Os06g0275900
| Gene Name |
Os06g0275900 |
|---|---|
| Description |
SMAD/FHA domain containing protein |
| Version |
NM_001063918.1 GI:115467567 GeneID:4340752 |
| Length |
7445 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0275900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:9399937..9407381 |
| Sequence Coding Region |
9400081..9400562,9400733..9400818,9401601..9401680,9402010..9402065,9402222..9402270 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:9399937..9407381 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:9399937..9407381 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacccctccatgcctccgcctccacctcgaaaccctaacccctcctccgcctccatgccgccccccccgccaccgcccaagttggagccggcgtccaagcccgaatccactaaccctaactcctccatgccgccgcctccgcctccactcccggtggagggtgcgagcactagctcctctatgcctccgcctccgccgccacggcccgcggcgccgccgcagccggaggtggagggggcggacgcgtcggccgaagggggcactagcgctagcgattccgaggcggatgaggcggcggggaacttaggtaggggctccagggatattgagatggcggaggcggcggcgccgccgccatcacagcagcagcagccgaggccgcgtgccccgtacgccatacccgagtggagcgccgcaccgggccaccccttcttcctcgaggttctcaaggacggcaccatcgttgacaagcttgacgtgtccaggaaaggagcttacatgtttggtcgaattgatctttgcgattttgtattggagcatcccactatttctcgctttcatgctgttttgcagtttagaaatgatggggaggttttcctttatgatcttggaagcacacatgggtccttcatcaataaaactcaggtcaagaagaagatatatgtggaaattcatgttggagatgtaattcgatttgggcaatcatcacgtttgtacatattccaaggaccatctgagctgatgccccctgaaaaagatatgcagaagcttcgggatgctagagttcagcaagatatgcttgatcgtgaagcttcccttttacgtgcaaaaaatcaagcagctttagcagagggtatctcatggggtatgtctgaggatgcagtcgaagattctgcagaggatgaagctgatgagatcacatggcaaacctacaaaggtcaactcactgatagacaggagaaaacacgaagcaaaataataaagcgattggaaaagattaccaacatgaagaaagaaattgatgcaataagagctaaggacatttctcaaggtgggttaacccaaggtcaacaaacacagattgcacggaatgagcaaaggacatctcagcttatggaggagctggaaaatttagaagaaactttgaatgacagtatacgggaaagtcttggtgctcgcactggaaactcaaatcgtggtagtcataaagcaagtcttgaggaagaagatgacattcttagtgacgaagatgacttctatgatcggacgaagaagaaatcttctagtcataaatccagtgagcagcaagtggagactgctgatagtcttcttgataaaaaagataccataaccagcgatattgaaagtaaaaagaaattggttgaagaagagaagaataagttggcaaaaagtgagaatgcggatgttggggacgaccttgatgcttacatgagtggattatcatctcaattagtacatgacaagattgcccaaatccagaaggagctttctgatcttcaaactgagctgggcagggtggtttacctactgaaaatagctgatcctatgggagaagcagctcgcaagagggatctcaagccacgagaaacaaaatctccagcatctaatgatagtctaagaccagagtccagaaagcaaaacaaagttgcacaaaacaaagcctcaacagaggagaagcttaaggaatcttgtgctgaaaaaacacaagtggataaaccagccgaggaagagaagggtatctccacaaaccaagaaaatggcagcaaacctgcattctccattccaaaacctcagtggcttggtgacaagaggaccgtggaatctgaagagaactgtataaaagaagaaagtgccaatgaagaggagactgataattttgtggactacaaagatcgaaaaactattctttcaggttccgccaatggaaaagaccttgaagaagctgctcctgggcttattttacggaagagaaagtctgatcaatcagcagccaatgaggtggaatcttcagttgaatccgaagcatctgctgctgatgctgtggccctcttgctgaagcacaaacgtggtttacaaacttctgaagatatggaggatgagaatgaaccacaagctagcaagagaaaaagtaaaaagtcgaaacaaaaacgcgtactgggtccagcaagaccagattttctggacgcaggtccagatcatgaaacatgggtgccacctgaaggtcaaactggtgatggccgcacttcattgaacgatcgtctgggctactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPSMPPPPPRNPNPSSASMPPPPPPPKLEPASKPESTNPNSSM