BGIOSGA028122
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028122 |
|---|---|
| Description |
Putative starch synthase DULL1 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028122, complete gene. |
| LocusTag |
DULL1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028122-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028122-PA |
| Length |
10823 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:5614172..5624994 |
| Sequence Coding Region |
5614172..5614267,5615212..5615275,5615362..5618595,5618779..5618993,5619527..5619797 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:5614172..5624994 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:5614172..5624994 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCTCCGGCCTCAAAGCCTTCTATGCCCTCGGAGCAGGCTGAAGGTCGTCATCCGGCCAGCTAGCAGTGCCAGCGGTGGTGGCCTCGCGCAGTATTTCTTAATGACCAGGAGATATACTGGAAGCAGAATTGTTCGATGCATGGTTTCAAGTTCAGACTGTCCTAATAGGAAATCAAAGAGGACGATTTCCCTTCATACGGAAGTCGCTTCTTCTAGGGGATATGCTCCGAGAATTGCTGCTGAATCAAGTATTCAGGAGCGAGAACATATTAATAGTGATGAAGAAACATTTGATACGTACAACAGATTACTACGTAATGAGTCAACAGAGTGGAACAAGTTAGATACTACTGAAGTGGATTTGTCACAAGATGTTTCAAGCAGTTCAATGAGGAAAGTGGATGCGACGGATGAAGCTAAGCTAGATATACTTGAGGATGATTTGCCCAGAAATTTGTTGAACGGTGTAACAATGGGGGAAGTAGATATGTTGGATGAAGCTGGGGCAGAAGATGATGTATTTGAGGTGGACTTGTCAACCTTGCATAATTCCACAGTGGGGAAAATGGATGCGGTAAATGAAGTTGGGACTGAAAATGACTTATTTGAGGTGGATCTGTCAGCATTGCATAGTGCTGCAGTGGGGAAGGTGGATGTAGTAGATGAAGCTAAAGCTAAAGAAGATTTGTTTGAGATGGATTCATTAGCATTGCACAGTGTTACAATGGGGAAGGTGGATGCAATAAATGCAGCTGGAGCTGAAGGAGACAAATTTGAGGTGGATCTGTCTGCGCTCGCGTCGAACAATTCAATGATAGAGGCAGTTAATGTGATGGATGAAGCTAAGGCTATAGAAGACACACTCGAGGTGGATTTGTCAGGAAATGCTACAAGCAGTTCAACATATGGGGAAGTTAAATTTGAGGTGGATTCATTAGGAAATACTTCAAGCACTGTAATGTATGGGCCAGCGGATGGAGCGTATGAACCTCGGTCCGATGAAGTCACTTTTAAGGTGGATTCATCAGAAAATGCGTCAAACAATGTAATGTATGGGAGAGCAGATGTGGTGGATGAATCTTGGGCTGATGAAGGCATATTTGAGGTGGATTTTTTTACAAATGCTTCAAGCGGCGCAGAATATGGAAAAGTGGATGTGGTGGATGAAGCTAAAACTGATGATTTCACATCTGAGATTGATTCATTAGAAAAAGATTCAAACAATAAAATGCACGGGAAAGCTCATATGGTGGATGAAGCTTGGGACGGTGAAGCCATATTTGAGGTTGATTTGTTTGGAAATGCTTCAAGCATTCCGATATATGGGGAGGTGAATGTGTTGGATGAAGCTCGGGCTGATGATGGAAAATTTGAGGTTGACTTATTAGGGAATACTTCTAGCAATTCAACACATGAGGAAGTGGATGTGGTAGATGAAGCTCAAACAGGTGAAGCCACATTTGAGGTGGATTTGCTTGGAAATGCTTTAAGCAGTGCAATATATAAAGAAGTGCCTGTCATGGGTGGAGCTCAGGATGATGAAGTTGATGTAGATTTCTCAATAAATGCTTCAATCACCGAAACAGAAAAGGAAGCAGATGCAGTTGATGAAGCTAGAGTTGAAGATGAGACATTCGATATGGATTTAGTAGGTAAACAGATATCAATCGATTCTATGAATGATGATGTAGTTGAAGAAGGGACTAAACATCACAGATATCCAATGTTGTCTTCAGCATTCATAGAAGTCAAGACCATTCATGAAACACCTGTAAGTTTAAAGCCTGAACTTATGTCAGTTGTCATGGATCAGGAACAAGACAAACCAATTTCCAGCGTTTATCAACAAGAAGGATCAATTTTTAATTTGCATGCAGAAAACCAATCAACGGTAGATTTTCATGAACGGGAGCAAATGGCTATTACTTTTGATAAACAAAAGGAATCAGTTGCTAAACTCTCTAAAGAAGACCAACAGACTGCTGGTTTACCTGAGCAAAACATGTCCTTTGATGGTGTCCATAGGAAAAGCCAGTCAATTATTGGGCTCCCATTTCAACACCAATCAATTGTTAGTTCCCCTGAAAAATACCGATCAATTGTGGGTTTTCATGGACAAAATCAATCAATCATCAGCTCTCATAAACAAGACAAATCAATTGTTGGTGTTCCTAAAAAAATTCAATCCATTGTTGGTTCCACTAAGCATGATGATTCAATTGTTGGTTTCCGCAAACAAGACAGATCAATTGTTAGTGTGCCTGAGCAAAAACAATCAATAGTTGGTTTTCATAAACAAGATCTATCAATTGTTGCTGTCAGCGAACAAAATCTATCAATTGTTGCTATACCTAGAGAGAGTCAATCAAAGCAAATTTCTATTGTTCGGAGACATGATCCACTACATTTGAAGGAAGTGGAAACAAAGGATAGAGATGGCATATCTAAAAAATCTGGTGGTGACGATGATTTGCCACATATGCTCTTCGAAGAAGAGCTTTCACAGGTTGAAGATGAAGCAAGGGCAATCGCCTATAAAAAGCAGCATGAAGTTGATGTAATCTCTTTGACTCCAGATATCCAGGAGTCACCACAGGACAATATCGACCCACAAGAACTCCGAAGGATGCTCCAAGAACTTGCTGACCAGAATTGTTCAATGGGTAACAAGCTTTTCGTTTTTCCAGAGGCAGTGAAGGCTAATTCGACAATTGATGTATATTTGAATCGTAACCTATCGGCTTTGGCGAATGAGCCTGATGTCCACATCAAAGGAGCATTCAATAGTTGGAGATGGAGGCCTTTCACCGAAAGACTGCACAAGAGTGAATTGAGTGGGGATTGGTGGTCTTGCAAACTGCACATACCCAAGGAAGCTTATAGATTAGACTTTGTGTTCTTCAATGGTCGTTTAGTCTATGATAACAATGATAGTAATGATTTTGTGCTGCAAGTAGAAAGTACAATGGATGAAGATTCCTTTGAGGAGTTCTTGGTTGAAGAAAAGAAAAGAGAACTTGAGAGAGTTGCCACTGAAGAAGCTGAAAGGAGGAGGCATGCTGAAGAGCAGCAGCGAATGGGAGAACAAAGGGCTGCAGAACAAGCTGCCAGGGAACAGGCTAAGAAGGAGATAGAGTTGAAGAAGAACAAATTGCAAAATCTGTTGAGTTCAGCCAGAACACATGTTGATAATTTGTGGCACATAGAGCCTAGCACATATAGACAAGGGGACACTGTCAGATTGTACTATAACAGAAACTCAAGGCCGCTTATGCATAGTACTGAGATCTGGATGCATGGTGGTTGCAATAGTTGGACTGATGGACTCTCTATTGTTGAAAGACTTGTCGAATGTGATGACGAAAATGGTGATTGGTGGTATGCTAATGTTCATATACCTGAAAAGGCCTTTGTATTGGACTGGGTTTTTGCTGACGGGCCACCTGGAAATGCAAGGAATTATGACAACAATGGTCGACAAGATTTTCATGCTATTCTTCCAAATGCCATGACTAACGAAGAATATTGGGTTGAAGAGGAAAACTGTATCTATACAAGGCTTCTCCACGAGATCAGAGAACGGGAGGAAGCTATTAAAATAAAGGTTGAGAAAAGAGCAAAAATGAAATCTGAGATGAAGGAAAAGACTATGAGAATGTTTCTACTTTCTCAGAAACACATTGTTTATACTGAACCACTTGAAATACATGCTGGAACAACTGTGGATGTTCTATATAATCCTTCTAATACGGTGCTAAATGGAAAGCCAGAGGTTTGGTTTAGGTGGTCCTTTAACCGATGGATGCATCCAAGTGGTGTTTTACCACCCAAGAAGATGGTGAAAACAGAAGATGGTTGTCACTTAAAAGCGACAGTTAGTGTTCCATCGGATGCTTATATGATGGACTTTGTTTTCTCTGAGTCGGAAGAAGGTGGAATCTATGACAACAGGAATGGGACAGACTATCATATTCCTGTTTCTGGTTCCAATGCAAAGGAGCCTCCCATTCATATTGTCCATATAGCGGTTGAGATGGCACCCATTGCAAAGGTTGGAGGCCTTGCTGACGTTGTCACAAGTCTTTCACGTGCAATTCAAGAGTTAGGCCATCATGTTGAGGTTATTCTCCCGAAATATAATTTTATGAATCAAAGCAATGTGAAGAATTTGCATGTACGTCAAAGCTTTTCTTTGGGTGGTACAGAAATTAAAGTGTGGTTTGGACTAGTTGAAGACCTGTCTGTTTACTTCTTGGAACCTCAAAATGGGATGTTTGGGGGTGGATGGGTATATGGAGGGAACGATGCTGGCAGATTTGGCTTGTTCTGTCAGTCTGCTCTAGAGTTCCTCCTTCAGAGTGGATCTTCTCCACATATAATACACTGCCATGATTGGTCAAGTGCACCAGTTGCCTGGCTATACAAGGAACACTATGCAGAATCCAGGTTGGCAACTGCCCGGATTATATTTACCATCCATAATCTTGAGTTTGGAGCACATTTTATTGGAAAAGCAATGACATACTGCGACAAAGCCACAACTGTTTCTCACACGTATTCAAAGGAAGTCGCAGGTCATGGTGCCATAGCTCCTCATCGTGGAAAATTCTATGGAATTCTCAATGGAATTGATCCAGATATCTGGGATCCATATACTGATAACTTCATCCCGATGCATTATACTTCTGAAAATGTGGTTGAAGGCAAGAATGCTGCAAAGAGAGCATTGCAGCAGAGGTTTGGACTGCAGCAGACTGATGTCCCCATTGTTGGAATCATCACTCGTCTGACAGCCCAGAAGGGTATCCACCTCATTAAACATGCACTTCATCGGACACTTGAACGCAATGGACAGGTGGTTTTGCTTGGTTCAGCTCCAGATCCTCGGATACAGAGTGATTTCTGCAGATTGGCTGATAGTCTTCATGGTGAAAACCATGGCAGGATATATGCTGGCTCTGACTTCATCCTTGTTCCATCCATCTT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