BGIOSGA028873
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028873 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028873, complete gene. |
| LocusTag |
P0419H09.34-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028873-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028873-PA |
| Length |
7154 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:25620297..25627450 |
| Sequence Coding Region |
25620297..25620431,25620544..25620756,25622398..25622493,25622756..25622901,25623015..25623234 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:25620297..25627450 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:25620297..25627450 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGTGGAAGGGCATCCTGGGGTTCGACCACGGCGTTGTGCAGGCGCCGCTCGGGCCCGACATCTCCGGCCCGGAGCTCGCCGCCGCCGTCGCCAACGCCGGCGGCATCGGCCTCCTCCGCCTCCCCGACTGGCCGGCGCCGGATCGCGTGAGGGATCTGATACGGAGGACGAGGAGCCTGACGGAGAGGCCGTTCGGGGCGGCCATTGTGCTGGCCTTCCCGCACGAGGAGAACCTACGGGTGGTGCTGGAGGAGAAGCTCGCCGTGCTGCAGGTTTACTGGGGAGAGTTCCCGAGGGAGCGAGTCGATGAGGCGCACCTCGCCGGTGTTAAGGTGTTGCATCAGGTTGGTAGCTTTGAGGAGGCAGCGAAAGCTAAGGAAGCTGGTGTAGATGGGATCATTGTTCAAGGCTGTGAAGCAGGGGGGCATGTGATTGGTCAGGAAGGACTGTTACCTTTGCTGCCCAGAGTGGTGGATCTAGTTTCAGATACTGACATTTCAGTTATCGCCGCTGGTGGAATTGTAGATGGCCGTGGCTATGCTGCTGCATTGGCACTTGGTGCTCAGGGCGTTTGCTTAGGAACTAGGTTCTTGACCACTGAAGAAAGTTTTGCACATCCCTTGTATAAGAAAAGGCTAATCGAGATTAATTGCACGGGCTATACCAATGTGTTTGGGCGTGCTAGATGGCCTGGTGCTCCCCAACGTGTCCTGAAAACAACCTTCTATGATCAGTGGAAGAATCTCCCAGAACAAGAAACAGAGGAAAATCAACCTATCATAGGCCACACTATCATCCATGGTGTGAGAAGATATCAAGATACAAGTCCTTCTATCAAGGGCAAGAAGGTAGTTGCTTCTGGCTTTGGCCACCTTCTTGTTGTCGACAAAGATGACGACCTCTTTGTCGTGTTCATCAACCCATTTACCAGGGAGACCACGACGATACCTCTCCTACCTAAGTTCTTGCACAACAACTGTGCTTTAGACCAGATTACCGATGAAGGGAAGATGACACGCTACATGGGCATACTCTTTGCCATGCACGGTGATCGAATGCACATACAGATGATAGAGCTCGATGACGATGAGATGTCGCACAGGGATATTCGTCGGTTCGCTGGTACTGTTCCTAATGCGACAACAACAGGTGATATTGATAGCATGGTCATGTATGCTGGTCAGGGTGTTGGGCTAATCACAGAGATCATACCAGCTAGTGAAGTTGTCAAAAGGTTAGTTTCTGAAGCACAGCACGTCATCAGAGAAAAGCTTTTGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGWKGILGFDHGVVQAPLGPDISGPELAAAVANAGGIGLLRLPDWPAPDRVRDLIRRTRSLTERPFGAAIVLAFPHEENLRVVLEEKLAVLQVYWGEFPRERVDEAHLAGVKVLHQVGSFEEAAKAKEAGVDGIIVQGCEAGGHVIGQEGLLPLLPRVVDLVSDTDISVIAAGGIVDGRGYAAALALGAQGVCLGTRFLTTEESFAHPLYKKRLIEINCTGYTNVFGRARWPGAPQRVLKTTFYDQWKNLPEQETEENQPIIGHTIIHGVRRYQDTSPSIKGKKVVASGFGHLLVVDKDDDLFVVFINPFTRETTTIPLLPKFLHNNCALDQITDEGKMTRYMGILFAMHGDRMHIQMIELDDDEMSHRDIRRFAGTVPNATTTGDIDSMVMYAGQGVGLITEIIPASEVVKRLVSEAQHVIREKLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..135#248..