PPPPPPLPVEGASTSSSMPPPPPPRPAAPPQPEVEGADASAEGGTSASDSEADEAAGN LGRGSRDIEMAEAAAPPPSQQQQPRPRAPYAIPEWSAAPGHPFFLEVLKDGTIVDKLD VSRKGAYMFGRIDLCDFVLEHPTISRFHAVLQFRNDGEVFLYDLGSTHGSFINKTQVK KKIYVEIHVGDVIRFGQSSRLYIFQGPSELMPPEKDMQKLRDARVQQDMLDREASLLR AKNQAALAEGISWGMSEDAVEDSAEDEADEITWQTYKGQLTDRQEKTRSKIIKRLEKI TNMKKEIDAIRAKDISQGGLTQGQQTQIARNEQRTSQLMEELENLEETLNDSIRESLG ARTGNSNRGSHKASLEEEDDILSDEDDFYDRTKKKSSSHKSSEQQVETADSLLDKKDT ITSDIESKKKLVEEEKNKLAKSENADVGDDLDAYMSGLSSQLVHDKIAQIQKELSDLQ TELGRVVYLLKIADPMGEAARKRDLKPRETKSPASNDSLRPESRKQNKVAQNKASTEE KLKESCAEKTQVDKPAEEEKGISTNQENGSKPAFSIPKPQWLGDKRTVESEENCIKEE SANEEETDNFVDYKDRKTILSGSANGKDLEEAAPGLILRKRKSDQSAANEVESSVESE ASAADAVALLLKHKRGLQTSEDMEDENEPQASKRKSKKSKQKRVLGPARPDFLDAGPD HETWVPPEGQTGDGRTSLNDRLGY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>145..626#797..882#1665..1744#2074..2129#2286..2334#2940..3089#3241..3336#3690..3803#3903..4033#4419..4651#6203..6970#7045..7094#tctcgccgccttcttcccccttgtcgccgtcgccgagccgcctccgcctcaccgtgccgaccaccacctctcccaacctcgccgtcgaatcctctctctctctctcgtctccccgcttcgcttccacctcgcactcacactcccatggacccctccatgcctccgcctccacctcgaaaccctaacccctcctccgcctccatgccgccccccccgccaccgcccaagttggagccggcgtccaagcccgaatccactaaccctaactcctccatgccgccgcctccgcctccactcccggtggagggtgcgagcactagctcctctatgcctccgcctccgccgccacggcccgcggcgccgccgcagccggaggtggagggggcggacgcgtcggccgaagggggcactagcgctagcgattccgaggcggatgaggcggcggggaacttaggtaggggctccagggatattgagatggcggaggcggcggcgccgccgccatcacagcagcagcagccgaggccgcgtgccccgtacgccatacccgagtggagcgccgcaccgggccaccccttcttcctcgaggttctcaaggacggcaccatcgttgacaagcttgacgtgtcagttgctgtctctcttcacccttagcatgattgtctattgtctatagaacaattgccactacctctttgctcgtagcctcatattttggttagcgctcggggttatggattgaaaatggcatgaatgtgtctgcttttatattcatgtttggtgttacatgtgacaggtccaggaaaggagcttacatgtttggtcgaattgatctttgcgattttgtattggagcatcccactatttctcgctttcatgctggtatgttactatgctttcatcattgtcttttcaattatgacataggtaaaactgtagaagaatcaagattcaaaatcctggtgtttaacttagtggctagcttgcatgttccgaatggttttgcattcttaaaaattgtcttgtccttgaggggttttgttgctgatgttagaaaaggaaaatggcattcagtctcaggaatagctttttgcatcatctttttaccaattgatcatatatgaaatgttgacaaactggtaaccagcctgtccttgttcttttcacattgaggagaacaaagcataattgctattcatgatgctgtgatttccgtgaacatatatgaaatagcattgcatgaggaaccgatgaaacttacccagtaaatttggcttgaaaggttaaactttcacttcaaactctacaacttgtgaataccttcagccctaaatagcagaaaaaaaacacaacaaaattcaagaatttgagagaccaggttatgagattttcttgtgcagagctctattatttttaacttacaaaaacattttatttcaagtgtttatgtatgagcacttgttgcctttcttgggaggtatccgtctttaatattcgaataatctctcaactccagtgtcactatcatagtggacattatttgctagctagagaaggaaatgaatggattaggtaaaattggtactattagtttgtaatatagaatattttcttgtttagtgcttaaagcaagacattcatgaactgcttttatgctattttagttttgcagtttagaaatgatggggaggttttcctttatgatcttggaagcacacatgggtccttcatcaataaaactcaggtaatagtcttctgtcatatatcttacttcagagaaagcttcccccttatcaaagctcaacatatctttataccttaaagctttataagcttttgtcatgagtgcattctgtcgttgctcgtgctcttttatttaaaaagcagtgatttatgtcagtagtttcttatcctgttgcgttttagttccatcatttatctcaaccttattgtatcgcattgtaaattttaagaagtcacctgccacattaattatttatatggaacattgcagtaatatttacaatttgttgttcatattatattctctgatgttatttgtgaaaatactaggtcaagaagaagatatatgtggaaattcatgttggagatgtaattcgatttgggcagtaagtgatcttgttaattaattgtttaatttttttgttgcctaattctatggaacttactggcccttctttccttaaatgtttctattttttttattgagttggtgctgttgttacttagtacaattggactaatcttctcgtcgtatttgccagatcatcacgtttgtacatattccaaggaccatctgagctgatgccccctgtaagattcatctgttctttcatattttcgttaccttatttggatcgttcaaccatccacaattttgtcagtgttattgatgatgtagtatgctgtttattcttatcaaattctgcttttggatgtcatattgaaatgaagatttttttctaccagttaggcatgttcgatttcttggcagtgatcttgtaatactttctgaagtagtgccaattgagtgtggctagtaaaatcatagcatgctatatcagatctgtgcttatgttggatttctttggagctctgtttctttttgagaggttcctttatgcaatgggtcacacctataaaagcttctaaaatacttatttttttccagaaatagttctcagagaaattcatttcaatacgaagatatattatcatgtaacaagcaaacatacatgaagttgaactagttattcttcattctaacttcactttgataattttaactgttaaaaacctcataatttgatcatgttctttgttattacgagggacattttcacatccagtgaatagtccagtgaatcaaattaacctatcctgttgtttaaagttgcttgaatttacgtatttggcaggaaaaagatatgcagaagcttcgggatgctagagttcagcaagatatgcttgatcgtgaagcttcccttttacgtgcaaaaaatcaagcagctttagcagagggtatctcatggggtatgtctgaggatgcagtcgaagattctgcagaggttagttgtttttgcaagaattatattttgtatattgataaatttacataaatatttgtgatgcgtgtaatcacgtaaactgtgttttattgaaatttccaaagttcatatttatatttcagcattacatcatttgttgcatttatattaggatgaagctgatgagatcacatggcaaacctacaaaggtcaactcactgatagacaggagaaaacacgaagcaaaataataaagcgattggaaaaggtaaacattacttgtgctgactactgagatttgatctctatgcaatgttctttgtgacttagcttaaccaactttcttgtggatttataacttcattttatctggaaaactattatttgtgaatctgaaatgtgtgcttcttgttacatggactgtcaattctgatttctattgttctttaaaaagtaacttcaacaagtactgaagaccattgattaataatatctggatgctggaaatcggggatatgttgttgaaatttggggggtggtctagactttttccttcccatggatgcatatggtttgcacctctgcttgtcttacaagtttatctttctgtctttgtttcagattaccaacatgaagaaagaaattgatgcaataagagctaaggacatttctcaaggtgggttaacccaaggtcaacaaacacagattgcacggaatgagcaaaggacatctcaggttagtggatcaaatgcttcataccttcttgcactaccttttcatatcatattaccagtccaccaccaacgggtatcataacaaaccttttttcctcagcttatggaggagctggaaaatttagaagaaactttgaatgacagtatacgggaaagtcttggtgctcgcactggaaactcaaatcgtggtagtcataaagcaagtcttgaggaagaagatgacattcttaggtttgtcttctaataaattttgcctagcctgttatgcattttttgtttacgatatttgttggttgttatttgaaatgatattccttttcttttaatttaaatctagttagatatgaactgcactgctgaatttggttgatcaagcttggctactaaatttcctttagatagttactgcaaactagaacacggataaatgtactaggaacttctaccttgcaacctattatcaaattatttatattttatccaattgcataagttttgtcctgtctgctggtagacgcttatatagctgtacattgttcataagtatgatttaagaaatttatctttatatatgctcattgtcgtgtactgattaatggattctcaaataatttagtgacgaagatgacttctatgatcggacgaagaagaaatcttctagtcataaatccagtgagcagcaagtggagactgctgatagtcttcttgataaaaaagataccataaccagcgatattgaaagtaaaaagaaattggttgaagaagagaagaataagttggcaaaaagtgagaatgcggatgttggggacgaccttgatgcttacatgagtggattatcatctcaattaggtatggtgctgtagtgcctacaaggtttatcatctcagaattttgacatgcttcaattttccttaagagttccggtcaaaaaattttccttaagagtgtagtctatggtatcatgtcactaagaatctgttgctgcctgttcacctcggtgtttattgttgagtcattgaaatttgttgagtggtagttttgtatgtagttctttccatggtctgtaattgcatctggggaagtagtggtgaatgaaaataaggtaaatgagcttcatatagttctggtttgaaagttcccgtgatctcttttggaaacttgacttgctatttggtaacgacactggcctcaaagcaacatttgcaactgaaatgactcgacctctctgtacgatttgataatcatcaactctattttgggacaatcaagttcatctgagtacagttgcaattacccttcagcaatatgtcttgtcattttctctactactaaaaagaggagttgatggtggttgtttgcctatgcatcctcagtttagatcatttgtattgtagtatccattttctaaaaaatcccattatttacacgtgtatttagttgcctgttgttttgataaagttatacttgtatgtaatatgggtgcaatcaattagattagagataactattttttttacttcatatttgtggtgtgtttgtttttagatttggcataatgcacaggtactgtctagaacaattttaatgtagttgttaatcatttggtttggtctaaaaaacatggtcacattaatatggatattttagcttgtttgcgttgaggaactatgatcaatgttatttcccagcaatacttttagcttctgtgatagtgggaactatgaaatatttcccttttctttgttttcttctttacttattcttgcattgtacttggcattagttgataacttaatataaaccacgaatccatgcaacacttgaagttcatggtatgcaacaatttccttctaattatatttgtagtgctattttctgaacatattgatagatgtgtgagtagatatcctacagcactgatgcatggaagagattctttactctgattggacgttggagcagaggatacatatgctccattattaattttcccttgtataatacttccaacactcaaattattacaaaaatgacatgagtaaagttactaccaatatgctttcatagtagtattacatatctgaatatatagtaataaatattggtcattaataaagtggtgatattgttgactttgaagtgtagggtagagcattcaatgaccgcaagctaagttactaaagtatacgtcattgaaatatgactttcatttacagaacaatctgatattgcatcagtttttgtaatatttactttgtttaacccctgattagttttagacttcactcatggaaaaacaaagcttgaaaatgatgcatgtctgtatgcttgttttccatatttatgttcagttttatgcttgccacttttcttcactcactagtttgaactgttctgcagtacatgacaagattgcccaaatccagaaggagctttctgatcttcaaactgagctgggcagggtggtttacctactgaaaatagctgatcctatgggagaagcagctcgcaagagggatctcaagccacgagaaacaaaatctccagcatctaatgatagtctaagaccagagtccagaaagcaaaacaaagttgcacaaaacaaagcctcaacagaggagaagcttaaggaatcttgtgctgaaaaaacacaagtggataaaccagccgaggaagagaagggtatctccacaaaccaagaaaatggcagcaaacctgcattctccattccaaaacctcagtggcttggtgacaagaggaccgtggaatctgaagagaactgtataaaagaagaaagtgccaatgaagaggagactgataattttgtggactacaaagatcgaaaaactattctttcaggttccgccaatggaaaagaccttgaagaagctgctcctgggcttattttacggaagagaaagtctgatcaatcagcagccaatgaggtggaatcttcagttgaatccgaagcatctgctgctgatgctgtggccctcttgctgaagcacaaacgtggtttacaaacttctgaagatatggaggatgagaatgaaccacaagctagcaagagaaaaagtaaaaagtcgaaacaaaaacgcgtactgggtccagcaagaccagattttctggacgcaggtccagatcatgaaacatgggtgccacctgaaggtgagaatttggtactaatttctagcacactagttatccctgacaaactggtaattgctgattgtattctgcaggtcaaactggtgatggccgcacttcattgaacgatcgtctgggctactgaagttttcacattcaagactcgactcgatgcgtcatgaagaagaattcagtagcgacgatcgcggtattactgcagctagtccttgagcatgcgtttcatataacttcaaatggaaactggcccctttttattagttgctcgccatttcctgagactgtagtagaggctgtgtaagattgcgaatttgtagaaaatgagagttgaaatgacaggtggtggatctgtatgggaatggtgtcacctgtccaggggtcacaaaggatgcaaatgtcattttcagttcgctacgagaatggggtgggattttgtaatgtacatcatcgtcccatagtataacggttgtttggtgcc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |