Os06g0199000

From RiceWiki
Revision as of 09:08, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os06g0199000| Description = Similar to Glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor| Version = NM_001063599.1 GI:115466929 GeneID:434040...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os06g0199000

Description

Similar to Glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor

Version

NM_001063599.1 GI:115466929 GeneID:4340403

Length

1107 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0199000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:5022094..5023200

Sequence Coding Region

5022127..5022924

Expression

GEO Profiles:Os06g0199000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:5022094..5023200 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008399:5022094..5023200 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggccagaaccaagtttgtagctcttagcttcgtcgtgctactgagcattgggctgtccaatgctttgccacggaaatatgctagcgccgggggcggcggtggaggagggggaggtggtggtgggtcagggaatggttctggatggggatctggctctggctctgggtatggccaggcaagtggacccggtgggtatgctagtggaggcggtggtggtggaggaggcggtggtggaggcggaaatggtggatctgggtatggttcaggatctggttctgggtatggtcaagctggaggatatgggccttatggaggctatgctcaaggaggtggcggtggtggcggaggcggcggtggacaaaatggtgggtctgggtatggttcaggttccggttctggctatggtcaggccggtggatatggtccttacggtggtggagcatatgctcaaggaggtggcggcggtggaggcggcggtggtggtcaaaatggtggttctggatatggttccggttctggctatggtcaggccgggggatatggtccatatggtggaggatatgctcaaggaggaggcggtggtggaggtggtggtggtggacaaaatggcgggtcagggtatggctcaggctctggttccggatatggtcaagctggtggatatgggccatacggcggatatgctcaagcaggcggtcaaggtggtggcggtggtggtggacaaagtggcccaggcggtagtggttccggaagtggctcaggaagtggatccggatccgccggttggcacccatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARTKFVALSFVVLLSIGLSNALPRKYASAGGGGGGGGGGGGSG NGSGWGSGSGSGYGQASGPGGYASGGGGGGGGGGGGGNGGSGYGSGSGSGYGQAGGYG PYGGYAQGGGGGGGGGGGQNGGSGYGSGSGSGYGQAGGYGPYGGGAYAQGGGGGGGGG GGQNGGSGYGSGSGYGQAGGYGPYGGGYAQGGGGGGGGGGGQNGGSGYGSGSGSGYGQ AGGYGPYGGYAQAGGQGGGGGGGQSGPGGSGSGSGSGSGSGSAGWHP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>34..831#atccatcccattcttcaatctaacaagttcaaaatggccagaaccaagtttgtagctcttagcttcgtcgtgctactgagcattgggctgtccaatgctttgccacggaaatatgctagcgccgggggcggcggtggaggagggggaggtggtggtgggtcagggaatggttctggatggggatctggctctggctctgggtatggccaggcaagtggacccggtgggtatgctagtggaggcggtggtggtggaggaggcggtggtggaggcggaaatggtggatctgggtatggttcaggatctggttctgggtatggtcaagctggaggatatgggccttatggaggctatgctcaaggaggtggcggtggtggcggaggcggcggtggacaaaatggtgggtctgggtatggttcaggttccggttctggctatggtcaggccggtggatatggtccttacggtggtggagcatatgctcaaggaggtggcggcggtggaggcggcggtggtggtcaaaatggtggttctggatatggttccggttctggctatggtcaggccgggggatatggtccatatggtggaggatatgctcaaggaggaggcggtggtggaggtggtggtggtggacaaaatggcgggtcagggtatggctcaggctctggttccggatatggtcaagctggtggatatgggccatacggcggatatgctcaagcaggcggtcaaggtggtggcggtggtggtggacaaagtggcccaggcggtagtggttccggaagtggctcaggaagtggatccggatccgccggttggcacccatagagcattcatttgatccggcatgtcaattaaatggctacatcgatactactgattgtgattgctgaagatacaaacgggttgtgtgcatttaaataatactactttgccatggctgtatgtaataaaagtagccatcttgcattgcatatgctgctgctatagcaatgtaagtgtgcttgtataatctttgtgaaatttgttatttgttgtcttacaaagtatatgaataaatccagggtctaggtctctaggctcagcatggaaatgtgataatat</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0199000, RefSeq:Os06g0199000