BGIOSGA033987
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033987 |
|---|---|
| Description |
Japonica Group Os11g0484000 (Os11g0484000) mRNA, |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033987, complete gene. |
| LocusTag |
NM_001074440.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033987-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033987-PA |
| Length |
6937 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:13585199..13592135 |
| Sequence Coding Region |
13591913..13592135,13590018..13590154,13589839..13589934,13588669..13588788,13588066..13588155 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:13585199..13592135 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:13585199..13592135 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTGCTGCGGCGGCGGAAGGGGGGAGGGGGCGGCGGCGACGGAGTCGGAGGCGTACCTGGAGGGAGAGGCGGTGAGGGAGGCGCGGGAGCTGGTGGCGGAGCTGTGCCGCCACTTCTACGGCCAAGGGTGGGTCACCGGAACGGTGGGCAGCATCACCGTCAAGGCCAACGACCCGGCGCTCCCCCTCGCCGATCAGCTCATCGTCATGTCCCCCTCCGGTGTGCAGAAGGAGAGGATGGTGGCAGAGGACATGTATGTGCTGTCAGCAGATGGGAAGGTGCTCTCCTCACCTGTATCAAAGCCATGGCCAAACAAGCCTCCAAAATGTACTGACTGTGCTCCTCTGTTCATGAAGGCTTATCTGATGAGAGGAGCTGGGGCTGTTATTCATAGCCATGGGATGGAAACTTGCATTGCAACCATGCTTGATCATGGTGCAAAAGAGTTTAGGATGACACATATGGAAATGATTAAAGGAATTAAAGGCCACGGTTACCGTGACGAATTGGTGGTTCCTATAATTGAGAACACTCCTTATGAGTATGAGCTCACTGACTCACTGGCTGAGGCGATTGCAGCATACCCTAAGGCAACTGCAGTCCTTGTACGGAACCATGGAATTTATGTATGGGGTGATTCCTGGATCAATGCCAAGACACAGGCTGAATGCTATCATTACCTTTTCGATGCTGCCATCAAGCTCTATCAATTGGGTATTGATTGGACAACTCCTGAGCATGGTCCAATAAACAGTGCCAAAAGACCACGCAGTGTTCTAAGCTCTAGTATTCCAAATGGATGCCCTGATTCCAAATCATCAAAGCATTGTGTTGTTCTTGACATTGAGGGAACAACTACTCCAATATCATTTGTGACTGATGTGATGTTTCCCTATGCCCGTGATAATGTGCGAAAGCATCTGACTTCAACATATAGTTCTGATGAAACCAAAGAGGACATCAAACTATTGCGCATCCAAGTTGAAGAAGACCTGAAAAATGGAATTGTTGGGTCTGTTCCAATTCCACCTGACGATGCTGACAAAGAAGAGGTTATCAATGCATTAGTTGCTAATGTTGAATCGATGATTAAAGCAGACAGGAAGATTACGTCGTTGAAACAACTCCAGGGCCACATATGGAGGACTGGTTTTGAAAGTAAAGAACTGCAAGGAGTTGTTTTCGATGATGTCCCCGAGGCGCTAAAGCACTGGCATGCTAGTGGCATGAAGGTCTACATATACTCAAGTGGCAGCCGGGAGGCGCAAAGGCTATTATTTGGCAATACGGCCTATGGTGATCTGCGACAATACCTCTGTGGTTTCTTTGACACCACAACCGGTAACAAAAGAGAAACAAGGAGCTACTTTGAGATTTCGCAATCACTTGGGGTGGACAGTCCTGCTCAGATCTTATTTATCACCGATGTCTTCCAAGAAGCTGTTGCTGCAAAAAGTGCAGGTTTTGAGGTAATAATTTCCATTCGCCCGGGAAATGCACCGCTCCCTGAGAATCATGGTTTCCGGACTATCAAGTCGTTTAGTGAGATCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MACCGGGRGEGAAATESEAYLEGEAVREARELVAELCRHFYGQGWVTGTVGSITVKANDPALPLADQLIVMSPSGVQKERMVAEDMYVLSADGKVLSSPVSKPWPNKPPKCTDCAPLFMKAYLMRGAGAVIHSHGMETCIATMLDHGAKEFRMTHMEMIKGIKGHGYRDELVVPIIENTPYEYELTDSLAEAIAAYPKATAVLVRNHGIYVWGDSWINAKTQAECYHYLFDAAIKLYQLGIDWTTPEHGPINSAKRPRSVLSSSIPNGCPDSKSSKHCVVLDIEGTTTPISFVTDVMFPYARDNVRKHLTSTYSSDETKEDIKLLRIQVEEDLKNGIVGSVPIPPDDADKEEVINALVANVESMIKADRKITSLKQLQGHIWRTGFESKELQGVVFDDVPEALKHWHASGMKVYIYSSGSREAQRLLFGNTAYGDLRQYLCGFFDTTTGNKRETRSYFEISQSLGVDSPAQILFITDVFQEAVAAKSAGFEVIISIRPGNAPLPENHGFRTIKSFSEI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..223#1982..2118#2202..2297#3348..3467#3981..4070#4906..5067#5269..5424#5765..5914#6000..6101#6332..6441#6527..6645#6846..6937#ATGGCGTGCTGCGGCGGCGGAAGGGGGGAGGGGGCGGCGGCGACGGAGTCGGAGGCGTACCTGGAGGGAGAGGCGGTGAGGGAGGCGCGGGAGCTGGTGGCGGAGCTGTGCCGCCACTTCTACGGCCAAGGGTGGGTCACCGGAACGGTGGGCAGCATCACCGTCAAGGCCAACGACCCGGCGCTCCCCCTCGCCGATCAGCTCATCGTCATGTCCCCCTCCGGTATCCTCCTCCTCCTCCGCCTTCCTCAGCCTCACACCCTCCCTCCACCTGTTCGATGAATTGCCACGGCGGCAGGGGATGTTATTCCGGGATCGACGAGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTAGGAACGTAGTCTGCTGCGTGGAGTTCGGTTAAATTAACAATTTCGATGGCATTGACTTGCCTGTGTCTCATCACTCTTGTGCTGCTACTACGTATCTAGAGCAGTCGAGCTTTGTATTGTTTAATTTGGTTTACTCATGCGTTGTGTTGCTCTGTGGCAATACAAAGTGGAGTCAGGAACAGGAAGGACCACCTCTCTCCTGTACTATCTTGCACTGCTCTGCTCCTGCTGGACGAACTGACTGATGTGATTTTGCATATGGGGATTGCTCGTTGGCATGCACAGTTGAAGATTGTGCTCTGCTGCTCATGTTAGTTATTGTGATCTGTATTAACGTACAAGATTGTGGGGGTGTAAGGCCCTGTTTCTTTCAGCTTGGCATTATTATAATCCAGATTATTGGGAGTAAGCTGAAAGAAACAGACAACTTATTGAAGTAGCTTATTATAATCTGGAGCCCAGCTTATTATAATCTGATAAGCTCATTTAGGTGAGCTTTTTCCAGATTATTGGGTAAAAAATTACCCACCATGCCACCCCACTCCCTCTTTAGATTTGCAAACCCAATAATTTAGGCTCTAATAATCTAGGAAAGAAACAACTAACCGCTTATTCTACTACAGATTATAACAATCTAGCTTATAGTAATCTAACTCAATAATCTAGATTATAATAATCTTAAGCTGAAAGAAACAGGGCCTAAGTATCAGATAAGCTTAGTTGGTGTGATTTGGGCTGTTACTAAAAAAATTGGAACTACGGTTGCTTTATTATTCTTATGTAGGCTGCTTGTCCAGACAGTTGGAATAGACTTAAGCATTTAGGAGGCTAGGTGCTTATTTCATATTGATATGGCCCACCCCTCGTATGTTTGACTGATTGCAGTTTTTGTGAAATGGCTCAGCAAGCACTGCAGTAGCGGTTGAACACTGTGGTCAACTTTATTTATCCGAGTGTGGTTAATAGTCTGGAACGTTCTCAGATATTTCACTGTTAAGTCAGAAACTGGCCAAGAAGAATTAACAGTTTGAATTATGGGAGCTGGAAAACCAAGTGATTTCTGTACAAAGTCAGACTAGAATAAAACATGCAATAATAATTGTACACTACTAAGGAAAAAAAATTCTTGTTATGTTAATAATTTCTATGACAAAGATAAGTTGCTAAGGAGCCAAGATCAATTTTATTTACAAACTAGTAACTTAAAATATTTCTAGCTTTCAAGTGTGAACTATTATGCTTATTAGCTTATGTCTCAATGCAATTGAGCATCAGTGCATGATGCATGTGAAGTGTTACTATTACAGTTTTTGCTTTAAAAATACTTGTGTAAACCTGTGCGTAGTTGTAATGTCCAGTATTGGACCACCTTGAGCATTTCATTATCTAGGCCTGCTATAAAGATACAATGTTATCCTCTTTTGATGAAAACATGATTTTGCAATTTTGGACATGCCTATTGATGTGGAAAGAGGTTTGTCTAGCGCCACAAATCAATCATGGGGATGAAACAAAGCTGAAAACCTGAATCACTAAACAGAACGTGATTTTCTACTAGTCGACCATAACTTCTGTGAGCACCAAGGTTGCGATTTGAACCAAAAGAAACGATATAAGAAATTTTAATCACATTCTCAGGTGTGCAGAAGGAGAGGATGGTGGCAGAGGACATGTATGTGCTGTCAGCAGATGGGAAGGTGCTCTCCTCACCTGTATCAAAGCCATGGCCAAACAAGCCTCCAAAATGTACTGACTGTGCTCCTCTGTTCATGAAGGTTATCAGTGCTATCCTTTGCTTAATTTGTCTGCTTCAACTTGTTTTAGTCTAAATTGTCTAATTTTCATTGGTATTTTGCAGGCTTATCTGATGAGAGGAGCTGGGGCTGTTATTCATAGCCATGGGATGGAAACTTGCATTGCAACCATGCTTGATCATGGTGCAAAAGAGTTTAGGGTGAACCCACTTGTCTCTTTTCCCCATGAATCTTAGCTAATGTTCCAGTTCTGCTTTATATTTCTCATGAAGTTAGCTGTGATGTTTACAAAAATGTGGTAGTACTAAGAAAATACACCATTTCTCATGTAGTGTACCACATTATGGACATTTTTCTGTCTGATCTAATGTGTCAAATTGAAAAATGGATAATTGTTCATATTTTTAGATTTCCACTTACTTTTCCATTACAAGACTTCCTATGGTACTAACGATTAAGTGCTAACCTTCTAGATGATGCACTATTCAATAAATTGGAGATTATGTTTGCTCCATTTGTTTTTCATTTCATGGCAGACATTATTACATATGTACTAAAAAGAGTGGTGAACATTTTTTAAAAGATTTGATCGATTATTGATTTCACACAGACATGCATCAGCTATCAGGACCAGTTGGAATAATGTCGTACATATTTTCTAAATTTGGTACACTGTTGATTCCAATATTTAGAGAAGTGCACGATGCATACATTGGTCGGGATGTCATGATACTAGAATGTACTCCCTCTGTCCCTAAATATAAGGGATTTTGGTTGGATGTGACACATTCTAGTACAACGAATCTGGACATAAAGCCTGTCCAGATTCGTTGTACTAGGATAAGTCACATCCAACCAAAATCCCTTATATTTAGGGACAGAGAGAGTATTAAATTTAAACATGAAGTTTACCATCCCCACATATTGCTTAGCATATCCAAGACATCAGTGCTATTCCAACACTATTCTATTGGCTAATTAATTCGAAAGCAAACTCAGAAAAATCCAAAATATCATATGTATCCACTATTTCAATAAGGTTGGTAATTTGTTCATTGTGTTCGTAGTAGGCAAAGCTAATAGCAGAAACTATTTGCTGTTTGCATATGGCCAGGGTTTTCAGTCAGTAGAACTTATGATAGTCATAGTATTATCTCATTTGATTGATTTTTTTTAGTCGTAGATCCACCACTAAAGTGACTGTGATATGGAAATCTTTTTTGACCATATACTGCTATTCTATCTTACAGATGACACATATGGAAATGATTAAAGGAATTAAAGGCCACGGTTACCGTGACGAATTGGTGGTTCCTATAATTGAGAACACTCCTTATGAGTATGAGCTCACTGACTCACTGGCTGAGGCGGTATGTTACTATTGTCCTTCTTTGGAGTTTCAGTTTCTCAATCTTCGCAAAAAAACAAATATTATATTTGTAGTCTGTTGTTCTCATAACTTCGTGTGGATAAAATAGATATTGTTCTAACAACGGGATTGGCCAACCTGTAGGCAATGAAGCAATCGTTACAACCATCTCGTTCATCTGTCATTTAGGATTTAACTTACAAAACTTATTAAATTGATGTTGATTATGAGGAGGTTATTCTCAATATTACCTCCATTCTCAATATGTCATTTTGGATTATGTACATTACTGCAGTCAAACCTTTAAACTTAAGCTTACTACAATGCGCAAAACAATGTAAGCTCGTCACTCATAGAAATGATATTAACAGATATATAATTTTTATATACAATTGAAAAGTAGTGATCAAAACTGTGTATTGGAGACTATGTTAATGACCAAAACAACAAATAACAAAGAACAAATAGAATATTTTGGATGGATCTAGAGAACTGATGTGAAAATATATAACAGATTGCAGCATACCCTAAGGCAACTGCAGTCCTTGTACGGAACCATGGAATTTATGTATGGGGTGATTCCTGGATCAATGCCAAGACACAGGTATGTTTTTCTAACCTCTCATTTTTACTTTGTTTATTTCTTGATTTTAGATTGTCAGCTCTTTCAACCATCAAATAGTAATCTCCTTACACTATGCCCTTGTTCATCAATATCTTCAAGACTACCTAGGTCGTGGGTATACATTAATTATATGACTATCTGTTAGATGCACTTCAATAATATTTATATCAAGCCTGCTATTTGATAATAGTTTTGTGATAAATATAAGGGTATATTGTGTTGGCGCTTTGGCGGTATATAAACTTGTTAGGTGGGTGCAATTTAGTACACAAACTTGTAAAATACTCATTATGGTGCATGAACTTATCTAGAGCGTGCGTGCTAGTCCAAAACTTGTGACTATTCATGTTGAGTTCGTCTGATTATAGAATGTCAGGCGCACACGTGAGGGTATGAGATATGTCGTATGTGTAAATAATTTAACCTTGTTCTTCTATTATTTCGTATCCATTGCATACTCCCTTTATGTATAATTAACATGACTTATTGTATGTTTGATTGACTATATGCATATTTACGTAACATCATATTGACATGTGAGCCTACATAACATCCTAATCAGTGCTCAACTTAGTGAAATTAGTTACAACATATTGTTTTGGCTCTAGTTTGCACGTATTAGACAAGTTTATGCACTGAAATGAGCGATTTACATATGCATGTACTAAATCGCATCCACCTTGTAAGTTCATGTACCAACTGTGCAATTTACTCTAAATATAACTGTGGTCATGCACACATTTTGAGGGATAATGGTTCCTGGACTT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