BGIOSGA029377
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA029377 |
|---|---|
| Description |
Japonica Group Os09g0533400 (Os09g0533400) mRNA, |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029377, complete gene. |
| LocusTag |
NM_001070304.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA029377-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA029377-PA |
| Length |
6367 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:19735004..19741370 |
| Sequence Coding Region |
19741261..19741370,19740444..19740547,19740217..19740328,19739611..19739780,19739272..19739363 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:19735004..19741370 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:19735004..19741370 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGACGCGGCGGTGGAGCTGCCTGGACGGCTCGCGATACTGCCGTTCCGCAACAAGGTGCTCCTCCCGGGGGCCATCGTGCGGATCCGCTGCACCAACCCCAGCAGTGTGAAGCTTGTGGAGCAGGAACTCTGGCAACGGGAGGAGAAGGGTCTGATCGGGGTGCTCCCTGTGCATGACTCCGAAGCTGCTGGCTCATTGCTGTCTCCTGGTGTAGGCAGCGATTCAGGTGAGGGTGGGAGCAAGGCGCCTGGTGGTTCTGCAGGAGAATCAACGAAGCAGGATACTAAGAATGGGAAGGAGACCATTCACTGGCACAGCCGGGGAGTAGCTGCTAGGGCTTTGCACCTTTCCAGAGGTGTGGAGAAACCAAGTGGAAGGGTTACATATATTGTCGTCCTTGAAGGTTTATGTAGATTCAGTGTTCAAGAGCTCAGTGCAAGAGGTTCATATCATGTCGCTCGTGTCTCACGTCTTGATATGACAAAAACGGAGTTGGAGCACGCAGAGCAGGACCCAGATCTCATTGCTCTTTCTAGGCAGTTCAAAGCTACTGCAATGGAACTAATTTCCGTTCTTGAACAGAAGCAGAAGACAGTTGGTAGGACTAAGGTGCTTCTTGAGACAGTTCCTGTGTACAGACTAGCTGATATTTTTGTGGCTAGCTTTGAAATAAGTTTTGAGGAGCAGTTGTCAATGCTGGATTCAGTTGACTTAAAAGTTAGACTTTCCAAGGCAACCGAACTTGTTGACAGGCACCTGCAGTCAATTCTTGTAGCTGAGAAAATAACTCAAAAGGTTGAGGGTCAGCTATCAAAGTCTCAGAAAGAGTTTTTGCTTCGCCAGCAGATGCGGGCTATCAAAGAGGAACTTGGCGATAATGATGATGATGAGGATGATGTAGCGGCATTGGAAAGGAAGATGCAGAATGCTGGAATGCCTGCTAATATTTGGAAGCATGCTCAAAGGGAGTTAAGGCGTCTAAGAAAGATGCAACCTCAGCAACCTGGATATAGCAGCTCTCGAACCTACTTGGAACTTCTTGCTGAACTTCCTTGGCAAAAAGTCAGTGAGGAGAGGGAGCTTGACCTTAGAGCTGCAAAGGAGAGTCTTGACCGTGATCATTATGGGCTGACCAAGGTTAAGCAACGGATTATTGAATATTTGGCTGTTCGTAAGCTTAAGCCTGATGCCAGAGGTCCAGTCCTGTGTTTTGTGGGACCACCTGGTGTTGGAAAGACATCATTAGCATCGTCGATAGCAAAGGCACTAAATAGGAAGTTCATAAGAATCTCTCTTGGTGGTGTAAAGGATGAGGCTGATATTAGGGGTCACCGAAGAACATACATTGGAAGCATGCCAGGACGTCTCATTGATGGACTAAAGAGAGTATCGGTCAGCAACCCAGTGATGCTTCTTGATGAAATTGACAAAACTGGTTCTGATGTACGTGGGGACCCAGCATCAGCGCTGCTAGAAGTTCTTGACCCTGAGCAGAATAAAACGTTCAACGATCACTATTTGAATGTTCCATTTGACCTGTCGAAGGTCATATTTGTTGCAACTGCCAACAGGATGCAACCCATCCCCCCTCCTCTGTTAGATAGGATGGAAGTTATTGAGCTACCAGGTTACACACCTGAAGAGAAGCTAAAAATAGCCATGAAACATCTCATACCAAGGGTACTGGAACAGCATGGCTTGAGCTCCACATATCTTCAGATTCCTGAGGCTATGGTCAGACTCATCATTGAGAGATACACGCGAGAAGCTGGTGTACGTAATCTTGAGCGGAACCTAGCTGCATTGGCCCGTGCAGCTGCAGTCAAGGTTGCGGAGCAAGATAGTGTGCTTAGACTTGGCAAGGAAATACAACCAATTACTACAACTCTACTGGATTCTAGGCTTGCTGATGGTGGTGAAGTTGAAATGGAAGTTATTCCTATGGGCCAGGACATATCAAATACTTATGAGAATCCATCACCCATGATTGTTGATGAGGCTATGCTAGAAAAAGTGCTTGGGCCTCCAAGATTTGATGATAGCGAAGCTGCAGATCGTGTGGCGAGCCCAGGAGTGTCAGTTGGGCTTGTTTGGACTTCATTTGGTGGGGAGGTACAATTTGTCGAGGCTACAGCGATGGTGGGTAAGGGTGATTTGCATCTGACAGGGCAACTTGGTGACGTAATTAAGGAGTCAGCACAGTTAGCTCTGACATGGGTGAGAGCAAGAGCTGCTGACCTTAATCTGTCACCTACTTCTGATATTAACTTATTGGAGAGTCGTGATATTCACATACATTTTCCTGCTGGCGCGGTGCCAAAGGATGGTCCTTCTGCTGGAGTGACATTGGTAACATCATTAGTGTCACTATTTAGCCACCGAAAAGTCAGAGCTGACACTGCTATGACGGGAGAGATGACTCTTAGGGGCCTTGTGTTGCCAGTTGGCGGTGTTAAGGATAAGGTACTTGCAGCACATAGATATGGCATCAAGAGAGTAATATTGCCAGAAAGAAACATGAAGGACTTGGCTGAGGTTCCAGCACCCATTCTCTCTGGCTTGGAGATTCTGCTTGTGAAGCGCATCGAGGAAGTACTTGACCATGCTTTTGAAGGTGGATGCCCTCTGAGACCACACTCCAAGCTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADAAVELPGRLAILPFRNKVLLPGAIVRIRCTNPSSVKLVEQELWQREEKGLIGVLPVHDSEAAGSLLSPGVGSDSGEGGSKAPGGSAGESTKQDTKNGKETIHWHSRGVAARALHLSRGVEKPSGRVTYIVVLEGLCRFSVQELSARGSYHVARVSRLDMTKTELEHAEQDPDLIALSRQFKATAMELISVLEQKQKTVGRTKVLLETVPVYRLADIFVASFEISFEEQLSMLDSVDLKVRLSKATELVDRHLQSILVAEKITQKVEGQLSKSQKEFLLRQQMRAIKEELGDNDDDEDDVAALERKMQNAGMPANIWKHAQRELRRLRKMQPQQPGYSSSRTYLELLAELPWQKVSEERELDLRAAKESLDRDHYGLTKVKQRIIEYLAVRKLKPDARGPVLCFVGPPGVGKTSLASSIAKALNRKFIRISLGGVKDEADIRGHRRTYIGSMPGRLIDGLKRVSVSNPVMLLDEIDKTGSDVRGDPASALLEVLDPEQNKTFNDHYLNVPFDLSKVIFVATANRMQPIPPPLLDRMEVIELPGYTPEEKLKIAMKHLIPRVLEQHGLSSTYLQIPEAMVRLIIERYTREAGVRNLERNLAALARAAAVKVAEQDSVLRLGKEIQPITTTLLDSRLADGGEVEMEVIPMGQDISNTYENPSPMIVDEAMLEKVLGPPRFDDSEAADRVASPGVSVGLVWTSFGGEVQFVEATAMVGKGDLHLTGQLGDVIKESAQLALTWVRARAADLNLSPTSDINLLESRDIHIHFPAGAVPKDGPSAGVTLVTSLVSLFSHRKVRADTAMTGEMTLRGLVLPVGGVKDKVLAAHRYGIKRVILPERNMKDLAEVPAPILSGLEILLVKRIEEVLDHAFEGGCPLRPHSKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..