BGIOSGA036353

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA036353

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036353, complete gene.

LocusTag

OsI_38022

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA036353-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA036353-PA

Length

7272

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:8791504..8798775

Sequence Coding Region

8798560..8798775,8797087..8797220),complement(8796829..8796988,8796310..8796496),complement(8794071..8794216
,8793905..8793977),complement(8793673..8793736,8792918..8793017),complement(8792589..8792747
,8791504..8791614

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:8791504..8798775 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGTGTCCGCCGCGGCGGCGGCGTCGTCGCTCCGCTGCTTCCCTCCCTCCCTCGGGAACCGTGGCCCCGGGGCCGCGACCGCGCGGGGTGGCCTCGTCAGGCTCTCCTCGCGGCGGGCCCGGTCCACGGCCGGCGTGGCGGCGCCGTCGCGGGAGGCGGAGTCGGCCGCCTCGCTGGGCGACCTCACCCGCGTCGACTTCCCTATCCTTGACCAGGAATTTGATGGTTCCAAATTAGTTTACTTCGACAATGGTGCAACTTCGCAGAAACCTTCTTGTGTAATGAAAACTTTGGATGAGTATTACCGGTTTTACAATTCGAATGTTCACCGTGGAATTCATGTTCTCAGTGCAAAGGCTACCGATGCATATGAGAGTGCAAGAACAAAAGTTGCAAATTTTGTCAATGCAGCTAATAGTAGAGAGATTGTTTTTACACGTAATGCTACTGAAGCTATCAATTTAGTAGCATATTCGTGGGGCATGTCCAACTTAAAACAAGGAGATGAGATTGTTCTTACGATTGCAGAGCATCATAGCGCTATTGTTCCTTGGCAATTTGTTTCCCAGAAGACTGGTGCTACTTTAAAGTATGTTGGGCTAACCAAAGAAGGGGTTCCAGACATTGAGCAGTTGAAAGGTCTTCTGTCAAACAAGACGAAGATTGTTGTTGTTCATCATGTCTCAAATGTACTCGGTTCAATGCTTCCTATTGAGGATATTGTAACATGGTCAAACAGAATTGGTGCTAAAGTTCTTGTCGATGCTTGTCAAAGTGTTCCTCATATGCCTGTCGATGTTCAGAGGCTTGGTGCAGATTTTCTTGTTGCATCATCACACAAGATGTGTGGCCCTACAGGCGTTGGATTCTTGCATGGAAAGTTTGACCTCTTATCATCCATGGAGCCTTTCTTAGGTGGTGGTGAAATGATTGCAGATGTGTTCCAAGACAAATCCACATATGCTGAGCCTCCTTCTAGATTTGAAGCTGGAACACCTGCGATTGGAGAAGCTATAGGATTGGGAACAGCAATTGATTATTTGTCACAAATTGGCATGCAGAAGATCCATGAGTATGAGAATGAGTTGGCGACCTATCTCTATGAGAGCCTTATTGCTGTTCCAAATGTTCGGATCTACGGTCCAGCTCCATGCCAAACTGTTCACCGCGCCCCATTATGTTCTTTTAATGTTGAAAATGTTCATCCAACAGATATTGCCGAAATTCTTGACCTCCAGAGGGAACTGGGACATCAAATGGCAGCCAAAACAGCTGACCATGGAGCTGTCATCTCAAAGTGGCCATTTTCAGCTCCATGTACTTACCTTTGTTCTTCCAAGCTTGACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVSAAAAASSLRCFPPSLGNRGPGAATARGGLVRLSSRRARSTAGVAAPSREAESAASLGDLTRVDFPILDQEFDGSKLVYFDNGATSQKPSCVMKTLDEYYRFYNSNVHRGIHVLSAKATDAYESARTKVANFVNAANSREIVFTRNATEAINLVAYSWGMSNLKQGDEIVLTIAEHHSAIVPWQFVSQKTGATLKYVGLTKEGVPDIEQLKGLLSNKTKIVVVHHVSNVLGSMLPIEDIVTWSNRIGAKVLVDACQSVPHMPVDVQRLGADFLVASSHKMCGPTGVGFLHGKFDLLSSMEPFLGGGEMIADVFQDKSTYAEPPSRFEAGTPAIGEAIGLGTAIDYLSQIGMQKIHEYENELATYLYESLIAVPNVRIYGPAPCQTVHRAPLCSFNVENVHPTDIAEILDLQRELGHQMAAKTADHGAVISKWPFSAPCTYLCSSKLD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..216#1556..1689#1788..1947#2280..2466#4560..4705#4799..4871#5040..5103#5759..5858#6029..6187#7162..7272#ATGGTGTCCGCCGCGGCGGCGGCGTCGTCGCTCCGCTGCTTCCCTCCCTCCCTCGGGAACCGTGGCCCCGGGGCCGCGACCGCGCGGGGTGGCCTCGTCAGGCTCTCCTCGCGGCGGGCCCGGTCCACGGCCGGCGTGGCGGCGCCGTCGCGGGAGGCGGAGTCGGCCGCCTCGCTGGGCGACCTCACCCGCGTCGACTTCCCTATCCTTGACCAGGTACCCCCACTTGCCTATCAAGCTTTGTATATCATGTTATCTCTATCATCTGAAATGTTTGAAGTTATTCCTGATTATAGACCATTCTTGAAGTCGGTTCATGCCTATTTTACAGTGTTTTCCACTCAAAAGTATGTTGCAGTTGCATATTAAAGACCATCATGTGTTCTTTAGTGATGAAACTTCTCCCCTTTTACCATACTGGGTCTGGTAGTTCAGTACAGTACATGATTGCAGCCATTAGCATCTCTGTTACTATCTTGGGTCTCAATGTTGATACCGGCATTCAGAAATTGCTTATGGAGCGCTTCTTATTGAGAACCAATGTTCGATTTCCTAGTTACCTTGTCAACTTCATGCCTCATTTTCTCTGAATGAAATGCCACATAAGTTGTTCTTGCTGCTTGCTAACAAAAAGGAAAACGATGTTGGTTAGTGGGTTGATGCTACTGTGTTGGAGAATGAATGCCTAGTTTGATTTAGGCTGTTTCTTGTAAACTTTCCTTATATGCGGATACTTATTTAAAAGTCTTCTTTGATTAGACCAATTATTTGAACTCATTTTTGGACAAATATGGGGCTTCATTTCATTGTAATTGTTCTGACTATTATCTAGTCTCTTGGTAATAATCACTGTGGAAAAATCAACATTGTTTACCTTTTTCATATGTTGGTCACTGCTCCATGTTGCAACTTTTAGTGTAATCTATAATTGGTTTTCTGTTGATCTGATTACTCGCTATTCCTTGTGCATGATGAGACACACTATTATTTTATTCGTTACCTATATGCTTTGCCTTGAATTGTTGTGGCTGCTGTGTGTTCTGTGACCTTAGGGGGTGCAATTAGTTTCTGTAGTTTTATTTTGTTGCAACCAATAACCTTTTGTTTTCTTACTTAGAGAGAGATGAGCTTTATATCATATTGTTGTCTCTGGTACGCTTACCACTGGGAGCGTGTGGGTTGATGCCAGACTCATGTACTTTGTAAATTGATTCAATTTTTGTTAGTTCTGGTGCACTTTTCATTATGAATGTGTGGGTTGCTACTAGATTGGTGTAATTTTTAAGCTGATTTACATTTGTATTAATTCAAGTCAATTCTTATTTATTCAGTGAAGCATGTGAAAGCTCCATGTTTTAATGATTGATTTTAAAGTAGCTGTTTGACATGGTTGTTGTAGTCAATGTAGCTTGAGGAATTGTAATGTTGACTTTTCTGTTGACATATTGGATTGTCATTCTTGTTACAAAAAAATATTAGCCTTGGAGTTGCCAGATAGTAATCTTGGCATTCAAGGTAGGAAAATTCCATTTTATCTGACAATTGAAACTTGCAGGAATTTGATGGTTCCAAATTAGTTTACTTCGACAATGGTGCAACTTCGCAGAAACCTTCTTGTGTAATGAAAACTTTGGATGAGTATTACCGGTTTTACAATTCGAATGTTCACCGTGGAATTCATGTTCTCAGGTAGTTTTTACATTTATCAGTTATGCCTTGTATGTGTTCAGTGTTTGTGCTTATATAAATCATGTGCCCCACTGATATGCTTGTTTCATTGGCATCAGTGCAAAGGCTACCGATGCATATGAGAGTGCAAGAACAAAAGTTGCAAATTTTGTCAATGCAGCTAATAGTAGAGAGATTGTTTTTACACGTAATGCTACTGAAGCTATCAATTTAGTAGCATATTCGTGGGGCATGTCCAACTTAAAACAAGGAGATGAGGTGAGTCCTCTATTTTTGACCAGCTGATTAATATGTGTTTTAGGCTGACTGTACCAGCTGTTGTAGTTTTATAGTGCATGTAATTGTACAAATTGTGTTTCTTCTAATGCTAAGTACTTAAGTTTTTGCTTCAAGTGCTTAGTCAAAATCATTTTCCTTTTTTTAGTCTGGACTCTGGAATTACCAAATTCTTCATCTAATCAAATGCACCTGACCATTGTAGTTAACTCATCCGAATTTCACCAAGTGTCATTATTTGGTATATATCATCTGAAGTTTGTAGTCTTTGTTGTACCCTCCTGATAAGAACTGTCTTCTATTTTGTTGGCCAGATTGTTCTTACGATTGCAGAGCATCATAGCGCTATTGTTCCTTGGCAATTTGTTTCCCAGAAGACTGGTGCTACTTTAAAGTATGTTGGGCTAACCAAAGAAGGGGTTCCAGACATTGAGCAGTTGAAAGGTCTTCTGTCAAACAAGACGAAGATTGTTGTTGTTCATCATGTCTCAAATGTACTCGGTAAGTTGATGTTTTTTTAAAGAAAATATTGTTGAGGTTTTGAAACATCATATTGATCCTTAACTGTAATTGTGATTCCGTTTTTAATGAAACGATCATAGGGTTGGCTTTGATACTGGCATTGCCAAATTTTTGTAGGGTGGAGATGTAGTTGACGTGTTTGGTTTGATGCCAACACTGTATGGGCAATTGCTGAAATTTTAGTAGGGTAATGTTTAGATGAATTGTTTGGTTTGCTACCTTACCATAATTTTGGTATTGTACCAAACCAAACAAGCCATTAGATTTTGTCTTAGAGCTAAAACATGATTGTGGAAAAAACATGTTTTTTATGGCTAACGAAATAATGAAAATGGATAACAACAGAAGTTAGTGTTTGTCCAAAGATATTATAGTTAATGACAGAATATTTAAAACAAATGTTTATTATAACACCCCTAGGTATTGACATACCTAGAGAGCTATCATCATTTGACGGCACTGCAGGAAACAATAGGGGTTGAAGCTGAATTGGGAAGAACCATCTGCACAGGACCCCGCAAAAGAAGAATTATACCTCTGCCACTTATAGAATCTGGGTTCTGTTTGCATACCACAACCATGTTGCCAACCCTGTTGCACATGCAATCTCTCAAAAAAGATACACTATGCAGAATGGCAGTTCTTCCCACATTTGAAGCTAATGAAACCTTGCTCTATTAGTGCTAAGCGAAGAAATGAGATTCCGAAAGCATGGTTCTGAATAAGACTTAGCTCCTAACTCCTTGGGCCTGAAAGACTGTTGAGTGTGGTTTTGCTCATAGTCTCAAAGTTCCTGGATCGATGCGATCGAGGAACGTGGTATGCTTCTTGTGAGAGGTTTTTACAAGGTGGGGATGAAAATGTCCCGTGTTCCTGGAACATGGAAGATGTTCCTGGGTTGAGGAATGCTTCCTTCGACCCTGTTTTCTGTGACTTTGGTTTTTTGCTTGGACTTGTTGAATGGGGATCGCTGGTAATTCTTTTCTCCCTCCTGGTGAACTCTCTTCTGATCACTAGTCACTACTATTGCCACTGGCACTCCTAGTTCTCTTGTGCAGCAGTAAGTTGGATATCTCCAACTCCTAGTCCTCTAAAGAAACTCCTGCCCTTAATGTTCCACACTTCCCACATTAGGCACAGAGGACAATGCTGCTAAAGTTTCTGTCATGCTCATCCAGTCTTATTTTCTTCCCAGATATGATTCAGTTCATCATTAATCCTGTTCCCTCAAGAATCCGGGTGATACTTCCCTGAAGAACTAAAGAATAACCTTTCAAGTGATAGCATCATGCGCAGGGGTTCAGGCTTCACAAATCACTCTTATCATATGTTAGCCCGACCAGTTAGCTGGAAAGACAAAAAATAATCTTCTCCTCTAGTGTCGTCCTAGATCCTTCTCATCTTGTGTAGTGTAGCTAATCTGCAGCATTGTTTTTGTGGTATCCTGAGTTCCTGACTCCCTGACCTAAATTGAGTGAAAACTCCACCAAATGAAATATATAGACTAGACCTACAGCTTGACTGAACCATGTGACTTGATTTCATATGGATTTTTAATCCTAGATTTCAAAACAGCGTTTCATCCTATGGATCAGGAAATTAAATTCAAATTAGCAGCGAGCAAACTTGATTTCTACTTGAAATTGATCCATCTAGGGACTAACTAGAGATTACCCTTGCTGTGAGGAAAATCAAATTTAAATTGCCCCAATTATCTCATCAAGTGGCACAGGCCTAATTCTTCAGCAAGATCTCCTGCATCCAGTTTTCCTGGAGCTTCTGGTTCAGCCAGTGGTGCCGTTCAGATGATGGTAGCTCTCTTGGTTTGCAGATACCTAGGGCATTACATTTGCATTAGAGCCTGTATATGATAAAGAGTAGTTTCTTTGTCACGTAACGAGCTGAAATTAGGTTCATGGTAACGTTGAATTAGTCTGTTTCTTACTGTATCGTGAACTATGGTGTATGGTATTCTGGGAAATTTTCCCTGATTGAATCCATATCCAGTTCTCATTTCATGTGATGTCTGCCTAGACAGCACATTTGGTAACATGGATCTTCATCTTTTCCAGGTTCAATGCTTCCTATTGAGGATATTGTAACATGGTCAAACAGAATTGGTGCTAAAGTTCTTGTCGATGCTTGTCAAAGTGTTCCTCATATGCCTGTCGATGTTCAGAGGCTTGGTGCAGATTTTCTTGTTGCATCATCACACAAGGTTTTATTATCAATTCTTTCTTCTAAATAAGTTTGTAATCATTGAGAGTAGCGCAATAATTGACTTTGACAAGTTATGGGCTAAACTTCTCAGATGTGTGGCCCTACAGGCGTTGGATTCTTGCATGGAAAGTTTGACCTCTTATCATCCATGGAGCCTTTCTTAGGTAAGATAC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA036353