BGIOSGA035823

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA035823

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035823, complete gene.

LocusTag

OS12G0617900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA035823-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA035823-PA

Length

7892

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:21927220..21935111

Sequence Coding Region

21934682..21935111,21933693..21933753,21933444..21933522,21933283..21933362,21933105..21933199
,21932904..21933003,21932311..21932380,21931630..21931731,21931444..21931525
,21930857..21931036,21930082..21930355,21929707..21929950,21929335..21929505
,21928888..21929126,21928497..21928581,21928301..21928399,21928021..21928220
,21927857..21927932,21927630..21927765,21927404..21927543,21927220..21927306

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:21927220..21935111 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:21927220..21935111 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGACGTGGACTCGAGGATGACGACGGAGTCGGACTCCGACTCGGACGCCGCGGCGCAGGGGGGAGGAGGAGGAGGGTTCGGGAGCGAGACCTCCTCGGCGTCGCCCTCGGCGCCCGGGACGCCGACGGCTATGGGGGCAGGAGGGGGAGCTGCTCCTATCGCTGCTGCTGCTATCGCTGCCGCCGCGTCGGCGGCGGTGGTGGCGGGCCCGAGGCCCGCGCCGGGGTACACGGTGGTGAACGCGGCGATGGAGAAGAAGGAGGACGGGCCCGGGTGCCGGTGCGGCCACACGCTCACCGCGGTGCCGGCCGTCGGGGAGGAGGGCGCGCCGGGGTACGTGGGGCCGCGGCTGATCCTCTTCGGCGGTGCCACCGCGCTCGAGGGGAACTCCGCCACGCCGCCATCCTCGGCCGGGAGCGCCGGAATCCGTCTTGCTGGTGCTACTGCGGATGTGCACTGCTACGATGTTTCATCGAATAAGTGGAGCAGGCTTACTCCAGTTGGTGAACCTCCTTCACCAAGAGCGGCACATGTAGCGACTGCTGTTGGCACCATGGTGGTCATTCAGGGTGGGATAGGTCCTGCTGGTTTATCTGCAGAAGACCTTCATGTTCTGGATCTTACACAACAACGACCGCGATGGCACAGAGTGGTGGTTCAAGGGCCTGGCCCTGGTCCTCGATATGGACATGTGATGGCTTTGGTTGGGCAGCGTTTCTTGTTGACAATCGGTGGAAATGATGGGAAGAGGCCCCTGGCTGATGTGTGGGCCCTTGATACAGCAGCTAAGCCATATGAGTGGAGGAAACTTGAACCAGAAGGTGAAGGACCACCCCCATGCATGTATGCAACTGCAAGTGCCCGTTCTGATGGACTTCTATTACTCTGTGGTGGGAGGGATGCTAATAGTGTGCCCCTAGCAAGTGCATATGGCCTTGCAAAACACAGGGATGGACGCTGGGAGTGGGCAATCGCCCCTGGTGTCTCTCCATCACCCAGATATCAACATGCAGCTGTTTTCGTCAATGCACGACTTCATGTCTCAGGAGGGGCCCTTGGAGGCGGTCGCATGGTTGAAGACTCCTCAAGTGTTGCAGTGTTGGATACTGCTGCTGGAGTGTGGTGTGATACAAAATCAGTAGTTACTACTCCAAGGACAGGAAGATATAGTGCAGATGCTGCAGGCGGTGATGCTTCTGTAGAGCTTACACGACGGTGCAGGCATGCAGCTGCTGCAGTTGGTGATATGATATATGTTTATGGAGGTCTACGGGGAGGTGTGCTGCTAGATGACCTTCTTGTTGCCGAAGATCTTGCTGCTGCTGAAACAACAAATGCAGCAAATCAGGCAGCTGCAATTGCTGCAGCCTCTGACATACAAGCTGGAAGAGAACCTGGTAGGTATGCCTACAATGATGAACAAACAGGGCAGCCAGCTACAATAACATCTCCTGATGGAGCTGTGGTTCTTGGAACTCCAGTTGCTGCTCCCGTTAATGGGGACATGTATACTGATATTAGCCCTGAGAACGCTGTGATCCAGGGACAAAGGAGAATGAGCAAAGGTGTTGATTATTTGGTTGAAGCATCTGCTGCAGAGGCTGAGGCAATCAGTGCTACTTTAGCTGCTGTAAAAGCTCGGCAAGTTAATGGTGAGGCAGAGCATTCACCTGACAGGGAGCAGTCTCCAGATGCCACACCAAGTGTGAAGCAAAATGCAAGCCTGATAAAACCAGACTATGCTCTTTCAAATAATTCAACACCACCTCCTGGGGTTCGGTTACACCATAGAGCAGTTGTGGTAGCAGCAGAAACCGGAGGTGCCTTAGGTGGCATGGTTAGGCAGCTCTCAATTGACCAGTTTGAAAATGAAGGAAGAAGGGTCATCTATGGCACTCCTGAGAGTGCAACTGCAGCAAGGAAGTTGCTAGATCGGCAAATGTCTATTAATAGTGTACCTAAAAAGGTAATTGCATCCCTCTTGAAACCTCGTGGTTGGAAGCCCCCTGTGCGAAGGCAGTTCTTTTTGGACTGCAATGAGATTGCAGACCTATGTGATAGTGCGGAAAGAATATTTTCAAGTGAACCAAGTGTCCTACAGCTTAAAGCTCCAATTAAGATATTTGGTGATTTGCACGGTCAATTTGGTGACCTAATGCGCTTGTTTGATGAGTACGGTGCTCCTTCGACAGCTGGAGACATTGCTTACATTGATTACCTCTTCTTGGGAGATTACGTGGATCGTGGTCAGCATAGTTTGGAGACAATCACTCTTCTCCTTGCACTTAAGGTTGAATATCCTCTTAATGTACATTTGATTCGAGGGAATCATGAGGCCGCTGATATCAATGCTTTGTTTGGGTTCCGAATAGAGTGCATAGAGCGAATGGGTGAGCGTGATGGGATCTGGACCTGGCATCGCATGAATAGGCTATTTAATTGGCTTCCTTTGGCTGCCCTAATAGAGAAGAAAATAATATGTATGCATGGTGGTATTGGCCGGTCTATCAATCATGTTGAACAAATTGAGAATCTTCAAAGACCAATTACCATGGAAGCAGGCTCGGTTGTTCTAATGGATCTTCTGTGGTCTGATCCAACTGAAAATGATAGTGTTGAAGGACTTAGACCAAATGCCCGTGGCCCAGGCCTTGTTACCTTTGGGCCGGATCGTGTTATGGAGTTCTGCAACAACAATGACTTACAGTTAATTGTGCGAGCACATGAGTGTGTGATGGATGGTTTTGAGCGTTTTGCTCAAGGTCACCTAATCACTCTCTTCTCAGCAACAAATTACTGTGGTACGGCAAACAATGCGGGTGCAATCTTGGTTCTAGGAAGAGATCTTGTAGTAGTTCCGAAACTCATCCATCCTTTGCCGCCTGCCATTACATCTCCCGAGACCTCTCCAGAGCATCATCTTGAGGACACATGGATGCAGGAACTAAATGCCAACAGGCCGCCAACTCCAACAAGGGGCCGCCCTCAAGCAGCAAACAATGACCGAGGCTCTCTTGCATGGATATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDVDSRMTTESDSDSDAAAQGGGGGGFGSETSSASPSAPGTPTAMGAGGGAAPIAAAAIAAAASAAVVAGPRPAPGYTVVNAAMEKKEDGPGCRCGHTLTAVPAVGEEGAPGYVGPRLILFGGATALEGNSATPPSSAGSAGIRLAGATADVHCYDVSSNKWSRLTPVGEPPSPRAAHVATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQRPRWHRVVVQGPGPGPRYGHVMALVGQRFLLTIGGNDGKRPLADVWALDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHAAVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAVLDTAAGVWCDTKSVVTTPRTGRYSADAAGGDASVELTRRCRHAAAAVGDMIYVYGGLRGGVLLDDLLVAEDLAAAETTNAANQAAAIAAASDIQAGREPGRYAYNDEQTGQPATITSPDGAVVLGTPVAAPVNGDMYTDISPENAVIQGQRRMSKGVDYLVEASAAEAEAISATLAAVKARQVNGEAEHSPDREQSPDATPSVKQNASLIKPDYALSNNSTPPPGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVIYGTPESATAARKLLDRQMSINSVPKKVIASLLKPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSSEPSVLQLKAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGAPSTAGDIAYIDYLFLGDYVDRGQHSLETITLLLALKVEYPLNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWTWHRMNRLFNWLPLAALIEKKIICMHGGIGRSINHVEQIENLQRPITMEAGSVVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVMEFCNNNDLQLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAITSPETSPEHHLEDTWMQELNANRPPTPTRGRPQAANNDRGSLAWI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..430#1359..1419#1590..1668#1750..1829#1913..2007#2109..2208#2732..2801#3381..3482#3587..3668#4076..4255#4757..5030#5162..5405#5607..5777#5986..6224#6531..6615#6713..6811#6892..7091#7180..7255#7347..7482#7569..7708#7806..7892#ATGGACGTGGACTCGAGGATGACGACGGAGTCGGACTCCGACTCGGACGCCGCGGCGCAGGGGGGAGGAGGAGGAGGGTTCGGGAGCGAGACCTCCTCGGCGTCGCCCTCGGCGCCCGGGACGCCGACGGCTATGGGGGCAGGAGGGGGAGCTGCTCCTATCGCTGCTGCTGCTATCGCTGCCGCCGCGTCGGCGGCGGTGGTGGCGGGCCCGAGGCCCGCGCCGGGGTACACGGTGGTGAACGCGGCGATGGAGAAGAAGGAGGACGGGCCCGGGTGCCGGTGCGGCCACACGCTCACCGCGGTGCCGGCCGTCGGGGAGGAGGGCGCGCCGGGGTACGTGGGGCCGCGGCTGATCCTCTTCGGCGGTGCCACCGCGCTCGAGGGGAACTCCGCCACGCCGCCATCCTCGGCCGGGAGCGCCGGAATCCGTAATGCCCTTTTAAACCTCAGCTGCTCTTGTTTTCATGTATGGTTTGGGGGGATGGTGTTGGCGTGCTAATTGTTTAGTTTGCTGTCGACGAGAGCCAAACTCCATGGGAGTTGGAATACTTGGGTTTGTACTGAATCTTGCTCGGGACTTTGGAGTGATATGCTGGTTCGCGTACCGACTGATTTAGGGATATAACTTACTGTTCGGGATAGCAGCTAGAGTTGATTGTAGCTCTGGTGTTTCAGTGTCTTAGTTAGAGGTAGAATTCGGAGCATCTGCTGATGGTGGTATTGCTAGTGTAGGCTGGATTAGGTTAAAAACTCGTACTGGGAGGGATTTTCATGTTCTGCCTGGTTAGGAAAGCGATTATGAGTGGCACGTTATGACAATATATGCAGTGTAACTCATGTGCACATGCTGTTAATTGGAGGGCCAAATATGGTGCTCTTTTATGATTTGAGGCACAAGATTTATTTAATGAACAACGATACTCGCATACTTCTGTTGCGGTGAAGTACCAGTTCCTTTTAATGTTTGTTGGTTGTTTCCTTTGGATTATGATTGTCTTTGTATGTTAGAAGAAGCACTCAAAGGTTTCAAATTGGAAAAACATTTATGTGCTTAGACTGTACTGATGCCCTTGGATACCCTAGGGCCTAGGTTAAGGCGTATGGGTTAATTAATTAGGTGAACTATGCCGTTTCAAAAGTTAAGCCTGAAATGCTATTATACGCATTCCGGTTCTCCAAGTCTTATTGGGGGATTAGACGTTTTGGTAGACCAGGTGCCAAATGTATTGTTTCAAAACTGAGCTTAGAAATGTTGGAGGTTTTGCTTGTGATGAAAGGGAAAGTTTATCTTCTTTATAGGCAAATCAGCAAAATTGACAAGATCTTACATAAAATTATCAATCTCCTTTCTTGCAGGTCTTGCTGGTGCTACTGCGGATGTGCACTGCTACGATGTTTCATCGAATAAGTGGAGCAGGTATGTTCTTTTTAGTAAGAGCCTTTTTTAGTAAATGTTTTAATTCCTTTGGATATTATGCTTGGATGCCATGTGTAAGTTTTTCTTTAGATCCCATGAAATTTTATCTCAATTGCACTTGTTAGTTCTGTGCACTACTACATTTGATTGACCACAGTAAATGTTGTCAGGCTTACTCCAGTTGGTGAACCTCCTTCACCAAGAGCGGCACATGTAGCGACTGCTGTTGGCACCATGGTGGTCATTCAGGTAGCTTTAATCTTTTTGCCTTAGAGTAGTAGCTATGTCAGTTTTATCGTCAGGCCAGCACTAACCTGCTCTCAACTACAGGGTGGGATAGGTCCTGCTGGTTTATCTGCAGAAGACCTTCATGTTCTGGATCTTACACAACAACGACCGCGATGGCACAGGTGGCTGCTGCTCTAATTTCGTTTGGGTTTAGAATATGCTTTTGCTGCTATCCCTAGTGAGCATTATCATGTCTTGTATGTAGAGTGGTGGTTCAAGGGCCTGGCCCTGGTCCTCGATATGGACATGTGATGGCTTTGGTTGGGCAGCGTTTCTTGTTGACAATCGGTGGAAATGATGGTAGGAGATTGCTTATGTGCCTATGAAACCTAGATTTTGGCTACTTAAGATATTGTTCCATCCCAAATGATGTTGATACTAAGAGTGAATAAATGTTTCAGGGAAGAGGCCCCTGGCTGATGTGTGGGCCCTTGATACAGCAGCTAAGCCATATGAGTGGAGGAAACTTGAACCAGAAGGTGAAGGACCACCCCCATGCATGTAAGTGTGCAGATAATAAAAAAGGAAACATCTCCCCTTTGAAATCTAGATCAACGAGGTTCTTTGGTGATGTTGAGTTTAAATCTTGCTATTTTCTTGGCAAGATTCCCCAGCTACATCCATGAGCCAACATATGATAATGCCTATATTTTCTAATGAAGCTTTCAGTGATTGTACTTTTGTTTGATGCCCATATCATATATAGTAACCTGTTTTGGCACCATTAGACTACTTTTAGGGCTCCACTTTCTTTTGTTGGCCAAGAAGTTACAGAAAACTTTGGTTATTTACAACTCAATATTGATAGTTTGTTCAAAAGCAACTGCCAATTAAGAACAAGCTACAAGTGTTTCGTTAAGTCTACTTGGATGCAGAACACAGTAAAGTGTCAAACCTAATATCCTAGGGTAACCCACCACTAGCTATTTTCTGTAATTTCACTTACGCTTTTCAATAGATTGCTAGAAGTTGAGATAGTTTTTGTATACTTCTAATAGTCTGTGCCTCTGGTAATGTTGCTCAGGTATGCAACTGCAAGTGCCCGTTCTGATGGACTTCTATTACTCTGTGGTGGGAGGGATGCTAATAGTGTGGTAAGTACCATTCTATTTGTGAATAGCTTTTGCTGAGGAAATTTTGTTCTAATAGGAATATAGGGTTGAAATTCTCTGTTCTTAGTTTTTAGATTTGAATCTGCTCTGAAGTCATAACACGAGAATGGTTCATATAGCTTTTTTGGTAAGTGATATTTATAAGCATTGCATGCTTGTGCCAACAAAGCATATTTATTTTTTCTCATGTTACATCTGCTTCTTTGGATGAGTGAGGAATTGTGATGTTAAGTGCACTGAATCCATATGGCATGCTTGAAAGGCCTGTTTTGTTCAATTTCACTTGTAAAGCCATGCCCTGCAAATAAAAAAAATAGAATCGTCTGGGCTGGAAACTGAATATGGATTCAACCGATTAGTTTTCATTAGATGGTAAGTGATTAGCATTTTGTAGGTGAATTGAAATAAGGATATATATGGACTTTTCTTTTTGGTAATTACGATTTTGGAGAGGCAGTGACTTCTATTTGTATGTCCTACACTGTTTTACTCCAAGGCTCAAGCATATTTGTCAAAGCTAACTATGTAGTTTTTCCTTTTCTTTTGGGCTAAAACCATCAGCCCCTAGCAAGTGCATATGGCCTTGCAAAACACAGGGATGGACGCTGGGAGTGGGCAATCGCCCCTGGTGTCTCTCCATCACCCAGATATCAACATGCAGCTGTGAGTTGTGAATATCCTTTCCCTTCAATTTTCTTTATTTTTCATCTTGAGATGGATCCCACTGCATGGTTTGTGTCATGTTTTATTTCCTTTTGTTTCTTTAGGTTTTCGTCAATGCACGACTTCATGTCTCAGGAGGGGCCCTTGGAGGCGGTCGCATGGTTGAAGACTCCTCAAGTGTTGCAGGTTCCTTACTATTATTTGCTTTGTATACTTTGCACCTGTTAGTTCATGTGGCATCCTTTTGAAAAATCTCCCACCTTTTGTGGCAACTCGAAACATTTCAAGCAATTTCTTTTGATTGTAAGTAGGATAAAGACCATATATGATTAATTATTTCAATTACTAAGTTCAATATATTGTTTTCTGTTTGCTAAATTACCCATTTACAATTCATCAGCAGAGAACAAGATGCATGCTGTTATTGATTGTCTCTGCAGTTCATATATCTTGTATTATTGAAAAAAGTAAATGGTCTGAATAATACTGGAACACAGTCGGTAGTTTAAGCATTGGCCAGTTGGTCTTAGTATGCATGTATATTTTCTTGTTTCCCTAGGTTCTTATTTTTAAGCCATGCTGCCCTTTTTCAGTGTTGGATACTGCTGCTGGAGTGTGGTGTGATACAAAATCAGTAGTTACTACTCCAAGGACAGGAAGATATAGTGCAGATGCTGCAGGCGGTGATGCTTCTGTAGAGCTTACACGACGGTGCAGGCATGCAGCTGCTGCAGTTGGTGATATGATATATGTTTATGGAGGTCTACGGGGAGGTAAGACACTTCAGTTTCTTAGCCTCATCTGATTTCTGACACCAATTCTCATGTTTGAATTGCGATCCGCTGTCCTATGAGTCCTGTTCAGCTGTATTCAGCAGCACACGTTTTTTAAGTAGTAAAGATGTTATCCGATGAGGAACATGTATATTCTTTCTGGGAAGATAAGGAATTTAGGATATTAAGATATCAGTACAAATTTAATTAGCATTGACTATGTTTACATAGCAGATCCAAAAGGTTTTTAAGGTGATCCGGATTTCAGCTTAATGGATTTCCAATTAACATTAGTATTATTACAATATCCTTATCTGAATGAAAAACTACTCCTGGAGCTAACTGTTAACTAACTTTTTACACTTGCATCACTTTTTTGAGGGTTGACTTTGGGTTATCAGAGCGAAATTGCCTCCTATTCAAATTAGGATATATTCATATTTTTGTTGATGCTAAGTTTTGTATAGTTGCAATTCTAAATTCCCTTTATTGTTACTCCAGGTG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