Os06g0583400
| Gene Name |
Os06g0583400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Histone deacetylase (Fragment) |
| Version |
NM_001064478.1 GI:115468687 GeneID:4341387 |
| Length |
5838 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0583400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:23671362..23677199 |
| Sequence Coding Region |
23671839..23671946,23672074..23672154,23674571..23674634,23674728..23674819,23675373..23675603 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:23671362..23677199 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:23671362..23677199 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgcctccgccggaggcggggggaactcgctgccgacggcgggggccgacggggccaagcggcgggtgtgctacttctacgacgcggaggtggggaactactactacgggcaggggcacccgatgaagccgcaccgcatccggatgacccacgcgctgctcgcccactacggcctcctcgaccagatgcaggtgctcaagccccacccggcgcgcgaccgcgacctctgccgcttccacgccgacgactacgtcgccttcctccgctccgtcacgccggagacccagcaggaccagatccgggcgctcaagcgcttcaacgtcggcgaggactgccccgtcttcgacggcctctacagcttctgccagacctacgccgggggatccgtcggcggcgccgtcaagctcaaccacggccacgacatcgccatcaactgggccggcggcctccaccacgccaagaagtgcgaggcctcgggattctgctacgtcaacgacatcgtcctcgccatcctcgagctcctcaaataccaccagcgtgttctctatgtggatatcgatatccaccatggggatggtgtggaggaggcgttctacacgacggacagggtgatgacggtctcgttccacaagtttggggattatttcccggggaccggggacattcgcgatattgggcactcaaaggggaagtattactctctgaatgtcccgttggacgacggtatcgacgacgagagctaccagtcgttgttcaagccgatcatggggaaggtgatggaggtttttcgccctggcgcggtggtgctccagtgcggtgcggactctctgtcgggtgataggttgggttgcttcaacctgtcaatcaggggccacgcggaatgcgtgagattcatgaggtccttcaatgtcccgctgttgctgcttggtggtggtgggtataccataagaaatgttgcgcggtgttggtgctatgagacaggagttgcacttggtcatgagctcactgacaagatgcctccaaatgagtattttgagtactttggtccagattatacacttcatgttgcaccaagtaacatggagaacaaaaacacacgccagcagttggatgatataagatcaagacttcttgataatctttcaaaacttcgacatgctcctagcgtccaatttcaagagcgaccccctgaggctgagctacctgagcaagatgaagaccaagaggatcctgatgaaaggcaccatgctgattctgatgtggaaatggatgatgtcaaacctttggatgactcaggaaggaggagcagtattcagaatgtgagagttaagagagagtctgctgaaacagatgccgcagatcaggatggtaatagggtcgctgcagagaacaccaagggcacagaacctgcggctgatggagttggttcctcgaaacaaactgttcctaccgatgcaagtgcgatggccatagacgaaccaggctccctgaaagtcgagccagataactcaaacaaattgcaagatcaaccatcggtgcaccagaagacataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDASAGGGGNSLPTAGADGAKRRVCYFYDAEVGNYYYGQGHPMK PHRIRMTHALLAHYGLLDQMQVLKPHPARDRDLCRFHADDYVAFLRSVTPETQQDQIR ALKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQTYAGGSVGGAVKLNHGHDIAINWAGGLHHAKKCEAS GFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYVDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKFGDYFP GTGDIRDIGHSKGKYYSLNVPLDDGIDDESYQSLFKPIMGKVMEVFRPGAVVLQCGAD SLSGDRLGCFNLSIRGHAECVRFMRSFNVPLLLLGGGGYTIRNVARCWCYETGVALGH ELTDKMPPNEYFEYFGPDYTLHVAPSNMENKNTRQQLDDIRSRLLDNLSKLRHAPSVQ FQERPPEAELPEQDEDQEDPDERHHADSDVEMDDVKPLDDSGRRSSIQNVRVKRESAE TDAADQDGNRVAAENTKGTEPAADGVGSSKQTVPTDASAMAIDEPGSLKVEPDNSNKL