BGIOSGA036821
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036821 |
|---|---|
| Description |
Os12g0102500 protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036821, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0102500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036821-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036821-PA |
| Length |
6784 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:189030..195813 |
| Sequence Coding Region |
195747..195813,195027..195561),complement(194433..194938,194211..194343),complement(194052..194123 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:189030..195813 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:189030..195813 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGTCTGCTTCCGCCGCTCTTGTGCTCCTCTTCGTCGCCTTCTCGCTCTCCAATGCTCAGCCTGGTTTCATCAGCTTGGATTGCGGGGGAGACGATGATTACACGGATGGCATTGGGATCCAGTGGACTTCTGATGCCAAGTTTGTCTCTGCTGGCCAGAAAGCGAACCTCTTGCTCCAAAATCAACAATTGCAGCAATATACCACCGTTCGCTCTTTTCCAGCAGACAACAGGAAGTATTGCTACACCATGAATGTCAGGAACAGAACACGCTACCTTGTTAGAGCCACCTTCCTCTATGGCAACTTCGACAACAGCAATGTCTACCCAAAGTTTGATCTCTCCCTTGGACCGACCCCATGGACCACCGTTGTCATTGATGATGCCACCACCCCAGTCGTCCAGGAGGCGATTATCCTCGCTGCTGCTCCAACACTCAGCGTTTGCCTCTCTAATGCCAGCACTGGACAGCCCTTTATTTCTACTCTCGAGCTTCGCCAATTTAACGGCTCCCTCTACTACACCACTGATGAAAAACAGTTCTTTCTTAGACTCTCTGCGAGGATCAATTTTGGTGCTGAAAGCAATGCATCAGTCAGGTATCCTGATGATCCATTTGATAGAATATGGGAGTCTGATTTAGTGAGGCGAGCAAATTACCTTGTCGATGTTGCTCCGGGGACGGAGAGAATATCAACTACAAAACCCATATTCGTCAGTACCAACGAAGAACCACCTCAAAGGGTCATGCAAACTGCAGTTGTTGGCAAAAATGGATCCTTGACCTACCGGATTGATTTGGAAGATTTCCCAGGAAATGCATGGGGAGTCTCATATTTTGCAGAAATTGAAGATTTGGCCCCAAATCAAACTAGGAAATTTAAGTTAGTCATTCCAGGCAAGCCAGAATTCAGTAAACCAACTGTTGATGTGGAAGAGAATGCTCAGGGAAAGTATCGTCTATATGAACCAGGCTACACAAATATTCCACTTCCATTNGTTTTCTCTTTTGGATTCAAGAAGACTAATGATTCGTCAGAGGGACCTATATTGAATGCCATGGAGATCTACAAATATATAGAGATTTCTGTGGGATCTCAAGATGCAAACATTATGGCCAGCTTGGTCTCACGGTATCCAGAAGCAGGTTGGGCACAAGAGGGTGGTGACCCTTGCTTACCAGCATCATGGTCTTGGGTGCAATGCAGTTCTGAGGCAGCACCTAGGATATTTTCAATCTCATTGTCAGGGAAGAACATTACAGGGAGTATCCCTGTGGAATTAACGAAGCTATCGGGGCTGGTCGAACTAAAGCTTGATGGTAACTCATTTACTGGTCAAATTCCTGATTTCACTGGATGCCATGATTTACAATATATTCACCTTGAGGACAACCAATTAACCGGTGCATTGCCACCTTCCTTGGGAGAACTACCTAACCTGAAAGAGTTGTATATTCAGAACAATAAGCTGTCTGGAGAGGTCCCACAAGCGCTTTTCAAAAAGAGCATTATTTTCAACTTCTCAGGAAACAGTGACCTTCGCATGGGACACAGTAACACTGGCCGCACTATAGTAATTATTGTATGTGCTGTGGTTGGGGCCATTTTGATTCTTGTTGCTGCTATTGTTTGTTACCTGTTCACATGCAAAAGGAAGAAGAAATCATCGGACGAAACCGTTGTTATTGCGGCACCAGCAAAAAAGCTAGGCTCATTTTTCAGTGAAGTGGCCACGGAATCGGCACACAGATTTGCATTGTCTGAAATTGAAGATGCTACTGACAAATTTGACAGAAGAATTGGTTCGGGAGGGTTTGGCATAGTATACTATGGAAAGCTTACAGATGGGAGAGAAATCGCAGTCAAACTTCTCACAAATGACTCCTATCAAGGCATCCGAGAATTCCTGAATGAGGTAACATTGCTTTCAAGAATTCATCATAGAAACCTGGTGAGCTTCCTTGGTTACAGCCAGCAAGATGGTAAAAATATACTTGTGTATGAATTCATGCATAACGGGACGTTAAAAGAGCACCTCCGTGGAGGCCCTGATGATGTAAAAATAAATAGCTGGGTCAAGCGTCTTGAGATAGCAGAAGATGCTGCAAAAGGAATAGAGTATCTCCACACAGGATGCTCCCCAACTATCATCCACAGAGACCTCAAGAGCAGTAACATTCTCCTTGACAAGAACATGAGAGCAAAAGTTGCAGACTTTGGCTTGTCAAAACCTGTTGTCGACGGGTCTCATGTATCAAGTATAGTTAGAGGAACAGTTGGATATCTGGACCCAGAGTACTATATCTCGCAGCAGCTAACAGAGAAGAGTGATATGTACAGTTTTGGTGTCATTTTACTTGAGCTAATCTCAGGCCATGAGCCAATCTCAAATGACAACTTTGGGCTCCACTGCCGTAACATTGTTGAATGGGCTAGATCGCACATGGAGAGTGGGGATATCCACGGCATCATTGATCAGTCGTTAGACGCAGGGTACGACCTGCAGTCGGTGTGGAAGATTGCGGAGGTGGCGACGATGTGCGTGAAGCCCAAGGGGGTGCTGAGGCCGTCCATCTCGGAGGTGCTCAAGGAGATTCAGGACGCCATTGCCATCGAGCTGCAACGGGAGCTGCCCTCCAGCATTCACCACCTCATGTCCAAGACGTCTCCCTCCGAAGCCGTCAACACGACAGGCAGTCTGCAAGACCTGGAGCAGAATGCGTCGTTTGATGAGCTGCTCATGCGCCCAGGTCTCAGGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSASAALVLLFVAFSLSNAQPGFISLDCGGDDDYTDGIGIQWTSDAKFVSAGQKANLLLQNQQLQQYTTVRSFPADNRKYCYTMNVRNRTRYLVRATFLYGNFDNSNVYPKFDLSLGPTPWTTVVIDDATTPVVQEAIILAAAPTLSVCLSNASTGQPFISTLELRQFNGSLYYTTDEKQFFLRLSARINFGAESNASVRYPDDPFDRIWESDLVRRANYLVDVAPGTERISTTKPIFVSTNEEPPQRVMQTAVVGKNGSLTYRIDLEDFPGNAWGVSYFAEIEDLAPNQTRKFKLVIPGKPEFSKPTVDVEENAQGKYRLYEPGYTNIPLPXVFSFGFKKTNDSSEGPILNAMEIYKYIEISVGSQDANIMASLVSRYPEAGWAQEGGDPCLPASWSWVQCSSEAAPRIFSISLSGKNITGSIPVELTKLSGLVELKLDGNSFTGQIPDFTGCHDLQYIHLEDNQLTGALPPSLGELPNLKELYIQNNKLSGEVPQALFKKSIIFNFSGNSDLRMGHSNTGRTIVIIVCAVVGAILILVAAIVCYLFTCKRKKKSSDETVVIAAPAKKLGSFFSEVATESAHRFALSEIEDATDKFDRRIGSGGFGIVYYGKLTDGREIAVKLLTNDSYQGIREFLNEVTLLSRIHHRNLVSFLGYSQQDGKNILVYEFMHNGTLKEHLRGGPDDVKINSWVKRLEIAEDAAKGIEYLHTGCSPTIIHRDLKSSNILLDKNMRAKVADFGLSKPVVDGSHVSSIVRGTVGYLDPEYYISQQLTEKSDMYSFGVILLELISGHEPISNDNFGLHCRNIVEWARSHMESGDIHGIIDQSLDAGYDLQSVWKIAEVATMCVKPKGVLRPSISEVLKEIQDAIAIELQRELPSSIHHLMSKTSPSEAVNTTGSLQDLEQNASFDELLMRPGLR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..67#253..787#876..1381#1471..1603#1691..1762#1844..1912#1998..2069#2272..2340#2541..2695#2769..3010#4994..5120#5688..5756#5868..6051#6188..6323#6455..6784#ATGCCGTCTGCTTCCGCCGCTCTTGTGCTCCTCTTCGTCGCCTTCTCGCTCTCCAATGCTCAGCCTGGTCAGTCACTCTCCCTCTCACTCACCCTACTCCCTTCTTTTCTTTTCGAGTTTCTTGGAACTCAATAATTTCCACCCTTCTTTACCATTCGCTGGACCTCCTTCAGCTTCAGGGCTGGGAAATCAAATCCATCTCCAAATATAAATCTCTACAAGAAAATTCCATCTTTGATTTGATGCATGCAGGTTTCATCAGCTTGGATTGCGGGGGAGACGATGATTACACGGATGGCATTGGGATCCAGTGGACTTCTGATGCCAAGTTTGTCTCTGCTGGCCAGAAAGCGAACCTCTTGCTCCAAAATCAACAATTGCAGCAATATACCACCGTTCGCTCTTTTCCAGCAGACAACAGGAAGTATTGCTACACCATGAATGTCAGGAACAGAACACGCTACCTTGTTAGAGCCACCTTCCTCTATGGCAACTTCGACAACAGCAATGTCTACCCAAAGTTTGATCTCTCCCTTGGACCGACCCCATGGACCACCGTTGTCATTGATGATGCCACCACCCCAGTCGTCCAGGAGGCGATTATCCTCGCTGCTGCTCCAACACTCAGCGTTTGCCTCTCTAATGCCAGCACTGGACAGCCCTTTATTTCTACTCTCGAGCTTCGCCAATTTAACGGCTCCCTCTACTACACCACTGATGAAAAACAGTTCTTTCTTAGACTCTCTGCGAGGATCAATTTTGGTGCTGAAAGCAATGCATCAGTCAGGTATGCGCTACTACTGCTGCGTAGCACCATTGTTCATACTTTCGTTGCAATATCTGCCTAAAGAATTTGTTGTTGATGATGTTTTCAGGTATCCTGATGATCCATTTGATAGAATATGGGAGTCTGATTTAGTGAGGCGAGCAAATTACCTTGTCGATGTTGCTCCGGGGACGGAGAGAATATCAACTACAAAACCCATATTCGTCAGTACCAACGAAGAACCACCTCAAAGGGTCATGCAAACTGCAGTTGTTGGCAAAAATGGATCCTTGACCTACCGGATTGATTTGGAAGATTTCCCAGGAAATGCATGGGGAGTCTCATATTTTGCAGAAATTGAAGATTTGGCCCCAAATCAAACTAGGAAATTTAAGTTAGTCATTCCAGGCAAGCCAGAATTCAGTAAACCAACTGTTGATGTGGAAGAGAATGCTCAGGGAAAGTATCGTCTATATGAACCAGGCTACACAAATATTCCACTTCCATTNGTTTTCTCTTTTGGATTCAAGAAGACTAATGATTCGTCAGAGGGACCTATATTGAATGCCATGGAGATCTACAAATATATAGAGATTTCTGTGGGATCTCAAGATGGTAAGCAATTGTCTGTCTGTCTGTGTTGTAGAATAAATGGAAAAATACACCTGCTGTGTTATAATTTGGTCTTCTGGTTATATTGACAGCAAACATTATGGCCAGCTTGGTCTCACGGTATCCAGAAGCAGGTTGGGCACAAGAGGGTGGTGACCCTTGCTTACCAGCATCATGGTCTTGGGTGCAATGCAGTTCTGAGGCAGCACCTAGGATATTTTCAATGTAAGATGATCCTGTCAATCTGCCTTCAATTTTGAGTTTTTGTGCTCAATATTTGAACATTTGAGATCTAAGGATCATTTCTTGCAGCTCATTGTCAGGGAAGAACATTACAGGGAGTATCCCTGTGGAATTAACGAAGCTATCGGGGCTGGTCGAACTGTAAGATCAGAATAGTTTATTTTTTGCTCTCCCCTCTTTGTAGTTGGCTTTTTTCTGATAAATTTATTTCTTCAAATTCAGAAAGCTTGATGGTAACTCATTTACTGGTCAAATTCCTGATTTCACTGGATGCCATGATTTACAATATATGTGAGTTTTCCATTATTTTGATAGTGTATCCTGGAAACATTATTCTTGTAATTTAGCACTTAGGGTGCTTGTGTCTGCACTGCAGTCACCTTGAGGACAACCAATTAACCGGTGCATTGCCACCTTCCTTGGGAGAACTACCTAACCTGAAAGAGTTGTAAGTTATACGCTTCAGTACACTTTCTTTCCACCCCCATGCTATTTGTATTGCAAGTGCAGTAAATATGAATTTGTGCTGTTATTTTGTTCTTATGATCCTCAAGACCTCAACATGCATCATTGCTATAGATTTTATCTCATTTTACTGCTTTATTCATTGTATTGAAACAAAAATACCTTACTGATCCAAGCCTTCACAGGTATATTCAGAACAATAAGCTGTCTGGAGAGGTCCCACAAGCGCTTTTCAAAAAGAGCATTATTTTCAAGTATGTGTAGCTTTTTCTTTAAGCATAGCTTAATCATTTGATATGAGCAGTGCATACTTTTGTGCCTATATGAACTCCAGTGTGGCTTAGCAAGCTTCATTTACCTTCGATGAAAGTATATATTTGTTTCCCATGTAAATTGAGTACCTAACTTGTGCATAGGATTGTGCTGTTTGTTCTGATCTGTTACCCGTATGCAGCTTCTCAGGAAACAGTGACCTTCGCATGGGACACAGTAACACTGGCCGCACTATAGTAATTATTGTATGTGCTGTGGTTGGGGCCATTTTGATTCTTGTTGCTGCTATTGTTTGTTACCTGTTCACATGCAAAAGGAAGAAGAAATCATCGGACGGTGCGTATTCTTTAGCTCATTGGGCATATCTGGTATGGTGTATGGTCGTGTAGTAATTACTTTGTGTCTCCAGAAACCGTTGTTATTGCGGCACCAGCAAAAAAGCTAGGCTCATTTTTCAGTGAAGTGGCCACGGAATCGGCACACAGATTTGCATTGTCTGAAATTGAAGATGCTACTGACAAATTTGACAGAAGAATTGGTTCGGGAGGGTTTGGCATAGTATACTATGGAAAGCTTACAGATGGGAGAGAAATCGCAGTCAAACTTCTCACAAATGACTCCTATCAAGGCATCCGAGAATTCCTGAATGAGGTATGTTTCTTTTCTTGCCTTATAGTTTTTTCTTGAAATATAAATCACATACACAGTAAGTGTTAGCATTCGGCCTAAAATATGAAGACTATTAAACTTAGGCTAAAAATGGATGACTATTCCCGTTTGGCCAAAAATTAACCTTGGGCCCAAAAATGGTTGACTATTAGCCTTCACCTCAATGACACAACTATTAAGTCTTTGGTCCAAAAACACATGAGTATTAACCTTGGGCCCAAAAACAAATGAATGTTAGCTTGGGCCAAAAATGCATGATTGTTTAGCCTTCAGCTCAAAAACACATGAGTATTACCTTCGAGCCCAAATCACATAAATATTACCTTCACTCAAAATGTCATGAATATTATCCTTGAGCTGAAAAAACACAAGAATATTTGCCTTACTCCAAATACACAGGTGTATTACTCTTCCACCAAAAAAACATACAAGTATTAACCTTCGGCACAAAATTTCATTAGTATTGACCTTGGGACCATAAGTGCATGAATTTGGGCTTCGTCTAAAAATTTCAAGAGTGTTAACCTTGGTCAAAAAACACATGAATATTAGCTTTTGCCCCATAATTTCTTTAGTCTTAGGGCTAGTTCGAACCAGCAGTTTGGCTGCAGCGGTTTGCAGCTCGGAAACGGGGCATATCATTAGCACATAATTAGTTACGTACTCCCTCCATCCAAAAGTGTTAGGCAATTTTTTTTTTGTTTTTTCTAAAAGAGATGATTATATTTGTAGTCTTCATGTGCTAAATTAATTGTTGACAGGAACCCAAGCAACCATCTTAATATTCATTGGTTGCATGCATATAGTTCCTTGATTTTGTTACATGGGAGATGAGTTAATTTCTCCTTGGTCTTGGTGACAAAAGAAATATGTCTTACATTTGAGGATGGAGGGAGTATTAACTATTATAAATTTAATAAATAGATTTTTTTGATTTTTTTAAGAACTTCTATATATTTCACAAAACACATCGTTTAGCAGTTTGGGAAGCATGTTGACGGAAAACGAGGAAGTTGTTGTTTCAAGTTGCTGAAAAGAACTCAACCTCAACCTTAGACCCATAAACACATGAATGTTAGCCTTCTGCTCAAAAAATTCATGATTATTAACCTTGGGGCTAAAAATGTATGGATTATAACCTTTGACCCCAAAACAAATGATTAATAGTCTTCAACCCAAAAAAAATTGTGAGTATTAATTTGGGCCAAAAACATATGAATATTATTAGCCTTTGGCCAAAGTGTACATGAGTATTAGTCTTGGGCACAAGAATTATCACTGGGGCCAAAAACACATGAATATTAGCCTTTGGCCCAACTACACATGAGTATCAGTCTTCAGTTCAAAAGCACGTGACCCTAATACCTTCAGCTGAAAAACACGTTACTATTTGCCTTCAGCCCAAAACTTCGTGAGTCAACCTTGGGCCCAAAAGTGCATCTATATTAGCCTTTGACCCAATTACTCATGAGTAGCCTTTAGCCAAAAACAGATGAATTTTAACCTTTGTGCACACAGTTTAATGAGTGTTGACCCAGGGCCCAAAAAGGCTTTGCGTTCGGCCCAAAATGGGCTGTTTTTCACAGTTTAACAGTTTAAGATATAAATAGAACTTGCGTACCTATTGCTAATTTTACCACTGCTTGGTAGATTGAAACCTTGAAGCTGAAGCTGAAGCCCAGTATATTCTGGGACACATTCATTTCCTACTTAATTGATAGACCTACACTAATGGGATGTGACCATGTTGCGTTACATATACTTATAACCTCAATTTATTTTAAGTAGTATAAGATATGAA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