BGIOSGA032247
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA032247 |
|---|---|
| Description |
' |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA032247, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA032247-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA032247-PA |
| Length |
4188 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:3955679..3959866 |
| Sequence Coding Region |
3959798..3959866,3959079..3959142),complement(3958894..3958958,3958293..3958340),complement(3958127..3958213 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:3955679..3959866 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:3955679..3959866 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGACGATCGTGTCCGTCAAGGCGCGCCAGATCTTCGACAGCAGGGGCAACCCCACCGTCGAGGTCGATGTGTGCTGCTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCTGCAGTTCCCAGTGGTGCATCAACTGGTGTCTATGAAGCTCTCGAATTGAGGGACGGTGGATCTGATTACTTGGGAAAGGGTGTTTCCAAGGCTGTCGACAATGTGAACTCGGTTATTGCCCCAGCTCTGATTGGCAAGGACCCTACGTCACAGGCTGAGCTTGATAACTTCATGGTTCAGCAGCTTGATGGAACCAAAAATGAGTGGGGGTGGTGCAAGCAGAAGCTTGGTGCTAATGCAATCCTGGCTGTGTCACTGGCCATTTGCAAAGCTGGAGCTATCATCAAGAAGATTCCTCTGTACCAGCACATTGCCAACCTTGCTGGAAACAAGCAACTGGTTTTGCCCGTACCTGCATTCAACGTCATTAACGGTGGATCACATGCTGGAAACAAGCTTGCCATGCAGGCAGAGTTCATGATCCTTCCTACTGGGGCCGCTTCATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGATACACTGGCAAGGTTGTCATTGGAATGGATGTTGCTGCTTCGGAATTCTACAATGACAAGGACAAAACCTATGACCTTAACTTCAAGGAGGAGAACAATGATGGTTCACAAAAGATATCTGGTGATAGCCTGAAGAATGTATACAAGTCATTTGTCAGTGAATACCCCATTGTCTCGATTGAGGATCCGTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAGGTTAACCAAATTGGATCTGTCACTGAGAGTATTGAGGCCGTGAAGATGTCAAAGCGTGCTGGCTGGGGTGTGATGACCAGCCACAGGAGTGGTGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGATTTGGCTGTTGGTTTGGCCACGGGTCAGATCAAGACTGGAGCACCCTGCCGATCAGAGCGCCTTGCCAAATACAACCAGCTTCTTAGGATTGAGGAGGAGCTTGGTGCGGCTGCTGTCTACGCTGGTGCCAAGTTCCGCGCACCCGTGGAGCCCTACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAATIVSVKARQIFDSRGNPTVEVDVCCSDGTFARAAVPSGASTGVYEALELRDGGSDYLGKGVSKAVDNVNSVIAPALIGKDPTSQAELDNFMVQQLDGTKNEWGWCKQKLGANAILAVSLAICKAGAIIKKIPLYQHIANLAGNKQLVLPVPAFNVINGGSHAGNKLAMQAEFMILPTGAASFKEAMKMGVEVYHNLKSVIKKKYGQDATNVGDEGGFAPNIQENKEGLELLKTAIEKAGYTGKVVIGMDVAASEFYNDKDKTYDLNFKEENNDGSQKISGDSLKNVYKSFVSEYPIVSIEDPFDQDDWEHYAKMTAEIGEQVQIVGDDLLVTNPTRVAKAIQEKSCNALLLKVNQIGSVTESIEAVKMSKRAGWGVMTSHRSGETEDTFIADLAVGLATGQIKTGAPCRSERLAKYNQLLRIEEELGAAAVYAGAKFRAPVEPY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..69#725..788#909..973#1527..1574#1654..1740#1839..1919#2008..2112#2186..2266#2342..2416#2644..2706#2806..2886#3003..3197#3281..3331#3412..3500#3591..3642#3754..3810#4108..4188#ATGGCGGCGACGATCGTGTCCGTCAAGGCGCGCCAGATCTTCGACAGCAGGGGCAACCCCACCGTCGAGGTACGTACCGCCGCCGAGACGAGCTTTCTCTCTCCCTCCCGCTGCCGATCTGATCTCTTCCGCCTCTCGCGGCCTCCCTGCTTCGATCTGGCCAGATGGGCCGTTCCGGTGTGGTGATTCCGTCGATCTCGCGGGGTGGGGGGCGCTGAGGCCGTCGCGATGACCGTGGATTCGTTTTTTCCGGCGAGGTTGTTTGGGGGTTTAGGCGATTTGCGGGGTTGTTTGCGGAATTTGGTGCAGGGTTTAACCCCTTTTCGCGAGGGGTTTTGTGGAGGGTAGGTGGGATCTGGAGACAGTGAACGACTGTTGTGTTGGATTTAAAGCGAGGGTTAAGGTATCGCCTAGATTTAATGCGAATATTGATTTATCGCCTAGATCAATTAGATGCTGCGCCGTGCACGAATTCCCCCACCTGTCATACATTTTTCTACGGATTTGAAGGATGCATGGTACAGATCTGTGGGTCCTGCACTTGCTCGTGGCTTCATTATTGTCGAAGCATTGTTGACCGTGGGTGTGGTAATTGTGATGTGGGTCGATAGTTCTAAATCCAACTCTTACCATGTATACAGTAAATGTTTCATTTTGTTTTCATGCTGTTGCGACAAAATGTTATTTGGTTGCTAGTATAATTTATGATACATATGTGCATCAGGTCGATGTGTGCTGCTCAGATGGAACCTTTGCAAGGGCTGCAGTTCCCAGTGGTGCATCAACTGGTGGGTTATTTAGATGTTCTTTTTTTTGCTTTGTTTGCTCATAACCATGGTTTCACATTATCTTAAATGATGTGATTATGGTTTGGCTAGAAGCTAATCTCATCTCTTCATAATCTACAGGTGTCTATGAAGCTCTCGAATTGAGGGACGGTGGATCTGATTACTTGGGAAAGGGTGTTTCCAAGGTTTGCCTTTGATACTTTTTATGTTGCAAACTATTTTAGATATTTAACTATGTAAGAGATCAGTTGATTTTTTAACATAAAACATCCTGCCCTTATTCAATGTTATTGCTTCACCAGCATCAAGCTCTCTTAGCATTTAAAGTGAGTCTATTGATAATATCTATTTTAGCATTGGAGATTGAATCCAAACAAATGCTATTTTTGGTTAAATTCCTTGTAGCCATGGGAGCATGTTCCTAGTTGCATTCCTTGCTGTGCTATAATTTAAACTACTCAAGAGTTCAGATTCTATGTTCTCTCTATCAAATAATTAGTGGCAGATGAGAAAGTCATATTGTCTTGGCTAAACTAAAAAAAGACAAAGTCAAATCAATTATGACTTGTCCACCTTTTAACTGCTTAAATAAATTAGTCAACTTGCTATACTGGTCCTATTGCATCATGATGTATACTTGTTTCATGGGTTATAAAAAATCAATTTGTTTCTGGTACCTGTTACAATGTTTTATTTTTGTTGTTTTTGTTTCTTTACATTTTTTTTCTGTTGTTTCAGGCTGTCGACAATGTGAACTCGGTTATTGCCCCAGCTCTGATTGGCAAGGTTTGTCTCATGGTTCACCTATTCTGTTGTATTTTGAGACTAAATCCAGAATTCATTATATGCTCTATTTCTTCTGCAGGACCCTACGTCACAGGCTGAGCTTGATAACTTCATGGTTCAGCAGCTTGATGGAACCAAAAATGAGTGGGGGTGGTGCAAGCAGAAGGTATTATCTAATCCATCTGGTCATGGGCCTTAGTCATGAAAATTGTAGATGTACCATTTGTAAGTGGATTCTACTAAGTCATTTATCAATATGTGCAGCTTGGTGCTAATGCAATCCTGGCTGTGTCACTGGCCATTTGCAAAGCTGGAGCTATCATCAAGAAGATTCCTCTGTACCAGGTTTGCTGCATGTTAAGATGTGCAATTTATTGCCCTCTTATCTATTCGTTTATGAATTTGCCAACTGATAATATGTTCTGTTTTGCAGCACATTGCCAACCTTGCTGGAAACAAGCAACTGGTTTTGCCCGTACCTGCATTCAACGTCATTAACGGTGGATCACATGCTGGAAACAAGCTTGCCATGCAGGCAGTGATCTGAACTAAGATTTTCTCATTCTATGTGTTGCTCATAAAGTTATTTAATGATGTGCTCTATATTGCAGGAGTTCATGATCCTTCCTACTGGGGCCGCTTCATTCAAGGAGGCCATGAAGATGGGTGTTGAAGTGTACCACAACCTGAAGGTAATTCTTTCATCTTCATTTTAAACCTTTTCCCCATCTTACGTCATTGAAAATTAATTAATTTTATCTGTACAGTCTGTTATCAAGAAGAAGTATGGTCAGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGGTACTTATGCCTGCAGCAGTGAATTCAATTATCTTTCTTTCCACTATGCTGTTGATCCATGTGAAGTGCTTCACTTCAATTATGTTTCCCTGTTTTGCTTTGTATTTGCTTGATGTTAGATGCTGAGATAACTTCTGTTTTGATGTATGAAGCTAATCCGTAATTAGAAATCTAAATGAATATACTTAGCATGTGGTTTGAATCGTTTGTGTTGTGTGATATTGCAGGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGATACACTGGCAAGGTTTGTGTACTTTGATTAATTTATTGTTTATCTTTCTGCATAAGTTAATGTTTTTGATTGACTGAGGCTTGAGACTTTTTTTGCAACCTGATATGGTAGGTTGTCATTGGAATGGATGTTGCTGCTTCGGAATTCTACAATGACAAGGACAAAACCTATGACCTTAACTTCAAGGAGGAGGTAGGTGGCGATCTGTTTCATTTTTGATAGTAGGGATTGGCTCACTGTTTGATATCATGTAGATGTATATAATGCTGTGAACTTATTGGGAACATTTGTGATTCTTTTTGTTGTAGAACAATGATGGTTCACAAAAGATATCTGGTGATAGCCTGAAGAATGTATACAAGTCATTTGTCAGTGAATACCCCATTGTCTCGATTGAGGATCCGTTTGACCAGGATGACTGGGAACACTATGCTAAGATGACCGCTGAAATTGGAGAGCAAGTGCAGATTGTCGGTGATGACCTCCTTGTCACCAACCCAACAGTGAGTGCATAGTTTTCTATTACTTCTAAATATGATCTCTCTTTCAGTGTGGTTGATAATTAATATTAATATATGTTATGCAGAGGGTGGCAAAGGCAATCCAGGAGAAGTCATGCAATGCTCTTCTGCTGAAGGTATGGTTCTATTGATTCTTTCCTTCACGTTTAATAGTTTATCTTCCATGTGCGAATATATCACCCTTGTCTTTCAACAGGTTAACCAAATTGGATCTGTCACTGAGAGTATTGAGGCCGTGAAGATGTCAAAGCGTGCTGGCTGGGGTGTGATGACCAGCCACAGGAGGTATACTGATATGCTTACCTGTCTTTATTCCTGGTGGACCTGGTCTGACTACCAACCATTTGTATATTGACTTGTGTTTCATTGCCACAGTGGTGAGACTGAGGATACCTTCATTGCTGATTTGGCTGTTGGTTTGGCCACGGTAAGATTCTGTGCTCTACATTCACTGTAGTGAACTTTACGGCATCCTGTATTAGTTGTTACTCTTGTACTGAATGTGAGGGCTGAATATATCTTTGTCATTCTGAAACAGGGTCAGATCAAGACTGGAGCACCCTGCCGATCAGAGCGCCTTGCCAAATACAACCAGGCAAGTAGTTTTTCATATTTTGTACCGTATAAAACCAATCAGCTGACCCAGCCAACCTCTATCTGCATTTCTTACGTGCTGTTTAGATCTGAAAGACTTGAATGATTACTTTAGCCCAAGCATGATTTTTTTTGTTCTCAGATGCTTTCATGTGTTAATGGGTAGTTCAGTTAATACTGTCCACTAATTCATGCATATTTTTGTTCAGGCGTTAACGAATCCATGCATATGCTTAAGCTAGTCATTAAAAAGGGGTAAAATTATTATACTAATTCATGTTATTTCTTATTTCAACAGCTTCTTAGGATTGAGGAGGAGCTTGGTGCGGCTGCTGTCTACGCTGGTGCCAAGTTCCGCGCACCCGTGGAGCCCTACTAA</dnaseqindica> |
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