Os06g0320700
| Gene Name |
Os06g0320700 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function UPF0061 family protein |
| Version |
NM_001064049.1 GI:115467829 GeneID:4340893 |
| Length |
5803 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0320700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:12524787..12530589 |
| Sequence Coding Region |
12525139..12525393,12525917..12526190,12526276..12526582,12526671..12526918,12528385..12528684 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:12524787..12530589 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:12524787..12530589 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcccccacacctctcctcctccctcttctcctcctcccctctccccaccgccctcctctcctccctcacccgccgcgcccgcgccctcctccccctccccctccccctccccgccgcctccacccgccgccgcctccctctccgccgcggcccgctgctgacgcgtggcatcatggcctccgccgccgcagaggcaccggccccgtcgccctcgcccaccgccgccgcgaacagccgaccgcggcgggtgctggaggagctctcctgggacgactccttcgtccgcgagctccccggcgacccccgatccgacgccatcccccgcgaggtgcttcacgcttgttacacaaaggtgtcaccctcagcgcccgtggacaaccctaagctggtggcgtggtcccagtccgtggctgacatcctcgatctggatcacaaagagtttgaaagacctgattttcctcagctgttctcaggagcaaatcctttggttgggagttcaccttatgcccagtgctatggtggacaccagtttggttcatgggctggtcagttgggcgacggacgagcaataactcttggagaggttatcaactctcgaggtgagagatgggagttgcagctcaagggctgtggaaagactccatacagccgatttgcagatggccttgctgtcctccgcagcagcattcgtgaattcctatgcagtgaagctatgcatggcctaggcatccctacaactcgtgctctttgtctagttgaaactggcaaatctgttgttcgagatatgttctatgatggcaattcaaaggaggaaccaggtgccattgtatgccgtgtagcaccatcctttttgcgttttggttcatatcagatacatgctacaagggacaaagaggaccttgaaattgttcgtcatttggcagactacacaatacgtcatcactacccacatctcgaaaatattaaaaagagtgaaggtttatcttttgaagcagctataggggactctccagcgatagatcttacttcgaacaaatatgcagcctgggcagttgaggttgcagagcgcactgctttcttgatagcaaggtggcaaggtgttggttttacccatggtgtgctcaacacggataatatgagtgtattaggactaactattgactatggaccctttggctttttggatgcttttgatcctagctatactccaaatacaacagacctccctgggaagagatactgttttgcaaatcaacctgatgttggcttgtggaatattgctcagtttacctcaccattgacagctgccgaacttatcagcaaagatgaggcaaattatgtgatggagaggtacgggacaaagtttatggatgagtatcaatccataatgaccaggaaacttggtctacccaagtataataagcagctaataggcaagctgcttaacaacctggctgttgataaggtcgattatacaaattttttccgtcttctttcaaatgtcaaagcagaccataacattccagagaaggagctacttgttccacttaaagctgcactcctagatattggaccagaaagaaaggaagcatggattagttgggtacaaacttacattgaagagttggtttcaagtggcgttcctgacgaagaaaggaaagctgccatgaactctgttaatccaaagtatgttcttcggaactatctctgccagactgcaattgacgcagctgagcaaggtgattatgatgaagttcgtcggttattgaaagttatggaacatccatatgatgagcagccaggaatggagaaatatgcccggttgccaccagcctgggcatacaggccaggagtgtgcatgctgtcctgctcatcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPHLSSSLFSSSPLPTALLSSLTRRARALLPLPLPLPAASTRR RLPLRRGPLLTRGIMASAAAEAPAPSPSPTAAANSRPRRVLEELSWDDSFVRELPGDP RSDAIPREVLHACYTKVSPSAPVDNPKLVAWSQSVADILDLDHKEFERPDFPQLFSGA NPLVGSSPYAQCYGGHQFGSWAGQLGDGRAITLGEVINSRGERWELQLKGCGKTPYSR FADGLAVLRSSIREFLCSEAMHGLGIPTTRALCLVETGKSVVRDMFYDGNSKEEPGAI VCRVAPSFLRFGSYQIHATRDKEDLEIVRHLADYTIRHHYPHLENIKKSEGLSFEAAI GDSPAIDLTSNKYAAWAVEVAERTAFLIARWQGVGFTHGVLNTDNMSVLGLTIDYGPF GFLDAFDPSYTPNTTDLPGKRYCFANQPDVGLWNIAQFTSPLTAAELISKDEANYVME RYGTKFMDEYQSIMTRKLGLPKYNKQLIGKLLNNLAVDKVDYTNFFRLLSNVKADHNI