BGIOSGA028770

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA028770

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028770, complete gene.

LocusTag

OJ1005_H01.29

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA028770-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA028770-PA

Length

10230

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:23440364..23450593

Sequence Coding Region

23440364..23440441,23440539..23440622,23441168..23441266,23441411..23441455,23441537..23441611
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,23444926..23445014,23445595..23445814,23446364..23446447,23446769..23446885
,23446989..23447021,23447137..23447223,23447314..23447376,23448381..23448497
,23448781..23448873,23449344..23449469,23449542..23449642,23450464..23450593

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:23440364..23450593 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:23440364..23450593 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGACGACGCCGGAGACGCTGCCCAACTCGGAGGCCGTCTCCCACGCCTACAAGTTCGCCTCCACCTGGGAGAAGAACGCGCCGCTCACGGAGCAGCAGAATGCCGCGATCGCCGCGCTCTCCCGCGCCGTGTCCGAGCGGCCGTTCCCGGCCAACCTGGAGAAAAGTTTAGTGAAGGATGGGGGTGTGGTTGTGCCAGAAAAAGAGGCTGCATTAGAGGAGGGTGCAATGGATGCAGTCTTGGTGAATACGCATCAGTTCTACAAATGGTTTTCTGAACTGGAATCAGCTATGAAATCTGAGACGGAAGAAAAGTATCGTCTCTACGAGAGTACATTAGAGGAACGTGTTAAAACATGTGATGGTATTCTTCAACAAGTGGATGACACACTGAACTTATTTGAAGAACTGCAATCGTTGCATTTGAGTGTTGCCACAAAGACAAAAACTTTGCACGATGCTTGCGACCAACTTTTGTTGGAGAAACAAAGGCTGATTGAGTTTGCAGAAGCACTTCGAAGTAGGTTGAACTACTTTGATGAATTGGAAAATGTCTCTACTAGCTTTTATTCTCAAGCTATGAACATCGGAAATGAACAATTTCTTCCACTTTTGAAACGGCTCGATGATTGTATTTCGTATGTTGAAAATAATCCACAATATGCTGAATCTGCGGTGTACTTGGTTAAGTTTCGCCAACTTCAGTCTCGTGCATTAGGTATGATTCGGTCACATGTCCTGTCAATACTTAAAGCCGCTTCATCCCAGGTTCAAGCGGCGATTCGAGGTAATGGTTCAGCAAAAAATGTTGTTACAGAGGGTGTGGAAGCATCCCTTATCTATGTTCGCTTCAAGGCAGCTGCTAGTGAGCTTAAACCAATCTTAGGTGAGATTGAAAGTAGATCTTCTAGGAAAGAATACACGCAGATTCTTTCAGAATGTCACAGCTTGTTCTGCGAACAGAGGTTATACTTGATACGAGGCATGGTGCAGCAACGAATTTCTGAATTTGCTAGAAAAGAAGCTTTGCCTTCTCTAACAAGATCTGGATGTGCCTATCTGATGGAGGCATGCCAATTTGAGCACCAGCTTTTTGCTCACTTTTTCCCGGCATCTGCATCAGATGTTTCAAGTATTGCTCCTTTAATGGACCCACTGTGCACGTACTTGTATGATACTCTGAGGCCTAGACTGATTTATGAGGGAAGCATTGATTCTCTGTGTGAACTCGTTGACATTCTGAAGGTCGAAGTGCTAGGGGAACAACTAAGTAGACGAGGAGAATCAGTAGCTGGGCTTCGACCCATATTGCAAAGGATACTTGCAGACATTCATGAGCGGTTGGCCTTTTGTGCTCGGACTCATATTCGTGAGGAGATTGCAAACTTCCGCCCTTCTGATGAAGATCTGGATTATCCTGGAAAGCTTGAGAGATCCGTAGATGCAACTACAAGTTCTAATGTTAGTGGCAACTCGGACATATATGTGACATGGTATAGACCACTGGAGAAAACAGTGTCTTGTCTGTCAAAGCTATATCACCGCTTAGAACCTACAGTTTTTACTGGATTAGCCCAGGAAGCTGTAGAAGTTTGCTCCACATCTCTTCAGAATGCAAGCAAGGTCATTGCAAAAAAAGCAACTGCAATGGATGGACAGCTTTTCCTAATTAAGCACCTTCTTATTTTAAGAGAACAGATTGCTCCATTTGATATTGAGTTTTCTGTCACGCATAAGGAGCTGGATTTCTCCCATTTGCTGGATCACTTAAGAAGGATCCTCAGGGGGCAGGTCTCGTTATTTGATTGGTCAAGGTCAACATCACTTGCTAGGACGTTTTCTCCCCGTGTTCTGGAGAACCAAATTGATGCCAGAAAAGAATTGGAAAAAAGCCTCAAATCTACCTGTGAAGAGTTTATAATGTCCATTACAAAATTAGTAGTGGATCCAATGCTTTCTTTTGTTACTAAGGTAACGGCTGTCAAAGTTGCACTGTCCTCGGGTAGCCAGGGTCAGAAATTGGATTCTGTTCTGGCTAAACCCCTTAAGACTCAAGCATTTGCTTCTCCTGATAAGGTTGCGGAGCTGGTTCAAAAGGTTGGGACTGCTATTCAGCAAGATTTACCCAAAGTAATGACCATGATGAGGTTGTATTTGCAAAATCCATCTACGCGGTTGATTTTATTCAAACCAATCAAGACAAATATAGTTGAGGCTCATATACAGCTACACTCCCTTCTGAAGTCAGAATACACAGCTGACGAAATCCAATCAATTGGTATGTTGCCTATACCCGACCTCCAGTCTCAGCTCGACGCTCTTTTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATTPETLPNSEAVSHAYKFASTWEKNAPLTEQQNAAIAALSRAVSERPFPANLEKSLVKDGGVVVPEKEAALEEGAMDAVLVNTHQFYKWFSELESAMKSETEEKYRLYESTLEERVKTCDGILQQVDDTLNLFEELQSLHLSVATKTKTLHDACDQLLLEKQRLIEFAEALRSRLNYFDELENVSTSFYSQAMNIGNEQFLPLLKRLDDCISYVENNPQYAESAVYLVKFRQLQSRALGMIRSHVLSILKAASSQVQAAIRGNGSAKNVVTEGVEASLIYVRFKAAASELKPILGEIESRSSRKEYTQILSECHSLFCEQRLYLIRGMVQQRISEFARKEALPSLTRSGCAYLMEACQFEHQLFAHFFPASASDVSSIAPLMDPLCTYLYDTLRPRLIYEGSIDSLCELVDILKVEVLGEQLSRRGESVAGLRPILQRILADIHERLAFCARTHIREEIANFRPSDEDLDYPGKLERSVDATTSSNVSGNSDIYVTWYRPLEKTVSCLSKLYHRLEPTVFTGLAQEAVEVCSTSLQNASKVIAKKATAMDGQLFLIKHLLILREQIAPFDIEFSVTHKELDFSHLLDHLRRILRGQVSLFDWSRSTSLARTFSPRVLENQIDARKELEKSLKSTCEEFIMSITKLVVDPMLSFVTKVTAVKVALSSGSQGQKLDSVLAKPLKTQAFASPDKVAELVQKVGTAIQQDLPKVMTMMRLYLQNPSTRLILFKPIKTNIVEAHIQLHSLLKSEYTADEIQSIGMLPIPDLQSQLDALL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..78#176..259#805..903#1048..1092#1174..1248#1354..1449#2333..2410#3047..3132#3221..3287#3375..3437#3515..3616#3742..3846#3931..4023#4563..4651#5232..5451#6001..6084#6406..6522#6626..6658#6774..6860#6951..7013#8018..8134#8418..8510#8981..9106#9179..9279#10101..10230#ATGGCGACGACGCCGGAGACGCTGCCCAACTCGGAGGCCGTCTCCCACGCCTACAAGTTCGCCTCCACCTGGGAGAAGGTCGGTTTCCTCGCTTCACTGCGCGTCGGGTGGGTGTGTGATCCAGTGGTAGCACTGGTGGATCTGATCTGATGGACTTGGGCTTTCGCTGCTGCAGAACGCGCCGCTCACGGAGCAGCAGAATGCCGCGATCGCCGCGCTCTCCCGCGCCGTGTCCGAGCGGCCGTTCCCGGCCAACCTGGTGAGGCGCCACATCTCGGGATTGTGTGCGATGGTTTGATCCATAGGCCCTGTTGCTTGCGATGACTAAATGTTGTGATCTGATGCTACCATGGTTTGGTTTGGTTTAGTTTAGTTTGCCGTGCTATGCTCGGGATAGACTAGCCCGTCAATTGTACTTGAAGGATTTGAGATATTTCATTAGTTGCAACACAGCATACATACTCCATTTGGTAGTTCAGCGGTAGCGGTTAGTTTGGTTTATAATTGACAGTACATGAGTCAGGTGAATTTGCAGTTCTGTTTCGTTGGTGATGTTTCTGTGCCACTATTAGCTCACTCTCCACAATTCAATACTCTAGCTAGTGCTGGATTTGTGATGATGTTTGATGTTTCAATTGGGTATCAAATGGGTTTATAAGTGCGTTGTTTTTGTGGTCTTGTTATGTTATTTCATTGGAGGGTTGCTTTTTTTAATTTGATAGAAGGCTGTATTTTGAGGTCTATTTCCCTTCCGGCTTTATATTATTGCTTGACATTAAAACATATTGCTGGGTGTTACATCAGGAGAAAAGTTTAGTGAAGGATGGGGGTGTGGTTGTGCCAGAAAAAGAGGCTGCATTAGAGGAGGGTGCAATGGATGCAGTCTTGGTGAATACGCATCAGGTTAGTTTCATAATCTTGTTGATATATCACTTGTATGATTGATCAGAGAATTTCGGTATTCTATCTATTCAACCTTAAGTTGTGTCAGGATAGAAGGTAAACTATTTCTGCAGGTTGAGCTAATACCTTTATTACCTCCTGTAGTTCTACAAATGGTTTTCTGAACTGGAATCAGCTATGAAATCTGAGGTTTGTGCATGTTCATTTCTTTTGTTAGTGATGGAAACTTGTGGTAAAACAATGATTTTACCCCTCTAGTTTATTTGACAGACGGAAGAAAAGTATCGTCTCTACGAGAGTACATTAGAGGAACGTGTTAAAACATGTGATGGTATTCTTCAACAAGTAGGTTTATGAACCCTTTTGTTTGTTAATATTTGCAAAATCTTTTAAGGAACATGGATGCTCTTATCCTTTTCAATATAACATATTTAAAATATGTCCATTCAGGTGGATGACACACTGAACTTATTTGAAGAACTGCAATCGTTGCATTTGAGTGTTGCCACAAAGACAAAAACTTTGCACGATGCTTGCGACCAACTTGTATGCACCCTTTTCTCTAAGATTCTAAATACTTGCACTTTTGCTATTCTTTCTGTTATTTTTTTGGCATTTTCAGATTAGTTATTTATAGTGAAACTTCCACTCTAAAGGACTGTTACTCTGCCATGTGCACATAAACCACTTTTAAGAATGTATTCAATATTAGTGAAACTTAACAGATCGCCTGCCTTGTATTGTGCAGCTTTGGTAAATTTACAATATGGCATTTTAGGTGCCCAAAGGAAAAACTCATTGGCCTGTTTGTCATCTTGGACCTCATGTTAATGATCTTATTAGTGATATATTTTGTATAGCTCTTATCTACTCTTTTAGTTTGAACAGAATTACAAAATTCTTTGATGCAGTTTCAACACATATAGATTTAACATTACAAAACTGTTGCATTAATAAAAACAAATCATTCTAGTAATCTTTTGTTTGTAGGAACTGTATTATGATCTACAAGCATGCTTCATTTCATATACCCCTGTTTGAGATAATTTTTTGACCAGATTATTGCTAAGGATTATCTACTTTAAAAGCAGGGAAAAAGGAAATATTTTGAGAAATAAACTTAACAAACAGCTTAGAACAAGTGATCTAAGCAATGCAGTAGTTTTTTTTTTGGAAAACGTATTTTTCGAAGCATGAAGCAAATAATCCGTTTCAACAATCTGGTGAATAATCTGAAAAGAACAGGGCCTAAATGAACACATGAGTTACCTTTTAACTACCCTTTTTTTTTGTAGTATTCTCTTAGTTTATTCATGTCGTAAATGCAAATATATATTCTCATTTTGCCATATTGCTGGTCCCTCTTCCGTTTTTTTAATGAAGTGTTTCAGTCAATGGACTATCATTTCTAAATTCGAATGTAATGCAGTTGTTGGAGAAACAAAGGCTGATTGAGTTTGCAGAAGCACTTCGAAGTAGGTTGAACTACTTTGATGAATTGGAAAATGTAAGGTTTGGCATCCCTAGTTTGTCTATTGAGCATTAGATTAATAAATTTGATTAAATTAATGCCTCTCCTACAAGTTCTACATCTCACACAAGCATAATGAATTCTGCCATACATCTACTTTGAAATTTAATTGTTGAACTTATGTGAAACCTTATTCAAAATTTCCAACGTTATCTACTACATCCTAATGCTTGCATCCTTGATCATTTTGTTAGTTGGAGAGGTCAGCATGGTCTCCGTGGTTCATTTGTTCCAGAAAATGTTTATTCCATGTTTCGGAGGATATATACTTTAGATTTGATCCCAATGGATGTCTTAGATCTGAATTTTGAGCTGATTCGTATTGTCACCTTGTGGTTAGTGCTAACTTGTACATGATGATGAGTGGCTTGTATTTTTGAAGATCCCACTGTTTGCTACTGTTCTAGTATATTCTGTAGCTGCATAATCTTGAACATTTCTGGCCACTAACCACACTTATTCAATTCTACCATCCAAGTACACAATGTATCCTGATGATCTCATTCATACATTATCTGTAATGTTGATTACACAATCTGTTTTTTTTAAAATCCTATTTTTTCTCTGGTTAACCTGCTTCATATGGTTTAAAATACTGTCTCCATTTTGCAGGTCTCTACTAGCTTTTATTCTCAAGCTATGAACATCGGAAATGAACAATTTCTTCCACTTTTGAAACGGCTCGATGATTGTATTTCGTAAGTAGTAATAGACAATGCTCTGTGTGTAGTTTTAGGGTGCTGAGATTTAAGGAGTTCATGCTGTATCCTGTTTGGGTGCTTATAGGTATGTTGAAAATAATCCACAATATGCTGAATCTGCGGTGTACTTGGTTAAGTTTCGCCAACTTCAGGTAAAGGTCTACTTGAATTGAACTACATGGATAGTCATCACAGGTTAGATACTTTGACCTGATAATTATATGCTTCTTTTATTGCAGTCTCGTGCATTAGGTATGATTCGGTCACATGTCCTGTCAATACTTAAAGCCGCTTCATCCCAGGTGATTTTCAGTTGAACTTTGGTAGGTAAATGCGATATGACTACTAAATACCAGATAATAGCTTGATTTTATTTCAGGTTCAAGCGGCGATTCGAGGTAATGGTTCAGCAAAAAATGTTGTTACAGAGGGTGTGGAAGCATCCCTTATCTATGTTCGCTTCAAGGCAGCTGCTAGTGAGGTATACCTTTTCATCAAATGATCTACAGTTATATAGAAAGGCTTAAACAAACTGTAGCTATGTGATCTATATACCAGTAACACCTCAAAGTTATAACTCTGCTGCCTCTGGTTCTTGTTTTCCAGCTTAAACCAATCTTAGGTGAGATTGAAAGTAGATCTTCTAGGAAAGAATACACGCAGATTCTTTCAGAATGTCACAGCTTGTTCTGCGAACAGAGGTTATACTTGGTAAGATCAAACAATTATTGGTTTTATATTTTCCTTTTTTGGCATGGACCTGATTATTTCTTATCACTTGTTATGCAACTAAAGATACGAGGCATGGTGCAGCAACGAATTTCTGAATTTGCTAGAAAAGAAGCTTTGCCTTCTCTAACAAGATCTGGATGTGCCTATCTGATGGAGGTAACTGCATGTTTAATACTTTCTAGTTTTCTTATTTTCATCTGTGTTGTAGGTTTCTCTTTCCGTATTCAGAAAGTTACATCTTACAGTTGTACACGATAGCATTCTGTAATGTAGAAGAATTGAGCAACACATTGTATATTTAGTTTCCTAATATTACGTGCTCTGCTTACTCCTCATGCTGAGTATGATGCACTTATCATTATTATTTTTAGCATATTTGTTCTAAAGCATTGAAAGTTCTTGATTTTTAGTTTTATACAACTGAAAGTCTCGGGGTTCACTTATTAGTATCTCAAGGTCACCCAATTCCTCATTTTACCATTTCCATCCTTTTGAGGCCAATAGAAGTTAGTTATGATGGCTTCCCCTCAACCTGGGACTTTCAATGTCATAAAACTGAATTCTGAGCCTTTGACGGCACATAACCAATTTTATCTAATCTCCAGTATTCATGCTTTTATTTTTCTCTCCTCTTATAATATTCAGCTGATTTTGACCGCAAGACATATTTTACTACTTTTCCTGTTGCTTCTCAGGCATGCCAATTTGAGCACCAGCTTTTTGCTCACTTTTTCCCGGCATCTGCATCAGATGTTTCAAGTATTGCTCCTTTAATGGACCCACTGTAAGCTTTTAGTCCCTCTGGTTCTTATACTGCAATGTAAGCATCTGTAATTTGTTCTGCAAATTCG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EnsemblPlants:BGIOSGA028770