BGIOSGA028165

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA028165

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028165, complete gene.

LocusTag

OsI_28190

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA028165-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA028165-PA

Length

8139

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:6278041..6286179

Sequence Coding Region

6278041..6278285,6279968..6280037,6280917..6281032,6281492..6281563,6281816..6281890
,6282583..6282627,6282705..6282769,6282861..6282887,6283654..6283818
,6285134..6285404,6285491..6285641,6285712..6286179

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:6278041..6286179 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGTGCCAATTGATCAGCTCGTGCTCGATCGTGTACGCGTCTCAAGCAGTGGCGGCGCTGAACACAATCTTCCGGCAGTGGGGCCTGAGGGCGTCACCGGCGTGGAACATCAGCGGGGAGCCCTGCAGCGGCGTCGCCCTCAATCAAACCTTTGAATTCGAAGACCGCTTGGATCCCGACCGCAACCCCGGCATCACTTGTGACTGCTCCTACAACAACGGCACAGTTTGCCACATCATCCGACTGAATTTACAGAAAAATTACTTGACAGGACCTTTACCGGCATTTAATAGTGTTGACATCACTGAAGTATCTTTATTTCGTACATCAGTACTAACATTGTTTCTTTATGGGTTCAGAACGGCATCGGATAATGATTTCTCTGGGAGAATACCTGATTTTATTGGGAGCTTTTCAAATTTGGAAAAACTGAGCCTTCAAGGAAATAATTTTGATGGTCCCATTCCTGAAAGTTTTTCTAGTCTTAACAAGTTGACAAATCTAACACTGAGGAATTGCAGGATATCTGACAATCTTGCTTCAGTGGACTTCTCAAAGTTCGTAGAACTTGGTTACTTGAATTTGGTGTGGAATAACTTCAAGATAAATAATTCCAACAAAAGTATTTTGCCATCAGGTCTAAATTGCCTCCAGCGAAATACTCCCTGTTTTCCTGCTTCTCCAGGGAAGTCCTCCTTTGCAGTAGATTCTGGTGGTGGCAACAATAAGGTGGATCCTGGTCCTATTAAAAACAGTGCTGGTAACAGTAAAATAGCTTTGGTAGCTGGAGTTGTTGTCTGTACTATAGTTTTAGGCTTTTTATCCACAGGGACATTTCTTTGGAGACAGAAAAGGAAAAAAATGGAGGCGGAGATGGGAGAAAATTCCAAGGTCCCTAAAATTTTAAGTTCACTTGTAGGCAAGACGAAACTGAACCTAGATTGGAGTACCCGCTTTGACATATGCGTAGGCATCGCAAGGGGCCTAGCATATCTCCATGAGGAGTCCAGCACACGGATAGTTCACAGGGACATCAAAACCAGCAATGTCTTGCTTGATGGTGATCTCAATCCAAAAATCTCTGACTTTGGGCTAGCTAGGCATTATGAGGACAACATGACTCACCTTAGCACAGGAGTAGCTGGCACGCTTGGTTATCTAGCACCCGAGTATGCCATGATGGGCCACTTGACAGAGAAGGCTGATGTCTTCGCTTATGGTGTTGTGGCAATGGAGATTATTGCAGGAAGGCCAAACTTTGATGAGAGCCTCGAGGATGATAAGAAGTATCTGCTTGGATGGGCTTGGCGGCTACATGAGCGAAGTCAGACTCTTGAAATGTTGGACCCTAAACTTGCAAAATTCGACGAGGAAGAGGTTGTGCGAGTCATCAACATCATTCTCCTTTGCACTGTGGGCTTGCCTGAGCAACGCCCACCGATGTCGAAAGTTGTCTCCATGCTTACTGAAGATACTGAGATGAGTGAAGTGGATATGAGTATGTGGCCTAGCTATGTGCCTCAGTGGCAGAGGAAGAGCGGAAGTGATAGTTTCTTCGCGTCATTGATGCAGCAATCTTCAGGCACCGAATCTTTGCGCCATCAAGCTCAGGAAACAACACAAAATCCCATGGGGAAACCTCCCCACTTGTTTTGTCGGCTAATTCTATCGTTTAGTTTGCTGAGGGAAGGTGATAAGTCCCCAAGGGTGCTGTTTTTAAGTTTGAGTGAATCTTGGTCCCTTTTTCTCCTACAAACATTGTGCCCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MCQLISSCSIVYASQAVAALNTIFRQWGLRASPAWNISGEPCSGVALNQTFEFEDRLDPDRNPGITCDCSYNNGTVCHIIRLNLQKNYLTGPLPAFNSVDITEVSLFRTSVLTLFLYGFRTASDNDFSGRIPDFIGSFSNLEKLSLQGNNFDGPIPESFSSLNKLTNLTLRNCRISDNLASVDFSKFVELGYLNLVWNNFKINNSNKSILPSGLNCLQRNTPCFPASPGKSSFAVDSGGGNNKVDPGPIKNSAGNSKIALVAGVVVCTIVLGFLSTGTFLWRQKRKKMEAEMGENSKVPKILSSLVGKTKLNLDWSTRFDICVGIARGLAYLHEESSTRIVHRDIKTSNVLLDGDLNPKISDFGLARHYEDNMTHLSTGVAGTLGYLAPEYAMMGHLTEKADVFAYGVVAMEIIAGRPNFDESLEDDKKYLLGWAWRLHERSQTLEMLDPKLAKFDEEEVVRVINIILLCTVGLPEQRPPMSKVVSMLTEDTEMSEVDMSMWPSYVPQWQRKSGSDSFFASLMQQSSGTESLRHQAQETTQNPMGKPPHLFCRLILSFSLLREGDKSPRVLFLSLSESWSLFLLQTLCP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..245#1928..1997#2877..2992#3452..3523#3776..3850#4543..4587#4665..4729#4821..4847#5614..5778#7094..7364#7451..7601#7672..8139#ATGTGCCAATTGATCAGCTCGTGCTCGATCGTGTACGCGTCTCAAGCAGTGGCGGCGCTGAACACAATCTTCCGGCAGTGGGGCCTGAGGGCGTCACCGGCGTGGAACATCAGCGGGGAGCCCTGCAGCGGCGTCGCCCTCAATCAAACCTTTGAATTCGAAGACCGCTTGGATCCCGACCGCAACCCCGGCATCACTTGTGACTGCTCCTACAACAACGGCACAGTTTGCCACATCATCCGACTGTGAGCTATGACCTTCCTAACCAAACTATTAATTTGTTACCACTGCTCCTGCTAGAATCTGTGATTTCGGTATCACTGAAAATTTTTTTACTTCAATATTTAGGCCTGATTTGAAGTTTACTTGATTATTTCAGAAATTCAAATTGCGATCAAATTTCACTGAAAAGATTCAAGAAATTGCGGTCAAATTACTACCCTCCAATATTTAGAAATTTCTGTCTTTACAGTTCAAGAAACAGGGTCATACAATTGTGTATTTGTCCATAATTATTCGAAAAGAACTTATGGACAACAGAATCATGGAGTGAATTTTGATCATAAAGGTTGCATAATTTTGTAAAGTATCAAAAGATTGCATCAATGGGGAAATCCAAAGAAGTTTGCGATTCTAATGATATGAAACGAATTATGCGGAAAAACAATGTCAAGAACTAAAACTGCAAATAAAGTGATGGCATCTAATGGATTTTTCCTTATGATTTTACTTCTTTAAGAAACAATTTCGATTAAAAAAATTATTATACCTATACTAATTGGATATTTTCTAGAAGCTCCCAAATTAACCAGAGAGATTCTGCCATTCATGAGGTTGATTGTATTATCGTGACTGTAGATTATGTTGATGGTCTGGTCAAATAAAACATGTTATTGTAACAATCGTGGACTCTTTGTTATTTTAATTTGGTTTATTTATGTATTGGTTTATTGTTAGTCGTGTTGCCATCCTATCAAGAAATTTGTTACGTTCCATGCTTAATTCCAACTTCTTCGATTCTATTTCCGCGAGAGAAATTCTGAACTTGGAATTACTAATTCATTAAACAACTATAATTAAAACTCCAAATTGAGTAAATTGATACTTATTAATTCCGAATTTTAAATTATTAAATTAAGAAAATATACAAGTAAAGGAAGAATATTAGGATGTATTCTATATGTATTTTTGTAATTATTGATTTTAATTTTTGGAACTATGAATAAAATATCTTTTGTTCTTAGAAATTTTAAACAAAGTTTACATTCGAATTTCAACAATATTTAATAACCAAAGTATTCAGAATAAGATTAAATTTTTAATATTTATAATACCAATAACAATAGCCTGTGCAACACATGGGTTGTCGACTAGTATGGTTAATTTATCATGATACAATTCTTTGTGCACCTCTTTGTGATATTGTCTAATGTAGTCGTGCTGGACAATGTTTTTAAACATGCAATGTTATGGTAAACACCACCGAGAGAATAGCCGGGCGGAGACGGCTGCTAAGGATGAGAGAGAGAGACTTAGGTTGGGGAAGACTAATTCTGATTAATTGCTTTAATCCAAATAACAATACAATTCATCATTATATATATGGATAAGATGGAGGGAATGGCCCAATCTAATCCTATCCAACTGAGCTAGCGTAAGATGAGGAACCGATCCTAGGGTCTCGACCCCTAGGTCCTCCACCTATCGGTCCACTACCTATGACATACAATTCTACAAATTACTATTCTGCTTCTTGTTCATGCAGGAGTGTGTATTCACAAAACGTTGTTGGTCAGATTCCAGAAGAACTGCAAAATCTAACCTACCTGACAGATTTGTATGAACTATGCCCAATGTTAAATGTTGAAGCCAAAGGACACTAGTTCAGATATCTAAATTTGGTACTTTTCAATTGTTGTGCTTTCAGGAATTTACAGAAAAATTACTTGACAGGACCTTTACCGGCATTTAATAGTGTTGACATCACTGAAGTATCTGTAAGAATTAGAATTCAAAAATTCATAGTGAAACATTTCAAGTTAAAACTTGCTATTACATGGTACTTGTGTGTAGAGATTTGCTCCGGTCCAACAAAAAGTACCTCGAGATACCGGTATCTCATAGTACCAAATTGTTTCTGATCATTGGATCTAACAATACCCATCCTGTTAGGTCCAACGATCGGAAACGATTTGGTACCGTGAGGTACCGGTACCTCAAGGTACTTTTTGTTGGACCGGAGAAAATCTCCTTGTGTGTAACATCACTTGCCATGTTCTTTTCTCAAAACTGCAAGAAATGTGGCATACAATGCGCTATCTGGAGTTTTACCAAGGGAGCTTGGCAACCTCGAGAATCTCTATGCATTGTAAGTAGTAGTGTCATTTTATTTTAAGAGAAGATCTCTTGCATTATGGAAAAAGCAGTAAAAAAAAACATATGGAACTTATCGAATCTTGATCTAGTTGGTCAGAGTTACTTGTACGTCTCACTATGCCAAATAACAAATTAGTTGGTTCCATGAAAGAGATTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGTACTGAATGGATAATATTTTTATTTTTTTTAATCCCCATCTCCGTGTGTTTCAGGGGCATTTCGACAAATAAGTTTGTTGGTCCACTTCCTGAAATATTAGAGAACTTGACCAATCTCGAGCAACTGTAATATATTGGTTCTGCTTCACCTAATTTTCCTAGTCCTGGTATTTGAACGAAGTGAGAATAACCATTTATCTTTAACAATCGCAGATATATTGACAGTTGTGGTTTAAGCGGGGAACTACCATCTACCTTGTCCAAACTTAAGAACCTAAGAGTCCTGTAAATTGTCTTGTGAACATTACTTCAATTTTCGAGTTATTTCGTACATCAGTACTAACATTGTTTCTTTATGGGTTCAGAACGGCATCGGATAATGATTTCTCTGGGAGAATACCTGATTTTATTGGGAGCTTTTCAAATTTGGAAAAACTGTAAGCTACTGCGTGACTACTTCCTCAATTGCATAATCTTTTATTCTTGTTGATGAATTTAAATGAAGGAAGTTATACCAAAATGATTGGATTATGTTTTTTGTATTTTCATTGTGAACACGCATGTAGGGCATTTGTAGAGCCTACAGTAGAGGGGATTCCAACCCAGGCTCGAACCCGGGTTTCTCACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAACCTCGCAGGTGCTGTAGAAGTGTGCTCCACACGTGAGGTTGTATGCTCTATATTCAGGGTGGTTTTTCTCGACTTATTTGAATGCTGCCGGCTGTCTTAACTCTTAATCCGCCAATCGGTTTTTCTTTTATATGTTCATTGGAGGGAGGGAATATTATGTCTGGTGCAATTTCATTTTCTTCAGAAGGTCTAGAAGGAAATGATCCCTTCTATTGCTAATGTGATGTATATACATCCATATAGGAGCCTTCAAGGAAATAATTTTGATGGTCCCATTCCTGAAAGTTTTTCTAGTCTTAACAAGTTGACAAATCTGTAAGTGCTTTCCCCCTTTAATTTTTGTGACATAAGGTGCGTACTTATTGCAAAGGTCTTGCTTTAGTAAATTAACTATCTCTTATACAGGCAAATGGGTGATTTAGTGGGCGGGAGTTCTTCATTAGCATTTATAGCTAACATGACATCCTTGTCGACTCTGTATGGTGGCCTGTGTACACACTTGTCTTTATTGGTCAGCTATGCCTTGACAAACATTGAAAATCTTATCAATATATTGGTTTATTTCAGAACACTGAGGAATTGCAGGATATCTGACAATCTTGCTTCAGTGGACTTCTCAAAGTTCGTAGAACTTGGTTACTTGTAAGAATCTAATAACCCTAAACTATAACTTGGTCACCAGTTGTTTGGTTAAAAGTGAAGTGAGCGTTTACCTTTTGCTCTTTCCCCTTTTGTATATGAATGGCACAGGGATTTAAGTTTTAACAGCATCACAGGCGAAGTACCTCCAGTCCTTTTGAACCTGCGCTTACTCAAATCCCTGTAAGGAAAAAAATTGTAGGATTAAATGCCTTCATCATGTCTGTTTCAATTTCAAATATTATTTTAAAATTTCTCTACAATCTTTCATGTGAGTCAGATTTCTTGGAAATAACAACCTCTCTGGGAGTTTGCCAGAGACAAAGAGTACTTCCCTTAATACTCTGTAAGTTTTTTCTTACCTTCAGTTTAGCTATCTGAGTATCAAATGCACCATTTAGCACAACATGTAAAATGGGGTTTTCCTTGGTATATGTCAAATAAATATTGGTCTTGTTTTACTAATGAAATCTTTTCAGAGATCTATCATACAACATGCTCTCTGGGGAATTTCCTTCTTGGCTCAGCACAGAAAATTTACATGTGTAGGTTTTTCTCAAGAAATGTTCATTTGGAAGCAAACAAAACAATACATGTCCACCACACTTTGTGGACTCTGGACTATGAAACTACAAATAGTAATTATTGTCATGACAGCTTGTGACCTTACTGTCTGTGTTGTATTTCTCTTCTAGGAATTTGGTGTGGAATAACTTCAAGATAAATAATTCCAACAAAAGGTTTCTTTTCTACTTCATGTAATTAGTTTCATTTCATGCTTCTCTATGAAGCTCTTCTAAATATATTGTGTTTGTAGTATTTTGCCATCAGGTCTAAATTGCCTCCAGCGAAATACTCCCTGTTTTCCTGCTTCTCCAGGGAGTGAGCACTGATATCTTCACCATTTGTTGTACTAGCTTAATCTCTGCAACAATAAAATGTGTACTCTTATATGTTTTCTGTTAAATTGCAGAGTCCTCCTTTGCAGTAGATTCTGGTGGTAAGAAAAAC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA028165