BGIOSGA035370
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA035370 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035370, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0528200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035370-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035370-PA |
| Length |
5839 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:15944487..15950325 |
| Sequence Coding Region |
15944487..15945770,15946815..15947386,15947459..15947678,15949006..15950325 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:15944487..15950325 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:15944487..15950325 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCCCTCCGGATCCGGCCCTCGCCACGGCCGCCTCCTCATCTCCCCGTCGCTCTCCTCCCCGACCTTCTCCACCAGCTCCCCCTCCCGCTCCCCCGCCCCGCACCACGACCGCCGCAACTCCACCTCCTCGCCGCAGCCGCTCCTCCCCTTCCCTTCCCCTTCTTCCTCCAGGTCCGGCGGCGGCGGAGGCGGAGCAGCCGGGGGCCCGCGCGCCGCGGGGGCGTTGCCCTCCGCGTCGCAGCCGGCGTTCGCGCACAACGCGCGGGTGGCGGCCGCGCTGGCCCCCGCGGCGGCGTTCCTGCTCGACCTCGGGGGGCTCCCGGTGTTCGCCGTCCTCGCCGTCGGCCTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGACGCGCTCCGACAGCGGCAGGGGGCCTTCTTCACCGTCTGGGCCGCGCTCATCGCCGCCGACGTGGCGTTCTTCTTCTCGGCCTCGCTCTCGTCGGCCGCGTCCGCCTCGGTGCCGCTCACCGTGCTCGCGCTCCTCCTCTGCGCCGAGACGTCCTTCCTCATCGGCGTCTGGGCGTCGCTCCAGTTCCGCTGGATCCAGCTGGAGAACCCGACCATCGTCGCCGCGCTCGAGCGGCTCCTCTTCGCGTGCGTGCCCATCGCGGCGCCTGCGATCTTCACGTGGGCTGTTGTATCCGCGGTCGGCATGGCCAACGCCTCCTACTACCTTGCCACATTCTCCATGGTGTTCTACTGGTTGTTCTCCATACCACGGCCGTCCAGCTTCAAGAACCGAAAGCAGGATGCTCCGTGGCAGGATACCGATGGCATTCTTGGCCCCTTGGAGAGCTGCGTGCATGCTTTGTACCTGTTGTTCGTGCCAGTGTTGTTCCATGCTGCATCGCACCATGCTACGCTCTTCGCGTCATGGGCCAATGTGTGTGATCTGCTGCTGCTGTTCTTCATACCGTTCTTGTTCCAACTCTATGCGTCTACACGAGGTGCCTTGTGGTGGATTACCAGAGATGCACGCACAATGGATCAGATAAGGATGGCAAATGGCTTGGTTGCGCTGGTTGTAGTGGTGCTTTGCCTTGAGGTTCGAGTTGTATTTCACTCGTTTGAGAGGTATATTCATGCTCCACCACCTCTGAACTACCTGCTTGTAACGGTCACGATGCTTGGCGGTGCTTTGGGTATGGCAGCACATGCTGCGGGCAAGGTTGGAGATGCTGTTAGCTCGGTGGCCTTTACCGGGTTGGCAGTGCTTGTCAGTGGAGCAGGTGCTATAGTCATCGGATTCCCTATTATGTTCCTTCCACTTCCAATGATTTCTGGCTATTATGCGGCAAGGTTCTTTACTAAGAAAAGCTTATCATCATACTTCACCTTTGTAGCAATAGCAAGCATGATGGTCCTTTGGTTTGTAGTCCATAATTATTGGGATCTGAATATATGGATTGCTGGCATGCCATTGAAGTCATTCACCAAGTATGTTGTTGCAGCCGTAATCATGGCAATGACTGTTCCTGGTTTGGCGCTTCTCCCAACGAAACTGCGGTTTCTTGTAGAACTTGGTCTTACTGGTCATGCATTATTGATATGCTACATCGAGAACCGATTGTTCAACTATGCTACGATGTACTACTTTGGATTTGAAGATGATGTCATGTATCCTAGCTATATGGTTTTGTTTACAACCTTTCTCGGATTGGCTCTGGTAAGGAGATTATCTGTTGATCAGAGAGTTGGGCCAAAAGCTGCTTGGATCTTGACTTGTCTTTATTCTTCAAAATTATCAATGTTATTTATCACATCAAGATCGGTGCTATGGGTTTCAGCGGTTTTGCTACTTGCTGTCACTCCCCCCTTGCTTCTTTACAGAGACAAGTCCAAAGGGGCTTCAAGGATGAAAGTCTGGCAAGCTTATTTCCATGCATCTGTAGTAGCCTTTTCCGCATGGCTCTGCCGGGAAACAATCTTCGAAGCTTTACAGTGGTGGAATGGAAGGCCTCCTTCAGATGGCCTACTTTTGGGTTCCTATATTCTGTTGACAGGTCTTGCTTGCATACCAATAGTCGCTCTCCACTTCCCTCATGCTCAGTCAGCCAAGAGATTCCTAGTGCTTGTTGTGGCTACAGGGCTTCTTTTTGTTATCATGCAACCACCTATTAAACTTTCATGGGTATACCGGTCAGAGTTTATCAAAGCTGCACATCTATCTGATGATGACACTTCAATATATGGTTTTATAGCATCCAAGCCCACATGGCCATCATGGCTGCTGATTGCAACAGTGGTACTGACATTAGCAGCAGTTACATCCATTATCCCTGTGAAGTATGTTGTTGAGTTGAGGGCTTTGTATGCATTGGGGGTTGGAATTACACTTGGCATCTACATATCTGTTCAGTACTTCTTCCAGGCAGTTGTTCTGTATCCTCTTCTTGTTGCAACAATTGTCTTGGCTGCTGTCTTTATAGTATTCACTCATCTGCCATCTGAATCCAGCACAAGGGTTTTGCCATGGGTGTTCTCTTTCTTGGTAGTTCTATTTCCAATCACATATCTTCTTGAAGGGCATCTAAGAGCTAAAAATTTTGTGGATGATGAGGAAGCAGAGAACTTCACCAACATGTTGGCTATAGAAGGGGCCAGAATGTCACTTTTGGGTCTATATGCTGCCATTTTCATGATTATTGCATTAGAAATTAAGTTTGAACTGGCTTTGCTATTGCGTGAGAAAGCTGCAGACAAAGGTGTAACACATGGTCCACCTGGTCGGAGTTCTGCCTTTCCACCAAAGGCAAGGCTACTTCAGCAGCGAAGAGCTCATGCTGCGCCAACTTTCACTATCAAGAGATTGGCAGCAGAGGCAGCTTGGATGCCTGCAATTGGCAACTTTTCAACTGTGCTGTGCTTCATCATCTGCCTTATTCTCAACGTTACTCTTACCGGTGGCTCAAATCGTGCTATTTTCTTCCTGGCGCCTATCCTTCTGCTCTTGAACCAGGATTCAGATATCATTGCAGGATTTGGTGACAGGCAACGTTACTTCCCTGTAACAATCTCCATTTCTGTTTATTTAGTATTGACAGCATTGTATCGTTTATGGGAGGAGACTTGGCCTGGCAGTGGCGGGTGGGCACTTGATATTGGGGGCCCAGGCTGGTTCTTTGCTGTGAAAAACGTTGCCCTTCTCATGATGACATTACCTAATCACATACTCTTCAATCGCTTCATGTGGGATTATGTCAGGCAGACAGATGCGAAGCTACTTCTGACACTGCCCCTCAACTTGCCATCAATTATAATGACAGACATACTTACTGTGCGGGTACTAGGACTGTTAGGTGCTATTTATTCTCTATCACAGTATGTTATATCAAGGCGGATAAGACTTGCTGGGATGAAATACATTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPSGSGPRHGRLLISPSLSSPTFSTSSPSRSPAPHHDRRNSTSSPQPLLPFPSPSSSRSGGGGGGAAGGPRAAGALPSASQPAFAHNARVAAALAPAAAFLLDLGGLPVFAVLAVGLAAAYLLDALRQRQGAFFTVWAALIAADVAFFFSASLSSAASASVPLTVLALLLCAETSFLIGVWASLQFRWIQLENPTIVAALERLLFACVPIAAPAIFTWAVVSAVGMANASYYLATFSMVFYWLFSIPRPSSFKNRKQDAPWQDTDGILGPLESCVHALYLLFVPVLFHAASHHATLFASWANVCDLLLLFFIPFLFQLYASTRGALWWITRDARTMDQIRMANGLVALVVVVLCLEVRVVFHSFERYIHAPPPLNYLLVTVTMLGGALGMAAHAAGKVGDAVSSVAFTGLAVLVSGAGAIVIGFPIMFLPLPMISGYYAARFFTKKSLSSYFTFVAIASMMVLWFVVHNYWDLNIWIAGMPLKSFTKYVVAAVIMAMTVPGLALLPTKLRFLVELGLTGHALLICYIENRLFNYATMYYFGFEDDVMYPSYMVLFTTFLGLALVRRLSVDQRVGPKAAWILTCLYSSKLSMLFITSRSVLWVSAVLLLAVTPPLLLYRDKSKGASRMKVWQAYFHASVVAFSAWLCRETIFEALQWWNGRPPSDGLLLGSYILLTGLACIPIVALHFPHAQSAKRFLVLVVATGLLFVIMQPPIKLSWVYRSEFIKAAHLSDDDTSIYGFIASKPTWPSWLLIATVVLTLAAVTSIIPVKYVVELRALYALGVGITLGIYISVQYFFQAVVLYPLLVATIVLAAVFIVFTHLPSESSTRVLPWVFSFLVVLFPITYLLEGHLRAKNFVDDEEAENFTNMLAIEGARMSLLGLYAAIFMIIALEIKFELALLLREKAADKGVTHGPPGRSSAFPPKARLLQQRRAHAAPTFTIKRLAAEAAWMPAIGNFSTVLCFIICLILNVTLTGGSNRAIFFLAPILLLLNQDSDIIAGFGDRQRYFPVTISISVYLVLTALYRLWEETWPGSGGWALDIGGPGWFFAVKNVALLMMTLPNHILFNRFMWDYVRQTDAKLLLTLPLNLPSIIMTDILTVRVLGLLGAIYSLSQYVISRRIRLAGMKYI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..1284#2329..2900#2973..3192#4520..5839#ATGGATCCCTCCGGATCCGGCCCTCGCCACGGCCGCCTCCTCATCTCCCCGTCGCTCTCCTCCCCGACCTTCTCCACCAGCTCCCCCTCCCGCTCCCCCGCCCCGCACCACGACCGCCGCAACTCCACCTCCTCGCCGCAGCCGCTCCTCCCCTTCCCTTCCCCTTCTTCCTCCAGGTCCGGCGGCGGCGGAGGCGGAGCAGCCGGGGGCCCGCGCGCCGCGGGGGCGTTGCCCTCCGCGTCGCAGCCGGCGTTCGCGCACAACGCGCGGGTGGCGGCCGCGCTGGCCCCCGCGGCGGCGTTCCTGCTCGACCTCGGGGGGCTCCCGGTGTTCGCCGTCCTCGCCGTCGGCCTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGACGCGCTCCGACAGCGGCAGGGGGCCTTCTTCACCGTCTGGGCCGCGCTCATCGCCGCCGACGTGGCGTTCTTCTTCTCGGCCTCGCTCTCGTCGGCCGCGTCCGCCTCGGTGCCGCTCACCGTGCTCGCGCTCCTCCTCTGCGCCGAGACGTCCTTCCTCATCGGCGTCTGGGCGTCGCTCCAGTTCCGCTGGATCCAGCTGGAGAACCCGACCATCGTCGCCGCGCTCGAGCGGCTCCTCTTCGCGTGCGTGCCCATCGCGGCGCCTGCGATCTTCACGTGGGCTGTTGTATCCGCGGTCGGCATGGCCAACGCCTCCTACTACCTTGCCACATTCTCCATGGTGTTCTACTGGTTGTTCTCCATACCACGGCCGTCCAGCTTCAAGAACCGAAAGCAGGATGCTCCGTGGCAGGATACCGATGGCATTCTTGGCCCCTTGGAGAGCTGCGTGCATGCTTTGTACCTGTTGTTCGTGCCAGTGTTGTTCCATGCTGCATCGCACCATGCTACGCTCTTCGCGTCATGGGCCAATGTGTGTGATCTGCTGCTGCTGTTCTTCATACCGTTCTTGTTCCAACTCTATGCGTCTACACGAGGTGCCTTGTGGTGGATTACCAGAGATGCACGCACAATGGATCAGATAAGGATGGCAAATGGCTTGGTTGCGCTGGTTGTAGTGGTGCTTTGCCTTGAGGTTCGAGTTGTATTTCACTCGTTTGAGAGGTATATTCATGCTCCACCACCTCTGAACTACCTGCTTGTAACGGTCACGATGCTTGGCGGTGCTTTGGGTATGGCAGCACATGCTGCGGGCAAGGTTGGAGATGCTGTTAGCTCGGTGGCCTTTACCGGGTTGGCAGTGCTTGTCAGTGGAGCAGGTGCTATAGTCATCGGATTCCCTATTATGGTACGTTGCAGTCTTATGGTGTCCTCTTGTGGTACTTGCAAATTTATCATCGGATTTCGTTTTTTCTTATGCTTGTAGCTGTATGTTAATCTTAGTCACTGACCAATGTGTTTCAAGGTGACACTTGGATAATTTACAGTTGACTTTATTCTATTCATGTATTTGCTTGGTCTTTGGTATGGATGATCTAAGTTCTCAGAAGTCGTTGGTTCTGGTGTTCCATCTGTTAAATTGATTAGAATTTGAGAACTCATTGCGTAACAACAATCTTTTAAAAGCTACTATGGGAAGTTATTGTAGCTGTATCTCAATCATTGTTAACTGTGGAAACAGTGTTACCAATGTCTCAATTAACATTAATTGTGGCGTTGTGATCTCATATTGGTTCTCTAGTACATGGCAATAGCTGGCTGTGCATGCTCTCCAACTATATACTCCTTTCTGAGTTGATATTGTTCTCCCTGAATTTGTCTACTCAAGCTGGTGTGATTTTAGTTTTTATACAGAAATGCTGTACCCGAATCCATATATTCCTATTGTGACACTCCTCACCCCTACTGCCTACAAACCTTGGGTAACTTTGCTCCTAAGTATACCATGATTGTGAATTTGTGATGATTCTCTTGAGTCCTTAGCTATTGTTAAGATTTAGTCAGTATTTCTATTTCAGGGTAATTCTAGCAAGCTTTGCATGTTCATAATTTCCCATGCTTGAAAAGGAAACTTGCATACACACACATGAGCGTAGTCTTATTTAACATCATAAAAATGACGTTCTTGCTAGACTTCAGGTGCTTAAATATTCATAATGAAACATGTTCCAAAGTGCATGGGCATCATGAGAATTCTGATTGTTGTAGAATAGCTGTCTCACTTCCCTTTGACCGACTGTGGTCTTGAGGCAGTAGTCTGCCCATAGATTTTCTTCTATTGTGGTTGTCCTACCATACCCTCGAATATGCAGCATCAGCATAAAAAGTTATTACGTAGCATTTTTATTTTTGATCACTCTATACTTATTTCTGTGAATTAATCTTCTTGCAGTTCCTTCCACTTCCAATGATTTCTGGCTATTATGCGGCAAGGTTCTTTACTAAGAAAAGCTTATCATCATACTTCACCTTTGTAGCAATAGCAAGCATGATGGTCCTTTGGTTTGTAGTCCATAATTATTGGGATCTGAATATATGGATTGCTGGCATGCCATTGAAGTCATTCACCAAGTATGTTGTTGCAGCCGTAATCATGGCAATGACTGTTCCTGGTTTGGCGCTTCTCCCAACGAAACTGCGGTTTCTTGTAGAACTTGGTCTTACTGGTCATGCATTATTGATATGCTACATCGAGAACCGATTGTTCAACTATGCTACGATGTACTACTTTGGATTTGAAGATGATGTCATGTATCCTAGCTATATGGTTTTGTTTACAACCTTTCTCGGATTGGCTCTGGTAAGGAGATTATCTGTTGATCAGAGAGTTGGGCCAAAAGCTGCTTGGATCTTGACTTGTCTTTATTCTTCAAAATTATCAATGTTATTTATCACATCAAGATCGGTGCTATGGGTTTCAGCGGTTTTGCTACTTGCTGTCACTCCCCCCTTGCTTCTTTACAGGTATACCACAACATCATGTTCTAATTGAGTGTTTTGACTTCTTTATATAACATTCTTCCCTGTACCTTCCAGAGACAAGTCCAAAGGGGCTTCAAGGATGAAAGTCTGGCAAGCTTATTTCCATGCATCTGTAGTAGCCTTTTCCGCATGGCTCTGCCGGGAAACAATCTTCGAAGCTTTACAGTGGTGGAATGGAAGGCCTCCTTCAGATGGCCTACTTTTGGGTTCCTATATTCTGTTGACAGGTCTTGCTTGCATACCAATAGTCGCTCTCCACTTCCCTCATGCTCAGGTATTTGATGCTTACCCCTTTGTTGTAAAAATATCGATCTCCTCATAATCATATTTGTTATTATCTGTTCGTGATCTGCTCTGTACTTTTGCACTGAAATTCTTCAAGTTTGCCGCCTTAACAAATTCCCTAGTGAGGGTTTGCTTCCCAGTGGTTATAGATGGCCCACTGACTTAAAACACTTTGAGGTTGAGGTTCTGTGGAATTTTAAATGATGACATCAATTGTCAGCTCCAGATTACATGCAAGCTTATTTACCTTCTTGAGGGTATCATGTTGGTTGACATTGCTTTGGGGACACTACTTGCTAAAGAACATTAGATGCAAACATTAGATGATAATATGCCCAATACATGCTACACACTGGTAGGATTCAAGCTAACCTTTTTTGGTTGGACAACCTTGATTTTGGTAAAGTTTTATTAAGTTCCATATGTTGGATTTCATTTTAGGTTATCTTTTTAAAAAGTTTTTGAAGTGATCCTACTCGTAAGTTTTATTATCATGCCCATAATGTTAAAAATTATTTTAGATTGGTCTAAGGCTTTGCTTGCACGGACTGCACTGTTTGAAGCACTTTTACTTACTGAATACTGATCACTAGCTAAATGCCTATGCTTCTCTATGGATAAAAGAAAATATGCCATAATATTGCCTAAAATAAATGTATTCTTTTTTTGCTTCAGGCATGTTACTCGCTTGTTTGCTATAGGCTGTGCTCACCTTGATCATATATATGTGGCAACCCATTTATTTTTAACTATTCTGTAATAGAAAAAAAGAGTATCAGGGCGCAATTTATAAAAGCTGGAGAGAATATATGTATGGATGAACTTTGAAAGGAGTATAGATGAACTTACTCCCTCTGAACACCCCCCCCCACCCCTCCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACCAACCTAGTATGGGATGGGGCATAATCTAGTACAACGATGTAGACATGCTCCTGTCCAGATTCATTATGTTCTATCTCGTACTAGGTTGGGTTTTTTTTTGGGACGGAGGGAGTACAGGTTTATACCTGAAGTTATGATGATGCTTGGATCCTCATGTGTTAGTTTTGCTTTTCTCATATGTGTAGTCGGTATTATTCATATTAGAAAGCATATTATTCAGTGTTTACAGTACCTGTTTAGCAGGAAGCACCTTCATTTTGAAATATTTAAATTCAACATTTTGCTGCCCCTATATTTGTTACTTGTTCTTTTCCTTTCTCATGTTGAAGTGTCAAACTTTTGGTAATGTGAACGTTACAAGGTATTTTGGAGCTGCTACAATTGATTCTATGTTACGATTTGTTTGCAGTCAGCCAAGAGATTCCTAGTGCTTGTTGTGGCTACAGGGCTTCTTTTTGTTATCATGCAACCACCTATTAAACTTTCATGGGTATACCGGTCAGAGTTTATCAAAGCTGCACATCTATCTGATGATGACACTTCAATATATGGTTTTATAGCATCCAAGCCCACATGGCCATCATGGCTGCTGATTGCAACAGTGGTACTGACATTAGCAGCAGTTACATCCATTATCCCTGTGAAGTATGTTGTTGAGTTGAGGGCTTTGTATGCATTGGGGGTTGGAATTACACTTGGCATCTACATATCTGTTCAGTACTTCTTCCAGGCAGTTGTTCTGTATCCTCTTCTTGTTGCAACAATTGTCTTGGCTGCTGTCTTTATAGTATTCACTCATCTGCCATCTGAATCCAGCACAAGGGTTTTGCCATGG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