Os06g0527100
| Gene Name |
Os06g0527100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Cyclic nucleotide-gated channel A (Fragment) |
| Version |
NM_001064302.1 GI:115468335 GeneID:4341189 |
| Length |
8407 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0527100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:20421603..20430009 |
| Sequence Coding Region |
20423125..20423156,20424041..20424557,20424994..20425206,20426494..20426768,20426864..20426975 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:20421603..20430009 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:20421603..20430009 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatgatgggaagagaggacaaatatgtgagatttgaggactggagatctgagcagtcagttatgtcaccacggaggcataatgctttaagttcacttaaagaaagaactgctggagtttttgcattcctaggaaaccttgtgcattctgaaaccttaaagagattggtgctgcatgaaaggaagttgacaactagaactcttcatcctcagggaccatttctgcaaagctggaacaagatatttgttttgtcatgtatctttgcagtttctgtggacccattgttcttctatattccggttatcaatgacaacaacacatgctggtatttggataaaaagttggaaatcacagcaagtgtcctgcgctttttcacagatatcttctatatactccatatcatatttcagttcaggacaggttatattgcgtcttctcttacaacttttggtcggggtgtcttggttgaggatagatatgcaatagcaaagcgatacttgtcaacatattttctgatcgatgtctttgctgttctacccctccctcaggtggttattttggttgtgctacctaatcttggaggctcagaggttacaaaagccaaaaatatcttgatgtttatagttatatgccaatatgtgcctcggctgatccgaataaggccactgtatctccaaatcacaaggtctgctggggtaattacagagacaccatgggctggtgctgttttgaaccttttaatttacttgctcgccagtcatgtccttggagcactctggtacttgctttccattgaacgcaaagatgcctgctggagagacatgtgtagtaataatagtacagtctgtaatcaggcatatttgtactgtggggataaggaaaactcgatcttacggactgcttgccttccaatcgactcaaacgatatagatccgaactttggaatttatgtgccagctctaaataatgtctcgcaatcaactaattttttggcaaaactattctattgtgtttggtggggtctgcaaaatcttagctctctgggccaaaaccttaagacaagcacttatgcatgggagaatctgtttgcagtttttgtctcaatatcaggcttggttctgtttgcactgctaattggtaatgtgcagacctatttgcagtcagcccatctgagagaagaagaaatgagagtgaaaagccgtgatacagatcaatggatgtcatatcgactgcttcctgagaatctcaaggaacgaatacgtcgtcatgaaaaatatagatggcaccagacgagcggggttgatgaagaactcttgcttatgaacctccccaaggatcttaggagggctataaaacggcatctttgcttatcacttcttatgagggttccaatgtttgaaaacatggatgatcaactcttgaatgccttgtgcgaccgcctaaagcctgttctttatacagaaggtagctgcataattcgtgaagaggatccagtaaatgaaatgctgttcatcatgagaggtaatctcatgagtatgacaacgaatggtggaagaactggcttcttcaactctgatgttttgaaaggtggagatttctgtggcgaagagctcctgacctgggctcttgaccccacgtcagtttccagcctccctagctcaaccaggacagtgaagacgatgtccgaagtcgaagcttttgccctgagggctgaagacttgaagtttgtggccacccagttccgacggctacacagcaaacagctccagcacacgtttaagttctactcgcagcattggagaacctgggcagcctgtttcatacaagcagcctggcataggtactgcagaaagaagatcgaagactctctacgcgagaaggagaagaggttgcagttcgcaatcgttaatgacggtgctacaactctcagcttcagggcagcgatatatgcttcgcgtttcgctggcaacatgatgcggatcttgaggagaaatgccacccgcaaggctcggttgaaggaaagtgtgcctgcaaggttgttacaaaaaccagcagaacccaactttgctgcagaagagcagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMMGREDKYVRFEDWRSEQSVMSPRRHNALSSLKERTAGVFAFL GNLVHSETLKRLVLHERKLTTRTLHPQGPFLQSWNKIFVLSCIFAVSVDPLFFYIPVI NDNNTCWYLDKKLEITASVLRFFTDIFYILHIIFQFRTGYIASSLTTFGRGVLVEDRY AIAKRYLSTYFLIDVFAVLPLPQVVILVVLPNLGGSEVTKAKNILMFIVICQYVPRLI