Os06g0245800
| Gene Name |
Os06g0245800 |
|---|---|
| Description |
Similar to Alanyl-tRNA synthetase |
| Version |
NM_001187762.1 GI:297724654 GeneID:9266147 |
| Length |
6511 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0245800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:7573954..7580464 |
| Sequence Coding Region |
7576627..7576721,7576825..7576984,7577071..7577181,7577268..7577860,7577962..7577983 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:7573954..7580464 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:7573954..7580464 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgataacttttggactagtggtgcaactggaccctgtggcccatgttctgaaatttactatgatttctatcctgagagaggatcctcagatgcgttgtatgcaggatttgggtgatgatagtcgattcatcgaattctacaatcttgtcttcatgcaatacaacaaaaaggatgacggatctcttgaaccattgaaacaaaagaacattgatacagggatgggccttgagcgtatggcacgtattcttcaaaaggttccaaacaactatgagacagacttgattttcccaattattgaaaaggcagcaagcatggcattagtgtcgtacaccacagctgatgatgctatgaagacaaatcttaaaataattggggatcacatgagagcagttgtttatctcatatcagatggagtcattccctcaaatattgggagaggatatgttgtccgaaggcttataagaagagtagttcgaactggtagactgataggtataagaggtgatgggcatggaaattcagaaggtgcctttttaccttcactagctgaggtagcaatcagtcttagcactgagatagatccggatgttgaatctagaaggaaatcaattcttggagaacttcaaagggaagaactgcgatttgtgcagactttggaaagaggtgaaaaattattggacgaacttctggatgaggcattatcaagtgctggtaataatggtggtaaaccttgtctatctggaaaagatgttttccttttgtatgatacatatggttttccagtagagattacagctgaaatatcaggtgaacgaggtgtaattgttgacatgaagggatttgatatggaaatggaaaaccaaaggaaacaatctcaggctgctcataatgtagttaaactttctgtaggaaatgagactgagattgtcaagagtatccccgatactgaatttctgggatcggacaccattttatgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MITFGLVVQLDPVAHVLKFTMISILREDPQMRCMQDLGDDSRFI EFYNLVFMQYNKKDDGSLEPLKQKNIDTGMGLERMARILQKVPNNYETDLIFPIIEKA ASMALVSYTTADDAMKTNLKIIGDHMRAVVYLISDGVIPSNIGRGYVVRRLIRRVVRT GRLIGIRGDGHGNSEGAFLPSLAEVAISLSTEIDPDVESRRKSILGELQREELRFVQT LERGEKLLDELLDEALSSAGNNGGKPCLSGKDVFLLYDTYGFPVEITAEISGERGVIV DMKGFDMEMENQRKQSQAAHNVVKLSVGNETEIVKSIPDTEFLGSDTILC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2674..2768#2872..3031#3118..3228#3315..3907#4009..4030#acaaacaccatacgcgcgcggacgcggaggccgcggagctctcagccatggaggcggccgcactcctatcccccaccgccacctctcgctcccctctccccctcctctccaccgcgcccgccgcccaccgcctccacgttctcctgcctctctccggccgccgccgccgcctgtgcctccgctcctctcctcgaccccgcggtaactcactcctcactgctgttcgaatccgcggaccgcgggcttctgaggcggtgcagaatttgatgcgtgatgctgcgctgcagggtcgttgggctgtgcgggagattgcgtcgtgaggagtatgggttcgtctcgtgagcgcggggtgctcgtgaagaccagcagctcatcaggtttagtaatttataatccctttagtctgattgatgattagtacttcttccgttttatattataactcgtttgacttttttcctagtcaaatttcttcaaatttgaccggatttatagaaaaatatattactattttcaacacaagaaacatattatcaaaatatatgcaatgtgagatttaatgaaactaatttgatattttaaatgttgctagctttttctataaaattagtacttaatagtaaaaaagtcaaacgacttttaatatgaaacggatggatggagtagtaagtttctgcttggtatgtatggttcggtttgtaattgtggtgaaattgaatgtaatccacagcctcagtcgaatcggcaacccaggaggtgggcgcagcgagttcgggggagtggagcggggacgccatacgccgacgtttccttgatttctatgctgcccgtggccacaagatccttcctagctcgtcgcttgtgccagatgaccccaccgtgttcctcactatcgccgggatgcttcagttcaagcctatattccttggcaaggtgattctcataagatacatattgcattcagtagtgcaaactgcacatttttgaaaagtgacccgtaaggtcatcactaagcgtttttaataagaacattggggaaaaaaggggatcattgcacacattgagctagcatttacaagacgttgaagtgcacatgagttttccacttgcgggaagcaaaagctacgcaagtgacaagtcttgtggcatgatctttgcacgatctcagaatcagaaacaaatttgcgaaatgacaacagtaagaggggctaatagtacgtagcaagtgaattaacatgggtgtctatatgtactaatgtgaatactaactttaatatttcagttaataagtgaagttctttagttgtccaatgttcattggtaatcttgatgcttatgtggaagaatccgttatcgaatataatcgttggctcgataatggtagtaaatagtaacacaatgagtattgctttgttctttatagatcatgtcacagcaaactatgttgcaacatgcatctgtttcttgtaacttcgttctgaagtccttatattgctattcctaggaacctaggcgtgtaccgtgtgctactacctcccagaaatgcatacggacaaatgacattgaaaatgtggggcgtacgagccggcatcaaaccttctttgagatgcttgggaacttcagctttggtgattacttcaagaaggaagcaatcacatgggcatgggagctaacaaccaaggagtatgaacaatttccttactccctatggagcatgatctctgtattggtaaatcttaagctgttcatctgaaaagtttgccatgtcaccatgaatattacattcatgcacacatgcctctaagtccactctcaagaaaaaaagggggaaaaacttccggacatttagggttgttcaaatgcttatgtcgatccccagagtattgaacagctcttctttcatctgaaattttatactttgtttgtacccattaatgctattaaaaatttagattatttgaggattatcagtattcctgcaattgtctttgatttctttgtcaatgctaatgacttgcatattgactttatctttccaaccatcagcatgctgttttagtgtatactactttactaggcttgatattcttgcatgcttttgttgctttaattctgcagctttcattttttgttatttatttaggtttgggttacccccagaaagactatggattagtgtatttcaagatgatgatgaagcattttccatttggcacaatgaggtcagttatcaaaaacctgcatgtttctgcaatcttgaagagctttgtttatttttggtttacacaacaatggaacatttattacattttagctgcatctcagagttactcttcatggttagctagaccatacaatatgcttactcactagcaaaataattatggtcaagaaaaacttatttctttaataacttattaatagtaaaagtatatagatctgatgttattgtacatcagttatttacagtgtcaaaatatgcttattctgttcaagaggtgatgggattgtatatggaaatatattgactgacacataaacacattgtcttaaaataatgttctgtgcctgactaagtacttcataagcttgtagtatgggtgagtgattttatatctatttattttatcaaggttggagtaccaaaggagcgaataaagagattgggcgaggatgataacttttggactagtggtgcaactggaccctgtggcccatgttctgaaatttactatgatttctatcctgagagaggatcctcagatgcggtatgtaaagactgtggtattactagttaagaaattcaaagcgccttttccattgtgtatgcaagatattcaccattaactgaaactagtgatatacatatagttgtatgcaggatttgggtgatgatagtcgattcatcgaattctacaatcttgtcttcatgcaatacaacaaaaaggatgacggatctcttgaaccattgaaacaaaagaacattgatacagggatgggccttgagcgtatggcacgtattcttcaaaaggtattgcctaccatctatttcttaaaacaaatgaatgtcatccttactaggtttaagctactctcttactcaattgtctatcataggttccaaacaactatgagacagacttgattttcccaattattgaaaaggcagcaagcatggcattagtgtcgtacaccacagctgatgatgctatgaagacaaatcttaaagtatgctattcaggaccttttactagtttcatcataaataaggaggttacccataacctttgctctttctttttctgttattccagataattggggatcacatgagagcagttgtttatctcatatcagatggagtcattccctcaaatattgggagaggatatgttgtccgaaggcttataagaagagtagttcgaactggtagactgataggtataagaggtgatgggcatggaaattcagaaggtgcctttttaccttcactagctgaggtagcaatcagtcttagcactgagatagatccggatgttgaatctagaaggaaatcaattcttggagaacttcaaagggaagaactgcgatttgtgcagactttggaaagaggtgaaaaattattggacgaacttctggatgaggcattatcaagtgctggtaataatggtggtaaaccttgtctatctggaaaagatgttttccttttgtatgatacatatggttttccagtagagattacagctgaaatatcaggtgaacgaggtgtaattgttgacatgaagggatttgatatggaaatggaaaaccaaaggaaacaatctcaggctgctcataatgtagttaaactttctgtaggaaatgagactgagattgtcaagagtatccccgatactgaatttctggggtacgactctctttctgccactgctgttgttaaaggtcttttagttaatggaaactcagtgaatgtagtttcagaaggttctgatgtagaaatatttttagatcggacaccattttatgctgaatcaggtggtcaagtgggagataatggtttcttgtatgtctatggagaagaagatgcaaaacagaaggcagtcatagaaatcaatgacgtccaaaaatccctggggaatatctttgttcacaaaggcacaattaaacaggggtccgtagaagttgggaaggaaatcgatgctgctgttgatgcaaaattgaggcagggggctaaggtatgaaattgtggaggcatcggattgttttttctggttgacatttttttttttgttttcaagattcaatgataatttgttttatttggattcacattaacttagcttatgtatttatttacctgacgaggtttctcgagattctgaaaaatctatctgatcagactactttaaagagcaaaataggaacatttgcaatagctaatttcttgtgttccatgactaattacagcttagattgttggcatttgaaacatgcaaatgtggttagaatataggttcataggctttattgcttccattatcttggttcttactttcatatgctatctttgttttgtactaggcccatcatactgcaacacatctcctacaatctgctcttaaaagtatcattggttcagaaacatcacaggcaggatcccttgtggcatttgaccgtctccgatttgacttcaatttccaccgccccctttctgaagaggaattgatgaaaattgaatcacttgtaaaccaatgggttagcagtgctactcatcttgagacaaaagtgatggatctgcaagatgcaaaaaatgctggtgcaattgcaatgtttggagagaaatatggcgagcaggttagtctgtatatatagatgtttttttcttcaaaaatagttagtgccctggcctctggaaattagtatgttgcagtgacatgcctgagtagggaagtgccaagtcatgaaagtttgtgcagatgaaattccgaacttgaaggagcatagaacaatgaaaatgcatgttataccatagtagcatagccaatagtttaacctcaataagactttttttttgttctgataggtcagagttgtagaggtccctggggtgtctatggaactctgtggtggaactcatgtgagtaacaccgctgagatccgtggtttcaagattatctcagagcagggaatagcttctggagtcagaaggattgaggctgttgcaggtgatgcatttgttgagtatgtttgtgcccgtgacaactatatgcggtgcttgtgctcatcccttaaggtatgatggtgctcatgctgttgcccttctgatttgtcttgtgtttgtttgtaagtttggttgctatactttgtgaatctatgatcgtttacttctttgccccatgttcaaatagacaaacatgcatgcttctaactactgctaatcataggcacatgtgttcagatacagcatgttggcaacaaattttactctgtaacttgattatagacatcatgttaatcacaagcaaaatgccaacagcatgctcatcctgtcatccatgcctaggatgatcaattcttgcaacaacaaactatgctgattatgtcttccatttgtgtttttcaattgatgtccatctactcaaaataactttgcaggtcaaggctgaagatgtgaatggcagagtagaaacaattcttgaagagctaagaacaaccagaaacgaagtatcatctctacgcagcaaaatcgcggtgctcaaagcagcatccctcgcaaataaagctacaactatcgataacacgaggtatgacgcctccgctttcgccattttcacatccagtcttcatgatcatcacttgctagttgctactagaaaaccaataacatttggcagttgacaatttgacataagcaacaaatccatcccaaaaatctgtgctctgcagggtcgtggttgagaacatgggtgatgtggacgccgatggtctgaagagcgccgcggagtatctcgtggacacccttgaagaccctgccgcggtgatcttaggctcaagcccgggcgatggcaaggtcagcttggttgcggccttcagccccggcgtcgtcaagatgggtatccaggcagggaagttcgtcggcggcatagccaaactctgcggcggaggcggcggcggcaagcccaattttgcccaagccggtggacggaagccggagaacttgccgggtgcgctcgagaaggcacgggatgaaattgttgctgctatatcgtcgaagtcgagctgatttttgtactgaaccatgtacatagggaatagaacagccttacggctatatggttcacagtggcagtaacatttttcgtcaaccaaaaataggaaattgttgttttgggattttttttctgcccggttgcgtacgtactttgcagaaaaccagcttgtaccatttgtaactaccccgtcccaaaaaaaactcaacagagcaagtttaataatatagtccactactagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
