BGIOSGA036238
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036238 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036238, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38235 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036238-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036238-PA |
| Length |
7394 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:12782425..12789818 |
| Sequence Coding Region |
12789353..12789818,12788342..12788626,12787982..12788115,12787471..12787768,12787267..12787356 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:12782425..12789818 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:12782425..12789818 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACAAATTACATTCTTTCAGTACAGAAGCTTGGCTTTGTGAAGTACATCTCATCACCTGAACTAGGTTTCCTGGAAACTCTATCAGGAGGCATTGATCATAAAGTGAAGCTAGTATTCCGCTTTGTTGATAAAGCTGTTTCCGATCTTTCTACAAACAAAACATATGACTCTATGCTGAGTGACCTGGCATTTATTAAGACAATTGCTTCTGGTATAATGGTTCCCAAAAGCTATATCTGGCCAGTGACGAGTGATAACTATATTCAGCTTCCCACACAGATTGTCAAAGATGCGCACGATGCAGGTTTAGAAATATATGCGTCTGATTTTTCAAACGATGGAATTTTTCCCTATAACTACAGTTATGATCCTTTGGAGGAATATCTGTCATTTGTCAGCAATGGTGGCTTCTCTGTTGATGGTGTATTAACGGATCACCCACTTACTGCATCAGAGGCTATTGGGAATATATTAATTATCTCACATAATGGTGCTAGTGGAGATTACCCGGACTGTACGGATCTTGCTTATGAGAAGGCAGTTGGAGATGGTGCAGATGTCATTGACTGTTCCATCGAAATGACCAAAGATGGAATTCCTATATGCATGAGTTCCATTAACCTGTATGATAGTACAGATGTTCAGAACTCGAAGTTTAGCTCACTTGCTTCTGTCGTTCCAGAAATTCAGACTAAACCGGGAATATTCACGTTTAACCTCACTTGGGAAGAAATTAGCACTTTGAGACCGAAAATAACCCACCCATATCATGATTTTGTAAGGAACCCAAGGTACGCAAATCAAGGAAAGTTTTTCAAGTTATCCGACTTTTTGACATATGCAAAGGACAAGGATTTATCCGGCATCATGATCATCATGAAGAATGCTGCATTTATGGCAAAATCATTAGGATTTGATGTCGTTGATCTTGTAACAACTGCGTTGAGTAATGCTGGCTATGACAACATGGACCCAACTACCAAGAACAACAAGGAGATTATGATTCAGTCTAAAGACAGTGCTGTTCTCGTCAAACTGAAGCAGAGGTTAACACAATGCAAGCTTGTCTACTCGCTCCCGGTAAAAGTTGGGGACGTTTCTGATTCCTGCGTAGCAGATATCAAGAAGTTTGCAGATGCTGTTATTGTTGACAGGGAATCTGTTTTTGCCGAGAGCAAAGATGGAACAGTGGAGATCAACAACTATGTTCAGTTGGTTCATGTTGATGGCTTCATAACTGACTTCCCCAAGACTGTTAGAAGATACAAAATGAATACTTGTACACGCCAAGGAGATGGTACGTCTACATCCATGAAGCAAGTGCCAATTGGCGACCTGGCGCAGCTACTCGATGCGGAGTGCAGTACTGGTGGCATGCTGCCAGCTCTGGCACCAATGCCGGTGCTCAACTCATCGGAGCCACCTCTCCCTGCTGCCGAGCCCAAGAGTGCAGCAGGTAGCTCTGCCACCAATGCTTGTGTTGTAGGAGTACTGGCTCCTCCTCCCCTCTTCAGCAGCAGCAGGGAGTACGTTCTTCTGGCCACGCTGCTGCTACTCCAGATGCTATTTTGCATCATGGTTAAATCTGGAGGTTCTGAAAGTAGTGGTGGTTCTCATCATGGTTTTGATGAGGAAGAGAAATTCACGAAGCTTGAGAGGAGTATTTCTATGTTAGTCGATCGTCTACCACTGCCACGTCAGGAACATGCTAGACAGGGTCGACGTCCACCACCTGAACATCATGAGTATGATGCGGAGGATGAGAGTCTAGGCTTGTGTTCTGATGGAGGTGATCATCATCGTCGTCCTCGACATCCTCCTCACCGAGGTCCTGCTTTTATGGATAGGGTTGTTGATGATATTCACCGTGACAATCGGAATCGTCGTGCTGCTCGTGTTCCGTTGGATGAAGGGCTTGGTAAGATAAAAATTTCCATGTCTGCTTTTTTAGGTTCTGGAGATCCAGAGGATTATTTGCAGTGGGAGATGCGTTGTGATCAGATCTTTAATAGTCACAACTATTCAGAGGATAAGAAGGCACGTCTTGCATCTATTGAATTCACTGGTTATGCTTTATCTTGGTGGAATCAATTGCAACTCAAACAAGGTGATCTTAGTGTGGATGCTTATTATAAGGAGATGGAATTGTTAATGAGCCGTACAGGGGTAACAGAGAATGATGAAGCTACTATCGCTAGATTTCTTAATGGTCTCAACGATTATGTGAAAGAACGTGTTGAGATATCATATTATTATGATATACAAAATATGGTGCACATTGCTCAAAGGGTGGAGCAGCAACTAACAAGTCGCCACACTAGCCGTTCACGTTCTTTTCAGCGAGATGGTGATGGAAGTGCCGCTAGTAAGTCGGTGTCTTTCAAGCTGGCTACTCCTTCTAGAGATGGGTCTAAACCTGCTGCTAGTTCGGTGAGTAAATCCAAATCTAAAGTTGAATCTACTGCTGCATCTGGTTCTAAATCACGAAGTGTAGAGTGTTATACTTGTGGAGGGAGAGGACATTATATGAGAGATTGTCCTAATCAGAAGAAGGTGTTGATGACTAAAGAAGGCTATGTTTCTGAGAGTATATTAGAAAATTCAGAAGGTGTACAACTTGATCATACTCTTACTGCGGGCTATCGAGATATTGATGATTCATCTATGGATGATGGTGCTGAAAAGAATAATGGTTTATCTATGCTTGCATATGCAGTTCAGCGAGATGGCTCTAATGTTGATGCAAAGGGGCAGCGCTGTAATATTTTTCAGTCAGAGTGCAAAATTCAAGAGAAGTTTAGACTTGGTGTATGCTTTATCCTTGTCTACACGAAGGCTTTCTCCACCACGTTATATTCAATGGATGAATCAAGCGGGCACACAGAAAATTACTCATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTNYILSVQKLGFVKYISSPELGFLETLSGGIDHKVKLVFRFVDKAVSDLSTNKTYDSMLSDLAFIKTIASGIMVPKSYIWPVTSDNYIQLPTQIVKDAHDAGLEIYASDFSNDGIFPYNYSYDPLEEYLSFVSNGGFSVDGVLTDHPLTASEAIGNILIISHNGASGDYPDCTDLAYEKAVGDGADVIDCSIEMTKDGIPICMSSINLYDSTDVQNSKFSSLASVVPEIQTKPGIFTFNLTWEEISTLRPKITHPYHDFVRNPRYANQGKFFKLSDFLTYAKDKDLSGIMIIMKNAAFMAKSLGFDVVDLVTTALSNAGYDNMDPTTKNNKEIMIQSKDSAVLVKLKQRLTQCKLVYSLPVKVGDVSDSCVADIKKFADAVIVDRESVFAESKDGTVEINNYVQLVHVDGFITDFPKTVRRYKMNTCTRQGDGTSTSMKQVPIGDLAQLLDAECSTGGMLPALAPMPVLNSSEPPLPAAEPKSAAGSSATNACVVGVLAPPPLFSSSREYVLLATLLLLQMLFCIMVKSGGSESSGGSHHGFDEEEKFTKLERSISMLVDRLPLPRQEHARQGRRPPPEHHEYDAEDESLGLCSDGGDHHRRPRHPPHRGPAFMDRVVDDIHRDNRNRRAARVPLDEGLGKIKISMSAFLGSGDPEDYLQWEMRCDQIFNSHNYSEDKKARLASIEFTGYALSWWNQLQLKQGDLSVDAYYKEMELLMSRTGVTENDEATIARFLNGLNDYVKERVEISYYYDIQNMVHIAQRVEQQLTSRHTSRSRSFQRDGDGSAASKSVSFKLATPSRDGSKPAASSVSKSKSKVESTAASGSKSRSVECYTCGGRGHYMRDCPNQKKVLMTKEGYVSESILENSEGVQLDHTLTAGYRDIDDSSMDDGAEKNNGLSMLAYAVQRDGSNVDAKGQRCNIFQSECKIQEKFRLGVCFILVYTKAFSTTLYSMDESSGHTENYS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..466#1193..1477#1704..1837#2051..2348#2463..2552#2980..3274#5816..5888#5982..6437#6544..7245#7293..7394#ATGACAAATTACATTCTTTCAGTACAGAAGCTTGGCTTTGTGAAGTACATCTCATCACCTGAACTAGGTTTCCTGGAAACTCTATCAGGAGGCATTGATCATAAAGTGAAGCTAGTATTCCGCTTTGTTGATAAAGCTGTTTCCGATCTTTCTACAAACAAAACATATGACTCTATGCTGAGTGACCTGGCATTTATTAAGACAATTGCTTCTGGTATAATGGTTCCCAAAAGCTATATCTGGCCAGTGACGAGTGATAACTATATTCAGCTTCCCACACAGATTGTCAAAGATGCGCACGATGCAGGTTTAGAAATATATGCGTCTGATTTTTCAAACGATGGAATTTTTCCCTATAACTACAGTTATGATCCTTTGGAGGAATATCTGTCATTTGTCAGCAATGGTGGCTTCTCTGTTGATGGTGTATTAACGGATCACCCACTTACTGCATCAGAGGCTATTGGTATGTGTCCATACTTTTGTTGCTTTGGTTACACTAATGTAATTTTAATCACCGTTATTTTGTCAGTTTCACCATAGCAAATAATTAACTCAACAGGCAATTCATGAAAGCTGTGTTGAATCTAAATTTTGCTAAGATCAATCAATTTGATTGATTAGTAATCACATTCGCATAGTGGGCGAATGCAAATGATGTCTTTAACGTACTTTAAAAATCCGTGTTATCTACTCTTTTGGAGGAGCATTGGAGAATTGATAGCCTTCTCTACACTCAAACACCGTAAAAGCTCTCATATAGTAATACATTTTTGAGTAAATTTCACAAAACTACACGTTTTGTTGTCTAAGTTAGGATGCCTCGTCTGTGTGACTTTCTACAACTTGGACAACAAAACGTATAGTTTTGTAAAATTTACTCTACATTTTTTGTTTCATTTATATATATGCTACCATGTGAGCTACGAGATTGCTTAATTTTCGCCAGTCATCAATCACTGTTGTGTTTCCTGTTGTTTATATTGTTGTTGTACACAAACAAGAATCGGGAATTAATGCATTTGAGTCTATATTTGCACAGGCTGTTTCACTAATTTGAACACAAGCAGGAAAACAGATCATGGTATGACACATTTAGCTGCAACCCCCCGCACTATATGTTCTTGCAGTGATATTTGAATTCCACAGGTTTGAATTCGTTTTAATTATCGACCACACTGTTTTTTATCAGGGAATATATTAATTATCTCACATAATGGTGCTAGTGGAGATTACCCGGACTGTACGGATCTTGCTTATGAGAAGGCAGTTGGAGATGGTGCAGATGTCATTGACTGTTCCATCGAAATGACCAAAGATGGAATTCCTATATGCATGAGTTCCATTAACCTGTATGATAGTACAGATGTTCAGAACTCGAAGTTTAGCTCACTTGCTTCTGTCGTTCCAGAAATTCAGACTAAACCGGGAATATTCACGTTTAACCTCACTTGGGAAGAAATTAGCACTTTGAGACGTGAGTTTCCTTATCATTTTTTTATTACAACTCTTTCAGATTTTATTGAAATGTTTTTAACATTGTTTTTCTCCTGTGTTAGAAAAATGTTTCTTCACGAAAAGAGTGTAATTTGTTTGGTTGTGTGCCCACGGGCAGAGACCGGATATGTAATCCATTTTTATTATCTTTAAAAAAACGTAGATGGCATACAAACATGAAAAATTCATGTGTTTTTTTTCTGCAGCGAAAATAACCCACCCATATCATGATTTTGTAAGGAACCCAAGGTACGCAAATCAAGGAAAGTTTTTCAAGTTATCCGACTTTTTGACATATGCAAAGGACAAGGATTTATCCGGCATCATGATCATCATGAAGGTGATCATAATTCCTTTTTTGGCAATTTTTTTAGTAGACATTTTCAACAGTTTCCCTGTTACCCGTATATGGGGGAGATTTTAGCACTTATTTTCATTAAGGTGATCACCATGAAAAGCAAAATATCTTACACACGGAGCCATTTTTTCTTAGTTTTCTCCTTTCTACAAAAATCTACAGTGAAAATTGATCGATCAACCTTGTGAAGTGCAGAATGCTGCATTTATGGCAAAATCATTAGGATTTGATGTCGTTGATCTTGTAACAACTGCGTTGAGTAATGCTGGCTATGACAACATGGACCCAACTACCAAGAACAACAAGGAGATTATGATTCAGTCTAAAGACAGTGCTGTTCTCGTCAAACTGAAGCAGAGGTTAACACAATGCAAGCTTGTCTACTCGCTCCCGGTAAAAGTTGGGGACGTTTCTGATTCCTGCGTAGCAGATATCAAGAAGTTTGCAGATGCTGTTATTGTTGACAGGGAATCTGTTTTTGCCGAGAGCAAAGGTTTTATTATTAGGAAAAGCAAGGTTGTGGAAGATGTGCAGTCTGCAGGGTTAGCTGTGTATGTGGAGGTATTCCGCAATTAGTATGTATCACCACCGGTGGATTTCTTCGCAGATGGAACAGTGGAGATCAACAACTATGTTCAGTTGGTTCATGTTGATGGCTTCATAACTGACTTCCCCAAGACTGTTAGAAGATACAAAAGTAAGTTTACTACTACTACTCTGCTAGCTAGCTACTACCTCCATCCCATAATATAAGAAATTTTGACTTTTTGAATTTTTGACTTTTTACTTTCAACGTTTGATCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTATACAAATATAAAAAACGAAAAGTTATGCTTAAAGTACCGTGGATAATAAAGTAAGTCACAAATAAAATAAATAATAATTATAAAATTTTTTGAATAAGACAAATGGTCAAACAGTACAAGCAAAATGTCAAAATCCCTTATATTATGAAACGGAGGAAGTAGTAAAGTAGGTACTAGTCCTCGTTTATTCTATTGTTTGCCACAAATATATATGTTTATTTCTTTTAGGTAGTCACATAATATATCCCAGATATTATGGAACTAAAGTTTTACAAAAACCGTAATTAATTTACTGGCAGTGAATACTTGTACACGCCAAGGAGATGGTACGTCTACATCCATGAAGCAAGTGCCAATTGGCGACCTGGCGCAGCTACTCGATGCGGAGTGCAGTACTGGTGGCATGCTGCCAGCTCTGGCACCAATGCCGGTGCTCAACTCATCGGAGCCACCTCTCCCTGCTGCCGAGCCCAAGAGTGCAGCAGGTAGCTCTGCCACCAATGCTTGTGTTGTAGGAGTACTGGCTCCTCCTCCCCTCTTCAGCAGCAGCAGGGAGTACGTTCTTCTGGCCACGCTGCTGCTACTCCAGATGCTGTAAGCTAGCGCCGCCATTTTTTGCTGGCATCTGTGCTCATCTGAGCTATCCTAGCCGATGGACGTCAATTAAGGCTGAAATATTTTCCATTCCATTAACGATGGACGGTGTGACGCTACAATAATGTATAACTTGGCTTTATAATATTAATGGTGCTTAATTTTTATCTATTGGCTCGAACTCCAGACTGGGTCTCACATCAATTCGTCTTACTAACTAGTTTCATTTTGTTTAATTTCTTTTTTTTTCTTTTTTGAAACAACCCGCGCAATGCTTGGCAATCCCCAGTGTGAATGGATGTATATCAGAATGTGTTGATTGCCATTTGCCACAACAATTTCCCACTTTCCGCAGCTTAATTAGTTGCATAGAGAGATATGTACTCCCTCCGTTCCATAAAAATCGAATCTAGGATTGGATATGACATATTCTAATACAATGAATCTAGAAAAATATATGTACAGATTTATAGTACTAGGATGTGTTACATCCAGTACTATATTGGTTTTCTATCGGATAGATGGAGTATGGTTCTGCCCCCGCAACTACAATCTCATCCAGAGAGTGCTTGAGATCACACATAATTAACACTCATCCTCTTGCTCTAAATCCACTAAAAATAAACGGCAGGTTTCCGTGCCGCATGGCCGATCAGTACTACGTACAATAATGGATTTCATGGGCACATAGGAAAAGACTAGGCATTAGGCATTATTCTGAGAAGCAAAAAAATCCAGTCAATAATTGAAACATTTGTCGATATTAGGGTTTGGGCGACTCCCTCGTGATCGGGGGGTGGCGGCTCTCGTTTCCTATAGAAGATGGTTTTGGATAAAGTTTTACTCTGATCCGTTTGAGAAGTCTGCAGGGATTATGCCTGCCTTGGCATCGCCTCATCTTGGTGATGTTTTTGGTATCCATTGTGATATGTCCCAGACTACTCAAGTAATATCAGTCGGTGATTTGCATATTTTTATGAAGTCTGGACAAGGCCAAAGAATATTTCAAGCTTCATGCAATGTACCAGTGCCAAACAGATGGAATTAAAATCGATGATATCAATCACAATGGTGAGGGCTAATTAGACCTAGATAATTAGCCAAGGTCATTAGGCATCATGGCCGCATTATTTTAATATACTAGAAAAAATACCCGTGCATTGCAACGGGAAAAAGAGATGAGAAAATTGAGGAGAAGTTGAAAAAGATTTATATTATGTAATTAATTAAATATAAATTTTCCGAAATATTTGATATTTTTTTAAGTTGGTAGGTGTTTAAATTAATTTAAAAGTAAAGTAAGTGTGGAAATAAAATGATATGGCTGGATTTAATTTTAATGAAGTTCTCCATAATTAATTATACTTTCTGGATTTTTCTAGAAATTTTTAGAACTTCATTTCGAATTTTTATAATACAAACATCATTTCAACATTTATTTAAATAAAAATCTAAATAAGAATCATTCTTACATTCTGGGCCATTTTCAGCCCATGGCCTCCCTCAGCCCGCATCCGAGCAACCTGCTTTTATCCCTTTTTCTCCCCTCCACCTTAGCCCGCAAGCACGCGTCCGGTTCAGTAAGCAAACACAAGTCTAATTTACC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|
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