BGIOSGA030487
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA030487 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA030487, complete gene. |
| LocusTag |
OS09G0308500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA030487-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA030487-PA |
| Length |
3853 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:7332177..7336029 |
| Sequence Coding Region |
7332177..7333244,7333755..7335879,7335986..7336029 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:7332177..7336029 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:7332177..7336029 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGTTGATCCTGGATGCATTTGCATCCAGCCTTGGTGACATACTCATTGAGACAATGAAAGAGGAGGCAAGTTTGATGCTCGGTGTCTCTGATGAGATCAGAAAGCTGTATGACACCCTGAACAGCCTCAAGAAATTCCTACAAGACGCAGAGAAGAAGCACATCACCAGCAGCTATGCACAAGACTGGGTCAGGAAGCTGAAGGGTGCAATGTATGAAGCGTCTGACATCACTGACCTTGTTCAGATCAAGGCTGAGGAGCGGCGCATATCCATGGACACCTCTTCGGGCTGCTTCCACTCCTTTCTGCTTTGCTTGCAGGATCCTCTTTTTGCCCACAGGATAGGAAGCCAAATCAAGTCAGTTAACCAGAAGATGGATGATTTATGCAAGCAAGCTGCTCAACTAAACTTCATCACCAACCTCACCGATGGAAATGGCAAGCACAAGGTCATTGACAAGACGGCACCAGGGCTTGTTCCTAGAGACGCTGTTGGAAAGAAGCTCGAGCAAGATACAAGGATGCTAGTAGAGGTCCTCACAAAAGAGGAGAAGGCCAGTGGTGGGGAAAGCAATAATGTTCATGTAGTTGCTAACAGCGACACTGAAAGCAACAACGTTACTGTTGTTGCTATCCTAGGTATCGGAGGGATTGGCAAGACTACCCTTGCCAAAAAGATCTACAGTGATCAAGCGGTCGAAGACTCATTTAACACGAAGATATGGTTGAGCGTCACTCAGGACTTTAATGAAGTTGATCTGCTCAGAACTGCCATAGTTGCTGCCGGTGGTGACCACTGTGGCGCTCAAGAGAAGTCCTTGCTTGAGCCAATTTTAGTTAGTGCCCTGACAGCGAAGAAGTTTTTGCTGGTGATGGATGACATATGGAATCAAAAGCCATGGGAGAAGGTGCTTAGAGTTCCAACCATTAAAGCAGGTGCTCGTGGATCTCGAGTTCTGATCACCACGAGAAATGAAGGAGTTGCTCGAGAGATGAATGCTGTGCACTTGCACCATGTCAGCAAATTGGGACCTCAAGATGCGTGGGCCATGCTCAAGGAACAGTTAGACTTGAGTGGACCTGAGACTAAAAGACTCAAAGAAAGTGGGATGAAGATTGTAGAAAAATGTGATGGCTTACCGCTTGCAATCAAAGTAGTAGGAGGAGTCTTGTGCAAGAGAAATAAAACTGAAAATGATTGGGAAAAGGTTCTAGGCAATCAGGTATGGTCAAAAATTGGACTGCCTGATGAACTAAACAAGGCAATATATTTGAGCTATGAAGACCTGGTTCCTAATTTGAAGCAGTGCTTTCTATATTACTCACTTTTTCCTAAAGATGAAATTATTGGTCCAGATAAGGTTGTTGCCATGTGGACTGCTGAAGGATTTCTTGGAAATGATGGAAATTCAACACAATTAGGAATGGATTACTACAAGGAATTAATTATGAGAAATCTTTTAGAGCCTCACGATGACTACTATAATCAAGAATACTGTCTCATGCATGATGTTGTCCGCTCCTTTGCTCAGTATGTTGCTAGAGATGAAGCTTTAGTGGTTGGGGACACAGAAAATATGACAAACCTCACATTATCAAATTTTTTCCGGCTATCTATATCAGCAAATGAAATAGAGTGGAGTAATTTACAAAAATGGCACTCACTAAGAACATTGTTATTATTTGGAAATATCAAGTTTAAGCCTGGTAATTCCTTAAGTAACCTTCCTTTTCTACGGACAATACACATAAGAGATGCACGATGTGCTACATTGATTGGCTCATTGTGTCACCTCAAACACTTGAGATACTTGGAACTAGGGTATACAAACATATCTGCATTGCCCCAGAACATTGGTAAGATGAAATTTTTAGAGCACATCGGTCTTCGAGGATGTCACAGTTTGGCAGAACTTCCTAGCAGTATTACAGAGCTACCAAAGTTAAGGCACCTCAGTATTGATGAAACAAAGATTAATGCTATTCCGAGGGGTTTTAAAAGATTAGAAAATTTGGAGATGCTTTGGGGGTTTCCTGTCCACATTATTATTGAAAACACTGGAGAATACAGATGTAGTTTGGAAGAGTTAGGGCCTCTTTCAAAACTCAGGAAGCTTAAATTGATTGGTCTAGAGAATGTACCTTATAGCTCTATGGCAACACTAGCTAAGCTTAAAACCAAGGAAAATCTCATATGCCTTGAATTATGGTGCACAAGTGGAGTGACAGTCAGTGGTAGGGTCAAAGAATCTATTGCCATGGCTGATCAGGAACAAATTGTAGATGTCTTTGACAAGCTTTACCCTCCACTCTGCTTGGAGGAGCTAACTATCGGAGGATATTTTGGCGACAAGCTCCCGAGTTGGATAATGATGCCAGCAAAATTCCTTAAAAATATGAGACGGTTGGACCTACAGGACATGGTTAACTGTGCACATCTTCCTTCAGGTTTAGGTCAGCTCCAAGATTTGGACTGCCTAGTAATTAATCGTGCACCACAGATTGAGCAAGTTGGATATGATTTCTTCGTCCAAGGAGGACAGAGGAAAACTGACAACAGGAATCCCAGTCATGCTGTATTTTTTTCCAAGTTACATGAGTTATGTCTTCAAGGAATGATAAAATGGAAGGAGTGGACATGGGAGAAACATGTGGAAGCCATGCCTGTTTTAAGTGTGCTTAATATCAGAAACTGTAAGTTGCACTATCTTCCTCCTGGTCTTTCCTACCAGGCAAAGGCACTTAGAAGGTTATCCATAGCTAATGTTCAGCACCTAAATTGTCTTGAGAATTTCAGTTCAGTTATTAAGCTTGATGCTTATGACAACCCTGATCTAGAGAGGATAGCCAATCTTCCCAACATGCAGAATCTAACTGTTGTTGGGTGCCCAAAACTGATGGTATTTAATAATGTGAAATCACTTCGGAGCATTCAATTGGGGATTAGTGAGATGGAAACACTCCCGGCATACCTGCAAGATACAAAATTGGAACAGTTAGAGATTGCTTGTAGCTTAAAGCTGCTTAAATTGATGGTCAAGAAAGAGTCTTGGTCGGAGTGGGGAAAGATCAGTAATATCATGCATGTTAAGGGGTTTGCTAGTGAAAATGGCAGGAGATGGTATATATCCTACACAAAACACCCCTTCTCCTTTGATACAAATATTGAATATACCCTCGAACTTCCAGAGGAAACAGGATATGAAGCTAATATCGCAATGGAGAAGATATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVLILDAFASSLGDILIETMKEEASLMLGVSDEIRKLYDTLNSLKKFLQDAEKKHITSSYAQDWVRKLKGAMYEASDITDLVQIKAEERRISMDTSSGCFHSFLLCLQDPLFAHRIGSQIKSVNQKMDDLCKQAAQLNFITNLTDGNGKHKVIDKTAPGLVPRDAVGKKLEQDTRMLVEVLTKEEKASGGESNNVHVVANSDTESNNVTVVAILGIGGIGKTTLAKKIYSDQAVEDSFNTKIWLSVTQDFNEVDLLRTAIVAAGGDHCGAQEKSLLEPILVSALTAKKFLLVMDDIWNQKPWEKVLRVPTIKAGARGSRVLITTRNEGVAREMNAVHLHHVSKLGPQDAWAMLKEQLDLSGPETKRLKESGMKIVEKCDGLPLAIKVVGGVLCKRNKTENDWEKVLGNQVWSKIGLPDELNKAIYLSYEDLVPNLKQCFLYYSLFPKDEIIGPDKVVAMWTAEGFLGNDGNSTQLGMDYYKELIMRNLLEPHDDYYNQEYCLMHDVVRSFAQYVARDEALVVGDTENMTNLTLSNFFRLSISANEIEWSNLQKWHSLRTLLLFGNIKFKPGNSLSNLPFLRTIHIRDARCATLIGSLCHLKHLRYLELGYTNISALPQNIGKMKFLEHIGLRGCHSLAELPSSITELPKLRHLSIDETKINAIPRGFKRLENLEMLWGFPVHIIIENTGEYRCSLEELGPLSKLRKLKLIGLENVPYSSMATLAKLKTKENLICLELWCTSGVTVSGRVKESIAMADQEQIVDVFDKLYPPLCLEELTIGGYFGDKLPSWIMMPAKFLKNMRRLDLQDMVNCAHLPSGLGQLQDLDCLVINRAPQIEQVGYDFFVQGGQRKTDNRNPSHAVFFSKLHELCLQGMIKWKEWTWEKHVEAMPVLSVLNIRNCKLHYLPPGLSYQAKALRRLSIANVQHLNCLENFSSVIKLDAYDNPDLERIANLPNMQNLTVVGCPKLMVFNNVKSLRSIQLGISEMETLPAYLQDTKLEQLEIACSLKLLKLMVKKESWSEWGKISNIMHVKGFASENGRRWYISYTKHPFSFDTNIEYTLELPEETGYEANIAMEKI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1068#1579..3703#3810..3853#ATGGTGTTGATCCTGGATGCATTTGCATCCAGCCTTGGTGACATACTCATTGAGACAATGAAAGAGGAGGCAAGTTTGATGCTCGGTGTCTCTGATGAGATCAGAAAGCTGTATGACACCCTGAACAGCCTCAAGAAATTCCTACAAGACGCAGAGAAGAAGCACATCACCAGCAGCTATGCACAAGACTGGGTCAGGAAGCTGAAGGGTGCAATGTATGAAGCGTCTGACATCACTGACCTTGTTCAGATCAAGGCTGAGGAGCGGCGCATATCCATGGACACCTCTTCGGGCTGCTTCCACTCCTTTCTGCTTTGCTTGCAGGATCCTCTTTTTGCCCACAGGATAGGAAGCCAAATCAAGTCAGTTAACCAGAAGATGGATGATTTATGCAAGCAAGCTGCTCAACTAAACTTCATCACCAACCTCACCGATGGAAATGGCAAGCACAAGGTCATTGACAAGACGGCACCAGGGCTTGTTCCTAGAGACGCTGTTGGAAAGAAGCTCGAGCAAGATACAAGGATGCTAGTAGAGGTCCTCACAAAAGAGGAGAAGGCCAGTGGTGGGGAAAGCAATAATGTTCATGTAGTTGCTAACAGCGACACTGAAAGCAACAACGTTACTGTTGTTGCTATCCTAGGTATCGGAGGGATTGGCAAGACTACCCTTGCCAAAAAGATCTACAGTGATCAAGCGGTCGAAGACTCATTTAACACGAAGATATGGTTGAGCGTCACTCAGGACTTTAATGAAGTTGATCTGCTCAGAACTGCCATAGTTGCTGCCGGTGGTGACCACTGTGGCGCTCAAGAGAAGTCCTTGCTTGAGCCAATTTTAGTTAGTGCCCTGACAGCGAAGAAGTTTTTGCTGGTGATGGATGACATATGGAATCAAAAGCCATGGGAGAAGGTGCTTAGAGTTCCAACCATTAAAGCAGGTGCTCGTGGATCTCGAGTTCTGATCACCACGAGAAATGAAGGAGTTGCTCGAGAGATGAATGCTGTGCACTTGCACCATGTCAGCAAATTGGGACCTCAAGATGCGTGGGCCATGCTCAAGGAACAGGTAAATCATCAAACAACAAACCCTTCCTAGCATTATATATTTTACTCATTTTCTCCTCGATTTGTTTAAAACATAGCCTGAATGCCTGATGCACTCCGAGCTAATTACCTATCAATAATTGCCAAATTTTGGTTACTAGCAACACTATATATGTTCATCAGAAATATATTTCTTTAATACATAATATTTCTGGGTATGAATTCTCTCTTACAATAAATTCCAACTGCTATAATTCATATGTGCCATTTAATGTCGAACAAGAAAATGTTTTTTTTTTCCAACTAATGCCTGAACTATATTTTTCACATATTGGGATAACTGTTGAATTTATTTGTTTTTATCATACTCTGAATAAGTTGATCCATTCATGGTGACAACATAGCTTGAATGTGTTTCCATGTATTATACCACCAGAACATTTGATTTTATTTTAATTCTAAACTTCGTATATAAGAACAAAAGATCAGCTATGGATGTTGTTTTGTTAATATTATATGTTTAAATTCGCAGTTAGACTTGAGTGGACCTGAGACTAAAAGACTCAAAGAAAGTGGGATGAAGATTGTAGAAAAATGTGATGGCTTACCGCTTGCAATCAAAGTAGTAGGAGGAGTCTTGTGCAAGAGAAATAAAACTGAAAATGATTGGGAAAAGGTTCTAGGCAATCAGGTATGGTCAAAAATTGGACTGCCTGATGAACTAAACAAGGCAATATATTTGAGCTATGAAGACCTGGTTCCTAATTTGAAGCAGTGCTTTCTATATTACTCACTTTTTCCTAAAGATGAAATTATTGGTCCAGATAAGGTTGTTGCCATGTGGACTGCTGAAGGATTTCTTGGAAATGATGGAAATTCAACACAATTAGGAATGGATTACTACAAGGAATTAATTATGAGAAATCTTTTAGAGCCTCACGATGACTACTATAATCAAGAATACTGTCTCATGCATGATGTTGTCCGCTCCTTTGCTCAGTATGTTGCTAGAGATGAAGCTTTAGTGGTTGGGGACACAGAAAATATGACAAACCTCACATTATCAAATTTTTTCCGGCTATCTATATCAGCAAATGAAATAGAGTGGAGTAATTTACAAAAATGGCACTCACTAAGAACATTGTTATTATTTGGAAATATCAAGTTTAAGCCTGGTAATTCCTTAAGTAACCTTCCTTTTCTACGGACAATACACATAAGAGATGCACGATGTGCTACATTGATTGGCTCATTGTGTCACCTCAAACACTTGAGATACTTGGAACTAGGGTATACAAACATATCTGCATTGCCCCAGAACATTGGTAAGATGAAATTTTTAGAGCACATCGGTCTTCGAGGATGTCACAGTTTGGCAGAACTTCCTAGCAGTATTACAGAGCTACCAAAGTTAAGGCACCTCAGTATTGATGAAACAAAGATTAATGCTATTCCGAGGGGTTTTAAAAGATTAGAAAATTTGGAGATGCTTTGGGGGTTTCCTGTCCACATTATTATTGAAAACACTGGAGAATACAGATGTAGTTTGGAAGAGTTAGGGCCTCTTTCAAAACTCAGGAAGCTTAAATTGATTGGTCTAGAGAATGTACCTTATAGCTCTATGGCAACACTAGCTAAGCTTAAAACCAAGGAAAATCTCATATGCCTTGAATTATGGTGCACAAGTGGAGTGACAGTCAGTGGTAGGGTCAAAGAATCTATTGCCATGGCTGATCAGGAACAAATTGTAGATGTCTTTGACAAGCTTTACCCTCCACTCTGCTTGGAGGAGCTAACTATCGGAGGATATTTTGGCGACAAGCTCCCGAGTTGGATAATGATGCCAGCAAAATTCCTTAAAAATATGAGACGGTTGGACCTACAGGACATGGTTAACTGTGCACATCTTCCTTCAGGTTTAGGTCAGCTCCAAGATTTGGACTGCCTAGTAATTAATCGTGCACCACAGATTGAGCAAGTTGGATATGATTTCTTCGTCCAAGGAGGACAGAGGAAAACTGACAACAGGAATCCCAGTCATGCTGTATTTTTTTCCAAGTTACATGAGTTATGTCTTCAAGGAATGATAAAATGGAAGGAGTGGACATGGGAGAAACATGTGGAAGCCATGCCTGTTTTAAGTGTGCTTAATATCAGAAACTGTAAGTTGCACTATCTTCCTCCTGGTCTTTCCTACCAGGCAAAGGCACTTAGAAGGTTATCCATAGCTAATGTTCAGCACCTAAATTGTCTTGAGAATTTCAGTTCAGTTATTAAGCTTGATGCTTATGACAACCCTGATCTAGAGAGGATAGCCAATCTTCCCAACATGCAGAATCTAACTGTTGTTGGGTGCCCAAAACTGATGGTATTTAATAATGTGAAATCACTTCGGAGCATTCAATTGGGGATTAGTGAGATGGAAACACTCCCGGCATACCTGCAAGATACAAAATTGGAACAGTTAGAGATTGCTTGTAGCTTAAAGCTGCTTAAATTGATGGTCAAGAAAGAGTCTTGGTCGGAGTGGGGAAAGATCAGTAATATCATGCATGTTAAGGGGTTTGCTAGTGAAAATGGCAGGAGATGGTATATATCCTACACAAAACACCCCTTCTCCTTTGATACAAATATTGAATATACCCTCGAACTTCCAGGTACAAGATTCTACAAGTTTGTGTTCATTTTGTTTTCTCTTTCATCTCCAGTTCTCCTCATAATCTGAATTGTTTATCTCCACTTTTGCTTATTTGTGCTTACTAGAGGAAACAGGATATGAAGCTAATATCGCAATGGAGAAGATATGA</dnaseqindica> |
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