BGIOSGA028479
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028479 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028479, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28845 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028479-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028479-PA |
| Length |
9006 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:16115760..16124765 |
| Sequence Coding Region |
16115760..16116012,16116098..16116514,16116914..16117110,16117817..16118017,16118753..16119463 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:16115760..16124765 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:16115760..16124765 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCCGAGGCGGCGGCGGCGAAGGAGGAGGAGCCGTGCTGCATCTCCCACGCATTCGACCGCGCCGCCCGCCGGAACCCTACCGGCCTCGCCGTCATCCATGCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCTCCGACAGCGAGCGCCACTTCACCTGCGCCGACCTCCTCGCCGCCGTCTCCACCCTCTCCCGCCACATCGCCGCGGAGCTCAGCTCGTCTACCTCCCGCCACCGTGATGAATCGCCTGGCTGTTCGGGTCGCCCCGTGGAAGCCGCCGCGGCGCCTAGGGTTGTGGGGGTTTACGCCTTGCCTTCGGTGGAGTACATCGCCGCCGTCCTCGCCGTGCTCAGATGCGGGGAGGCGTTCCTGCCGCTGGACCCATCGTGGCCAGAGGAGAGGATTCGATGGGCCACCTCGTCGTCGAATGCGGTGCTCGTTGTATCATCAGGGGGTTTGGGAGCAGCTCATGTGTTTGCGAGCAGCTCTTGCTCTGTTATTCACATGGACGACGACTTATGGCAAGTGTTTGAGGATGAAAAGGGTGGGATTGGTCGAGATGAGCTTGCTTGGCCGTGCGAGTGCAAGAAGCCGAGGGAGTTCTGCTACGTGATGTTCACATCTGGTTCCACTGGAAAACCCAAGGGTGTTTGTGGAACAGAGAAAGGTCTTCTGAACCGCTTTTTGTGGATGCAAAGATGGAAACCTCTATGTTCAGATGACATGTTATTGTTTAAGACATCTGTCAGCTTTGTAGACCATCTGCAGGAGTTCCTTTCTGCTGTGTTGACTTGCACAACACTTGTCATTCCTCCTCCTAATGATTGGAGAGCTAATCCAGCATCCTTGGCCAACTTGATTAAGGCATATGGTATATCAAGGATGAATTTGGTTCCATCATTGATGGAGATAATACTACCTTCCCTGGAGAAAAATCTTTCATGGGGACATAACCCGCTTAAGATGCTAATATTTAGTGGCGAGAATCTATCCATATTGTTGTGGAAGAGAGTGCATGAAATTCTGCCAGAGACTACTATTGTAAATCTGTATGGAACGACAGAGGTTTCTGGTGACTGTACATTTTTTGATTGCACAGATCTGCCTATACTTTTAAAGCGAGAAGAATTAACTAGTGTACCAATTGGATTTCCTATTTCAAATTGTGAAGTTTGTATTGCAACCGACGCCGAGGTAGCAGATGAAGGAGAAATGCATGTCACTGGAGCATGTTTATTTGCTGGATATTTAGAAGAGTCCATGGCGAGTAATCACACTGAAGAAAATGGAAGTTCAACATACTACAGAACCGGTGACTTTGCTCGACGCTTAAAGAGTGGTGAATTTATTTTCCTTGGGAGAAAGGACCGTACTGTAAAAATTTATGGGCAGCGTTTTTCACTGCAGGAAGTGGAATCTACCTTAAATGAACATCCAGATGTCAGTGCTGCTGCTGTTACTTTTCAAAATAATGAATTTCTGGATTTTAGGGCATACCTGGTGCTTAAGAGTAGCGCCGCATCTGTGGAAGACTGTCAGCGGCGTAAAAGATACAAATCTTTTGAAGTTATCATGCCATCAATTCGAAGTTGGCTCATAATGAAGCTTCCACCAGCCATGATTCCAAGGTTTTTCCTTCCCATGGAATCATTACCTCTGACTTCTTCAGGAAAGATTGATTATATGAAGCTATCAAGCTTGAAGTGTGCCTTGGAGTCCTGTGAAACTGAAACTGAAAGAATTACAGTTAATCCACATTTGCAAGTTATCAAAAAGGCATTTTCTGATGCCTTACTTGTTGATGAAGTTTCCGAGTTTGATGATTTCTTCACCTTGGGTGGTAATTCAATTTCTGCTGCGCACGTAGCCCACAAGCTGGAGATTGACATGAGGATGCTTTATATATATTCCACCCCTTCTAAGCTCTTGGATGCTTTATTTACAAAGCACGGTTGTTTACTTTCTTCTAGTCATGAGCCTCACCCTAAGAAGGGATTGGACATATCTTCCAGCATACATAGCTCATTTAATCCGATCGCTACAAGTGTAGATGATAACTTTCCTGAAGTAAAAGCACATATAAATGGAGATGGAGAGTGTGCACATGATGCCATTTCAGGGAATTATGCAAATGAAGTAGATGGCCAGCTTAACAGAAATGTGCCTTTATCTAATGATAGATACCAGACAAAATCCCTCTTGTTGGATACATGCTCAAATGACAGAAACAGTGTCGATGTCAGTCCATGGATCTTGAATTTTTGTTTAGTAAAGAAATGGTCTATTGGACGTTGCAATAGATTTATGCATAGATACGAAGATAAGCTGCAAATTGAAGATGTTTGCTCATATGTTCCCTACAACAAAAGAGGTTATCTTCAGGCCCTTTGGAACATTCCTCTCGGTTCATGTGTTGACGCGTCACCTTTGCTTGTCTCCAACAATGGCATGCTGAGTATATTTATCGGGTCCCATTCACACAGATTTCTCTGCATTGATGGCTGTAGTGGTTCTGTGAGGTGGAGTGTCAAATTGGAAGGACGTGTAGAGTGTTCTGCTGCTATAACAGGTGACTTTTCAGAGGTTGTAGTTGGATGTTATAAAGGGAAAATCTACTTCCTTGATCTGTTAACTGGAAAACAAGCTTGGACCATTCAGACTGATGGAGAGATTGTAGAAGTTCCTCCCATTAAGCATCAGCTGGAAAGATATATAGTGGCAGGTGTCTATCTCTTCTTAAAGAAAGAGCATCCAAAAAGGTGTGGCTCTTATGACCACCATTTATATGCGTTAAATTACAAAGATCGTTGCTGCACTTACAAAATTTCTTGTGGTGGAAGCATTTATGGTTCTCCTGCTATAGACATGACACACAACATGATATATGTTGCATCTACGAGTGGCCTTGTGACTGCAATATCACTTGAGGTATCGTCATTTAAGATAATTTGGCAATATGAAGCCGGGGCACCAATTTTCGGTTCTCTTGCTATACATCATCATGGTGGAAAAGTTATCTGCTGCCTGGTGAATGGTCTGGTGATTGCATTGAACTCACATGGCTCTGTCGTTTGGAAGGCATCTGTTGGTGGTCCTATTTTTGCTGGTGCATGTTTGTCATCTGGCCTTCCTACTCAGGTGTTGATACCTTCCCGTGACGGAAGATTATACTCTTTTGATACTACATCTGGTGCTCTTCTTTGGAAATATGAAGTTGGAGACCCTATTACCGCATCTGCTTTTGTCGATGAAGTGTTAACAGCAACCTCACCTGGAGCATCTGAAAGATTCGCTTGTATCTGCACGAGTTCGGGACAGGTCCATGTCATTAGGATTAGAGCTGATGCTAAGGAAGAGAAAGTTAATGGAAGTATTTGTAATGACTTGGTGCAAGGATTTGCTGCAATAGATCTTCCTGGGGACATCTTCTCATCGCCCTTGATGGTTGGTGGACGCATCTTTGTTGGATGCAGAGATGATCAACTACACTGTCTCACAATCAGCTCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAEAAAAKEEEPCCISHAFDRAARRNPTGLAVIHAASSSSSSSGSDSERHFTCADLLAAVSTLSRHIAAELSSSTSRHRDESPGCSGRPVEAAAAPRVVGVYALPSVEYIAAVLAVLRCGEAFLPLDPSWPEERIRWATSSSNAVLVVSSGGLGAAHVFASSSCSVIHMDDDLWQVFEDEKGGIGRDELAWPCECKKPREFCYVMFTSGSTGKPKGVCGTEKGLLNRFLWMQRWKPLCSDDMLLFKTSVSFVDHLQEFLSAVLTCTTLVIPPPNDWRANPASLANLIKAYGISRMNLVPSLMEIILPSLEKNLSWGHNPLKMLIFSGENLSILLWKRVHEILPETTIVNLYGTTEVSGDCTFFDCTDLPILLKREELTSVPIGFPISNCEVCIATDAEVADEGEMHVTGACLFAGYLEESMASNHTEENGSSTYYRTGDFARRLKSGEFIFLGRKDRTVKIYGQRFSLQEVESTLNEHPDVSAAAVTFQNNEFLDFRAYLVLKSSAASVEDCQRRKRYKSFEVIMPSIRSWLIMKLPPAMIPRFFLPMESLPLTSSGKIDYMKLSSLKCALESCETETERITVNPHLQVIKKAFSDALLVDEVSEFDDFFTLGGNSISAAHVAHKLEIDMRMLYIYSTPSKLLDALFTKHGCLLSSSHEPHPKKGLDISSSIHSSFNPIATSVDDNFPEVKAHINGDGECAHDAISGNYANEVDGQLNRNVPLSNDRYQTKSLLLDTCSNDRNSVDVSPWILNFCLVKKWSIGRCNRFMHRYEDKLQIEDVCSYVPYNKRGYLQALWNIPLGSCVDASPLLVSNNGMLSIFIGSHSHRFLCIDGCSGSVRWSVKLEGRVECSAAITGDFSEVVVGCYKGKIYFLDLLTGKQAWTIQTDGEIVEVPPIKHQLERYIVAGVYLFLKKEHPKRCGSYDHHLYALNYKDRCCTYKISCGGSIYGSPAIDMTHNMIYVASTSGLVTAISLEVSSFKIIWQYEAGAPIFGSLAIHHHGGKVICCLVNGLVIALNSHGSVVWKASVGGPIFAGACLSSGLPTQVLIPSRDGRLYSFDTTSGALLWKYEVGDPITASAFVDEVLTATSPGASERFACICTSSGQVHVIRIRADAKEEKVNGSICNDLVQGFAAIDLPGDIFSSPLMVGGRIFVGCRDDQLHCLTISS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..253#339..755#1155..1351#2058..2258#2994..3704#3850..4580#4847..4922#5001..5087#5334..5422#6307..6415#6495..6554#6740..6824#7083..7147#7599..7658#7774..7818#8604..8707#8784..9006#ATGGCGGCCGAGGCGGCGGCGGCGAAGGAGGAGGAGCCGTGCTGCATCTCCCACGCATTCGACCGCGCCGCCCGCCGGAACCCTACCGGCCTCGCCGTCATCCATGCGGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCTCCGACAGCGAGCGCCACTTCACCTGCGCCGACCTCCTCGCCGCCGTCTCCACCCTCTCCCGCCACATCGCCGCGGAGCTCAGCTCGTCTACCTCCCGCCACCGTGATGAATCGCCTGGTGAGTGAGCGGTGACTTGGTTCGTGTTTTTTTTAATTAACTCGTAGTTTCGTCCTCTGATCGAAGGGGGAATTTGGAACCCTAGGCTGTTCGGGTCGCCCCGTGGAAGCCGCCGCGGCGCCTAGGGTTGTGGGGGTTTACGCCTTGCCTTCGGTGGAGTACATCGCCGCCGTCCTCGCCGTGCTCAGATGCGGGGAGGCGTTCCTGCCGCTGGACCCATCGTGGCCAGAGGAGAGGATTCGATGGGCCACCTCGTCGTCGAATGCGGTGCTCGTTGTATCATCAGGGGGTTTGGGAGCAGCTCATGTGTTTGCGAGCAGCTCTTGCTCTGTTATTCACATGGACGACGACTTATGGCAAGTGTTTGAGGATGAAAAGGGTGGGATTGGTCGAGATGAGCTTGCTTGGCCGTGCGAGTGCAAGAAGCCGAGGGAGTTCTGCTACGTGATGTTCACATCTGGTTCCACTGGAAAACCCAAGGGTGTTTGTGGAACAGAGAAAGGTAACGTCACTGCACCTTGCTGCTGGTTCACTGTTTCTTCTATGCTATCATTTAGAAATTTTGCTTCTGACATGGCAAAGGAATTGGTTGACATGTCTCTAGATGCTCTTCTTGAGAAAGAGTAGTTTAGTATACTGCCGTCATGGCTATCTTATGCCAATGTTTACAATATCCAAAATGCTAGCCTAAGCCCAAATGTTTACTATGCCAAACTGCAGGCATAGAGTATCTGAAATTACATGGTAGCAAAAATATATGTTACCAGCGAAACATTAAATGGCTCATGTTTTTTTATCTTTTGCTTTGTAATTTCTTATTTAAGGTCTGTTAGATTGTCTTTCTAGGTTTGGATTGGGCGGACAGCTCATTAAGATCTCTTATTTTGCTATTATTCCTTAGGTCTTCTGAACCGCTTTTTGTGGATGCAAAGATGGAAACCTCTATGTTCAGATGACATGTTATTGTTTAAGACATCTGTCAGCTTTGTAGACCATCTGCAGGAGTTCCTTTCTGCTGTGTTGACTTGCACAACACTTGTCATTCCTCCTCCTAATGATTGGAGAGCTAATCCAGCATCCTTGGCCAACTTGATTAAGGTTACCTAGTTTAATCATTGTTTTGGTGGAAATATTGCTATTCTTTTTTAATGAAATAGTAGGGGAGAGAGAGTTATGCTTTCATTGTCCAATTTGTCTTCTCCATAAAACATTATATCCAAGGCTTCTGCTTGTTGAAATAAATTGCAGTAGCGTTCGAAAACAGCATCTCTGATGAATTTTGCAAATATAGTCCTTTTTGTAGCAGTCATTTTGAAATTTTGAATTACAATTTAGTGGGGCAAACTAGGATGAAAGTGGACTGTGCACATGTTGGCACGGTTGTACACTAATTTGCGATAAATAGGCTTACCTTTTCATTTTCCTTACATTTTTGCAGTTAGGAATTTTTTTTTTCTAATACAAGTTATATTTGCTTAATTGTGTCCAAAAGTGGGTAAAATTTAATGTATATTAGTACATTTTTGTCCTCTTTCAAATATCATTGGAAAGAGCTACTGCTAAGAGATATAGTTCTACATTATTCTTCTTCCGTAGCAAAACAGTAATTTTAGGATGCTACCAATGTTGTCAGAATTGGTACTATAGTTTCTGGCTCTTGTCTATTTTAGATTCAATTGCTTTGATAAAAAAGTAGCAACTCATATAATGGGATTTTCATGGTAAATCAATACATATTACGATTATAGCTATTACGCCATGTTCTTCTTGGTGGGCCTGATTTTTTTTTCTAATTTTTTCTTAGGCATATGGTATATCAAGGATGAATTTGGTTCCATCATTGATGGAGATAATACTACCTTCCCTGGAGAAAAATCTTTCATGGGGACATAACCCGCTTAAGATGCTAATATTTAGTGGCGAGAATCTATCCATATTGTTGTGGAAGAGAGTGCATGAAATTCTGCCAGAGACTACTATTGTAAATCTGTATGGAACGACAGAGGTGAGAAAATTAACCACTTGCATTTCATATTATGTTATCTTTGTTTTAATAATGTATTCTTATAATCATATGGTTTACACCATTTATCTTACTGGCTTCTGGCGATCAAAATCAACAGTACATTGGCTGGCCATCTGGCTTGACTTCTCCTAAAATAAATATTGGTGAAAACTGATTTGTACCACATCTTTTCCATGCACACAGAATTGAGAGCATGACTTGTGTCATCTTTACTAGTGTTAGCATAAATTACAGTAAAATATTCTTGCAATATTAAGCTTGTGACCATGAGTGGTAATTCATGGTTTGGTTGCACATCATTTCCTAACCATCATTTTACTGATTCCTGTTATACTAAAACTTTAAGGGAGTTATGATGAAGAGCACATGTGCCATAAGGGTTGAGTAGTTAAATTCTCTTACACCTTTTTATTCAGCATGAATCAAACTTGATATTTGCTTCATGATAATTTAAATTGGTCTTGAATTATGATATGAAAATTGAAAAGGTACAGTTAGTGTTCCATTCTGAAACACGTGTTACGGTGTTAGGTAACTCGTGTAGCAATATAGCGTACTTATCATTACTTGGTATATGAAGGCCATCGAACTGTGATCTTGAAACTAGCATGTTTCATTTATGCTATATTGGTCCTGTTCTCCTCATGCAAGGAGCTGAAATGGCAGTGGTGATATTTCTTCTTTAGCTAATCAAATGTTGCGCTTGTGATTCAGGTTTCTGGTGACTGTACATTTTTTGATTGCACAGATCTGCCTATACTTTTAAAGCGAGAAGAATTAACTAGTGTACCAATTGGATTTCCTATTTCAAATTGTGAAGTTTGTATTGCAACCGACGCCGAGGTAGCAGATGAAGGAGAAATGCATGTCACTGGAGCATGTTTATTTGCTGGATATTTAGAAGAGTCCATGGCGAGTAATCACACTGAAGAAAATGGAAGTTCAACATACTACAGAACCGGTGACTTTGCTCGACGCTTAAAGAGTGGTGAATTTATTTTCCTTGGGAGAAAGGACCGTACTGTAAAAATTTATGGGCAGCGTTTTTCACTGCAGGAAGTGGAATCTACCTTAAATGAACATCCAGATGTCAGTGCTGCTGCTGTTACTTTTCAAAATAATGAATTTCTGGATTTTAGGGCATACCTGGTGCTTAAGAGTAGCGCCGCATCTGTGGAAGACTGTCAGCGGCGTAAAAGATACAAATCTTTTGAAGTTATCATGCCATCAATTCGAAGTTGGCTCATAATGAAGCTTCCACCAGCCATGATTCCAAGGTTTTTCCTTCCCATGGAATCATTACCTCTGACTTCTTCAGGAAAGATTGATTATATGAAGCTATCAAGCTTGAAGTGTGCCTTGGAGTCCTGTGAAACTGAAACTGAAAGAATTACAGTTAATCCACATTTGCAAGTTATCAAAAAGGTCTGTTCAAGCACTCTCTTGTTTTTACCGTCTACTCTACTGTTAATTTTGTTTCTGTTTGTTTCTCTTTGGAGCTATTGTATTCTTTGAGTATTCATTATTATAATGATCATTTTTTACTGATGTCATCTCTTATCTACTGTAGGCATTTTCTGATGCCTTACTTGTTGATGAAGTTTCCGAGTTTGATGATTTCTTCACCTTGGGTGGTAATTCAATTTCTGCTGCGCACGTAGCCCACAAGCTGGAGATTGACATGAGGATGCTTTATATATATTCCACCCCTTCTAAGCTCTTGGATGCTTTATTTACAAAGCACGGTTGTTTACTTTCTTCTAGTCATGAGCCTCACCCTAAGAAGGGATTGGACATATCTTCCAGCATACATAGCTCATTTAATCCGATCGCTACAAGTGTAGATGATAACTTTCCTGAAGTAAAAGCACATATAAATGGAGATGGAGAGTGTGCACATGATGCCATTTCAGGGAATTATGCAAATGAAGTAGATGGCCAGCTTAACAGAAATGTGCCTTTATCTAATGATAGATACCAGACAAAATCCCTCTTGTTGGATACATGCTCAAATGACAGAAACAGTGTCGATGTCAGTCCATGGATCTTGAATTTTTGTTTAGTAAAGAAATGGTCTATTGGACGTTGCAATAGATTTATGCATAGATACGAAGATAAGCTGCAAATTGAAGATGTTTGCTCATATGTTCCCTACAACAAAAGAGGTTATCTTCAGGCCCTTTGGAACATTCCTCTCGGTTCATGTGTTGACGCGTCACCTTTGCTTGTCTCCAACAATGGCATGCTGAGTATATTTATCGGGTCCCATTCACACAGATTTCTCTGCATTGATGGCTGTAGGTGAGTTTTCCTTGTTGCAAGGAGTTTTTTTTTATCTTAACTAGTCATTGTTTCTTTTGCTTTTCCTGATTTACTTTGAAGTTGAATCTAGAACAATCTAATGTGCCACATACGCTCTAATGTTCTTATGAAATGGCATGTTGTGTATTTAATATAAAGTAATTTATTATTGATTTGTTTCATTTTAATTTGATTCAATGAAGTATTTAGGTTCTGACCTTTGCA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