110#824..927#1043..1154#1591..1760#2008..2099#2246..2425#2538..2621#2886..3013#3098..3299#3378..3584#3787..3917#4215..4428#4744..5037#5144..5338#5552..5797#5913..6014#6284..6367#ATGGCGGACGCGGCGGTGGAGCTGCCTGGACGGCTCGCGATACTGCCGTTCCGCAACAAGGTGCTCCTCCCGGGGGCCATCGTGCGGATCCGCTGCACCAACCCCAGCAGGTAAGTAGTGGGGGCGGCGTCGTCGTCGGCGCCCCTCGAGCGGATTCCGCGCACCGCGAGATTGGGGGGTTTCACGGTCTCGGGTTGTGTGGGTTTTCTAGGGTGGAATTTTGGGTGGTGGCCGATGGGCTGATTGGGCGCGCGGGGGATTGGGTGGTGGATGGATTATTAGTCCAAGTTAGGTTTAATCAGCGTGTGGTTGGTAAAATCGCAGTAGCTTAGCTTTGTTTGATGCTATTGTATTGGCTTAGTCAGCTTAGCTCATGATTCGTGAGGCCTTTTTCTTCGATTTCGTCTGTGGTTTTGTGAATTTGTGTGGAGCAAGTAGAAATTGCTTTTTCTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTGCTTTTTTGTATTGTAGTCGTCACTTGTTGTTTTCTCGATGGGATGATCTCGTCTGTGATGTGAACAGTTAAAAAGTTTCCAGCGCAGTTTGATGAACTCGCTGAATCCAAAGTGGTTTAGAGCGGCTTTGGTTGCTTTATGGTTGACTAATTCAGCTCCTAATTATATCTGTTTGGTGTTCAAACCTTCTAGGCGTGTTGTACTTACTTGTGGTTCAGATTAGTATTGAGATTTTTCCTCTGTGTATGCGTACGATGGCTTTGCTAGTGTGTGTTGACTTGGTGGGAAGGGAAAATTCTGCCTTTTGGTTTGGATTTTGACTTCATCAATGTACTTGTTTCTCCTGCAGTGTGAAGCTTGTGGAGCAGGAACTCTGGCAACGGGAGGAGAAGGGTCTGATCGGGGTGCTCCCTGTGCATGACTCCGAAGCTGCTGGCTCATTGCTGTCTCCTGGTGAGATAAAGGCTGCTGCTGCTGCTGTTTTTTTTTTTTAATTTGGTTCTGTGAGCCATTTGTGGGCATTGTTGTATGGTGGTTTCTTACTGTTATTGCTGTTGCTCGCAAATAGGTGTAGGCAGCGATTCAGGTGAGGGTGGGAGCAAGGCGCCTGGTGGTTCTGCAGGAGAATCAACGAAGCAGGATACTAAGAATGGGAAGGAGACCATTCACTGGCACAGCCGGTGTGTAACATTGCCATCTTTGCTAATATGTGTTTTTCCATATGGTCATATCTCTGAACAAGATTTAAAGAAGAAATTCCTTTGAATATGTCGGGAATAGTGGGAAAACAATAGCATACGATTACTAAAGGTAAACAAACTAGTGTTAGTGTGGGCACATGCTCTTATTACATTCTATGAACACTTGATAAGTTGATAGAAGCAAATAATTTTCTTTCTGTTGGGCGCACTATGCGTTGGTGTGACATTGCATTAACTTGCAGTGGGCTTAGATAAAGCAAGAGGGTTAAGATTGGTTGATAGTGGTCAACTCTTCTTTGACACAATTATTTGATTGAGAACTGTTGGAAATTAGTCAATTTTGTTGTGTTTTCCTACCTGTCTCCCTTTCTCCAAAAAAAGGTGTGTAACACTTTTTCATTCCGTCCATCTATAGGGGAGTAGCTGCTAGGGCTTTGCACCTTTCCAGAGGTGTGGAGAAACCAAGTGGAAGGGTTACATATATTGTCGTCCTTGAAGGTTTATGTAGATTCAGTGTTCAAGAGCTCAGTGCAAGAGGTTCATATCATGTCGCTCGTGTCTCACGTCTTGATATGACAAAAACGGGTAAGATCTTGTTTGTTAAAAATATTAGTTTATTTTTGTTGCTATTTTCCTGCACTACATTGTCATAAGTCTGTTGTAGCTGTTATTTTGTACAGCTCCACCCTTTTCTTCCACTTTCCATTGTAGTTATGCCGATAGTTTGGTGGTATATTAGTTTATTCTTGTACCTTCTTTGTTAAGTGCCTTTTGAATTCACCTAATATCAAATTCTAACACTTACATTATTAATGTTTGTGCAATTTGCTAGAGTTGGAGCACGCAGAGCAGGACCCAGATCTCATTGCTCTTTCTAGGCAGTTCAAAGCTACTGCAATGGAACTAATTTCCGTTCTTGAACAGGTGAAGAAATTTAACAGAGCGCTATACCCTAAATAGATATTCCCAATGTGACTATCAGATCTGCAGTCTCATCTTTCTGTTATCCATGACATTTTTCTTTCAAGGTTATGTATGACTTACGGCAATGATGTTGTTTCTAATTGCAGAAGCAGAAGACAGTTGGTAGGACTAAGGTGCTTCTTGAGACAGTTCCTGTGTACAGACTAGCTGATATTTTTGTGGCTAGCTTTGAAATAAGTTTTGAGGAGCAGTTGTCAATGCTGGATTCAGTTGACTTAAAAGTTAGACTTTCCAAGGCAACCGAACTTGTTGACAGGCACCTGCAGGTGAAGACATTTATGATTAGTGAATTAGTTTTCCTTAATTTTAATAACTTCATCATCAAAGGTTTAAACATTGGGTAGTTTTTAACTTATTTCCTTTCCTTGTGATGAACAGTCAATTCTTGTAGCTGAGAAAATAACTCAAAAGGTTGAGGGTCAGCTATCAAAGTCTCAGAAAGAGTTTTTGCTTCGCCAGCAGGTTTGTTTGCCCATCATGTTATTTTCTGTTCTTGAAGATTCAGGATTTTCGGGCTGCTGATGTTTTTGCTCTCAACAATTATGTCAGTATAAGTTACATTTCATCATACTTACATGTTTTTTGAAAGTTTGAAAGTATACATGATGAGCACAACCCTTTTTTTACGATTCACATCTTGTTGGAGTTTATTTGCTTTGTTTCCATTGCTTCTTTTGTGCCACATTGTTTTGTTTCCAATATGATATCAACCCTTTTAATGCACAGATGCGGGCTATCAAAGAGGAACTTGGCGATAATGATGATGATGAGGATGATGTAGCGGCATTGGAAAGGAAGATGCAGAATGCTGGAATGCCTGCTAATATTTGGAAGCATGCTCAAAGGGAGTTAAGGTAACTTATCATCTCATTCTCAATGTACAATTGTACAGGCATGTGGTACCGCCGGTTCCTATATCTAGTTGTTTTTTCTTGCAGGCGTCTAAGAAAGATGCAACCTCAGCAACCTGGATATAGCAGCTCTCGAACCTACTTGGAACTTCTTGCTGAACTTCCTTGGCAAAAAGTCAGTGAGGAGAGGGAGCTTGACCTTAGAGCTGCAAAGGAGAGTCTTGACCGTGATCATTATGGGCTGACCAAGGTTAAGCAACGGATTATTGAATATTTGGCTGTTCGTAAGGTTGGTACACATGCATAAATTTATGTGCTTATGATATCATGTATTTTCTCTCTCATGGGTGCACGTTAATACTGGCAGCTTAAGCCTGATGCCAGAGGTCCAGTCCTGTGTTTTGTGGGACCACCTGGTGTTGGAAAGACATCATTAGCATCGTCGATAGCAAAGGCACTAAATAGGAAGTTCATAAGAATCTCTCTTGGTGGTGTAAAGGATGAGGCTGATATTAGGGGTCACCGAAGAACATACATTGGAAGCATGCCAGGACGTCTCATTGATGGACTAAAGGTTTAATCACTTGTTTTTCTTATTTCAGGAGTAACTTATGACCTTACAATTTCTTTGACCAGACCAATCTTGTTTTACTTTTGCTTATTAATGTCGTATTTCCACCTGACAAACCATTTTGTGTTTCTAATATACTTAAGTCTTGGATTAATAGTGAAATCTCTTGTGCTATATTCATATTCTGCCCATTAAAAAAATGCAGAGAGTATCGGTCAGCAACCCAGTGATGCTTCTTGATGAAATTGACAAAACTGGTTCTGATGTACGTGGGGACCCAGCATCAGCGCTGCTAGAAGTTCTTGACCCTGAGCAGAATAAAACGTTCAACGATCAGTATCCTTTCAAATTATTCAGATAATGAACAGCATTTTCTGATTAACTGGTTACTTTCTTAATGGAGTTGGGGGGGATCACTACCTGTGGACATCTTTCTATTGTGTTTTTCATGTACCGCTCAATTTTCATATTTAGTTGGATAGTTACAGTTTATTTCCCCCATTATCTGCAATGCTATGTTCTGGGTTGCCTATAACTTGCGTACACTACACAATGCTTAGAGAAGAGATTTCTTTACTTGATATATGATCTATATTATCATACATTTAGAATTCCTTAACATGTTTTCACCAGCTATTTGAATGTTCCATTTGACCTGTCGAAGGTCATATTTGTTGCAACTGCCAACAGGATGCAACCCATCCCCCCTCCTCTGTTAGATAGGATGGAAGTTATTGAGCTACCAGGTTACACACCTGAAGAGAAGCTAAAAATAGCCATGAAACATCTCATACCAAGGGTACTGGAACAGCATGGCTTGAGCTCCACATATCTTCAGATTCCTGAGGTAAGATATGCAGTTTTCTGCTGCATCCTTTGTTGCCTATAAAGAAATTCGGCATATTGTTTGATTAAAAATAGTTTAGTTTGATCTAGAATCAATGCAAGATTAGTGAATGTGGAGAGCTGGAGATGCATACTATTTACCATGCTTTTGCACCTTTGATGAAACAGTAGGCACTGCCTGATTGTGCTCTGCTAAATAATAGAGTTGATCTCATCATTCCGATATTTTGCTAACAGCAGTACTTTGATGAACTGCTACATTTTTGGGTTAAGTTCTTGACTCCTGAGTATTTCGTCATGCTTGCCATTTCTCCAGGCTATGGTCAGACTCATCATTGAGAGATACACGCGAGAAGCTGGTGTACGTAATCTTGAGCGGAACCTAGCTGCATTGGCCCGTGCAGCTGCAGTCAAGGTTGCGGAGCAAGATAGTGTGCTTAGACTTGGCAAGGAAATACAACCAATTACTACAACTCTACTGGATTCTAGGCTTGCTGATGGTGGTGAAGTTGAAATGGAAGTTATTCCTATGGGCCAGGACATATCAAATACTTATGAGAATCCATCACCCATGATTGTTGATGAGGCTATGCTAGAAAAAGTGCTTGGGGTATGCTATTAAACATTTGAGTATTGAGTATAGCCTTATGAGAAGCTACAGAGTTATTTCTTTTTGTTTGTCTTACTTATGGTAATATGCTATATTTGTGCTACAGCCTCCAAGATTTGATGATAGCGAAGCTGCAGATCGTGTGGCGAGCCCAGGAGTGTCAGTTGGGCTTGTTTGGACTTCATTTGGTGGGGAGGTACAATTTGTCGAGGCTACAGCGATGGTGGGTAAGGGTGATTTGCATCTGACAGGGCAACTTGGTGACGTAATTAAGGAGTCAGCACAGTTAGCTCTGACATGGGTAAGCATCTTCTTTAACTTTCACCTATCTATGCATTGGTTGCATCATGCTGCTTTGTTTATTTTCTGCTGGTTCTCTGATATCGCCCTTTGAAGTTATTTTTCTCCAATTATTGTTACTGGAATGAAACTCCAATATTACATAAGAAGAAAACACAATGTTTTGGTGCCTAGTTTTGCATAGTGGTACTCATCATTTCCTTGGTTTTGACAGGTGAGAGCAAGAGCTGCTGACCTTAATCTGTCACCTACTTCTGATATTAACTTATTGGAGAGTCGTGATATTCACATACATTTTCCTGCTGGCGCGGTGCCAAAGGATGGTCCTTCTGCTGGAGTGACATTGGTAACATCATTAGTGTCACTATTTAGCCACCGAAAAGTCAGAGCTGACACTGCTATGACGGGAGAGATGACTCTTAGGGGCCTTGTGTTGCCAGTTGGCGGTGTTAAGGATAAGGTACTGCCCTATAGGTTCCTGACATGTTATTTAATTGACTTCAGAAGGATGAAAGCTTAACCATTTTCTCTGCTCTGCTCTTTGACTAACTTGAAATGTTTTTTCTGGAATTCAGGTACTTGCAGCACATAGATATGGCATCAAGAGAGTAATATTGCCAGAAAGAAACATGAAGGACTTGGCTGAGGTTCCAGCACCCATTCTCTCTGGCTTGGAGGTATGTATTGAGAGCTTTGCTCTATGTATTTCGACAGTCAGAGATGCTCTAAGGCCCTGAGCATATAGTTGATATGTATGGTGCACAAATTGTTTCGGAGTTAAAAAATATATCATAGATAAAGTAGCATTGGAAGAAATTTCCGATACCATATAGTAGACGTATGTTTTGAATCGTAGATGACCAGTAAATAGAATTTTCCCTTTTGGGTGCAATGTAGCTGTCTAAAAAATGTCTATTGCTGACTTTACTTCGACCTGCTACTGTAGATTCTGCTTGTGAAGCGCATCGAGGAAGTACTTGACCATGCTTTTGAAGGTGGATGCCCTCTGAGACCACACTCCAAGCTATAG</dnaseqindica> 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