Os06g0538000
| Gene Name |
Os06g0538000 |
|---|---|
| Description |
Similar to T-complex protein 1, gamma subunit (TCP-1-gamma) (CCT-gamma) (Matricin) (mTRiC-P5) |
| Version |
NM_001064331.1 GI:115468393 GeneID:4341219 |
| Length |
6933 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0538000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:21035672..21042604 |
| Sequence Coding Region |
21035768..21035798,21036131..21036192,21036564..21036636,21038115..21038182,21038319..21038388 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MALNAPVLVLKDSLKRESGTKVHHANIQAAKAVADIIRTTLGPR SMLKMLLDASGGIVVTNDGNAILREIDIAHPAAKSMIELSRTQDEEVGDGTTSVIVLA GEMLHVAEAFIDKHYHPTVICRAYTKALEDALAVLDKIAMHVDVNDRAAMLGLVKSSI GTKFTGQFGDLIADLAIDATTTAGVDLGQGMREVDIKKYIKVEKVPGGQLEDSRVLKG VMFNKDVVAPGKMRRKIVNPRIILLDCPVEYKKGENQTNAELMKEEDWQVLLEMEEEY IKNLCAQILKFKPDLVVTEKGLSDLAIHYLSKAGVSAIRRLRKTDNNRIAKACGAVIV NRPEELQESDVGTRAGLFEVKKIGDEFFTFIVDCKDPKACTVLLRGASKDVLNEVERN LQDAMSVARNILKNPKLLPGGGATELTVSAALKQKSSSVEGVEKWPYEAAALAFEAIP RTLAQNCGLNVIRIMTQLQGKHANGENAWVGIDGRSGDIVDMKERKIWDSYSVKAQTF KTAIEAACMLLRIDDIVSGIKKKQAPGASAPKQPQIEQEGDADNEQMIPE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>97..127#460..521#893..965#2444..2511#2648..2717#3060..3128#3217..3288#3399..3472#3572..3849#3956..4340#4420..4545#4735..4839#6192..6266#6354..6542#tcgatcccccgcggcgcctcacccccttcctctcccttgccgcctctcgcccccactccgccgccgccgccgcctcgcctcccgcgggatcgcgccatggcattgaacgcccccgtcctcgtgctgagtaagcgcgcccccctccccttcccctgctctccctccctccccgtggctagggttatggcccctcccgcgtttcccgcctcggatcttttccataggaaacggtggttgtttcgtgccttctaggttttcgatttggtggtgtctgtttgacacccccctcccctcgtgtggtggggggtttacctgatctcttggtgtgaacccgagatttggttttggtgttatggttttgttaggtttttgtcattctgatctgatccctgtcgcttccgtttatgcgggaacttctctctgattttgttttgtttttttttgttttgatttgagcagaggactcgctgaagcgggagtccggcacgaaggttcaccatgccaacatccaggccgccaaggtgaggacagactcttataagctttttatatactgtctagatgtggtgaagttgttttttttattgtactgtaggtgataattatcacacagtcaattaggggtaaccggtgctaaacaagatgtcagattatttttgttatacccttctttggacagcacatagtaggtgttttagatgtaggcatatgtagcaacttaagctgtttttgtgattgttgcgacccaaccattgcttttgcattattttctgttttagattaaaattttaagacctagctggctgtctggctagctgtaaaaattgttaattttgagaacagaaatgaattttcctgtcacttggtaaaaccgtgatcaattgctctgcaggctgtggcagacatcatccgtactacactcggtcctcggtccatgttgaagatgcttctggatgcttctggaggtgctgtctgaactctaatctagtgtataaacacttcagtattgcacttttcacggtgcacacttgatgattatttacttgtattgaataagctttggtacagttgtgcttcattctattgtatatctgttaatttttgtgtcggcccactcataatgctagcctgccatagccttttcagaggaatacgttatgtttaaacacaagacactagattcccactatttaccactgaaagttgggtgtatacacagatatccttccgaagggcacagccacgaataagttactaatccaaatttgttctttattgtgtatctgtgtaaaaatccctccctagtcaatatgttggctctatatgtttgatgttacgttctgatgcaagagcagttggattaaattaactcacttattaaagttgacattggctaattgttttttatttgtacatttatttattacctactcaattatcccatagactactactcaatcctcccatagactaatgtgcttcctaagtaatacaaatcaggatcagtgtctttcacaaagtatttgacagatctcgattgctgtagacatacataatattttggccatattgctgtaataaatgggcttttcataaccttttctaaatcttcacaggactagaatttgtaaataaaatttgtcgctaacatattaactgtgttttaaccttttttgagccgtgccaacatcgtaaatgcatttgcaaattgcaacaacataaaactgcacatgtttgaagaaaccatgccaagatgcctatttctaagttactaaaccaatgcttgaaaattatgcctgcattctcacttccacaaagactagttccaccgatgtttgaattggattgccactagatgtctcacgtgaagagcagcattaattattttgtcgcttgcacacaatgatttttactcagcttttacacctttatgtatggaaatggcttgtttttttattttttctctatattttcacatcaatgatctttccttcacttttctacttttgttttttaaaaaaagtgaaaacagtagttgagtgtcacttgttgcttatattaaccataactagtattaatgatgaccatcgtttactcaaaaaagttgagtctcttctgggcaatgacaaagcagttcagccatgttgcatgtgatccttttgaactggttttactcaatggataacccaaacaggcttttgcaccacattattaggtcacttgcatacttttgtttatgccatttgcaacttgcgccttcatttgtatatagctttttaagaaaattatcgtgagtacttttgtgcagtacattatgctgagaacggagatagaagataattcattttctatctcatcaccttggaggcatttctgttttcacatttgcaattttcctggttttacaaggttcattgtatttgggttctttctgtttttgcaggtattgtggttactaatgatggcaatgctatattgcgagaaatagatattgcacatcctgctgccaaggtatgtggaacgttagatgttttctctctgttgagtactactgatgaaattattagtctgatgtgttaaattgccaatattttctgctaatgtatgaattagtacttaatctaactttcttgtcactctttggcagtctatgattgagctaagccgtacacaggatgaagaagttggtgatggcacaacatctgtcattgttttaggtatgtgttccctgattcattcagtttcattcagttttatttaaatgtcatatgagatcgcaacactaggatatcgtgacatctctttctggtcgaactaaaacacttggctattactatgagctgcaaagtcatcaataaacgtctgtggcaactgtcaaggaaagttagcaaaccccactgcaaattttaagctaactctgcatgattaagtaagattattttggtgtgttaggggtagaatagcaataacttgtaggtgctccatcagatcaatgtgagcaactttgttggattttatcattttcttctgatgcactaactttaattattattttttagctggtgagatgctccatgttgcagaagcattcattgataagcactaccacccaactgttatttgccgaggtattgcttgatcattgtatcagatggtgttatttcctttgttgattttttagtctgttctgaaacatttagtgtctctcattttcagcatacaccaaagctcttgaggatgctttagctgtccttgacaaaattgcaatgcatgttgacgtgaatgaccgtaagtatatgtcaagcttattacaaatattgcaaattttagtttggagaatctatgtatcgtcttctgtgtttttgttactgatttgagtgagatgtaccataatgcaggtgctgctatgctagggctagtgaagagctctattggtacaaaattcacgggtcagtttggtgaccttattgctgtaagtatttcttttattcaagatttgagtgccacacaacttctcggttaagtgtgttcagtttatagtttatctgacgtcttgttgtactatgctcaggaccttgctattgatgctactacaacagcaggtgttgacctaggtcaaggtatgcgtgaagttgatatcaagaaatatatcaaagtggagaaggttcctggtggtcagttagaggattcacgggttcttaaaggagttatgttcaataaagatgttgtagctcctggaaaaatgagaaggaagatagtcaacccccgcattatccttctggattgccctgttgagtacaagaaaggagaaaaccagaccaatgctgaactgatgaaggaagaagattggtaagggatggataaattcaaatgttttgccaatttgaattgttgaactattgtggtgctattgaagcaatgtagcatggaataatttgtaaatatgctatttcaggcaggttctgctagagatggaggaagaatacataaagaacctctgtgcgcagattttaaaattcaagcctgatttagttgtcacagagaaaggtctcagtgatcttgctatccattacctaagcaaggctggtgttagtgcaattcgtaggctaaggaagactgataacaacaggattgctaaggcttgtggagcagtcatagtgaacaggccagaggagcttcaagaatcggatgttggaacaagagctggcctctttgaggtcaagaagataggtgatgaattctttaccttcattgtcgactgcaaagatcccaaggcatgcactgttcttttgaggggagcaagcaaggatgtcctgaatgaggttgagaggaaccttcaggtatttgttaatgttcctgtggtacctgtaattttgcatgccatgttcaccaataaccatttcttattctttttgacaggatgccatgtctgttgcaaggaacattttgaaaaacccaaaacttttacctggaggtggtgctaccgagctgactgtatcagcagcactgaagcaaaagagttcttcagttgaaggtgtagaaaaggtactttttcagcatatttttatgttagtgatttaaaaggttagcaaagtgttctcataaagaggtgcttgcctatttgtatgtttgtctaagtcattcatcaatgcagcattcattagtttttttaatggctactttctgttttgtgactatgttatatcttatttatattttgtttgtttggatcagtggccctatgaagctgctgctttagcatttgaagcaattccaagaactttggctcaaaattgtgggttgaatgtcatcaggataatgacacaactccagggaaag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