEYWRPFGALLVKMETEGMLVDRAYLSEIEKTAVVERKLAADKFRKWASKHCPDAKYMNVNSDNQIRQLFFGGIKNRNKPGETWPQSKTFKVPNDESIATEGKKTSKSRTIKLFTIVEDLKLFTTEGKKTTKTGWLKVRGDVLWSLAGKIPTDHIYKIDDGQEFDEDGSSVELPEQDIENTSPYGTAYEAFGGGKKGREACHAIAALCEAFSIDKLISGFIIPLQGDRISCKEGRIHCSLNINTETGRLSARTPNLQNQPALEKDRYKIRQAFVAAPGNTLIVADYGQLELRILAHLTNCKSMLEAFKAGGDFHSRTAMNMYQHVRDAVEEKKVLLEWHPQPGQDKPPVPLLKDTFGAERRKAKMLNFSIAYGKTAVGLSQDWNVEVREARDTLKLWYRDRKEVSAWQKKQKALALEKCEVYTLLGRSRQFPNMTHAGPGQKGHVERAAINAPGQGSAADVAMCAMLEIERNARLKELGWRLLLQVHDEVILEGPTESAEEAKSIVVECMSKPFYGTNILKVDLAVDAKYAKSWYAAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..116#615..1332#1746..1943#5154..5821#6266..6710#7247..7342#8143..8235#8317..8511#9050..9142#9321..9533#9614..9703#9930..10091#ATGGCGGTGGCGCCGCCGCGGCTGCTCTGGCGGTGGCAGGGGTCGTCGCCGTGGCTGTCCTCTCCCTTCCGCTGCACCCGCTACTTGTCGCGCCCGGCCTTCGCCGCAGGAGGAAGGTAGCCGTACTGTTTATTTGTGTGTGTTGCATAAGCTTTTTCTTTTTCTAGTAGTAGTTAAGATGTCCCTATCATGGAGGTGGGAGAAAGCTCTGTTCCGGTAGTGCCTAATTCGTGATGAAAAATAATAGATGATGTTTTGGTTAATGGATGGGTGTATGCATCTTTTTCGCGTGTTCTAATGTGATGATTTATTTAGACTGTGTAGGACTTCGGATACGTCTCCTCATTTGAGCTAGTGTCGATTAGCATTCCTTATATACTTTTTTTGTTTTGTTTTAAGAGATCTAAAGCATTCCTTATATAGTCACATTCCCTTATAGACATACAATTATTACTACAGAAGTACGAATTGCCCGATAATAGTAATCTGCCAAAGAGTAACTGGGTTCTACTGTCACTATCCTGAATGTCGCGCTTTTGCCTTACTAGTTGATGATTTCACATTGCTTGGGATCTTGGGTGCTACTGAACTTTGCAAATGGTTCTCGTTGGCAGGCAAGATTATTCTCCTAGTTCTGGCATGGGGGTTAGCAAAACCGGTGCTTTCAGGCTGGGATTGCATGGCAACTTAAATGTACAAATTAGCGTGCAAGAATGGGTTGATGAAACCAAGAGGATATTTTTCCTCAGGACCACCAACAATGTCAGGAACAACATCACTAATGGCACTACTCCTCTGCGGGTTGGAAATCTGCGTCATGATCCCTCAGAAGATATCAGGAGTTCAAACTATCCTTCCTTGTATAATCAAAGAGAAAGAGGGCCATCTAATTCAATTGTAAATAGACATGTCGATACAGATTTGGCTAAGCATCGTGTGATGTATCAGTCAGCACATGCTGTGCCTGCCCCATTCAGTGTCGCTAATAATGATATCAAACCACTGAACATGCTTGATGGCTCCAACGAGGATATTCCTTGGCATGATTCCGTTACGGTGGAATCTTATCTGCCTAAAGTTTCCAAGTCAGAGACAACTTTGGTGGTTGATAAAGCTATCCCAGACAAAAAGGAGCACAAACGCATTACAAGGAGAGTGACGCCAAATATCCCGGACAAAGCTTCCTTGTCCACTGAGTCAAAAAATGCACGGAAGTTGCTTGCTACCATCTATGACAAAGTTTTGGTTGTCGACAATGTTGAGTCAGCTAGGAGTGTTGTTAAACTGCTTACTACAAAGTACAAAGGCTTTATTCATGCATGTGACACGGAGGTATTTCGCCAAACCCTGCTTGAGTTCTATCATCGGTATATCAGTTTTGGCTATGTTATTTAGGTTTTCCCTCATAATTGTGAGAGTATCAATAAGAAGTATATTTCTGATAGGTGATACTATAGTATCTTGTTTGGTCATCAATTATTGCTGACCTCAAGTGTTTGTTGTTAGTGCCTTTTTTCCCTATGTATCTTCTCTGAAAATGTAAGTTGCAGAGTTTACAGGAGATGTCATGAAGAATGTAAAATATTAAATGCTAATGCTAATTATTGGTTTCTTCTAGTTACATGGTTTGACATGCTCATAGTCTACTTCTGTGGTAGCAAGCTCTGCTCAGAACTATTTACAGTTTTGTTACATATCAAGCTCCAAACATACATTCTAATTTAGGATAGTACAATATTACGCAGGTGGCAAATATTGATGTCAAAGAAGAGACACCAGTTGGTCACGGAGAAGTAATATGCTTTAGCATCTGTTCAGGAAATTCTGATGGGGAGGCTGATTTTGGAAATGGCAAAACATGCATATGGGTGGATGTGCTAGATGGTGGAAGGGATGTTCTAATGGAGTTTGCTCCTTTCTTTGAGGACCCATCTATCAAAAAGGTTCACTTCGATTCCTCATTTTATAAGTCATTTATCTTGGAGTAAATTTATTGTGGTTATCTTCTCCCTTTATGTGTTGGATGAAATATATTAGTGCAATAGTTCCTTTTTCCTCTTCTATTACTACTGTAATTACATTACTTCTTTTTGATTAGGCCTTAGTTTGGCAGCAAACTGCACTAAACACAATTTCCTATCACTCGTAAACTTATACTTCAACACTGAAAATAACTAGATATAGTTCACTATTTTATAGTTATGCAGTTCACCTGATTGTCAGCACCATATAGTTGTGGGGTTATAACCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAATTCTACCTGGCTACCTGCTAAAACCCCTATCCTAGAGTGATAATGTAAATGGACTACCTTAAGATTGCTGTTTTAGACAGACCTTCTGTGGTCTGACATACTGTCTTTATATTTTTCCTTGACTAGAAAAAATGCCCCTGCGTTCCAACGAGTGAAGGCAACTTGCAAATAACTGAACAAAATTAACTGTTTATCCTAGGCTGTAGCTACAGGTCCATCACCTAATGAACTATGAAATCATGTGGGTATGATCGATGAATATAATTGTAACAAAAAAATGGCATCATTTCTAACACGGTGATGGTGTTTAGTTTTGAAGTTATGGAGTGTATTTCTTTCGTGCAATAGCGTGTGTGCTTGCGTCGACTAACATGAGTCAGGTCATAAGAAATCTTGGTATGGTAGTCTATTGATTTGCAGGAAGCTTGGAATAAATCTTAGTCAATAGTGAGGACTTGGACTACCACTAAGGGGAGAGCTGAAAGACACATGGTAGATTGACATTGGCATCGTTTGATTGACATCGTGTAGAAGGAATGATGTGACATGTGACTCATTAGTGTTATGTTGCTTGAAATTATGGTAGCAGAATTATGGACTTACAAGAATGTTGACCTTGCCGTCGAACAAAGTACGTACCTTGCCGGCTATCTCCTCTTTGTCGGTGCGCACCAACACGTTGCAGACGGAGACGATGATAGTGAGGCTTTTGGTCATCCACTCCTCCTGGTATATACTCAGCTCCGTGTCATTTGGTGCAGGCGTGCATTGTTGCGCCGAAGCCCGCGAGCTCCTCCACGATGAAGCGGCTGCACGCGCGGTTGATTCTATAATGGACAATTTGGTAGATAGATGTTATGTAGCGTGTTGGTGAATAACCACTTAGGGGCTGTTCAGATTGATGCCATTTTCAACCATACCATTTTTTGACAAAGTTGCCAAAAAATGTCTACGTTTAGTTTGTTGCCAAATTTGATAAATACAAAAGAAATCCTGCCAAAATTTTGGCATTGCCAAAATTTGGTAAGGTTTATTTTGGCTACAATCTGAACATGCCCTTAGATTTGGATGACTAACCTGTGCTTTTGCTGTCGCCGGTGACAAGCACAAGTGGCGCCAGTGAGCTAAAGCAGAGCTAGAACAAAATGGAGAAGGTTCCAGTCTAGGGCTGCAGTGCTAGGTCACTAGGTTTGTTTTGCTTCTTGTGGACGTGTGGTGTTGGTGTTATACTTCCAGTTGGGTGGGTGTCGGAGTTTATCTCTAACACCGTCCACCTTTTTTCCTCTATCGTAATGGAATGTACGCAGATCTCCTGCGCGTTCTAAAAAAAATTCTTAACAGAACTGATGCAGAAAAGAACACTGTTTTATCTTTTTCTCAAAAGTGCACCCATTTGGCTATGAATCAACTGAAATTTCATTGGATAGTCCTTTTGGGTAGATCTGTGAGGCTAGAAATAAATATAGGTCTATGGAAAGTCAAATCTGCACACAGGTGTACCAGGTCTGAAAATCATGAATAAAATATTTATAAAAATGGAAAGGGAAGAGATAGAGAAAAAAAATCTATTTTTGAAAATCACAAGGGAACAACATTTCACCTCAACCACTGTTCACGCGGGAACTGTTCATCACCAGAGAGGTGAAGAGCTTCATGGCTAGCTTGGGACAGGCTTGGGACAGTAGACCCATCTGATCTAAGTAGGCCATGAATTCATGATCGGTCAATGCAGCCAGCTGACCCAGGTAGGGTCAGTGGTAAAAAGACCTGGCCAATCCAGGGTACTGAATAAGGAGGACATGCGCTGTGTACAGAGTCAAAGACCAATGTGGTAGCGGAGTAGAGGACAGACGAAAATTTTGAGTACAGAATCATCTTCAATTTTTATATTATAATAGGTAAAGATTGATTAGATTCACATCTTCGTACCCCAGAGCCCCATATTTCCTACTACTTCACTTAGAAAAAAAAATGTTGTTTTAGGCATTGACACAGTCCCCGAAATACAACTTTGACAACTTATTTCTGTTATAGTATATTTGTATGACCCTATAAAATTATAATATTATGATATTCTGGTCACGAAAACTATTTTCTATTGCAAAATGCTAAAGGAACCCGATATAATTCTAATATTGTGGAAGTACTTTTTGAGAAAAATCTACAAGTACAATTTTCATGTATCCAATCTAAATCTAAATAGTTACTACCTCCGTCCCATAAAAATTGAATTTTTACCTTTGAACCTTTGTCCCATAAAAGTTGTATTTCTACTGATGTGGGATCCATTAAACTGATTACATTTCCTTGTAATCTTCTTTTCTTCCATCCCATCTCTAACCCATTGTCTCAACATTCCTTTTACTCAAGTTTATATATGGAATGTGTGCATGTACTGTGTTCATTAAATAGGGTTATTGTAGTCATTTGTCTATCCTCCTAATATGTCCTAAATTCCCTAGAAATTCAATTTTTAATGGGACGGAGGTAGTAAAAGATATCGATGCCAACATTTTTAAAGTTTGACTTCAAACATGTCCAAGACGAGATGTTTTTTGTGACTGGAGGGGGTAGTAAGTTTGGTG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