BGIOSGA030303

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA030303

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030303, complete gene.

LocusTag

P0415D04.46-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA030303-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA030303-PA

Length

8521

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:1474451..1482971

Sequence Coding Region

1474451..1474790,1475454..1475524,1475988..1476066,1478573..1478655,1478747..1478798
,1479052..1479119,1479293..1479359,1479440..1479519,1479590..1479654
,1479799..1479861,1480285..1480441,1480525..1480602,1480691..1481233
,1481335..1481511,1481593..1481802,1482284..1482343,1482888..1482971

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:1474451..1482971 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCACCGCGGCGGCGACCGCTCCACCGACCCCTCCTCCGGCCCCGCGCCCGGTTCTCGCGGCGGCGGGGACGGCCGATTCGGCCGCGGCCCTTCTCGCTGGTCGTCCGGCGGTGGCGGCGGCGGTAGCGGCAGCCCACCCCACCGCTTCTCCCGTGGTGGGGGTGGGGGCGGCGGCGACGGTGGCGGAGGCGGAGGTGGAGGCGGGAGGTTCCACCCGTACCGTGGCCCTTCGGACCACTCCGGCGGCGGAGGCTACAGAAGCGGCGGCGGCGGCGAGTACGGGGAGCCGGGTAGCGGGCCGAGACACCGCTACGGCAGTGGCCGTGGTGACCACTCAGATCATGATAACAGAAACAACTATGTTAAACTTTTTATTGGGTCAGTTCCAAGGACAGCGACTGAGGATGATGTACGTCCTTTATTTGAGGAGCATGGAGATGTTGTTGAAGTTGCTTTGATCAAGGATAGGAAGACTGGTGAACAGCAAGGTTGTTGTTTTGTTAAATATGCTACTTCTGAAGAGGCTGAGCGAGCCATCAGAGCTCTTCACAACCAGTACACTTTACCTGGGGCAATGGGCCCTATTCAAGTCAGATATGCTGATGGTGAAAGGGAACGCCATGGGGCTATTGAGCACAAGCTGTTTGTCGCATCACTCAATAAGCAAGCTACTGCGAAGGAGATTGAAGAGATTTTTGCGCCGTATGGTCATGTGGAAGATGTCTACATTATGAAAGATGGCATGAGGCAGAGCCGAGGTTGTGGCTTTGTCAAATTCTCATCACGAGAACCGGCGCTGGCAGCCATGAGTGCTCTGAGTGGGAATTATGTAATGAGGGGGTGCGAGCAACCATTAATAATTCGGTTCGCTGATCCTAAGAGACCTAGACCTGGAGAATCAAGGGGTGGTCCTGCATTTGGAGGTCCTGGTTTCAGTCCACGATCTGATGCAGCTCTTGTTATCAGGCCGACCGCCAACCTTGATGAACCAAGGGGTCGGCATATGCCTCCTGACTCTTGGCATCCATCAAGCCCAAGGTCAGCACCTCATCAGTTTAATAACTTTGGATCTGACAATCCTATGGCTCCGAAAGGGAGTACTGTTACATCAACAACAGATACGGCCACTTTTCGACCTCAGATGTTCAGCGGAAATGGCTCTTTGTCAAGCCAAACAGCTGTGCCAAGTTCGTCACATATGGGCATGAACCCTCCTCCCATGGCACAAGGCCATCATCTGGGAGGCCAGCAGATCCCACCTTTGCAAAAGCTACCAGGGTTGCCTCAGAATTTCCCTGTTCAATTGCAGAATAATCAGCAGGGACAACCCTTGCAGGGGCCTGCTCAACAGATTGGTCAGCTTCAAGTTCCACAATCTATGGGTCCTGGTTCTTTTGGCCAGAATATGTTATCTGGTCAGCTTCCTGTGTCACAGCCGTTGATGCAACAAAATGCTTCCGTCGGCGCTGTGCAGGCGCCTTCAGCCGTGTCCAATTCCATGCAAGCTATTCCCGGGCAACAGCATCTTCCCTCAAATGTTGCACCACAAATGCTTCAGCAGCCAGTGCAGCAGATGCCATCGCAAGCACCACAATTGCTACTCCAACAGCAAGCTGCTTTGCAATCCAGTTATCAATCTTCACAGCAGGCAATTTATCAGCTTCAACAACAGCTGCAACTAATGCAGCAGCAGCAGCAATCGAATCTAAACCATCAACAACCCACACAGGTCGCTGAGCAACATGGTCAGCCAGTGCAATCTAGTAACCCTGGTGCCCCAAATGCCATTATTCCATCAAACATTAATACAATTCCCCAGCAGGCTACTTCACCTGCAGTTCCTTTAACCTGCAATTGGACTGAACATACGTCTCCTGAAGGTTTTAAATACTACTACAATAGCATAACTCGAGAGAGTAAGTGGGATAAGCCTGAAGAGTATGTGCTGTATGAGCAACAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAGAAACTACTTTTGCTTCAACAGCACCAACAAAAACTTGCCATGCAGCAACTTCAGTCACCACCTCAGGCTCAGACACATCCAGCAATGCAACCTGTCCAACAAATTCCTCAGGCACAACAAGGACAGCAACAAATGCAGATGAAACAGCAGGAATTGAATTATACTCAGCTACAGACTCCTGGTGCTATTGATCCCAGTAGGATACAACAGGTGAATGATAAATTGGTAAGCTGTTACTCGGAAATGAGCTCCACTCAACCTGCTGCCTCCATCAAATGCCTTAACGGTGCCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHRGGDRSTDPSSGPAPGSRGGGDGRFGRGPSRWSSGGGGGGSGSPPHRFSRGGGGGGGDGGGGGGGGGRFHPYRGPSDHSGGGGYRSGGGGEYGEPGSGPRHRYGSGRGDHSDHDNRNNYVKLFIGSVPRTATEDDVRPLFEEHGDVVEVALIKDRKTGEQQGCCFVKYATSEEAERAIRALHNQYTLPGAMGPIQVRYADGERERHGAIEHKLFVASLNKQATAKEIEEIFAPYGHVEDVYIMKDGMRQSRGCGFVKFSSREPALAAMSALSGNYVMRGCEQPLIIRFADPKRPRPGESRGGPAFGGPGFSPRSDAALVIRPTANLDEPRGRHMPPDSWHPSSPRSAPHQFNNFGSDNPMAPKGSTVTSTTDTATFRPQMFSGNGSLSSQTAVPSSSHMGMNPPPMAQGHHLGGQQIPPLQKLPGLPQNFPVQLQNNQQGQPLQGPAQQIGQLQVPQSMGPGSFGQNMLSGQLPVSQPLMQQNASVGAVQAPSAVSNSMQAIPGQQHLPSNVAPQMLQQPVQQMPSQAPQLLLQQQAALQSSYQSSQQAIYQLQQQLQLMQQQQQSNLNHQQPTQVAEQHGQPVQSSNPGAPNAIIPSNINTIPQQATSPAVPLTCNWTEHTSPEGFKYYYNSITRESKWDKPEEYVLYEQQQQQQQQQKLLLLQQHQQKLAMQQLQSPPQAQTHPAMQPVQQIPQAQQGQQQMQMKQQELNYTQLQTPGAIDPSRIQQVNDKLVSCYSEMSSTQPAASIKCLNGA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..340#1004..1074#1538..1616#4123..4205#4297..4348#4602..4669#4843..4909#4990..5069#5140..5204#5349..5411#5835..5991#6075..6152#6241..6783#6885..7061#7143..7352#7834..7893#8438..8521#ATGCACCGCGGCGGCGACCGCTCCACCGACCCCTCCTCCGGCCCCGCGCCCGGTTCTCGCGGCGGCGGGGACGGCCGATTCGGCCGCGGCCCTTCTCGCTGGTCGTCCGGCGGTGGCGGCGGCGGTAGCGGCAGCCCACCCCACCGCTTCTCCCGTGGTGGGGGTGGGGGCGGCGGCGACGGTGGCGGAGGCGGAGGTGGAGGCGGGAGGTTCCACCCGTACCGTGGCCCTTCGGACCACTCCGGCGGCGGAGGCTACAGAAGCGGCGGCGGCGGCGAGTACGGGGAGCCGGGTAGCGGGCCGAGACACCGCTACGGCAGTGGCCGTGGTGACCACTCAGGTTTGTGCCCAGATTATCGCGCCTGGGATACTTTAGGTTTTCCCGAGCTATCTTAGGATTGGGATCTGCTTACACGTGACGAGGTGTTTTGGTCACGATTTGTACCTTAGCTTATGTATGAAAATTATCTTAGTAAATCAACTTTTACTGTGGATGTTGGAAAACCTAAGCAATTAATATTCGCATGTGGGATATCTTGCTGAAATTCGCACTGCACACGAGTGTACAGTTCCATTATATGGCTCTGACGTATGTACTAGATGGCAAAGCCACCACCTAACTTTTTTTGCATGGAGGACGACCTTTGATTGGTTTTAGTCTTGTAGAGAATGTTTTACTTCATAACATGGCCTAATGGTTGCAGGAGGGGCTAGGAAATCGTCTCGTTCTGAAACTTGAGAGTCTGTTTATTCTAGGTTCAGCATTCAGTTATAGCATGTTCAGCTAAACGTTTCTTGTTTTATATACTATTTAGTTCTTTTTTCCAGTTCAAAGCCAACCAGGGCCAATGTAGGGATTGTGATAGTAGTAATGAATACAATGCTCTAGAGCATCTCGATGTACTGTTTTATCTAAGTGGGCTTCACTGGAGAATTATTTAGAGCTTATGTTTTACACCCTTTCATCTGCAAAATATGATTTACATCTAATTTTTCGGTGCAGATCATGATAACAGAAACAACTATGTTAAACTTTTTATTGGGTCAGTTCCAAGGACAGCGACTGAGGATGATGTGAGTGTTACACTTACACCACTTGATGTTGTATCTGCTCTTTCGTCCTTAGTTAACTCTTTATGTTCTGCTTTCAATTTGTATTCTTCTGCCTGACTATAATCTGTTATTTGAGGTTGTTTTATCGTAGCTATCGCTGTATCTGAAACAATCCGTAGGCTTAATGCTTACAAGTTCTACAAGTTGGCTTAGAAGATAATATAAATATAGGCATTCATGTTGGTCAAAAATCATCTAAGAAACTATCTACGTTGAGAGAAAAAAGCTCACTTAGAAACTAGCTGAAGCTACCTTTTGCCTATTGCTTAGTTTCGGGTTTATCTGATCTCATATCCATTATAAGTAATTCATATGGTTACCCATTTAATTTGTTGTTCACTACTTGATTTTTGGCACTCTTTTGTTGCCTTCTATTTTCTTCTTGAGCTATCCAGTTTGTAAAAGACATTTCTCCTTTCTCCAGGTACGTCCTTTATTTGAGGAGCATGGAGATGTTGTTGAAGTTGCTTTGATCAAGGATAGGAAGACTGGTGAACAGCAAGGTACGGCAAAACTTTTTTCCTTAATATTATTACAAGTTCTGTATCTCTTTCTTTTCAGGTCCTGAGAGTTACTAGGAGCAACGAGGTTGCATCTTCTCTCAGTTAGATTTGGCAGTTGTTGACTTCATTTTACCGCGCTTCCATTCTGTTTCTCTCCTGTTGGTTCAGTAGAGGAAGAGAATGGAAGCAATTAACTGTTGTCTGATTACTGTAATCTAACTGGATATTCTGATCTGCTGCTAGACAAAGTAGCAGATTCAGTACCAGCAACTTTGTTCAGTCACATCAATCTGTTGAAAACTTTTGCATCCATTTCTTTTGAATGTGCTGCAAAAGAACAGGGAACATTTTGATGAATTCAGACCAAACTATTTCATCATTTTCTGTTCCATGGATCCAGATTTTGTTATTCTAGCATCGTGAATTTCTCTGTATGGAATCCCGTTGGTATGAGTGATGAACCCTTTGATTTGTGAGTGGGTTTCTGGTTGGATGGTGCACTGTAGTGTTGTCCTGACTAATCTAAACTGGTGCTATACTTTTTGTTGTTTAGTGTTCAGAAATCATGGGTGCTTGTTGTGAGCAGTACTAATCTAGAGTTGTGGTTGGATGGACAGTAATGCTATTTGTTCAGTTCAGCTATACATGATTACCATGAGTGGCGCGGCCTTCCTGGTTATTCTGAAATAATAATGATATCCTGTGAGTTCTGGTTGTTTGATTGTGATATGCTGACTATGCAATTTATGGATGCTTGGGCATGACAACATTTTATTCTGTATGCATTTAGTGGGAATTGTATGTTTGCAGACAGAGTGTCATTACTGGGTGTGATGGTCATCACGATGGTACTTGCCATTTGTATGAAATATATCTATTAAAGTGCAATCTCCAACAGCTTTTGCTGTTGTATGTGATCAGCTTGCTCTGTTTGAGTTGACCTGTATTTGAGAATGAATGGCACTGCTGGTATCACTTCCAGTACCAGATAATTATGGCTTTGCTTTTGATGATTCAGCCATTCTGGTTCTTTAGCCTGGGACTGTGGCACCAAAAAATTGAGTCGATCTTTTGTAGAACTTACCTTTATATGATGGTGATGATGATACATTAAGCAATGCGTACTGCACCATGTGTTTATAGTAGTCCTCACCTTTGTGATTTTATGTATTTCATTTGTGGTAACTTTCACTCCGAACTTTTTACTCAGATTCATGATCCATGCATTTCTGTTATTATGGCGTACTAAAGATTTGAGTTCAGAATACCCAAAATCAGATTATGTGGCATGGAATTGATGGTAGTGCTGGGAAAAGCCCTTGCACTTGAACTGTGGTGCTGGTATTTTATTTTTTGTGGAAATGATTGGATGAGCATTTGTTTTTACCATCAGTTGAAGTTGAACTCTGATTCTAGACCCGTTTATACTTTATAATATGCTATCTGGGTTATGACCACACTCCAGCCATTGGAGTCAGGAGGCTGCGCAAGGCATCGTACCCTGAGATGTGCTGTTGTGATTATATTTTGTTTATTGCGCACGACTTGGTTGCCATCTTTAATGTGTGCCTCCCATCAGTTATGAGTACAGGAGTTATGCTCATTATTATTGTTGAGAGAGGATGGTACTATGATGTTCAACATGTAGCACTTATTCTTGGTCAAGCTGTGACTGGCTTGTATTGATATTGAATGGAACTATTAGGTAGTTGGTACATTATGCCACGTGCGCTAATCAGAATCTGAGTGCATCGACATTGTTGAATCTAGGTCTGGCTCATATTATCAGATTGCAAATGCGGTCTCCCTTTTGTGAACCCTTTGAAGATTTTTTGTTATCCTGTCTATTTAATGGGTACATGAGCTTTCTTCCTACTGTTACCACAATTTTCTGCAATTGCTGTGCACCACATGATCCATTACTGTGAACTGCTGTCTGTATGCCATCTTCTGGAGTGATGGATGTAGTATAGTGCTGTATGTGAAGTTGTGAACCAGGCACACCCTGTTTCTTTTATTACGAGCAAAACACTTTATGTTTGTTCTAGTATGCTGGTAACATAAGTTGTATGATGCAAGCTGTTACTGAAATTTTAATGGAATATGCAGTCAGTTGGAGCATCGCGAAAGAACTTAATGTTTCATACATTAGCCGTAAATTCTTCTTGCATGAATGTTGCTGGCAGTTGCACAGTGTAGTCTAAATATTTTGACATGCCATATTACCAAATAGTTATATTATTTAATCTTATTACTTTTTAATAAGGCTTTTATGCTTGTCTCGTTGAATGGATTTCGCTTCTTGATGGTGGGAGTAGTATTGTTCATCTTCAATGTCAAAGATTGGAATGTGGAGTCGAATTTCACGACCTGTTTCAAAATAATGCGCCACCTTTCTATCCTGCTTTGGCTAACTCTGCTATGTTTCTCTCATATACATGATCATTGTGAAACATACAGAAAATTGCAACGGCTTGTGATCAAATCGATATGCTCATATTTGCAGGTTGTTGTTTTGTTAAATATGCTACTTCTGAAGAGGCTGAGCGAGCCATCAGAGCTCTTCACAACCAGTACACTTTACCTGGGGTAACTAATCTCTTTGTTGTGTACTCATTTATAGTCAGTCTTTTGTCTGTAAGACTCTTGAATTATTGACTGTGTGTATCTTTTCTGTCAGGCAATGGGCCCTATTCAAGTCAGATATGCTGATGGTGAAAGGGAACGCCATGGTAACTAATAGTATTTTTGTTATCAGTGGGCTATTGGTACTTTAGAACAATGCTGGGATTTGAGTCAATTGTATAGCATAGCTCCACCCCATAACTTCTATGGTTGATAATCGTACTGTTCCCTTTTTAGGCTAAACAAAAATATTAGTGGAGTGAAATATGTTTGACTTGTTAATAGAAATTTACTTTCTTCACTTATATTTTCTTTATTGTACTTATTGGGTGGTTTCATCACTTTTCATCTATTTGTTAGGGGCTATTGAGCACAAGCTGTTTGTCGCATCACTCAATAAGCAAGCTACTGCGAAGGAGATTGAAGAGGTAAGGGTCTGTTGTTCAAAAGAAGGTTATGTAGATTTAGAACTCATCTATCCAAGACCAATGTGAAATTTTGCATTGCTTTTTGATGCTTTATTTATGAACTCATCATTTTAAGTTAAGAAGCATATATCAAG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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA030303