PEKELLVPLKAALLDIGPERKEAWISWVQTYIEELVSSGVPDEERKAAMNSVNPKYVL RNYLCQTAIDAAEQGDYDEVRRLLKVMEHPYDEQPGMEKYARLPPAWAYRPGVCMLSC SS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5197..5451#4400..4673#4008..4314#3672..3919#1906..2205#1766..1822#446..555#4..333#gccatgcccccacacctctcctcctccctcttctcctcctcccctctccccaccgccctcctctcctccctcacccgccgcgcccgcgccctcctccccctccccctccccctccccgccgcctccacccgccgccgcctccctctccgccgcggcccgctgctgacgcgtggcatcatggcctccgccgccgcagaggcaccggccccgtcgccctcgcccaccgccgccgcgaacagccgaccgcggcgggtgctggaggagctctcctgggacgactccttcgtccgcgagctccccggcgacccccgatccgacgccatcccccgcgaggtgcgtgcgtcgctggggtttactccccgcttcgtggctcgtctcgtctagtgcccttcgctttgcttgcttctgcttcacccggtgattttgtgctgcttgggtgacgcaggtgcttcacgcttgttacacaaaggtgtcaccctcagcgcccgtggacaaccctaagctggtggcgtggtcccagtccgtggctgacatcctcgatctggatcacaaagagtgagcccccagaattattctagtagctgttatgcatttatgcttgccgtccctagattattttggttttggggggtatccctgatgtctgtggataaatcagatgagggttggacaggctgcctttgaattagcatagctcgcttttttcagatgcagtaagagatactgttttattcgaaataattagctttccgtgattggcaatgcgttggagcatatacctcgatcgaaaatagtccgttatggatagagatgtaaatgagaagtggaaatttgagtgtgtataacctgcaaaaatattacaaaacctatcatatcacccttggtagcacatgagctcgaactggtccatacagcacctctaacttatgcattcactgttcgaagatttagtgtcattaccttttgcccaccagggactcttatcgctaacattttaatttatgcccacaacactgacaagtaaggtgaaaattttattcatttatgtttttgctgatgtgctgcagtgtgggtgaaagtggtgttgcctagagttaatgttaccgaaactttccaataaaaaatacaccttgtctttaagtttttgaagaaagttagcacagagaaaaggattactaatcagatgttcaaaattcgaacaccagagcgaagtattacatggtacacagacatggcatcatgacactcgtgtcagaatcctaattggagtggtgtgtccgatgcggcataaaaagtgggcacacataatacaactcagaatcggactggagtggtgttggaatacgacttggacctgggtgcctgattcggcaagaaattatttgcccatgcaatattctttttctgtgttgcccaactcaaacttcttgttttttaatttgccacatgataggccaagtgtgctgtctggcatgttatcagcttcttcttttggctactgaccactgaaactgtttatgacaagttggttttgctttttatacagatttttgtactggttgatttgttacaagaatactgtatttcttaagttgcttttgatcttgatatgatctgttaatgaattaagctgagtaatgcatttttacctcctaccaactctcattttctccatttttgtgtagaagcatgttcattgttctcttccctgttactgtcatccattccttttaatcattttgtatccttgttggtctactttcaggtttgaaagacctgattttcctcagctgttctcaggagcaaatcctttggttgggaggtgcgtaatactaatgcttaacattctcttcatatgattgcacaagaaaagcaacacaccttctgatgaacaactacctgcagttcaccttatgcccagtgctatggtggacaccagtttggttcatgggctggtcagttgggcgacggacgagcaataactcttggagaggttatcaactctcgaggtgagagatgggagttgcagctcaagggctgtggaaagactccatacagccgatttgcagatggccttgctgtcctccgcagcagcattcgtgaattcctatgcagtgaagctatgcatggcctaggcatccctacaactcgtgctctttgtctagttgaaactggcaaatctgttgttcgagatatgttctatgagtatgtcatgacatctctgttttctgaactacatcatgctcgatctatttttctttctaaatttactttagaaacagatcgttccatatccgaagttgtatatctcattgttatgagatatttcttccttctatctaacatggtcacaaagattaaaaagagaacaatagatgatatgagtctctctatagaaagaatgatagatgatcaataatattattatttaaagctaaatatgaagctgccaataggcaaaaataataatggtagcgtgtttctgaaaacgtggtactattttaaacttttaactgtatgtttatggagaacatatcctatccgcacaagcttcccgtgcacattaacagccaaatatcacggaaaattctagaaaaaatatgacatgtactcttaatagtattacacatatctacaaagtcttatattcaaattcgctatattttagctgtaacaaaaaaaagtgaaaattttgacagttttaagattaaaaatctgtcataatttcgtcttttcgttacgattaaaatataatgatttgaacatgaaatgtcacagataggtgtaatactatttaaagtatgtgttcaattttttctagaaattttttgtgacatttgctagttggtgtgcacgggaagcttgtatgcataggatatgttcccatgtgtatgttgcttgagccacatatatataccagcataagctgcagtgggcctgctactgaacaagtctgttagcttctttggtgatggttgtgctggggatgtagaaattaccctgaatggcacgaatcatgtggtgatggctcattttcgtttttagcacatgtgagtttgagttttttttttccatttctttagtgcatgactgtatgtggaaatcatatttggcatattccagtatcattagtctacataagtaaattgtctggttttcatgatatatataatagcacttgtgagcactaaatgttgaaatgattaccccttgccactatgtcaactatgattcttggctgcaatattacgcaaccgagttactgcagctgctaactgcttttgtccacaagtgtgtgtagttacataacaaagcagcagcgaccactgtaatgcagcatgtagcagctgctctaagattcttcaggtttccttgggccatataacacgtccttcttttaagaaagtgcataattttgcccccccccccccaattttttttatttttattaactttgtattgaatactatcatacaaactccattgtccctttcatttacctactgttgattaacattaccttagcggctttttcataaagaacactggttgccaggacctttccccttttttttttccagaaccttccttttgaaggttttagtaattatgttgtatctattagcatttgtttatgatgataaatctaatggtttgtctttatatatcagtggcaattcaaaggaggaaccaggtgccattgtatgccgtgtagcaccatcctttttgcgttttggttcatatcagatacatgctacaagggacaaagaggaccttgaaattgttcgtcatttggcagactacacaatacgtcatcactacccacatctcgaaaatattaaaaagagtgaaggtttatcttttgaagcagctataggggactctccagcgatagatcttacttcgaacaaatatgcaggtaaatatcattatgtgctattttctttcagtctactcattgatatttaaaaggctaagtattctccccttttaatccttggttacagcctgggcagttgaggttgcagagcgcactgctttcttgatagcaaggtggcaaggtgttggttttacccatggtgtgctcaacacggataatatgagtgtattaggactaactattgactatggaccctttggctttttggatgcttttgatcctagctatactccaaatacaacagacctccctgggaagagatactgttttgcaaatcaacctgatgttggcttgtggaatattgctcagtttacctcaccattgacagctgccgaacttatcagcaaagatgaggcaaattatgtgatggagaggtgcattgttttgtccaatatttactgattattacccatgattatgtccagatgtatcatacattttgatttctgtgtactgcaggtacgggacaaagtttatggatgagtatcaatccataatgaccaggaaacttggtctacccaagtataataagcagctaataggcaagctgcttaacaacctggctgttgataaggtcgattatacaaattttttccgtcttctttcaaatgtcaaagcagaccataacattccagagaaggagctacttgttccacttaaagctgcactcctagatattggaccagaaagaaaggaagcatggattagttgggtacaaacttacattgaagaggtaggctttacttttggtaatcgtttattcagtttgtttctctaattctattttataagtgcactttcaaacccaacataatggtatagcacatcaatatattatcaatgatttttgtcttgcttgttggtgtttgggtatgtgtttgtcaacccctgtcattttgtgaagttggaatagtcatgtgtacaaaagaatgtcacaaggcagaaatgagtggttgtttgctcccgttatatgcttccaaatatttacaatcatttacatattggattatattgttttgaaaattgcatcaactgttggttttggataatatctcattcattgttaatgtatcatcagcatgctaatcaattccctgaattattgacttattctgccaatagccaatatgttggtagatcctctttgcttcattagttcaaacatttatagcgaactacagctttgagaaacgacaagttgtaaagaggctatttggacatccttgatctaatgatatatttttttctttgtgaagttggtttcaagtggcgttcctgacgaagaaaggaaagctgccatgaactctgttaatccaaagtatgttcttcggaactatctctgccagactgcaattgacgcagctgagcaaggtgattatgatgaagttcgtcggttattgaaagttatggaacatccatatgatgagcagccaggaatggagaaatatgcccggttgccaccagcctgggcatacaggccaggagtgtgcatgctgtcctgctcatcatgaaaccaacattccatcacgtcaaatatgcaaacttgttttttttatattatttttttctgtataggaggtttaattttgagctactgctatagtgtctaaagcatcacatgctattttactgccgatgcatatcagaaactggtgttgttaatcttcgagttatcatattgttgacggtagctaagcgttcatagcagttgggaaatagagccaccaaactcatccgattttcttagatatagtgctttgttgttgtgaacagattatattttcgcagatgaacatgatgtgcatttagttttagctgtccatctaattatgtccagcaacatgagaggtgtttatttacttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |