BGIOSGA028490
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028490 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028490, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_28874 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028490-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028490-PA |
| Length |
5483 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:16437443..16442925 |
| Sequence Coding Region |
16437443..16438156,16438494..16438581,16438730..16438800,16440267..16440299,16440378..16440456 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:16437443..16442925 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:16437443..16442925 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTTCCACGGCCAGCAGTTTCATGCTTGGATCATCAAAGCAGGTGTTGACAATGATCCGCATGTTTCAAATGCTCTTATTGACATGTATGCTAAGTGTGGCTTCATTAAGGAAGGGAGGATGCTGTTTGAATCAACATGTGGGGAGGATGTCATTTGTTGGAACTCAATGATTACGACTTATGCACAGCACGGTCATGCTGAAGAAGCTCTTCAGGTTTTCCGGCTGATGGGAGAAGCTGAGGTAGAACCTAACTATGTGACCTTTGTCGGTGTGTTATCAGCATGTGCGCATGCAGGTTTTGTGGGTGAAGGATTAAACCATTTTAACTCTATGAAATCAAATTATGATATTGAACCAGGCATTGAGCATTACGCTTCTGTAGTCAATCTTTTTGGTCGTTCTGGGAAACTGCATGCTGCCAAGGAGTTTATTGAAAGGATGCCAATCAAACCAGCTGCAGCTGTTTGGAGAAGTTTGCTGAGCGCTTGCCATCTTTTTGGCAACGCTGAAATTGGGAGGTATGCCGCTGAAATGGCACTCTTGGCAGATCCAACAGACAGTGGCCCTTATGTTTTACTGTCAAATATTTATGCCTCTAAAGGACTCTGGGCTGATGTGCACAACTTAAGACAGCAGATGGATAGTTCTGGCACAGTGAAGGAAACAGGATGTAGCTGGATTGAAGTGACAAAGGAAGTTCACACGTTCATTACTAACTGGCAGATAACCATTAAACCTGAAGAGGTTTCCAGTGGTGGGGATAGCACGGACCAAAAATTAGAAGGATCTGCAAGGTGTGTTTTCAACTTGTGTCCTGACAATGAGATACACCTGTTGGGTGCCCAACAGATATCAACGATGGTTCTTCAGGAGGACATTGTGGCTTGTTTCAACATAAATATGGCACAAGTGCTGTGCTCAAGGGGAGATGGGAATTGGTACTTCTACCTCTGGTGCCTGGGTGGTGTCTTCCGTTTTGGTAGGTTGGGTCGTCTTGCTGGCTTGATCACACTAGAGGCAGAAGACAGCAATGCTCCCCTTGATGCTCTTAAGAGAGTTGGGAAATCTATTGCAATGCATATCGTTGCAACAAAACCATTGTTTTTATTAAAAGAACTGGTCTCCGCTTCAGCTGTTGAAAATGAGAGGGGCATACTCCGGACTCAAGCTGAAAGCTCCGGGAAATCCCAAATGGCCATGGAGAAAATGAGCGTCCTGAATGATTTGTCAAAGGAAGTTGGTGAAGGAGTTCAAAGGCCTGATGAGTACACTGGGTCTGAAGCTACGGCTCGTGCTGCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