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MALRPQSLLCPRSRLKVVIRPASSASGGGLAQYFLMTRRYTGSRIVRCMVSSSDCPNRKSKRTISLHTEVASSRGYAPRIAAESSIQEREHINSDEETFDTYNRLLRNESTEWNKLDTTEVDLSQDVSSSSMRKVDATDEAKLDILEDDLPRNLLNGVTMGEVDMLDEAGAEDDVFEVDLSTLHNSTVGKMDAVNEVGTENDLFEVDLSALHSAAVGKVDVVDEAKAKEDLFEMDSLALHSVTMGKVDAINAAGAEGDKFEVDLSALASNNSMIEAVNVMDEAKAIEDTLEVDLSGNATSSSTYGEVKFEVDSLGNTSSTVMYGPADGAYEPRSDEVTFKVDSSENASNNVMYGRADVVDESWADEGIFEVDFFTNASSGAEYGKVDVVDEAKTDDFTSEIDSLEKDSNNKMHGKAHMVDEAWDGEAIFEVDLFGNASSIPIYGEVNVLDEARADDGKFEVDLLGNTSSNSTHEEVDVVDEAQTGEATFEVDLLGNALSSAIYKEVPVMGGAQDDEVDVDFSINASITETEKEADAVDEARVEDETFDMDLVGKQISIDSMNDDVVEEGTKHHRYPMLSSAFIEVKTIHETPVSLKPELMSVVMDQEQDKPISSVYQQEGSIFNLHAENQSTVDFHEREQMAITFDKQKESVAKLSKEDQQTAGLPEQNMSFDGVHRKSQSIIGLPFQHQSIVSSPEKYRSIVGFHGQNQSIISSHKQDKSIVGVPKKIQSIVGSTKHDDSIVGFRKQDRSIVSVPEQKQSIVGFHKQDLSIVAVSEQNLSIVAIPRESQSKQISIVRRHDPLHLKEVETKDRDGISKKSGGDDDLPHMLFEEELSQVEDEARAIAYKKQHEVDVISLTPDIQESPQDNIDPQELRRMLQELADQNCSMGNKLFVFPEAVKANSTIDVYLNRNLSALANEPDVHIKGAFNSWRWRPFTERLHKSELSGDWWSCKLHIPKEAYRLDFVFFNGRLVYDNNDSNDFVLQVESTMDEDSFEEFLVEEKKRELERVATEEAERRRHAEEQQRMGEQRAAEQAAREQAKKEIELKKNKLQNLLSSARTHVDNLWHIEPSTYRQGDTVRLYYNRNSRPLMHSTEIWMHGGCNSWTDGLSIVERLVECDDENGDWWYANVHIPEKAFVLDWVFADGPPGNARNYDNNGRQDFHAILPNAMTNEEYWVEEENCIYTRLLHEIREREEAIKIKVEKRAKMKSEMKEKTMRMFLLSQKHIVYTEPLEIHAGTTVDVLYNPSNTVLNGKPEVWFRWSFNRWMHPSGVLPPKKMVKTEDGCHLKATVSVPSDAYMMDFVFSESEEGGIYDNRNGTDYHIPVSGSNAKEPPIHIVHIAVEMAPIAKVGGLADVVTSLSRAIQELGHHVEVILPKYNFMNQSNVKNLHVRQSFSLGGTEIKVWFGLVEDLSVYFLEPQNGMFGGGWVYGGNDAGRFGLFCQSALEFLLQSGSSPHIIHCHDWSSAPVAWLYKEHYAESRLATARIIFTIHNLEFGAHFIGKAMTYCDKATTVSHTYSKEVAGHGAIAPHRGKFYGILNGIDPDIWDPYTDNFIPMHYTSENVVEGKNAAKRALQQRFGLQQTDVPIVGIITRLTAQKGIHLIKHALHRTLERNGQVVLLGSAPDPRIQSDFCRLADSLHGENHGRIYAGSDFILVPSIFEPCGLTQLVAMRYGSIPIVRKTGGLYDTVFDVDHDKDRARVLGLEPNGFSFDGADCNGVDYALNRQVPPHLTIVAISSWFEARGWFHSLCKRVMEQDWSWNRPALDYIELYHSAHKF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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