RIRPLYLQITRSAGVITETPWAGAVLNLLIYLLASHVLGALWYLLSIERKDACWRDMC SNNSTVCNQAYLYCGDKENSILRTACLPIDSNDIDPNFGIYVPALNNVSQSTNFLAKL FYCVWWGLQNLSSLGQNLKTSTYAWENLFAVFVSISGLVLFALLIGNVQTYLQSAHLR EEEMRVKSRDTDQWMSYRLLPENLKERIRRHEKYRWHQTSGVDEELLLMNLPKDLRRA IKRHLCLSLLMRVPMFENMDDQLLNALCDRLKPVLYTEGSCIIREEDPVNEMLFIMRG NLMSMTTNGGRTGFFNSDVLKGGDFCGEELLTWALDPTSVSSLPSSTRTVKTMSEVEA FALRAEDLKFVATQFRRLHSKQLQHTFKFYSQHWRTWAACFIQAAWHRYCRKKIEDSL REKEKRLQFAIVNDGATTLSFRAAIYASRFAGNMMRILRRNATRKARLKESVPARLLQ KPAEPNFAAEEQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1523..1554#2439..2955#3392..3604#4892..5166#5262..5373#5948..6184#7348..8046#acccgttttcgtcctccgctttccatcgctccctccacctccaccgcactaccaccaccaccaccaccaaccgccgtgcggacgccgccggcttcccggccgcgacgcggaggaggaccgaattcccccccacccctccgtccaatccgcgcgcaccacctccgaggtaaagcctctgcgctccccctgctccgtcgcgcggcgggttctccctccacagccagccgaggggggcggtggcgtcatgcgaggcagagggagggaggccgcctgaggggggcaaggcgccgcctcaggccggacttaatttgttactgcttcttcgctacgatgccctgcttgctttctcttagcgaatttttgtggtctcgtgtgtctagaataggtagcgcggcgtcagcaggttttgggggtttggtttgcggctgcggagttttcagcctttcaggccaagccatggttataactgggtgggttagaatttttttagttgcttgatcggttgcttttacctatcatcacagggaacaaataggtcacaattggtaattctaatcatttgttaatcggaacgactatgggcactggtggtaattgatgtttcatatactaactgtcactttcctgcttatctgttcatcggggtgaaattggtgtgacactttgggagttgagatactcggcagccataccttatctatgctttgcaaagtttaaccaccatgtatttgatggcgactccctccgaaataacagagagggatagaaatacagagttatatatgttaaggctaggctaggctaggtttgctgtggaaatgattcttataagctatagctgtttagtttattttatgggatcaatcaaattatagtttgataaaatatatcatccaactttcatgtctctcctaattatttcatattttcacaacataataatattatcatttagaacatctttgtattatagtgggaagctgattttaacatgattactaaaaagaagtaataagctctatctgaattaaaaaatagtcataatttgaaactcaaaattaacttttgatttaaatacaagcattttaccaaacactggaatacccaaaaagctgttgccctaaatgaaacacagtccgccgcaataccaaatggagcctgcctacacgagggaaacaccaaatcaccacttcagcattctatctattgtccagttagctaaatgcaatcattcaatattcaacaatcaaatggacatttcctgtcaggtgtgatgagtgattgtccatgcacaaaatctaagctgactgttgtgacataacaaagttaaatttactgtttccatttgattatgttgctgttctttgttctgtgtccatattcatgtgcatacgcgttacttcccttactcaattatgcttgataatcatcagggaactccatgtatgcaaatgtcgccacccttgtagaatcaataaagctgttctagcagctaacctttggtttggtggatttttggaaaatgatgatgggaagagaggacaaatatgtgaggtcagtttcctccatcaccagttgtttgaaatagtttacaaagaataaaggcttgtcaaatgtcttgtgtcataacttatagtaacaagtttaggacatgaaacatggagagggtttggtgatttctaaagagcaatggtaatttggtggttctacactagtgtggtggatgtgatccaagctgtcaataatgaggccacactttggtgtttggcgggagcttcgaaactccaaaagctgttgtctaaggcagtagttcttgcaccctagggaggtcggcttgagtttcttcggttttagagtgggtgtgtgttgtgttctgtaagactttcgatgggtgggtgtcagggtttgtttaaatcttgcatccctcgcatttctttctctcttaatgaaatgatacgcatatctcctgcgtgttcgaaaaaaaaatcgatgcttctactttcatcacatgatggttttggacattttggcctctgagagaccctggcatggattgacttgttggaacgattgttactgctcatttccttgtcttttgcagcatataaacatgaatgcaataatttctctccaatttttccaaaatagaaatctagcttcggttcaagatcatcaagaagtctgacatataaatgtatggaaatgacaacaccagtatctgattaaatttttgagtaaataatgaagactgctggtaaaaataacgtagttgaagtaagagagaagagagaagagagaaaaaaagtttgggtctctagggacctgatcaatgaatattaaagtcctgggacccattaaagttttgagtaaatattgaaaacaactactgaaaactcgatgtaataattattctgtattttttttaaccatgtatgcagatttgaggactggagatctgagcagtcagttatgtcaccacggaggcataatgctttaagttcacttaaagaaagaactgctggagtttttgcattcctaggaaaccttgtgcattctgaaaccttaaagagattggtgctgcatgaaaggaagttgacaactagaactcttcatcctcagggaccatttctgcaaagctggaacaagatatttgttttgtcatgtatctttgcagtttctgtggacccattgttcttctatattccggttatcaatgacaacaacacatgctggtatttggataaaaagttggaaatcacagcaagtgtcctgcgctttttcacagatatcttctatatactccatatcatatttcagttcaggacaggttatattgcgtcttctcttacaacttttggtcggggtgtcttggttgaggatagatatgcaatagcaaagcgatacttgtcaacatattttctgatcgatgtctttgctgttctacccctccctcaggtactccgcataccatgtacttagttaagctcagtatggaactatttcatagtatagttcacatgattctttagaattatgatggtatgttggtgatatacatataaattatgattagtggatgcacctttgatagtccctacatgagaaaaataatagatattcacctcttttatgatttataatgatataatggaattcacatattggtatcatgggatgattagtaaggatgcacttttggtagataccacatcagaaaaataaaagattttgattttactctgatacatgcaattcacatgttagaaaaatggggtcatatacaaagagctctgtctgtttcttctatgactttgcagtcttaatagtgcactaagttatgcgcctttgatttctcagtcaagcttgtaagcatggtcaattttgttaccaggtggttattttggttgtgctacctaatcttggaggctcagaggttacaaaagccaaaaatatcttgatgtttatagttatatgccaatatgtgcctcggctgatccgaataaggccactgtatctccaaatcacaaggtctgctggggtaattacagagacaccatgggctggtgctgttttgaaccttttaatttacttgctcgccagtcatgtaagtattctattcaataactctggatagtcaacaatgccaaatcaactgtcctttgctagagcaatatttaactgcaatagtggaaagctgaaaacatgatcaatttcctgtaaagattacatgaatttattattgatcaaaataaattcggctaacctggttgatgtgtggtatgggtggaatagcacttgtgtagtctcatttttttttattttttgccaaaccagagccataaacacctcttgttttgtggttttcatcagcaaagttgtctaaatttgtatacagaaagcaatggtgtaacctttaaaggtttattttacttaagttacataagtattataaggaaaaggattttgtccaacattttctcgatccatttctctgcgagagaaacaaaattttagtttgtccaatctgaaatacactctaattgtaacagtataaattattagtttatatcagctatcatgtaccaaatattttcaatgaaatttgatacttagcgcttagtagttcatcctgtttctcgtgggtcaattctcaagagatattctatcacatatacaccaatttcaatgtcatcaatgcatatttgtaacaatgttgtccaatttttctatgattctatttacatgctttattggctctatatctgtttcctgatgggtgtcatttaggaagtcataacagtcaagatttacaaaataaaagtcgtaatattggtaagaaaataatatgcatggattttgttttctgtaaaaaaaatggctataatatccttatgggtaacaacactttggtctctcaagttttgcttgaggctcctgttgggctctgatgtatcatccagatgtgtgtgtgtcctcaaattttcctcattaaaaattaaaattggatccaccgggagcagcgcctgtacaggactaatcggtgttgacccttgatctcttggcttggccaattcgtttgatatgcatgtccttgtagtgcttcaactggttcaaaggagtaaggacaatcatgacccatagtcggaaaacttggaggactgggtggataaattggaatgtcatggacaatcacaaccaaagaatggcctatgaaacttgacttcatactactaaattggcaaataattaaaatattagtggcccatgcaaccatctagttgacttcattcataagtgggatacttttgcaactgcagtgccactaaattggatataattaaatatttccatgcaccttatatatttatgacaaatctttgaactgctgcaggtccttggagcactctggtacttgctttccattgaacgcaaagatgcctgctggagagacatgtgtagtaataatagtacagtctgtaatcaggcatatttgtactgtggggataaggaaaactcgatcttacggactgcttgccttccaatcgactcaaacgatatagatccgaactttggaatttatgtgccagctctaaataatgtctcgcaatcaactaattttttggcaaaactattctattgtgtttggtggggtctgcaaaatcttaggtttgtgcaaaacagaaacatttaaagtattttctgcttgaaccaataaacttctctatgccacctatatttatgtgttggtctatttaatgcagctctctgggccaaaaccttaagacaagcacttatgcatgggagaatctgtttgcagtttttgtctcaatatcaggcttggttctgtttgcactgctaattggtaatgtgcaggtacgcatatttagcttcattggctattaattttacaagtcattttcttgatttatgttattattcaagcttttcataatagaacttgcattgcaaatcagaaatatgctaaaattttaagtgtgttatgtgtctaatgcctacataatcaattgaagagaacatgaatgctatatactgctgctaaagatataccccagaacaacagagaatatttttatgagtgaattatggaaaacttaaaaataataaatcaaattaattctgagaaaaatgagtccaacttattttatctcctagggatatgaaactaaagatatggaaccttgtgctaggtttcgagtgttcattccaataccatttggagataagactagcataatcttggtaggaataagatcatcagtccttatttgcaacagtagtctttgtacaaaatggttcaggtcttgtactacaaagaatgtttcacaggatccctgacattgaatgaaattaggtgtttttgctgcgtaatgataaatgcgtaatttgggtagctaactcatccttccattttttgtgacttctacagacctatttgcagtcagcccatctgagagaagaagaaatgagagtgaaaagccgtgatacagatcaatggatgtcatatcgactgcttcctgagaatctcaaggaacgaatacgtcgtcatgaaaaatatagatggcaccagacgagcggggttgatgaagaactcttgcttatgaacctccccaaggatcttaggagggctataaaacggcatctttgcttatcacttcttatgagggtatgttctcacaagcttcttttgcagagtaacctgctgtagtagtcttatttttgtgtcttatccaattgcagaaaatatgttggttaagtaaataatttggccattttcacgtagctcagccaaatctagttacagtagcagacccaagaaatatgatctgagatttggctgagcaccatttgttttctacttattgtagcataatattttcagtccatgcagctcatcatgctatattgtttaaaaccggaattgcatcttcctcacaattgctgatgacataaaagtatcctggttgttcaagaatgacaaagaccatgttccaaaaggcacataaatgaaagcttaaggcttcttttaccttcttttcaatagttgtagagttgcttatgtgttgcaaggtgtcattgtttcttgctctgaacctaagccaattacctctaaagtggtgatgtaggtcttccaatagtcgcgtgctttaggtgcacaccagtaatctagcatgaaattttcagtgcatgaaatgtgtttgaggtactcacgtagaaactggaaaattaagtaatgtaaaaccattggcgtactagttatgggtcatcttttcacattttaaggttctgggttcagacatcagaaagcattactaaactgggaagcagtgggaagggtgtaaaggacgagggtcactggggtttacatggtgaatcggaaatcagctccatcatccaacttctgtagtttctatgcatctgaaatgctcttcatttacgcttataggcatcttttttcacagcattggatttagtagcaccatagcaagtcatcagtttggctgtggctttgaaggtcacgtgtttatttcttttttttggatgtataaaattttgttggagcattaatggcaaaatcgtactggaattagtaaataactcttctaactaactaggagtaaattaaacaggacaacaatgccaaacggagccataatctagggaggttctttggggacatgttccagggaaaccttgaatctgttgcagcagtaaccgttgtgttaatatcttttgtgtgtgaatgtagatcatttatctccctgctatggatggacatagaccatctccccccgttatgatattacaattcttttttctttgcttcaggttccaatgtttgaaaacatggatgatcaactcttgaatgccttgtgcgaccgcctaaagcctgttctttatacagaaggtagctgcataattcgtgaagaggatccagtaaatgaaatgctgttcatcatgagaggtaatctcatgagtatgacaacgaatggtggaagaactggcttcttcaactctgatgttttgaaaggtggagatttctgtggcgaagagctcctgacctgggctcttgaccccacgtcagtttccagcctccctagctcaaccaggacagtgaagacgatgtccgaagtcgaagcttttgccctgagggctgaagacttgaagtttgtggccacccagttccgacggctacacagcaaacagctccagcacacgtttaagttctactcgcagcattggagaacctgggcagcctgtttcatacaagcagcctggcataggtactgcagaaagaagatcgaagactctctacgcgagaaggagaagaggttgcagttcgcaatcgttaatgacggtgctacaactctcagcttcagggcagcgatatatgcttcgcgtttcgctggcaacatgatgcggatcttgaggagaaatgccacccgcaaggctcggttgaaggaaagtgtgcctgcaaggttgttacaaaaaccagcagaacccaactttgctgcagaagagcagtagttctgtttaccacgaatgcgtaaggaattttttgtgcatggcttgtgcattttttacttgctgatgtttttgctttcagttgacactagacctacaaattaaggagaggaaaaaatcgcaataggtgtctgtatctttctgtaagatctgtatatgtgttcgtgtatgataataggtgatacgtgtaattattattcatcaggtgtttatatacaaattgtgtttatagtagtgtagtgagcattccatcccgtgttcccatcaggctcttgaagtccaggcacggagcaagatcacattgtaacggagacacttgttttaactcacatatattgacatgatatagaattaatggattgtt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