QDQPSVHQKT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5254..5361#5046..5126#2566..2629#2381..2472#1597..1827#699..1139#84..623#aggagagggcaaagaggggaaaagaaaaaaaaaagagataaaaaaaaaatctcctcctcctcgccgccgccgccgccgccgccatggacgcctccgccggaggcggggggaactcgctgccgacggcgggggccgacggggccaagcggcgggtgtgctacttctacgacgcggaggtggggaactactactacgggcaggggcacccgatgaagccgcaccgcatccggatgacccacgcgctgctcgcccactacggcctcctcgaccagatgcaggtgctcaagccccacccggcgcgcgaccgcgacctctgccgcttccacgccgacgactacgtcgccttcctccgctccgtcacgccggagacccagcaggaccagatccgggcgctcaagcgcttcaacgtcggcgaggactgccccgtcttcgacggcctctacagcttctgccagacctacgccgggggatccgtcggcggcgccgtcaagctcaaccacggccacgacatcgccatcaactgggccggcggcctccaccacgccaagaagtgcgaggcctcgggattctgctacgtcaacgacatcgtcctcgccatcctcgagctcctcaaataccaccaggttctctcgcgctggagagcctaataatcttgcggaattagggttttgggtgtgctaattgtttttgtattgcagcgtgttctctatgtggatatcgatatccaccatggggatggtgtggaggaggcgttctacacgacggacagggtgatgacggtctcgttccacaagtttggggattatttcccggggaccggggacattcgcgatattgggcactcaaaggggaagtattactctctgaatgtcccgttggacgacggtatcgacgacgagagctaccagtcgttgttcaagccgatcatggggaaggtgatggaggtttttcgccctggcgcggtggtgctccagtgcggtgcggactctctgtcgggtgataggttgggttgcttcaacctgtcaatcaggggccacgcggaatgcgtgagattcatgaggtccttcaatgtcccgctgttgctgcttggtggtggtgggtataccataagaaatgttgcgcggtgttggtgctatgaggtatgtatcaggggcatttcctggacatacatttctctgttgtttttgtttgaagagccttcactaatttattaactttaaagatgtatgaaatggcatagttcttctagcatccattttagcgccggcactatgcctgacatgtgtatgtagcaccttggacaactgttttgactaagcgactcacatctataagtacttatgtaaaaaaacctctgttaatcatttcaaactgttatagctattctaataagcacaactcactctgtgatgaactactatggattgtttgataattattgtacttttaatcactgaaatctaacagtatataaccaatgattgtctgagaattttatgaaatactttgagcttctaatgcttttagacgcatgtttcttttattgtaatcattattttcccgtatggtcttatttttctccttatgtttatgcagacaggagttgcacttggtcatgagctcactgacaagatgcctccaaatgagtattttgagtactttggtccagattatacacttcatgttgcaccaagtaacatggagaacaaaaacacacgccagcagttggatgatataagatcaagacttcttgataatctttcaaaacttcgacatgctcctagcgtccaatttcaagagcgaccccctgaggctgagctacctgaggtgagtgagaaattattggcattatggttcttttttgtcctgtagaattcctcagcttcaaggataaaggagtataaggcgtctttctagtagttgctgtaaataataatatttcacaatttgtatgaattgtaaatgtcagctccggaaatatcaggaatgccaaattgacaggtggttagttatttttacatgattgaattttgaaaagttcgttttttttgttttatggtcaaaagctttatattatggtatggattatctatgcagattttttcatgcttgaagtaatctgtcatgtgtgctctaatgctggcacttcacattctgttaataatgttcaaatcgactttgaattttcaagctgaatgcatataatttaaattactaattcctagcataaggaccagttgtctgatgtgtctcagtttatagctttgaaactttacaagtgttgtaagatgcccagtggcatgcccatattgattatggatgtagtttcgaaagtgagaggaaggattttcgcttagttacatctatgtgtctcgtgcagcaagatgaagaccaagaggatcctgatgaaaggcaccatgctgattctgatgtggaaatggatgatgtcaaacctttggatgactcaggaaggtatttgtttctattcagttctgtaaccgttcaggggattctagcagttagaatcatatgacatggtctgatgtatatccttttgtcttttaggaggagcagtattcagaatgtgagagttaagagagagtctgctgaaacagatgccgcagatcaggtatttttctattaaaactcattgaagtaatgttatgtgctggtggtgacagttgttatggttaatgtgtgctcaaaggtgtgtaagcagctatactttctttcatgaatagtgtattctgctgtttgttcctttctgaatggttgttgcatcttcagagagcatattgatattaaatagccgtggactgcgaaagacatcaattgtgagttgatgtgttgtgatgttgaatattttgaattttaatccttgctgtagcgacagttctgaaatttatatactcaacttttcaaattaaacactaaggattggaagagctgaatcatcatagcgaagtaaaggacaactattatgatgtgactatacaacatgaaaatctaatttcatttttctggataatgcatcagtaccatattcgtttgtctgtatcatggtttcttttatggtcctcgggtgttggtattagtttttcaaccttagcccttaattttagttaaggttgtaagatgaatgaagctatataggatccagcattgtttgattcttgagagtcagatatttaattcagatttctcaaatgttctgatgcacatttgcacccggttgggacttatttctaatagtaattctatttgataagtgatttgcataggcttcaaaagtataatttgacagtttgaccattaacttctcttacaatatattgttagtggcaacaaaaccaattcatgtggaagcacttccgaatatgaatccactggtacaacttttgtacagtaaacttgcaaatataatttgactcattgttggttagagcttacaaaatttgacttttcaagtacatggacgagttagggcaaagggaataccttttctttgcaagtgcaaatctaatttatcaattcactgtggttatgtatatcaaataatttcctcggacttgtgaaagtttgatgctcccatgttctaccgttggtcttttgctgttggtgcagttctagtaaaagaattgttgcattgatcatttaacgtcttatagtgaatcctttattggcaccaaaaagtgttattccctcgtatggaatcaaataaaaaaattatccatctcgtcaatggtcttgtttggtagaacaccgcagcagctacagtggctgcagcgggacacgcttacagttctgcttgatgaccatccactgcggtgctgccgctgttctgctcgggctgtgctgtacagtaaaaagcgctgcatgttggcctacctagcaggcccaatgtgtgctcttccgggtgctacacaagcaccgaacaggatcattgcatctaggcaacaactgcctactgcctccacagagcaatgctgtctcggtggcaatgccaatatagaaaaaaaatgcatgacaaaataggaaaaaaaatattaccacacagcttaagtttttcaaacaccagagaaaaaaaaaagagtggtgtaatttcgaaatgtagttggacctgcaagatatggacaagctgtgaggaagtggttagctcagctcacacattggagaccgcaaagagggcatgtatccaaagattcggagattcatatcctgttcttccatgagccccaaatcagtgaagtttgtcatttcaggcctaccaggaggagctacacccagggtcgggcagcacaagtgccggcacacaaccctgctgcaacatgctctgcacaacttcatcgcccttaccatggttgacctcatctggaggaaggggcaccagagttgagtcacaatccaccatggcatggcgagcaggaggtggagtgtagcatgacggatgttaagtgcggtggcagctcaatacggtatccaaggctggtgggaggagcgagatttgtagagatgaggaaaaataatagataagagatgatgctgacaagtgggctcaggggcattttaccatttgcttacactactgacaaactctgctaatggcaatttttaacggtggcgtccgtagtggcttatgagggatgtgaaaaattgctcggtaatataagggaagcatctaatttagatgtcgaataaggaaacttgttaatttcagatgtcaaataaggaattttctcttcagatgtccttgttcttttctgattaagattcagattttaccttggtttctgttaggacgcttttcaaactactaaacggtgtgttcctgtgaaaactttctatatataagttgctttaaaatatcaaatatatccatttgtcaagtttgtaataattaaaatttaattaatcatgtgctaatggttttctcgttttacgtacgtcaacttaatcctcatcttcatcttcatcagtgaaaacttaatcttcaacttaatcattctctgttggtaatagtttgccttgttatttgtatgttgcaggatggtaatagggtcgctgcagagaacaccaagggcacagaacctgcggctgatggagttggttcctcgaaacaaactgttgtaagtgctcttttatttgtgcaaacttgtaatcttgcaaaaggtagacttgcacgtaagtgaactgtcatggatctctgtggtaacaacggctgccttttcatgttttgctctttgacaactgcagcctaccgatgcaagtgcgatggccatagacgaaccaggctccctgaaagtcgagccagataactcaaacaaattgcaagatcaaccatcggtgcaccagaagacataatagttctctctaccttaaaacttagtaactgatgccatctatcatccattgattatattggagaaactcccaactttgaagcagagagttcatgccataccaaaagttatataccaaatttcgaatggtatgtacacctttcgaactggtggtgttttgtgcaatacatttatgccaggctgactattatgtggtatctattattagctttagtttaaccctgtctgctgtcgagcaatcggtatagtcgtgcaatatattctggatctatcaagcaatgtgagacggatgtcaaaccattggttgtgacttcagcaatgtatgtatatgtaagtatagggacaggcagcaggcgttactttggtggaagctacaagctttgtctctcttctcatccctaatacctacgtggggtgcgtctcgttgttgtttaggtattactgcattcttaaaagtgctcatttagggtgaaattct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
