BGIOSGA034971
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034971 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023047F24, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034971, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0191300 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034971-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034971-PA |
| Length |
8503 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:4483405..4491907 |
| Sequence Coding Region |
4483405..4483638,4483757..4483799,4485651..4485772,4485854..4485961,4487282..4487426 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:4483405..4491907 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:4483405..4491907 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACGCCGTCGCACGGCGCCGCGGCTGCGGCGGCGTCGTCCTCCGCCGGCGCCGGGCGGAGGGCCGCGACATTCGCGGGGGCGAGCGTGTTCCTGTCGCGGAGCCTGGTGGCACCCGAGGTGTACGACGCCGTGCACGACGCGCTCCGCCTCAACGGCGCCGAGGTCTTCCTCTGCGCCGACCCCGCCCGGACGGGGCCGCTCGACTTCCACGTCATCTCCTCCTCCTCCCACGAGAGGTTCGCGGATCTGAGAGCCAAAGGCTGCAATTTACTCGGACCACAGTGCATTCTTTCCTGTGCGAAGGAACACCGCTTCCTACCTAAGCAAGGTTATACTTGTTGTCTTGCAATGGATGGGGTTAAGATACTTTGCTCAGGTTTTGAAAAAGATGAGAAGGCAAAGATTGAACAATTAGTGACAGCTATGGGAGGTACTTTACAAAACAAAGCATACACGGATGCTAACTTTGTAATTGCAAAGGATGTATTGGCTGCCAAATACAAATGGGCTGTGAATACTCTGAAGAAGCCTATTGTCAGCAGGAACTGGTTAGAGCAATGTTGGATTGAACATCGTGTTGTACCTCATGAACCTTACAGAATCCCTCCTTTTTCTGGGTTGAATATTTGCATCACCAAACTGAATGTAGACGAACGGAGGGAGTTGGCAAAAATAATAGTGCAGAATGGTGGCCAGTATTCAGCAAATCTTACACGGCGGTGCACTCATTTAGTTTCAAATATATCCTTTGGTGACAAGTATGTTGTGGCCCAAAAATGGGGTAATATCCACATAGTAGTTCCCAAATGGATCGACCAATCTGTTGCTCGAAAAGTTTGCCTTGATGAAAGTGCATACCTTGTTTGTCAGAATTCCACTAATATTAATGGTGTAAAACATTCCCTTAAGGAGCAACACAACCCTGAGATCAGTAGTGCAAGTTTTCAACCTGTTCCAACAACATCTGTAGATGACTCAGTATCAACGTCACAGTATGTGCCTGCTTCATTTGATGACGCTTCAAAGATCTGCAGTACTGATATTGGCGCACCTAGTTTCCAAGAGACAAAAGAACTACAGGTTGATAGCCATGTTGCTGAGGACTCAGAGGCAGAAGATGATGACCTTTATTTATCAAATTGTAGAATTTCTCTGGTGGGTTTTGAGGAGAAAGAGTTGTCAAGATTAGTCATGATGATACGCAATGGTGGTGGATCCCGGCATGTTATGTTAAGTGAGAGACTCACACATATTATTCTTGGTGCACCATCAGAGGAAGAAAAAAAGGAGGTGAGACGTCTGGCTGCTTGGGGTGTAATCAATGTGGTAAAAGCAACATGGTTAGAAGACTGCAACAAAGCAAAAAAGGAGGTGAAAGTATCCCCAAGTTATGTGGCTAATGAGTTGCTCGCGAAAGAGTTTTCATGTGCGGTTATGGAAAAAACTGTTATGCGGGAAACAAAAGCAGCCAAAAACTCAGGTGGAATTTTTCATATTCCAACCGTCAATGACTTGCATGATAAACAACTTGGAAACGATCTGTCATCTGAAAGAAAATCAGCACGGGGCAAACATGAAACCATGAATAGTAACCGGACAGCAACGAAGTCTGCAATATCAAGTCAACAGAATGGAGTGGCTAGTACTAGCGAGTACCACCCCAAATTTCAAGTAAACTCTTCTGCAATAAATCGGCAGAGTAGCAGATCATCAAATACTTTCAAAGGGAGAACATTTTGTTTCTCAAATTCATTTTCCCATGATCGGAGAGCTCAGGTTGTTGACTGGGTCAGAGAAGGTGGAGGCATTATGGTGGATGATGCACAATCAACAGTTGTGGATTTCATTATCGAGAGCCATGGACAGAATAGCATGCTCCGCGACTCTTCTCATTCAACTGCTGTTTCCACTCATTGGATACGCTCATGTTTGGAGGAGGGCTGCTTCCAAGATGTGGGAAGCCATCCTATTTTCTCACCTTTGTGCTGTCGCATCCCGTTTCCTGGGTTTGAAGATTTTCGTTTCTGTGTGTCACAATATGAAGAGAAAGATAGACTTCTGCTGAAGAACTTGTGCTTTATCCTCGGAAGTAAATTTACAGAGAAAGCAACAAAGAAAGTGACCCATCTTATCTGCAAATTTGCAAGTGGTCCAAAGTATGAGGCTTACTATAGTAGGGGAATTCCAACCATAACAGCAGAGTGGCTCTTTGAGTGTGTAAGACAGGATAGAATTGTCCCTTTTGACCAGTTTCAGCCAAAACCACCTACTTCTCAGGACAGAGATGCTGGTCTATGCACTGTTAGTCAATATCCCACACAGGCCGCAAAGACAATTTCCAGATTTGACTGCTCTGAGTCGCATACTGAATCTCAATTACCAAGAAGCAGTTCAAAATACAACTCCGGTAATGCCTCTGTTAATGAGGAACCAAATGACCCTGGTGTTAGTAAAAGGAGGCGATTATCCGAGTTTGGCAAAGCTAATAATACATCTGGAAACATAGGAAGAACTGAGGAACTCCAGGATAGTACCCCTGTTCCTGATGTTGCAGATGCAATAGAGGACCTACTGGTTCAATCATCCAAGATTCAGGACGTACAACCTCCTAGGAGTATTTTTGCACCCGATGATTCTGTTCTTAATCAAGATCAGGAAAATACACACTCTTTTGGCATTTCAAGGCACTGGTTGAACATGCCACAGAAGCTACACAGCACCCCTGACACGAAAGTTCAAAGTGGGAACTCAGCCACCACCTCTGCTGCCCCTCCTGCCGCAGCCACTGCCTATTATCCTTTCAGTGAAACTCAGACTGAGTCTCAGGTCGTTGGCTATGAAGAAGATTTGACTGGCAGGCAAAAGATTATCGACAGAGTTCGTTCTCAGAGCATTAATGTCACCCCGGCAGCTGAAATGTCTTCCGATACTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTPSHGAAAAAASSSAGAGRRAATFAGASVFLSRSLVAPEVYDAVHDALRLNGAEVFLCADPARTGPLDFHVISSSSHERFADLRAKGCNLLGPQCILSCAKEHRFLPKQGYTCCLAMDGVKILCSGFEKDEKAKIEQLVTAMGGTLQNKAYTDANFVIAKDVLAAKYKWAVNTLKKPIVSRNWLEQCWIEHRVVPHEPYRIPPFSGLNICITKLNVDERRELAKIIVQNGGQYSANLTRRCTHLVSNISFGDKYVVAQKWGNIHIVVPKWIDQSVARKVCLDESAYLVCQNSTNINGVKHSLKEQHNPEISSASFQPVPTTSVDDSVSTSQYVPASFDDASKICSTDIGAPSFQETKELQVDSHVAEDSEAEDDDLYLSNCRISLVGFEEKELSRLVMMIRNGGGSRHVMLSERLTHIILGAPSEEEKKEVRRLAAWGVINVVKATWLEDCNKAKKEVKVSPSYVANELLAKEFSCAVMEKTVMRETKAAKNSGGIFHIPTVNDLHDKQLGNDLSSERKSARGKHETMNSNRTATKSAISSQQNGVASTSEYHPKFQVNSSAINRQSSRSSNTFKGRTFCFSNSFSHDRRAQVVDWVREGGGIMVDDAQSTVVDFIIESHGQNSMLRDSSHSTAVSTHWIRSCLEEGCFQDVGSHPIFSPLCCRIPFPGFEDFRFCVSQYEEKDRLLLKNLCFILGSKFTEKATKKVTHLICKFASGPKYEAYYSRGIPTITAEWLFECVRQDRIVPFDQFQPKPPTSQDRDAGLCTVSQYPTQAAKTISRFDCSESHTESQLPRSSSKYNSGNASVNEEPNDPGVSKRRRLSEFGKANNTSGNIGRTEELQDSTPVPDVADAIEDLLVQSSKIQDVQPPRSIFAPDDSVLNQDQENTHSFGISRHWLNMPQKLHSTPDTKVQSGNSATTSAAPPAAATAYYPFSETQTESQVVGYEEDLTGRQKIIDRVRSQSINVTPAAEMSSDT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..234#353..395#2247..2368#2450..2557#3878..4022#4111..4212#4689..4772#4900..5341#5430..5569#5686..6035#6312..6479#6589..6879#7004..7184#7260..7441#7552..7578#7681..7763#8187..8313#8396..8503#ATGACGCCGTCGCACGGCGCCGCGGCTGCGGCGGCGTCGTCCTCCGCCGGCGCCGGGCGGAGGGCCGCGACATTCGCGGGGGCGAGCGTGTTCCTGTCGCGGAGCCTGGTGGCACCCGAGGTGTACGACGCCGTGCACGACGCGCTCCGCCTCAACGGCGCCGAGGTCTTCCTCTGCGCCGACCCCGCCCGGACGGGGCCGCTCGACTTCCACGTCATCTCCTCCTCCTCCCACGTACGCGAACCTAGCTCCTCCCCAACCCCCCCACATCCGCGCGATGATGCGGCTGGCTCTTTCGTTCCCCAAAACCCTAACAAAATGTTGGCTTCCGATCTGTTGCCTTCTTTTGCAGGAGAGGTTCGCGGATCTGAGAGCCAAAGGCTGCAATTTACTCGGTAAAATGCGCTGATCTCCCTGCAGTTTGGCGACGCGGCTATTAATTTTCTGTACTGGCTGTGAACTGTTAACCCCTTAGTAGCGGAATTAGCCCAGAGCGTAATTGTACTTAACTGATTTGAATACCTAGAAAATTGGAAATAGAGCAATTTGTGGATTGGAATCTACAAGTTTGTGCATCCATTACAGATTGGCTAAGGTTTTCGTGGCTAACTGTGCTAATTGCACTGAAACTAGTTGGTTTGGAATTGTCTTACAATAGAGGTTAGTTCTTCAGATTATTGCAGTACTAGATGACAATAGCTGAAGGATTTGAGAGCATTTTAGATATGAGGGTTAGAGGATGCAGTTTGCTTGTGGTCAGCTAAAATTTTAATTTAGGGCTACCATTTCTTAAATCTGGATAGCATCTTCGAGAAGACGAGAATAGCTTACGACCTCAAAATGTAGTGAAGTTGGCTAAATTACTTTATTTAAGTAGCTGAATCTTCAGATTGAGAATCTGAGATTTCGGTGTGGCTCTGTCTGATAATGATTACTATTACGAGTCTTTTTCAGGACAAATTCCGTTATATTTTGAGTAAACATGCCTTTTTGTATGACTTAAATTTTCGTATGCTATACACTGCTTATAGTTCAGATATGTTGGCGCATGTTTTCACACCTGATGTGGAATAGTTTGGTGGCTAAATGTTCCACTAGTTTGTATGCTTCTCTTTCATAATGTTATTAGTTACTCCCTCCGTTTCATATTATAAATCGTTTTACTTTTTTCTTAGTCAAAGTTCTTTAGGTTTGACCAAGTTTACAGAAAAAATTAGCAACATCTACAACACCAAATTAGTTTTATTAAATTTAATATTGAATATATTTTGATAATATGTTTGTTTTGTATTGGAAATGTTAGCATATTTTTCTATAAACTAAGTTTGACTAAGAAAAAAGTCAAACGACTTATAATATGAAACGCAGGAAGTACTAAAGATCGTTATATTGAAAAAAATCAATCTACATAAAATGTTCTTGCAACTTGAAAATTTGATCTCATACATGTTTCTCTCTTCTATCATGCCTCTTGTTAATACAACTAAGATATGACATGTTTTCTAATTGCTGTAGCACATAAATTTTTCTAAGGTTGAAACCACTGTCAACCAAAACTATCACTTATTACCAGTGTTGTGGAAGATGGGATACGGGTGGTCGGCGGAGAGGGTAGTAGGGTACCGACAAATGATTTATCAGAATTTGACGGAAATTTAACGTTCTGCAAATATATGTATATATTTGATAATAATTTGCCTTTTTAAGAGGTAAATGCATACACCTACATATGTTGATCATATTCCTATAATAATGTTTAAATAGAACATCCATAACGTTCATAATGCATAGCTGTGCCTTAACTAAAAGAACTTCAAGCATGCACATCTGCTTAAGATTTAAACAAAAGATCAAAATAAGATCAACAATACATGAGAGATTATTGGATTTGGAAGAGAATTAGAGGGAAAGAAAAGAAACAAATGTACAGGCTGTACAACTAGCTATATACTACTAGTAGAGAAGATAGCTAATGGGCAAGGGTAGTTGTTTTGCAGACTGGGCCTTGTGATCACAATGGATTATGTGGCCGATTAGTCGGAAACGGCTCATTAATTGGCAATGATGGTAATTATGCATTCTCAAACGACTAATGAAGACCGTTTTGCAAAAACGTGACAGACAACTCACTGACTCAGATTTAACAGCCGTTTATATGGCCGTACCAACCGTTTTCCACAACACTGCTTGTTACCACTATTGTTCTTAATTTAGCTTTAAATGTAAGACCAGGTTTAATTTGACAGGACCACAGTGCATTCTTTCCTGTGCGAAGGAACACCGCTTCCTACCTAAGCAAGGTTATACTTGTTGTCTTGCAATGGATGGGGTTAAGATACTTTGCTCAGGTTTTGAAAAAGATGAGAAGGTATATGTATCATAACTTATTGTACTGTCATAGTTCCAAATGCACAATGTATTTATCTCTATTTTGTTTTTGTTTTTCCAGGCAAAGATTGAACAATTAGTGACAGCTATGGGAGGTACTTTACAAAACAAAGCATACACGGATGCTAACTTTGTAATTGCAAAGGATGTATTGGCTGCCAAATACAAAGTAAGTTATGCTTAAAGCAGTTAACATGGAGCGGACTTGATTTGCTAATTTTGCTATTTCACTTGCTGTAGTATGACAAATGGTATATGCTTACTTTACACTGATATTTTCTATATAGCTTATCTACAATTAGGAGTAAAACCTTTGGCGTTAATTAGTTGTTAATAACTTAATATAGAAAATTGCCATGGTATATGTACTGTTCAAACAAATTCCTTCACTTCTGTTAGGAAAATGTTCAGGTCTGTCCATAGTTGCTGTTTAGTCCTCCTAAAACTAAAAGCATTACGCATTTGTGGTATTTCATTCGTTGTTATCTGGTCCTATGCATACCTAGTGCCCTATTTAACTCTATTGCATTCCTTCATTATCTCTCCTTTGGTTACCCTCTAAAGTTCTTAAACTAGAAATTACACTAACACATGAAACTGAAGCTTGGTTTATTGCCTTTATTTTTCACTTGCATTTATAACATGAGATGGTTCTGATTTTGAGGGGTAGCTTGGCATTGCTGTGCTGTGCCATGCTGGTAAATTTGGTTAGATCAGAAAAGCAGGTCATTGACTATTAATTTAAAGATATATAATTGACACTGCTGATTATAAACCACCGTAGTGCCAAATTATGCCATAATTCATCTGGTCTCCATCTCACCACAACCTAATGGATACCATTTTCTGGGCTTTTGGGACTTGTATAGCAAACCTTAACAGAAAATTTTGTTTGATTTATTGCTCATATTGAGGCTGGCACTTTTGTGCTGAACAGAGCCATTTGGTTCAACTAGATAGGGTTGATTATGACTATATTAACATTTAACATGAGTAATTTTCATGGAAGATTTATGTATCTTCTTACCTCTCCCTCCGTTCCAAAACATAAGCATTTCTAGGTTCTTTAGCAAAAACTAAGTTAGAGGGAAAATATTCTCTTTTGGTCATTTCAATGGTCAAATTTTGAACTTTGAATTGCCTAGATTCCCTTCCCAAGCATCTCATTTGCTGAAAATGTATAGATTTCCGTGCATGGGAATCAGTGCCCCAGAAATGCTTATATTGTGGTATAAATAATGAATCCTATAAATGCTTATATTTTGGGAGTATTATTTTACCAGTTGAGCTTCTGTATCACTATCAAAAGCTCTTATGCTGTAAAACTAGCAAGACTGATTATCTGCTATCTTTGGTTTCTGATAACTTCTTAAAATCTGGAAGGTTAGAAATTATTGTTTTGTAACTTGACATCACACTGTTACTGCGGTTGACATGATATGACTAATAGAGAAACTGCAAAATGCTTTAATATTTTTGTTTTCTGCAGTGGGCTGTGAATACTCTGAAGAAGCCTATTGTCAGCAGGAACTGGTTAGAGCAATGTTGGATTGAACATCGTGTTGTACCTCATGAACCTTACAGAATCCCTCCTTTTTCTGGGTTGAATATTTGCATCACCAAACTGAATGTAGGTAGGTGCAGCTGAATTCTATTTTAGCTGGAGATGGAGTGAGCTCAACTTTTCTTAAACAATTCATATGCTTTATTTTGTTTAATCAGACGAACGGAGGGAGTTGGCAAAAATAATAGTGCAGAATGGTGGCCAGTATTCAGCAAATCTTACACGGCGGTGCACTCATTTAGTTTCAAATATATCCTTTGGTGTTTCTGCATATAGTTTTCCTGATTTGGGATTTTGTTTGTTCAAACCAGTCATTGCATCTCTTTTATTTTTAAGCTTATACTTCTAATAAAGGATATATACTTTGCTGGCCAATATTCAGCTAAAACAAGTAGTATTGCAACAAGATAAAGACCATCCACATGGCTTCAGTGAACACATCCAAAGACATTCAGCTAAAACATCTGATGATTAATATTTCCATATACGAGGCCAGAAATATTAGTTCAAATTCCTGCAGGCCATGCATCTGACACATCCATCCCTACAGTGAAAACTACCATTGGTAGAAACTAACTCTAGATTATGAGAATTGACTTAATTTCTACTGTACTGTTGGTGGCATGTACTGCTTAGCACACAGTAAGTGTTCTTCATTTTATCGCAATGCATTTATATATTATTGTTAGAAATTTTAAGAAAACTTTTCTTAACATGCCATTTTACGAACCTGGAGGTGACAAGTATGTTGTGGCCCAAAAATGGGGTAATATCCACATAGTAGTTCCCAAATGGATCGACCAATCTGTTGCTCGAAAAGGTAAAACAATCTACCTACATGG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|
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