BGIOSGA036403

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA036403

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036403, complete gene.

LocusTag

OS12G0239900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA036403-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA036403-PA

Length

12700

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:7231331..7244030

Sequence Coding Region

7244023..7244030,7243272..7243395),complement(7243075..7243160,7242907..7242991),complement(7242455..7242614
,7242284..7242360),complement(7241784..7241874,7240769..7241070),complement(7239808..7240089
,7238284..7238597),complement(7237835..7237995,7237628..7237731),complement(7237371..7237524
,7237053..7237148),complement(7236846..7236919,7236060..7236392),complement(7235580..7235870
,7234676..7234759),complement(7232919..7233052,7232430..7232663),complement(7232122..7232293
,7231726..7231980),complement(7231331..7231600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCGGGTGGGAGTGCGGCCGCCGACGGTGGAGGTGCGGTGGCGCGACGTGTGCGTGGAGGCGGAATGCCAGGTGGTCTCCGGCAAGCCGCTCCCGACGCTCTGGAACACCGCGCTCTCCAGATTCTCGCTGCTCGCGGCCAAGCTGGGCTTCAGCCATCACCAGTCCAAGGTCCAAATCCTCGAAAATGTCAGCGGAATCATCAAGCCTTCCAGGATTACTCTTCTGCTTGGACCCCCGGGGTGCGGCAAAACCACACTCTTGAAAGCACTTACTGGAAGGCTCAATAAAAGCCTCAAGGAAACAGGAGAAATTGAGTACAATGGTGTGAAGCTAGATCAGTTCGTTCCAGCAAAGACATCAGCTTATGTAAGTCAGTATGACCTTCACGTTGCTGATATGACTGTGAGGGAGACGCTCGACTTCTCAGCAAGATTTCAAGGCGTTGGCAGCAGAGCAGAAATCATGAAGGAAGTGATTAAAAAGGAGAAGGAGGCTGGGATTACCCCTGATCCTGACATAGATGCATATATGAAGATCATGGGACTTGACAAATGTGCTGATGTAAAAGTGGGAAATGCCATGAGAAGAGGTATTTCAGGTGGTGAGATGAAGAGACTTACCACAGGGGAGATGATAGTCGGACCATGTAAGGTGCTCTTAATGGATGAAATATCAACTGGGTTGGATAGCTCCACAACCTTCCAAATTGTTTCTTGCCTCCAACAGTTGGCACATATCTCAGAGTATACCATACTGGTTTCACTCCTTCAACCAGCACCAGAGACATACGATCTTTTTGATGATATTATCTTAATGGGAGAAGGAAAAGTTGTATATCATGGACCAAAGAATCTCATAATGACCTTCTTTGAGTCATGTGGGTTCAAATGCCCAGAAAGAAAAGGACCTGCTGACTTTCTTCAAGAGGTGTTGTCAAAAAAAGATCAACAGCAGTACTGGAGTCGAAGTGAACAATGGTACAATTTCATTACTGTTGACCAGTTCTGTGATAAATTCAAAGCATCTCAAGTTGGTCAGAGTCTAGCTGAGGACCTTTCAAAGCTATATGAGAAATCAAAAGCAAACAAGAATGCCTTGTCCTGCAGTATTTATTCATTGTCCAAGTGGCATCTCCTCAAGGCATGTTTTGATAGAGAGCTTCTTCTCATGAAAAGGAATGCTTTCCTCCACATAACAAAAGCTGTTCAGCTTGGACTTCTTGCAATTATTACTGGGACAGTGTTTTTCCGTACACACAAGAATTTTGATATAGTTAGTGCCAACTATTACATGGGTTCACTCTTCTATGCACTCATCCTGCTGATGGTCAATGGAATCCCTGAGCTGGTCATGTCAATTAGCAGACTTCCAGTTTTTTACAAACACAGAGATCACTACTTATATCCTGGATGGGCTTATGCAATACCAGCTTTTATCCTAAAGATTCCAGCCTCTTTAGTTGCGGCATTATCTTGGACATCAATATCTTATTACCTCATCGGATATACTCCAGAAGCCCCCAGATATTTCCGTCAGCTTCTCGTCCTCTTCCTCGTCCACACAGGAGCATTGTCATTGTATCGATGTGTTGGTTCATACTGCCAAACAATAGCGGTTGGTCCAATTGCTGCCACAATGTCACTTCTAGTCATCCTTCTGTTTGGCGGTTTCCTCATTCCTCGGCCATCTATGCCTAATTGGCTAAAATGGGGGTTTTGGCTCTCTCCATTGTCATATGCTGAGATAGGCCTAACTGGAAATGAGTTTTTGGCACCAAGATGGCTAAAGATCACAATATCTGGTGTAACAATTGGAAGGAGGATACTGATAGATCGAGGGCTAGACTTCTCTGTCTACTTTTATTGGATCTCAGTTGCTGCTTTGATTGGGTTTATTTTGTTATACAATATCGGTTTTGCCATTGGTTTGACTATAAAACAATCTCCAGGGGCTTCTCAAGCTATTATTTCTAATGATAAGATAAGGATACGTCATGGAAGAGACCAAGAAAAGTCAAAGGACATCAAGATTGGGATGAGGAGGATGGCATTACCTTTCACACCCCTTACTATATCGTTTCGAGATGTGAACTACTATGTAGACACTCCTCCGGAAATGAGGAAGAAAGGTTACATGGGAAGAAAACTACAACTGCTCCGGAACATCACAGGGGCATTCCAGCCTGGGATCCTGTCTGCACTAATGGGTGTTACTGGAGCAGGGAAAACAACCCTCCTCGATGTTCTTGCTGGAAGGAAAACTGGGGGTGTTATTGAAGGAGACATAAGAATGGGCGGTTATCCTAAAGTTCAACAAACATTTTCTAGGATATCAGGCTACTGTGAACAGAATGATGTTCACTCCCCACAAATCACAGTGGGGGAGTCTGTAGCATATTCGGCCTGGCTACGCCTTCCAGCAGAAATTGACACAAAAACTAGAAAAGAATTTGTTGACGAAGTTCTTGAAATAATTGAGTTAGACGAAATTAGAGATGCTTTGGTTGGAACACCTGGGGTAAATGGTCTATCTAGAGAGCAACGAAAACGGCTCACAATCGCAGTTGAACTCGTTTCTAACCCTTCAATTGTATTCATGGATGAACCGACATCAGGCTTGGATGCAAGAGCAGCTGCTATTGCCATGCGTGCAGTGAAGAATGTGGCAGAAACAGGTCGAACTGTTGTGTGCACAATTCATCAACCAAGTATCGAAATATTTGAAGCATTTGATGAGTTAATGCTGATCAAAAGGGGTGGAGAGTTGATTTATGCCGGGCCACTTGGACAACATTCGTGCAAGGTCATTCAATATTTTCAGTCAATACCAGGAGTACCCAAGATCAAGGACAACTACAATCCATCAACGTGGATGCTAGAAGTTACTTCCACATCCATGGAAGCTCAACTTGGAGTAGATTTTGCACAAATTTACACGGGATCATCAATTTGCAAGGACAAGGATGAGCTGATAAAGGGCTTCAGCATGCCACCACCAGGTACGAGTGATCTCCATTTCCCAACACGGTTTCCGCAGAAGTTTCTGGAGCAGTTCAAAGCTTGCCTCTGGAAGCAGTTCCTGTCGCATTGGAGAACTCCTTCATATAACCTGGTGCGAATTGTGTTCATGGCATTCTCTAGCATTATCTTCGGCGTGCTATACTGGCAGCAAGGCAACATCAGGCACATAAATGACCAACAAGGTCTGTTCACTATTTTGGGATGCATGTATGGCATCACCATCTTCACTGGTATTAACAACAGCCAATCAGCGATGCCATTTGTCGCCGTTGAACGCTCTGTCATGTACAGGGAAAGGTTTGCTGGAATGTACTCTCCTTGGGCCTACTCCTTTGCACAGGTTGCTATGGAGATTCCCTATGTTTTGATGCTGGCATTGTTGTTCATGTTGATCGCATACCCAACAATAGGGTATGCCTGGACAGCAGCGAAGCTCTGCTGGTTCTTTTACACCATGTTCTGGACGCTGCTCTACTTCGTCTACTTTGGAATGCTGATAGTATCAATCACCCCCAACCTCCAAGTGGCCTCAATATATGCATCCTCATTCTACATGACACAACACCTCCTTTCTGGCTTCGTCGTGCCTCCTTCACAAATACCAAAATGGTGGATCTGGCTGTACTACATCTCCCCAATGTCGTGGACGCTGAATCTCCTCTTCACCACACAGTTCGGGTTCGAGGACAGCAGTAACATTCTTGTCTTTGGAGAGACTAAACCGATCGCAGCCTTCGTAAGAGACTATTTTGGTTTCCACCGCGAGCTGCTACCACTTTCTGCCATAATATTGGCAGCATACCCTGTCCTCTTTGCCATCCTGTACGGGTACAGCATCTCAAGGTTTAACTTCCAAAAGAGATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARVGVRPPTVEVRWRDVCVEAECQVVSGKPLPTLWNTALSRFSLLAAKLGFSHHQSKVQILENVSGIIKPSRITLLLGPPGCGKTTLLKALTGRLNKSLKETGEIEYNGVKLDQFVPAKTSAYVSQYDLHVADMTVRETLDFSARFQGVGSRAEIMKEVIKKEKEAGITPDPDIDAYMKIMGLDKCADVKVGNAMRRGISGGEMKRLTTGEMIVGPCKVLLMDEISTGLDSSTTFQIVSCLQQLAHISEYTILVSLLQPAPETYDLFDDIILMGEGKVVYHGPKNLIMTFFESCGFKCPERKGPADFLQEVLSKKDQQQYWSRSEQWYNFITVDQFCDKFKASQVGQSLAEDLSKLYEKSKANKNALSCSIYSLSKWHLLKACFDRELLLMKRNAFLHITKAVQLGLLAIITGTVFFRTHKNFDIVSANYYMGSLFYALILLMVNGIPELVMSISRLPVFYKHRDHYLYPGWAYAIPAFILKIPASLVAALSWTSISYYLIGYTPEAPRYFRQLLVLFLVHTGALSLYRCVGSYCQTIAVGPIAATMSLLVILLFGGFLIPRPSMPNWLKWGFWLSPLSYAEIGLTGNEFLAPRWLKITISGVTIGRRILIDRGLDFSVYFYWISVAALIGFILLYNIGFAIGLTIKQSPGASQAIISNDKIRIRHGRDQEKSKDIKIGMRRMALPFTPLTISFRDVNYYVDTPPEMRKKGYMGRKLQLLRNITGAFQPGILSALMGVTGAGKTTLLDVLAGRKTGGVIEGDIRMGGYPKVQQTFSRISGYCEQNDVHSPQITVGESVAYSAWLRLPAEIDTKTRKEFVDEVLEIIELDEIRDALVGTPGVNGLSREQRKRLTIAVELVSNPSIVFMDEPTSGLDARAAAIAMRAVKNVAETGRTVVCTIHQPSIEIFEAFDELMLIKRGGELIYAGPLGQHSCKVIQYFQSIPGVPKIKDNYNPSTWMLEVTSTSMEAQLGVDFAQIYTGSSICKDKDELIKGFSMPPPGTSDLHFPTRFPQKFLEQFKACLWKQFLSHWRTPSYNLVRIVFMAFSSIIFGVLYWQQGNIRHINDQQGLFTILGCMYGITIFTGINNSQSAMPFVAVERSVMYRERFAGMYSPWAYSFAQVAMEIPYVLMLALLFMLIAYPTIGYAWTAAKLCWFFYTMFWTLLYFVYFGMLIVSITPNLQVASIYASSFYMTQHLLSGFVVPPSQIPKWWIWLYYISPMSWTLNLLFTTQFGFEDSSNILVFGETKPIAAFVRDYFGFHRELLPLSAIILAAYPVLFAILYGYSISRFNFQKR</aaseq>

Gene Sequence

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