BGIOSGA036643

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA036643

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036643, complete gene.

LocusTag

OS12G0143900

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA036643-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA036643-PA

Length

7997

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:2317500..2325496

Sequence Coding Region

2325343..2325496,2324776..2324836),complement(2324623..2324700,2324070..2324141),complement(2323900..2323981
,2323637..2323742),complement(2323483..2323559,2323011..2323055),complement(2322824..2322910
,2321469..2321558),complement(2321295..2321374,2321096..2321189),complement(2320321..2320409
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,2319135..2319221),complement(2318322..2318425,2318158..2318243),complement(2317851..2317937
,2317500..2317595

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:2317500..2325496 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:2317500..2325496 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCGGGAGGAGGAGAGGGCCCCAATGGGCGCGGCCCAGCGGCGGCTGCGCGCCGTCTCCGGCCACCTCCAGCCGCCGACGGAGTCCGGCGGCGTTGACCTCGCCGCCAACCCCACCGCCGGCGAGTACGCGCACGTGCAGGGCTACAGTGCTGTACTCCCTGAGAAGTTGCAAACTGGAAAGTGGAATGTGTACAGATCCGCGAAGTCACCTCTTAAGTTAATAAATAGATTCCCTGATAACCCAGACATTGGAACGCTTCATGATAACTTTGTGTATGCAGTTGAAACCTTTAGGGACTGTAGATACCTGGGCACAAGAGTCTGTGTTGATGGAACAGTTGGGGACTACAAATGGATGACATATGGAGAAGCTAGTACAAGCCGGACTGCGATAGGTTCTGGTCTTATTTACCATGGAATACCTGAAGGTGCGCGCATTGGTTTGTATTTTATAAACAGACCTGAGTGGACCATAGTTGATCATGCCTGTGCGGCATATTCATATGTATCCGTGCCACTTTATGATACTCTAGGTCCAGATGCAGTTCAGTTCATTGTTAACCATGCGACAGTACAAGCTATTTTCTGTGTGCCTCAAACACTAAGCACTCTACTAAGCTTTATAACTCAAATGCCGTGTGTTCGCCTTATAGTGGTAATTGGTGGAGACAATGCAAATATGCCATCTACCCCAACAGCTACTGGAGTGGAAATTATAACTTACTCCAGACTACTTAGCCAGGGAAAGATGAGTTCTCAATCTTTTCGCCCTCCAAAACCTGAAGATATTGCCACTATTTGTTACACTAGTGGCACTACTGGCACACCGAAGGGAGTTGTTCTTTCTCATGGGAATTTAATTGCAAATGTAGCAGGATCAAGCCTAGTCATTAAGTTTTACCCATCTGATGTGTATATCTCATATTTACCTTTAGCTCACATCTATGAGAGAGTTAACCAGGTCTCAGTGGTTCACTATGGTGTTGCCATTGGTTTCTACCAAGGGGATAATTTGAAGCTGATGGATGATCTGGCTGCATTGAGACCAACAGTATTTCCTAGTGTGCCTCGGCTATATAATAGAATTTATGCTGCAATTACAAATGCTGTCAAGGAGTCTGGAGGGTTGAAAGAAAGATTGTTTCATGCTGCATACAATGCTAAGAGGCAAGCGATTATTAATGGGAGAAATCCGTCCCCAATGTGGGACAGGTTGGTATTTAACAAAATAAAAGCTAGGCTTGGTGGACGTGTGAGGCTTATGACTTCAGGCGCTTCTCCATTGTCAGCTGATGTAATGGAATTCCTAAGAATATGTTTTGGTGGTGAAGTACTCGAAGGATATGGAATGACAGAGACATCATGTATCATCTCTGCAATGAATATTGGTGATAGGTTAATTGGTCATGTCGGATCTCCAAATCCATCTTGTGAGATTAAACTAGTGGATGTCCCAGAAATGAATTACACCTCTGAGGATGAACCATATCCTCGTGGAGAAATCTGTGTTAGGGGACCTACGATATTCTGTGGTTACTATAAAGACGAAATCCAAACTAGAGAGGCTGTTGACGAGGATGGTTGGTTACACACTGGAGACATAGGTTTGTGGATGCCTGGAGGGCGTCTAAAAATTATAGATAGGAAAAAGAACATTTTCAAGTTAGCTCAAGGAGAATACATAGCTCCCGAGAAGATTGAGAATGTCTATGCTAAGTGCAAGTTTATTGCGCAGTCCTTTATATATGGTGATAGTTTAAACTCTTCTTTGGTTGCCGTAGTAGCAGTTGAACCAGATGTGTTGAAGGCTTGGGCTGCATCTGAGGGAATCCAGCACGAGGATTTAAGACAGCTTTGTGCTGATCCGAGAGCAAGATCTGCTGTCCTGGCTGAGATGGACTCTATTGGAAAGGAAGCACAGGTCAAAAGACCGCAAGCTAAGGCATACTTTGCAAAAGAAATCGCAGATATGTATGCACAACTGCGCCAAGCAGAACAGATAAAACCTAAGCTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARQQQQREEERAPMGAAQRRLRAVSGHLQPPTESGGVDLAANPTAGEYAHVQGYSAVLPEKLQTGKWNVYRSAKSPLKLINRFPDNPDIGTLHDNFVYAVETFRDCRYLGTRVCVDGTVGDYKWMTYGEASTSRTAIGSGLIYHGIPEGARIGLYFINRPEWTIVDHACAAYSYVSVPLYDTLGPDAVQFIVNHATVQAIFCVPQTLSTLLSFITQMPCVRLIVVIGGDNANMPSTPTATGVEIITYSRLLSQGKMSSQSFRPPKPEDIATICYTSGTTGTPKGVVLSHGNLIANVAGSSLVIKFYPSDVYISYLPLAHIYERVNQVSVVHYGVAIGFYQGDNLKLMDDLAALRPTVFPSVPRLYNRIYAAITNAVKESGGLKERLFHAAYNAKRQAIINGRNPSPMWDRLVFNKIKARLGGRVRLMTSGASPLSADVMEFLRICFGGEVLEGYGMTETSCIISAMNIGDRLIGHVGSPNPSCEIKLVDVPEMNYTSEDEPYPRGEICVRGPTIFCGYYKDEIQTREAVDEDGWLHTGDIGLWMPGGRLKIIDRKKNIFKLAQGEYIAPEKIENVYAKCKFIAQSFIYGDSLNSSLVAVVAVEPDVLKAWAASEGIQHEDLRQLCADPRARSAVLAEMDSIGKEAQVKRPQAKAYFAKEIADMYAQLRQAEQIKPKL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..154#661..721#797..874#1356..1427#1516..1597#1755..1860#1938..2014#2442..2486#2587..2673#3939..4028#4123..4202#4308..4401#5088..5176#5309..5397#5583..5712#5804..5922#6067..6190#6276..6362#7072..7175#7254..7339#7560..7646#7902..7997#ATGGCGCGGCAGCAGCAGCAGCGGGAGGAGGAGAGGGCCCCAATGGGCGCGGCCCAGCGGCGGCTGCGCGCCGTCTCCGGCCACCTCCAGCCGCCGACGGAGTCCGGCGGCGTTGACCTCGCCGCCAACCCCACCGCCGGCGAGTACGCGCACGGTACGTACGATCGATCGATCGATCGTCTATTCGTCTGCACTACTACTTGCTACTTACTAGTGATGTGGTATGCATTTGTGATTTTATCCATCCCGTGCATGATTGATGCCGCGATTTGGATCTTGGGGTTGGATTGCGTGGGGCCTACTGGGCGCGCGCACCGCTCGAGCGTAAAGTGGATAAAGTGGAGAATAACAAGTGCAACCACTCCCAAATTCCCAATTCTTAAGCTGTAGAGATAGCTTCCTCTTTCTGAATTTGTGCTTAGACTGGGCATCTATGCCATAATTCCATTGCTGAGCTCGGTAACCGTCTAAAATAATTGCTTAGCTCCGAGCTCGTTAGCTTTTAACTGACTGGGATGCTTCTTTTCCTATTTTTTAGTACGCCGACGCATGCTAGTTGCGGTTTCTCAACTGCACTCTGCATGTTTTAAGTTATCTTTCTTGACATAGCAATGCTTTTTTTTTTTAAAGTTTACAACTCAATGTGCATAGCTTCTCCAGTGCAGGGCTACAGTGCTGTACTCCCTGAGAAGTTGCAAACTGGAAAGTGGAATGTGTACAGGTAGGTTATTTAGTAGTATATGTTATACTGCATTTGCTTATGTCATGGCTCAAAATTTCTGTTTCCATCTTGCAGATCCGCGAAGTCACCTCTTAAGTTAATAAATAGATTCCCTGATAACCCAGACATTGGAACGCTTCATGATAACTTTGTGTAAGAATCCTCATAGTCTGACTTGAGCATCAAACTTCTATTTCTGAATGTTAATCTCAACTTCGACAAATCTCAGTTATTTACCAATGTTATGCTACGATTTATCAAATTCTTGTCTTGAATTGTCAGCAAACCTTTGAGTGTAATTACATACCATCAAGCAAAATAAATGCTAGTTATGTTTTCCTTAGGAATCTCCCATATTTTTTGTTTCTGAATTGTATCAGGAAGATTTTTAGGAAAATCTAATCTAATTAGGAAAAAGAATTATTCGCAAGTGAGTCTGTTATTTTATTGAAACCTTGGAGTTGGAAAATGTTTGTATGCAACGACTTGAATGCAAAGGTTTTTATCTGATGTTTTTATGAAAACTGGTAAACTTAAATGCCTGTTGCAGGCTACATGTTTTACAAGAGAACTATTAGTGTTCAAATTTAAGTGCTGTGATAAGTTCTCAGGCAATATACCCAAAATTGTGCAGGTATGCAGTTGAAACCTTTAGGGACTGTAGATACCTGGGCACAAGAGTCTGTGTTGATGGAACAGTTGGGGAGTAAGAATTGGTTCCTGGATATATATGTCATTATTGCCTTTTGTAGCTTTGTTAAAATCTTTTAAATGATATATATGAATTGTTGCAGCTACAAATGGATGACATATGGAGAAGCTAGTACAAGCCGGACTGCGATAGGTTCTGGTCTTATTTACCATGGAATACCTGAAGTGAGTCATTATGATCTCAACAAGCACCGTCCTTCTGATTTTAACTACTAACAGGCAGATCTTGTCACACATTGCCATAATGATATAGCATTTGTGGTTACACTTACAGATTCCTTTTTTTAAACTTGCATTAAATAATTTTCTAAAACTGAACCAGGGTGCGCGCATTGGTTTGTATTTTATAAACAGACCTGAGTGGACCATAGTTGATCATGCCTGTGCGGCATATTCATATGTATCCGTGCCACTTTATGATACTCTAGGTATGCACTCATCACATAATGATCATCTATCTCCTTTTCATTTATCTAGCAACAAGTTTTATGTATTGTTTATACAGGTCCAGATGCAGTTCAGTTCATTGTTAACCATGCGACAGTACAAGCTATTTTCTGTGTGCCTCAAACACTAAGCACTGTGAGCTTTAACCCTTATTCTCAACCTTGTATAGTTACTAGTCTATACAATCATTAAAAGTCGCAGTTTTCATGTCACTGCTCATACTGGTCCTTAACTTAGTGATGCTGGGAACTAGCTAGTTATTTCCAGGAAACAGATCTGTGCTTTCAGGTGCTGATCTCATCCTGCAGAAACTGCATGCACATCAAATACTGTTTTTTTGGGACCATATCCACATGCACACAACCAATGGGCTGAGTGCTGGGCTGGGGCCTGATCATGAAATACATTCTATGTGGATTCTGATCCTATTTCCATTTTCTTATTTCAAACACTACATCAATTTTGGTAACACTGCCTAGCATTTAATCTTGAATTTTATCATGGTATATTCTATGGAACGAAGTGTACTTATGTTCTGCTTATGTGTAACTATTTATTGCAGCTACTAAGCTTTATAACTCAAATGCCGTGTGTTCGCCTTATAGTGGTAAGTTCAAACCATTTATAGTTAGTATATTCAATGAACGGCCATGATTGTTTAAGATTCTCTCTTTTTCTTTTTTTTTTAAAAAACTTGTTTAATATAGGTAATTGGTGGAGACAATGCAAATATGCCATCTACCCCAACAGCTACTGGAGTGGAAATTATAACTTACTCCAGACTACTTAGCCAGGTGAGTTTGCTAAATGGCCCTTAAGTTTACTAACACTACTTCTTGCTTATGGTATTTGTTCTCTTTTTCATAAAAAAAAAGTATCTGTTATCTAATGTCAGTCAACCAACTGGCATTTAAACTTGTTAAAAAAACACTTTACATGCATACCTGTAGTCCTTGAGAACCACATATCTAGTTCCAAAGTTGTATGGGCATATGGTTCAATATTTATATGAAATCTCTTGGGATACGAATTACTTGGCTGCACTCTTGCACTGATTAATTTAGTACTGTTTCCAAAAGATTTATCCATGGCAAACAAAGTTGATGTGACATCTTGTTTCCACTTCCATTAGAAAACACATTTGTTATGCAATTATATTTATGTATGTATGAGACACGTTGATATTTTGGGGTGAAAACTGGGAACATGAATATTGGATATCCAGTTGACAGCTGTAATGCACGTATGCATACGTTAGCTCTCTAATTCCATTTCATATTTTCATGTATAGTAAACTTGAAAGCTAAATGACAATCTTACATAATAACAAATTGTAGGGCTACCACATGGAGTAAACATTACATAATAACAAATTGTAGGGCTACCACATGGAGTAAACATCTTTTTTTCCTTTCAAATTGTTATAAAACCGGCCCCGAAATCACATCGGAAACCAATCCGCGGAAGAAAACGCCATAGGAGATCCAAACACGATGATGACACCGAGGCATGATATTTGATAACGGAGTTCAGCCGAGGCCTACATCTCCGGGGCACTGATTACGGGTGCTCCTCCCCGATCTAGCATATACAGTGTATCAGAGTTACAACGACTCACGGCCGGTAGCCGCCGGCAGCCGCTCCCTCTCGCTATGCTAAGTCGCCATGCGGTTACAACAGGCACGCCCTCTATTTATGAGAGATCCTAGGATAGAGTCCGACTCATACTCTAGTCCTAATACCTATTACAACTCCAAGTCCTAAACTGTAACCGACTACGTATACATATTCGACACAAACTCTAACACAAATCATAGTTTTGTCTATGTGCTATAGCAGTGTGCGGTGTGCACACTTGCTCAATTCTTTTCTTATGGACACACATAGTATGTGCATGGTGGATATATATTGCCTTAGTTTTAGTTTTGCATCAACGGCCTGCGAAATAAAAAGTATGTGTGTATCTATTTCCAGCCATATACATTATCTTTGCTGTTAGATTAAATGATGCTAGCACATTTTGCTCACTGTTCTTCTGATCTTTCAATCTTCAACTCAGGGAAAGATGAGTTCTCAATCTTTTCGCCCTCCAAAACCTGAAGATATTGCCACTATTTGTTACACTAGTGGCACTACTGGCACACCGAAGGTAAATAACTCATCTTTCTGATTATTTTTAGTTTCATTCAAAGAGCTCTTCTAATTCAACCTTCCAATCTGTGACGATGTCATATTTATTTCAGGGAGTTGTTCTTTCTCATGGGAATTTAATTGCAAATGTAGCAGGATCAAGCCTAGTCATTAAGTTTTACCCATCTGATGTGTGAGTTTACATTAAATCTAGATTTGTTTCTTTCTGCCATAGCTTAATAAATTTATCCCATCTGGTAATGTTTTGAATTATAATCATGTTGGTATGTCTTTGCAGGTATATCTCATATTTACCTTTAGCTCACATCTATGAGAGAGTTAACCAGGTCTCAGTGGTTCACTATGGTGTTGCCATTGGTTTCTACCAAGGGGTATGCAGATCCAAAACCATTTAGGTTGTTAATTTTGTAGTTATTTGCATTTGCTGTTTGTGTAAATAATAAAACCAGTAGAATAATGGGGTTTCTGAGTTCTGACCTAGCAAAGGTAAATATGAATAACCGGGGACAAATGAATTAAACCACTCGGAAAAGTAATTTCTAATGTTAGTTCTGCCACAAGTTACCCCTAGATATAGGAGCAGAATTGAATCACCTAGTGCAATATTTCAAACTGTTATATGACAATCATTCAGAGGTTAATTGAACACAACAGATGCATTTTATGCTGGACCTTTCACCTACAAGGCTACAAGATAATATTCTGATAATCCCATTGTACTA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA036643