MFHGQQFHAWIIKAGVDNDPHVSNALIDMYAKCGFIKEGRMLFESTCGEDVICWNSMITTYAQHGHAEEALQVFRLMGEAEVEPNYVTFVGVLSACAHAGFVGEGLNHFNSMKSNYDIEPGIEHYASVVNLFGRSGKLHAAKEFIERMPIKPAAAVWRSLLSACHLFGNAEIGRYAAEMALLADPTDSGPYVLLSNIYASKGLWADVHNLRQQMDSSGTVKETGCSWIEVTKEVHTFITNWQITIKPEEVSSGGDSTDQKLEGSARCVFNLCPDNEIHLLGAQQISTMVLQEDIVACFNINMAQVLCSRGDGNWYFYLWCLGGVFRFGRLGRLAGLITLEAEDSNAPLDALKRVGKSIAMHIVATKPLFLLKELVSASAVENERGILRTQAESSGKSQMAMEKMSVLNDLSKEVGEGVQRPDEYTGSEATARAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..714#1052..1139#1288..1358#2825..2857#2936..3014#4112..4296#4847..4888#5072..5118#5438..5483#ATGTTCCACGGCCAGCAGTTTCATGCTTGGATCATCAAAGCAGGTGTTGACAATGATCCGCATGTTTCAAATGCTCTTATTGACATGTATGCTAAGTGTGGCTTCATTAAGGAAGGGAGGATGCTGTTTGAATCAACATGTGGGGAGGATGTCATTTGTTGGAACTCAATGATTACGACTTATGCACAGCACGGTCATGCTGAAGAAGCTCTTCAGGTTTTCCGGCTGATGGGAGAAGCTGAGGTAGAACCTAACTATGTGACCTTTGTCGGTGTGTTATCAGCATGTGCGCATGCAGGTTTTGTGGGTGAAGGATTAAACCATTTTAACTCTATGAAATCAAATTATGATATTGAACCAGGCATTGAGCATTACGCTTCTGTAGTCAATCTTTTTGGTCGTTCTGGGAAACTGCATGCTGCCAAGGAGTTTATTGAAAGGATGCCAATCAAACCAGCTGCAGCTGTTTGGAGAAGTTTGCTGAGCGCTTGCCATCTTTTTGGCAACGCTGAAATTGGGAGGTATGCCGCTGAAATGGCACTCTTGGCAGATCCAACAGACAGTGGCCCTTATGTTTTACTGTCAAATATTTATGCCTCTAAAGGACTCTGGGCTGATGTGCACAACTTAAGACAGCAGATGGATAGTTCTGGCACAGTGAAGGAAACAGGATGTAGCTGGATTGAAGTGACAAAGGAAGTTCACACGTTCATTGTGAGAGGGAGAGAACACCCATAGGCAGAACTGATATATTCAGTACTGGATGATCTGACGAGTCTAATTAAAAATATGGGTTATGTTCCTGATACTTCTGACCATACTCTGTTGTGTGAGACTGGTTAATCTAGTAATCTACTTGTTAAGGCTTCTACACAGATTTCATTTGCCAGAGTGTCTTTTACTGACTGCAACTTTGAGTGAGAACCTAAATGGCAATATTTTTAGACCGATCTAAGACTAACAGCTTAAGTGCTGTTTATGCCTTTTGACCAGTGGTTTTGCACATAATATCACGCTTGCTACAGACTTGTTCTTTGAGAATGTTTGACAGACTAACTGGCAGATAACCATTAAACCTGAAGAGGTTTCCAGTGGTGGGGATAGCACGGACCAAAAATTAGAAGGATCTGCAAGGTGTGGTATGCCTGTAATTGTTTTGCTGTAACGCCATTTCATTTATTAGTAGAGTTCTTGCAACGACATCTTTATCAGTTTATCTTCATTCTGTTATCAGTCCATTTCTTTTTTGTTAAAATTTTCTCACATAATTATCATTTATACCTGAAGTTTTCAACTTGTGTCCTGACAATGAGATACACCTGTTGGGTGCCCAACAGATATCAACGATGGTTCTTCAGGTCCACTTTCATCATTGTCTGCCCTTTAACTTGTCTGTGCTCCACAGGATATGACATCCAGCAGAACTTTACCCTGGCATTGTTTTATTTTGTGTGACCACTGCCCATGGGCCTAAATGTATTTCTATTCAAGGGAAACCAGTTGAGAGGAATGTTTGAATATACCTGATGTTTTGTAAATTTCCACTTATATCCACTCATCACTTCACTTTTGTTCATCAGTAAGAGAACAAGAATATGGGCATCAGTAGAATATTGGGGATGTGATCTTTTATCGGTGATTGCAGAAAAAGTCTTATTAATAGTAGTTACATATGGTTTATCTTAGGTTATAGCCAACGCACTAACAATTTAAGTCTTAACTGCTTTGAGCTCTATCTCCAAGGAATCAATATATTGATATGTCAATAGTGGCATGTTGAATTGCAGCTACTAAGATGGAATGCCAGATTGCCAGAACATATGTTTAACTGGAGTACACGGTGTAAGGTCATATTTCTCACACCTGCGTTTCATTTGATTCTAACAAGGAAGACTGATTTAACTGTCCTGAATTTTAGCTTTCTGAGCTTATCATCAATAGTAGTGTAATACTTAGTTGAGAAAGTTTGTTCCAATAAGATAGTAACAGTATTCTGAATTTAAGTAACCATGCTTAGGCTGTGTTCATTCCTCCTGGTTGGGAACGCTCCCCTCCGGCACGGAAAATGGAGCAGTCCATTAGTGCGTGATTAATTAAGTATTACTCCCTCCATCCTAAAATATAAGGCTCAACCACTCATAACACAAAGACCAAGAAAACCTTTAATCATCTTCTTGGTTGGATCACCTTGATACATGCAAGCAATGTGATTGGGGGTTTGATGGTATAGGATTTAAAACAAATAAATTCTATTGGACCAAGATGTGCTAGTTAATGTATGCATGCATGCACACCTTATATTATAAGACATGAGAGAAAAGTGGTTGTGCCTTATATTTTGGGATGGAGGGAGTAGCTATTTTTTTTTCAAAAATGGATCAATATGATTTTTTTTTAAACAACTTGTGTATAGAAAGTTTTTGCAAAAAACGAACCGTTTAGCACTTTGAAAAGCGTGCGCGCGGAAAACGAGGGAGTGGGGTTGGGAACCCTCAAAACGAACTCAGCCTTAGTTGATGACCATGCTTAATTGATATCTTAACGGACCATTTTTTTTAACTAGAAGCAGCACTGATTCTGAAGGATCAGAGCAATTAGTTATTGTATATTTGTATCTACAATACTCTTTTTTTTTGTGTAAAAGCATCAACAACGCTCAAGTATCAATCAACTTTATTTACTGAAGTAGTAGCTTGTGTGATATTTTGCCTGTCGATAGAACCAATCTTTCTTGTCAATTTGAGTGTATGTCCTGTCAACTATTCAATGTTCTTTTTGTATTGATTTGCATCTCAATTTTTTTTATGTAACTTCAAATTTGTAGGAGGACATTGTGGCTTGTTTCAACATAAATATGGTAAATTCCCTGACTATTTCATCTCTATATGAGATTTTGGTCCTGTCATTTAATCAAATTCTTATGTTGGATTTGAAGGCACAAGTGCTGTGCTCAAGGGGAGATGGGAATTGGTACTTCTACCTCTGGTGCCTGGGTGGTGTCTTCCGTTTTGGTAGTAAGTTACTGCTTGCTGATCTAATTATTACTACATTTTCTTCATTTCCTATGAATAAGATCAGTGGAATAGAGATAATGATTTTGGATTTATAACAGCATTAGATCTACATTTATTTAATTACATTGCATCTCTACTACTCTAAAAAGTGGACTATTGTCTCCCACCAATCGTGCACAGCGCGAGACCCAACTCTTCCATTAGAAAACTGGTTCAGAAAAAGACCAAATGGGCAATCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTATTCGATCCCCAGCATTACATCCCTAGACACGACAGCCAAGATGGCGATGGCGGTTGCATGGTTAACACCTCAGTATTGCATTGGGGCTGGGTCTGCTATTTTGATTTTTTATACTAGATTTTCTACCGGGAAGAATGGGTCTCACTGCACAGAATGGGTGGGAGGGGAGGACAAAGGAAACTCTGCTTTTCCATCCAATCGGTACTTTGCTGGCTGGTCCTTGATTGGCATGTACAATTATTTTGCATGCATAATTTATGATTACAATAGTTGGATGAATTATTTGGTTTAACACTCGGATCAGGGGGGCTCACTGACGACAAATCAGTTGGGGGCAGAGGTGGCCTTGCTCCTAATTAACATAGCTAGAAGTGATCCTATTACTTGTGCAGACGAGGCCCTCCACCAAGCTGTTGCAATGGGCACCTTACTAGTATTTGGCAATAGTGAATGAGTTGTGGTGCTTTTGGGTTCATTTTTCAGAAATCCAAATTTGTTGGACTTTCTGGACATTATGTTCCTTAATCTAAATTGTAGTTAATCTATTCTCTTAGATTGTCCAGTGATGAATTTTAGCTTTTTTAAAAATTTATTTAGTAGGATGCAAGCTCATAGTTTACTTTTGTAAAACCATTGGTAGTAATATGACTTTAGTGATACTTGCCTCTTACACTGAGCTGGCTAAGCTTGCTCGCGTTATTAATTTGATTCCTACCAGCAATCCATATTTTATGTTCGTCAGAATTATGAAGTTCTATTTGATATATGGTAAATGGTGCAATTTCTCATTCACTGAATGAATGAGTTTTTTTTTTTCTGAAATAAGGGTTGGGTCGTCTTGCTGGCTTGATCACACTAGAGGCAGAAGACAGCAATGCTCCCCTTGATGCTCTTAAGAGAGTTGGGAAATCTATTGCAATGCATATCGTTGCAACAAAACCATTGTTTTTATTAAAAGAACTGGTCTCCGCTTCAGCTGTTGAAAATGAGAGGGGCATACTCCGGACTCAAGTACCTTATTCTGACAAATGCTACTTTCTTTGCACCGGAAAAATTTAGCATCGCCGTAATTCTATATAATTAGCTTACAATTGCAGAAATGGACGTGTGCTTTACATATTAAGTGAGATATCAGGTATCATAAGGTCATACCGTACAAAGTGTTATGATGTTATCTTAACAGAACAACAGACATGGGCAATAATGACCTATAGTTGAGAGAAAAATGCATATCTTGCGACAAGTCCTAACTCATTATAATTAAAAGAAAAGGAAAGGAAACTGTTGACTCACAATGGAATTAGTATTCCTGTCACATCGTTTTATGTTTATGTAAGCAAGACAGCTGGGCTGTTAAAATTCAGAGATGAGCTATGCAATGGAACACAATGTGAATCACATTAGAAGTTTATGATACCAGTTATGTTTATTTTTCCATGAATTAAATAGCAATATCTTTTGTCATCTTCTGGGGACACATGGACTGCATCCATCCAGAATATGACTGAACTGCATGCAAGTTATGTGAGATTTAATGACATGCTACTATGAAACTTTTTAGGCTGAAAGCTCCGGGAAATCCCAAATGGCCATGGAGAAAATGGTGGAAGGCCGACTAAGAAAGTATTTTGAAGAAGTTGTGCATTTGGAGCAAAAATGTTGACAACGATAGCACAAACATCAAGGTGAACTGATAAAACCTTTTCCTTTTTTTTAATTATGTACTAGTTTGAATTGTGAATTCATGGTACATAATGGTTTTGCTTCTTGATGTCAATATTTTCAGAGCGTCCTGAATGATTTGTCAAAGGAAGTTGGTGAAGGAGTTCAAAGGTACAATATATTTGTCACAACAACAATGGATTGAGCTTTTTTGGGGTTTTGGTGGGGTGGATGGTAATTTTATCTGATTAATCTTTTGCAGTAGTGCATATGCACTATAAACCTTCTTGTCCTTTAACAGCAGATGCACTAAACAAACTGATGGCCCATAAAAAAAGCAATCTCTTCTTTTAGACATCAATTGTTTGCAATGTAACTTTATGGTTCTTGCTAATTTTCTCATCCGACTTCAGTTTAATTTGACCTATCCCTAATTCTTCATTGCTTTTTCCATATAATCAACTACTAACCAAAGTTTTGTGTTCATCAGGCCTGATGAGTACACTGGGTCTGAAGCTACGGCTCGTGCTGCATAG</dnaseqindica> 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