460#2102..2197#2460..2605#2719..2938#5458..5656#5774..5865#6972..7154#ATGGGGTGGAAGGGCATCCTGGGGTTCGACCACGGCGTTGTGCAGGCGCCGCTCGGGCCCGACATCTCCGGCCCGGAGCTCGCCGCCGCCGTCGCCAACGCCGGCGGCATCGGCCTCCTCCGCCTCCCCGACTGGGTACCCCCCACCCCACCCCTCTATCTGTTCCCTTTTCCCTTGGGGCTCTTCTTCACAGCTAGTACTAGTATTATTCTGTTCGATTTTTTTTTTTCTGATTCGCTCACTGCAGCCGGCGCCGGATCGCGTGAGGGATCTGATACGGAGGACGAGGAGCCTGACGGAGAGGCCGTTCGGGGCGGCCATTGTGCTGGCCTTCCCGCACGAGGAGAACCTACGGGTGGTGCTGGAGGAGAAGCTCGCCGTGCTGCAGGTTTACTGGGGAGAGTTCCCGAGGGAGCGAGTCGATGAGGCGCACCTCGCCGGTGTTAAGGTGTTGCATCAGGTGAGATTTTCACATGCCATTGTCTGTTCAATTAGCTTCTATCAGTGCTTTTGCCAGTGGGGTAGCTAGAGCTTCGCTAGTTAGTACTTCCTCCATTCCATAAATTAGGTTTACTTTTAGCTTCTATTTGTTCCAAAATAAGTTTATTTTTGAGTAATCATTGTATCGGAGTTTATGAAAGTAGTAAACAATTGTATTGGGGTAGATAAAGTAGGCAATAATTGCATTGAGATTTGATAAAGTAGCGGTATTTCAGTCCTTTTGGTTTGTATTGGTATGTGTGGGATGGGTGAGGTGAAAAATTAACTTATATTTTGGGACAGAAGGAGTATATTTGTTATGCTATTGTGGTTACTTATCAGGGAGGTTATAATAGCTGCTAGCTAGAACTTCGCTAATTAGTAGTATTTCTTAATTGTTATGCCAGTGCCATTGTTTGTGGTTACTTATTATTAGGGAGGTTGTAGTTATAATGACTGCTGAATAGACCATTTGTTCCCAATATGTTGTAAATGATTGGTGAATCTTTTGAAGATATTCTTATGTTTAACGTTGTTGCGAATCAGGAGTGCTTCAGTACTCCACTCTGGATCATGTTGGTCTTGTTTGCTCAAAATGCTAACTGATAAGCAACCAATTTGCCAACGCTGAAAGGAGAAAAACCATTTCATTTTATCTAGAGTAGAGGAAAAATCATCGATGGTAAACTGGTCAATGGCTGGAGATAGTTACCAACAAATTGTTAATAGTCAAAGCATGTGTTGGAAGTCGGAACAGTAGATGCCAGACAACAAAAAGACAGCACTCATGACAAAAACAATGATTGTCTAAGATAACGGTATAACACGCAAAAGATGATCACAAAGAGCACATGAGACAAGCCATGAATTAGCTAATGCAGGTCGGTTAGTCCAAACCTCAGGCTCTTTTGGCTTGGTCATGAGGATAATTTTGTAGCACAGCTAATACAAGCTGAATTTACTTTGGCTGTTGATTAATGAAAGTTCTCTTTCCTCGCAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAGACCACATGAATTACCGGAAACTGCTCCTAACTGTTACATGCCCACATATGACTATATGAGCCACAGTGCCACACTATATTGGCTCCTTTCACTATCATTCCTTGGCTTGGCTTAAGTAGAAATATAGGAACAAGTGAACACTGTTAGTGTTAGTACGATTTATCTGTTATAGAGCATTCAGGCGTTGATACTCTTCTTTTGGTGCAAAGAAAGATGTAACAAGCACCACTGCAAAAAACTTTTTTGTAACAACCCTCCCTCCAGAAGAACCGCACAGCTTAGCCCAACCGACGGGCGGGCCCATTTACACATACAATTCCACTTATACTTTCGTCCTCGCTTCGTGTAAAAGGGTTAACCCGGAAGTGATATGGTTGGAGGGAAGAGGCCTTATAAGTTGGTTCCACCATTGCTAAACTAACAAGGTGGTACTAAACAAGCGCACACAGCTCTCATGGGCCGCACATGCCTCATCCTAATTGGGCCAGGATGTCACATTTTTGCACTTTGTGATGATGATACACGAACTCTTTCCTGTATACGTCTTCACATTTGTTCAGTTGATTATGAACTTTGCAATATCCCTTGTTATTTGCGTAGGTTGGTAGCTTTGAGGAGGCAGCGAAAGCTAAGGAAGCTGGTGTAGATGGGATCATTGTTCAAGGCTGTGAAGCAGGGGGGCATGTGATTGGTCAGGTAAGCCAGTGTTTTGTAGTTTTGGTTTGTTAAAAGTCTCAGGCAGCCTTTCAAGAAGCTTCTTGGTCAACTTCAGGAGTGTTCATGCATGCATTTAGAATGTACAGTATGCCTCGAATCTATATAAAAGGCTAAAGATTTAGCTTAGGGCCCCTGTTGTGGTGCCATCTCTAAAGCATAACATACCTCCCTAGCTTGTCGCCATATAATTATATTCATGAGATTTCTTCTCCAATGCCTTTTTTGTTGTGGGGAAAAACAGGAAGGACTGTTACCTTTGCTGCCCAGAGTGGTGGATCTAGTTTCAGATACTGACATTTCAGTTATCGCCGCTGGTGGAATTGTAGATGGCCGTGGCTATGCTGCTGCATTGGCACTTGGTGCTCAGGGCGTTTGCTTAGGAACTAGGTATTCTTGCAATCTTTTCTCTGCACGAGTTTCTCGATAGTCCATCTGCAATCTTTTCTTTGCTTAGGAACTCATAGTCTGATTTTCACATTACTAGTTCCATGAACATTCAGGTTCTTGACCACTGAAGAAAGTTTTGCACATCCCTTGTATAAGAAAAGGCTAATCGAGATTAATTGCACGGGCTATACCAATGTGTTTGGGCGTGCTAGATGGCCTGGTGCTCCCCAACGTGTCCTGAAAACAACCTTCTATGATCAGTGGAAGAATCTCCCAGAACAAGAAACAGAGGAAAATCAACCTATCATAGGCCACACTATCATCCATGGTGTGGTAAGTATTCGGTTATTTCTTTTCGTTGAATTTGTCCTCCTTTATTTATAAGTTGCAATCATTTTTGTTATGGGCTTATGGCCTTTTTTTCTGGCTTATTTTGCTATCTGGTATAAAGTATTTCAATGCCTTCAGTTCCAACATGATACTTCATCTAGACACAATCAAAATCAGCTCAGGCTTTTAATATGGGCAAATAGAACCTCAGTAGTCTAGTTCCCAATGAGAACATGAAGGCTTTGCTGCTGTAAGTTCGCAACAAACACTTTTGGTTAATATGAATGCTATAGATGAAGTTTTCTCCTCCCTAGTCTAAAAACAGTGTACCACAGGATTACAGGAATTTCATAGGAAAACAATGAATTCCAATGGGACCAAGTTTTATGAGTAGCAGTTTAGCTCAGCAGTTAACAAAAACAAAATAGACTAAGCTCACAAGACATATCTTGCCCTGAATAACAGTTTGCAAGACATTCCAAACTGCGAAGTTCAGACAAACAGATTTGAAATGGTTATTGTAGTTCAGGATTCTATTTCCTTGAGGGAGTATTACCCATTTCAACAAGGTTTTATATTTGCCTTCTTACCTTCTGTTTTTCTAAGATAGAGCACCGCTACTTGTCTCTTAGGACATCTGGATATGGTAGGGTAGCCCTTAATTAATTGCTTCGCTTTTGGCCAAAATGGTACTGCTTGCTGTTTTCTAATACCGATAGACATCTACAGTGGTGGCCTGTCAATTCTTCTAGATAAAGCTTTGTATTTTTACAATAGGACTTCCATAACTGTACAGATTCAACCATTTTTAGTACATACAAAAACCAACTTCAAATACCAGAATTATAACGAATAAATTTACCAGAAATATAATAAATATTTTCTAGATTAGTTTGATCCAACATCTCAAAAAAGTCCTATTATAATCTCATACTTGTCTAACAAATAGTTAATTTTCATAGTTATGAGCCTTCATATTGGCTGTTATGGAGATCTTTAGATTAAATTGTAAGTCGTCTAGCAATGTAAATTATTTCGATCAAATCATCAGATTCATAAACATGATGAAAACATTAACTTCTTCATGATAAGGTAATAAATGTAGATATTATTTAAAATTTATATTCTTGAAGATATACTCTTGGTCATTAAAAAATGATTCTTGATATGCGGTAGTCTAATATTATTCTTGATTAGATTGTTGCAATTATAGCTAAGGCAAATACGATGTAATATGAATACTAAGTATGCACAAATTTAACTAAAGAAGTAAAATATTATCTAAAACAGAAACAAAATATTTGTTAACTTGACAATCTCACATTGTTCCGGTGCTAAAAAGGACACATAATGTATGATGTTGTTAAAGACCATTACAAATATATGGAATTACTCATGGAACTCTTAACATGCACCTAGCTAGCTACTACCCGAAAGTAGGCATGATCCGGTTGTCCGATGGTTAAACTCCATTGGCCAGGCTCTTCTTATATAGGGCATTATACGCAACACAAAAAAGGAACTACCTTCCAAGATAGTAGAAGGCATTTTTGCTACGAAGTGTAGCAAAGTCAAGGCTCGATGGGATCATCTAGGTGGAATTGCAATAGCCACGACTCTAAACTAATATGGAATCTCCGATGTCGTTTACAGATACTCTATTCTGTCCATCCATCATGTACTGTGCAAACCATTAGGGATGTTATGGGCATGTTGCCTTTAACAACCTATCGGACATGTACTGGCAGGTGACAAGCAGCTCAACCTTTCATGATCCACCCACTCCCACACACTGACATCGTCGTCATCGAGCTCTATCAGCTGCTTGTGCATCTGATCAACATTCATGGTAGTAAGTATGCACGGGTAACGTTTCATCTTCTCTTTCAAATTATTCCTTGAGACAATAGCCTAAGCAACAATAGTGATAGGCTTGCCACGGTACCAAAATGTTGTATTTTCACTCATC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