BGIOSGA037521
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA037521 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037521, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0538300 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA037521-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA037521-PA |
| Length |
5999 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:17077373..17083371 |
| Sequence Coding Region |
17077373..17077540,17077636..17077788,17080352..17080500,17080700..17080777,17080855..17080948 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:17077373..17083371 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:17077373..17083371 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGTCCTCGACGCCGGCCACCGCGCCACGGCGGAGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGACATGTCCGGCGCCTCCGTCCTCCCGCTCGCCGGCGCCGCCTACCAGCCCTACGTCTCCGAGCTCCTCTCCTTCTCCATCGAGCGCCTCCACAAGGAGCCGGAGCTGCTGCGGGTGGACGCGGAGCGGGTGCGGCGGCAGATGCAGGAGGTGGCGGTGGAGAACTACGGGGCCTTCATCGCCGCATCCGAGGCGCTCTCCTTCGTCCGCGCGCAGCTCGAGGGGTTCGACAGGCACCTCGAGGCACTGATAGAGGAGATACCGAATTTAACATCTGGCTGCACCGAGTTTGTTGAGTCAGCACAGCAAATTTTAGAAGAGAGGAAGCTCAATCAGACATTACTAGCCAATCACAGCACACTGCTTGATCTGCTTGAAATCCCACAACTGATGGACACATGTATACGAAATGGGAACTATGATGAGGCACTTGACCTGGAAGCCTTTGTTAGTAAAATATCAAAGTTGCACCCTGATTTACCTGTTATCCAAGGCTTAGCTGTTGAAGTCAAGAAGACAATACAGTCATTAATTTCTCAGCTTCTCCAGAAGCTTCGATCAAATATTCAGTTGCCTGAATGCCTCCGTATTGTTGCACATTTGCGCCGCATTGGAGTGTTCAGTGAATCAGAATTGCGTTTACAGTTCTTGAGATGCAGGGAAGCTTGGCTTTCTGGGATTCTTGATGACCTGGACCAAAGGAATGTATATGGGTATCTAACAGGCATGGTGGGTTACCACAGAACACATCTATTTGATGTTGTCAATCAATATCGAGCAATATTCAACAATGATAAGTCCGGAAGTGATGAGAACTACGATGGTGGATTGCTTTTCAGCTGGGCAATGCACCAAATAAGTAATCATCTTACCACTCTTCAAGTTATGTTGCCAAATATAACGGAAGGTGGCTCTCTCTCCAACATTCGTGAACAGTGCATGTATTGTGCAATGGGCCTTGGCTTGGTTGGACTGGATTTCCGTGGCTTACTTCCACCAATTTTTGAAAAAGCTGTGTTAAATTTGTTTTCAAAGAACATGGGTACAGCAGTCGAGAATTTTCAGGTTGTTCTGGATTCACATCGTTGGGTTCCAATGCCATCTGTTGGCTTTGTAGCGAATGGAGTTGTGGATGAGACTTCTGATGATGTGACGCCGCCTTCTGTTTTAATGGAGCATCCACCTCTTGCAGTCTTTGTCAATGGTGTTTCAGCGGCAATGAATGAGCTAAGACCGTGCGCACCATTGAGCTTGAAAAATGTACTTGCCGAGGAGGTGGTGAAGGGATTACAAGCCGTTTCTGACTCCCTAGTCAGATACAATGCCATGCGGATGCTGCGTGGAAATGAGTCCTCTCTTTTCCTTTCACTTTGCCAGGCATTTATTGAGGTCGCATATCCTTACTGCTCTGCATGTTTTGGCCGATGCTACCCCAATGGAGCAATATTGATCACAGAGCGACGAAGCACATTCGACGCAGTCAGCCAGCTGCTGACTGTACCTGCAAGGTCCAACAGCTCAGGGATCAGCATCGAACGGAGGCAATCAGGCAGCATTGAGAGAAAACAGTCTGGAGCCATTGAACGTAAGCAATCGGAAGGCATCGAAAGAAAGCAGTCGATCGACGAGAGCGCGGGGACAACAGCCACCGACAATGGGACCCCAGCTAACGGACCACCTCCAGTGGCGAACGATGATTCTGGGACCTCCTCAGCACCAGCTCAGCCTGATGGGCAAACCACTGCAGCAGCAAGTACGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDVLDAGHRATAESSSSSSSAAAADMSGASVLPLAGAAYQPYVSELLSFSIERLHKEPELLRVDAERVRRQMQEVAVENYGAFIAASEALSFVRAQLEGFDRHLEALIEEIPNLTSGCTEFVESAQQILEERKLNQTLLANHSTLLDLLEIPQLMDTCIRNGNYDEALDLEAFVSKISKLHPDLPVIQGLAVEVKKTIQSLISQLLQKLRSNIQLPECLRIVAHLRRIGVFSESELRLQFLRCREAWLSGILDDLDQRNVYGYLTGMVGYHRTHLFDVVNQYRAIFNNDKSGSDENYDGGLLFSWAMHQISNHLTTLQVMLPNITEGGSLSNIREQCMYCAMGLGLVGLDFRGLLPPIFEKAVLNLFSKNMGTAVENFQVVLDSHRWVPMPSVGFVANGVVDETSDDVTPPSVLMEHPPLAVFVNGVSAAMNELRPCAPLSLKNVLAEEVVKGLQAVSDSLVRYNAMRMLRGNESSLFLSLCQAFIEVAYPYCSACFGRCYPNGAILITERRSTFDAVSQLLTVPARSNSSGISIERRQSGSIERKQSGAIERKQSEGIERKQSIDESAGTTATDNGTPANGPPPVANDDSGTSSAPAQPDGQTTAAAST</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..168#264..416#2980..3128#3328..3405#3483..3576#3799..3873#4221..4517#4602..4669#4756..4810#5017..5155#5319..5503#5628..5999#ATGGACGTCCTCGACGCCGGCCACCGCGCCACGGCGGAGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCCGACATGTCCGGCGCCTCCGTCCTCCCGCTCGCCGGCGCCGCCTACCAGCCCTACGTCTCCGAGCTCCTCTCCTTCTCCATCGAGCGCCTCCACAAGGTAGTTCCCGCCCCCGCCCCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCCTCTTCTCGATGGCGATGGTGATCTGATGGGTTGTGGTGGTGGGTGCGCAGGAGCCGGAGCTGCTGCGGGTGGACGCGGAGCGGGTGCGGCGGCAGATGCAGGAGGTGGCGGTGGAGAACTACGGGGCCTTCATCGCCGCATCCGAGGCGCTCTCCTTCGTCCGCGCGCAGCTCGAGGGGTTCGACAGGCACCTCGAGGCACTGGTAATGCGGCTGGATCCCTTTTTGTCCCGTAGTACGAGAAATTACGGTTGCTCTGTGATTTGGGACGAGTAGATCCCCCACTTTCTCTGTTGTGTGGCAATGTGAGGTGGAGTGATCGGATTGATGGTTCTGCTTCAGGTGGAAATGGGATGTCGAGTGATCCAAATCTGTTGCCTGATGCTGTAGACTGAAGTAACTAGATCCAGACTTTGATGTTCGTGAAATTTAATGCTTAGATTTGCTTCTGTGTTTTCATCTGCAATATTATAGCCTGGCCCTGGTTGATTTTTCATCTTATTAGTTTTGAGTCAGTGAAGACTTCTCTTCTTGCTCAGGCCATTTCAGTTTGGTGGCCACTGAGAATTGCATGGGCTTGGTAATGCCTGTAATTGATTGCTGTGGGCTGTACCATGTAGGAACTTTCACTAATACTAGCCAATGGTGTCACGCGTTCGCGTGACCATGACCTCCATCTCTATTATGGAATTAATATCTTACTATGCTATTTGTATCAATAATAGAAATAAGTGTCTAGGGAACATAGTTTGAAGGAAGTCAATCTACAATTTCTTAATTTATGATGACCATGTTATGATGACAATAAATAATTAAGATTAAATTTCATAGAACTTCAATTATTTGGTGTATCACTTTACTACAACTTTAGAAATGATGAGCTGAATCAATCTGCTACGAACTGGTAGTTTTGACAAATAATTGTGGTTTTCTAAAATATACTCAATGATTAACCTTTACTATGCTCAACTTGTAAAATTTATTGGAAATCTTATATTCATATATCAAACCAAAATTATCTTAAGTCTTAGAAATATTGAAAAACTTAGATTTAATTTCATTTTAACACACACAATTCTAGGTAACTTAATATTTACAATGTTTTGAACGACTCAGTTGATCAAATAACTAAACACATTTGGATTTTTTTAGACAAAATAGATTTGGAATTTGTGACAAATTAAATACATTGAATCTGTCCTCATGCGAGAGCCTCGCACATTCAATGTTCCAAGCCAATGCATATTTGTCTGCATAGTACCACGTAATATATCCGTCGTAATATATGCATTTGTACCATCGTTCACGCTACTACTTTGTCTCGTCAATATAAGTAGCTTGTGACGTAAATCGCTAGCCGTGATAATACATGAGAGAGTTTGGTTTTATGACGTCCTATAGGCTAGAGACATAGGTAGTAGGAGGAATGTATGTTGTATTTTTTTTAACTCACTTCTTTTTTCCCCTTTTCTTTTTACCATGGCGAGGAGGATCTGGCAACCTACAAGACCAGGGACAAGTAATTTTTTTAGCATTTTCTTTTGATTTTGTTTGACTCTTAATTGGTATTGTCCCTAGCTCTCTCGATATGGGTTGCTTGGAGATCAATCAGGCTTCAGCTTGAACACTCCAGAAGGTTCTCATGGAAGTTGATTAGTTGACTATGAGTCTACAACTGTCTATGGATCCAACGGTTGATATTTCCTCTTTTGGTGTATCCAACGGTCCCCATTTAATTATTACGTGGCTCAATGAGAGAGCTTGAAAGTTTAGTACTTTCACTACTTTAGATGGGATAGTGTGTAATTTCGATCCCGTCCTACCTATTCGTGTGTAAAAAGATCACAGCATACCTCAGGATGCCATGGCACTAGCTTCTCTTCTATAGGGACAGCCAAACTGCTAATTGTTGCAGGTATGCTGGTGACATTAGTTTCATAGGATGAAATAGACATGGATATTTGCTCATGGATTCAATCATTCAAAAGGTTCACAGCGGAGTTCTTGTTCTCACATCTAGGGCAGATCAGATTGTTGTTGTTTAGATGTCTCATCTTATGCAGATTTTATGATGGATAAGCCACAGCACTATCAATTAATGGGGGTTTTAATGGCAACTTCTATAAAATATCTGGTGCTCTATATTTCTGTTGGGGTGCAGTTGACTGGAAATTTTAAGTTAGTATTGTTGTAAACTTATAATACCACAGGATGATCTGATCACTTTTAGTAGAACATAGATCTTTCTTACTGCCGTCCTAGAAGCTTGTTCCAGATGCCCAAAATGTTCAGAGTGTTGTCGTCACCTTGAGCACTTTCTGCACTGCCATTGTTATTTGCGTTGATGAGAGATTTCTAGGTACATGTAAAGATTGTGCAAAATGACTTGGATTTGAGGTACCACTTTATGGCAATGTATTGTTATCACTGATTGCTTGTTTATTAGTCAGTTTTTAAAGTCAAATAATTAGGTAAATGTTTTTCTTTTTTCTGTCAATGGATGTTGGTGTGCTCTCTTCTGTGCTCGTGCAAGTTAAGACATTTTCTGACTTCTGAAAGTTGCATATCCCGATTTTTTTCATGTGGATTATTTTAGACTTTTAGTTATACTATAGACCAACAATGCAACCTTTTCTCTTCTTCATGCTTTTTTTTTTAAAAAAAATTGTCTAGTGAGATGCATTTTTATGCAATTTAGGTTTTCTCAGCAGTATGGCATGTAATATTTGACCCTTTTTTGTGCACTTTGTACATTTATTTATTACAGATAGAGGAGATACCGAATTTAACATCTGGCTGCACCGAGTTTGTTGAGTCAGCACAGCAAATTTTAGAAGAGAGGAAGCTCAATCAGACATTACTAGCCAATCACAGCACACTGCTTGATCTGCTTGAAATCCCACAACTGATGGACACGTATGTGCCATTTTTTTTTATAATTTCTTAAAGACCTTCAGTCATCTTGTGTTGTTTGATGTTGTTGATATGCTGTTTAGTTCTCGATTCTTCTCTAATTTGTGTATGCTACAGATCCATTTTGTTCAGTAAAACATGGTTTGATTTGTACAATTGACGAATCATGAAGAATTACATTTAACAATCTACATGCTCACAGATGTATACGAAATGGGAACTATGATGAGGCACTTGACCTGGAAGCCTTTGTTAGTAAAATATCAAAGTTGCACCCTGAGTAAGTCATTTGACATAATCTTTATTATGGCCTTTGTAATTTGCAATTAATTTAACTGTATGCCTTTTCGATTGAAGTTTACCTGTTATCCAAGGCTTAGCTGTTGAAGTCAAGAAGACAATACAGTCATTAATTTCTCAGCTTCTCCAGAAGCTTCGATCAAATATTCAGGTGATTATGTTGGTGCACTAACAATCTGTCATTGGTTAAACCATTATCGTATTTTTCATTTGCTCCATCTGTTCTATGCAAGTTGAACATTGTAAAGATTGTATCCTGTATATAACCGAGTTCTTTGTTGTGCAACTAATTTCATTTCTTTTCCAAATTTACTTGGTTTTGTCTCCTCTTAGCACATCTATGTCTAACTCCTGGTCATTTGACTGTCTACAGTTGCCTGAATGCCTCCGTATTGTTGCACATTTGCGCCGCATTGGAGTGTTCAGTGAATCAGAATTGCGTTTACAGGTATTCTGAACTTCTGATGTAATCTGGATTTTTTTTTTTGCGGGGAATAATCTGAATAGAATTATACGTCAGTATAATGCTTTTACATTTAATTTTGAATTTATGAGTAATTCATTTGTTACCCTAAACCCTTACTTCAAAGCGGTGGTCCAGAGTATATAAACTACTAATGGAGGAATTTTAATTGTAATAATGACATTTCATTTAGTTCAAAGTGTTGGTCCAGATTACTACAAACTACTATTGGAGGAATTTTAATTGATAATAATGATATTTCACTGAGTCAAATTCATTGGATGATACATATCGAGTATTTTTCTCTCTCCTAATTCTGATATAGTTTCTAGTTCTTGAGATGCAGGGAAGCTTGGCTTTCTGGGATTCTTGATGACCTGGACCAAAGGAATGTATATGGGTATCTAACAGGCATGGTGGGTTACCACAGAACACATCTATTTGATGTTGTCAATCAATATCGAGCAATATTCAACAATGATAAGTCCGGAAGTGATGAGAACTACGATGGTGGATTGCTTTTCAGCTGGGCAATGCACCAAATAAGTAATCATCTTACCACTCTTCAAGTTATGTTGCCAAATATAACGGAAGGTGGCTCTCTCTCCAACATTCGTGAACAGTGCATGGTAAGCTTCTGCTAGTGAGTAACAGGAGTTTGATTGGGATCATTTGATTCATCATAAATTTGCATCACTTGTTTCATCTTGCAGTATTGTGCAATGGGCCTTGGCTTGGTTGGACTGGATTTCCGTGGCTTACTTCCACCAATTTTTGAAAAGTAATTAGCATTTTCTTGTAAATTTTATTAGAGTATTCACGCTGCAAACAGAACCTATTCTTATTGATGATGTTATCTGCATGCAGAGCTGTGTTAAATTTGTTTTCAAAGAACATGGGTACAGCAGTCGAGAATTTTCAGGTAATGCAAAATGTGCACAATCGTTATCGATGTGGATGTGCTATTTACTTCTTATCTAGATAATAGAATGAATTTAGGTTACAGGCTTCATGGTAGATGGTACTATTTTACTTAGTGTTTTCAGCTGTAGTCCACATTTTCAAATGTCTATACTTTCTTCCTCAAACATTATTTTAATTTCACCATTTTACCTTCTATCATGTTAGGTTGTTCTGGATTCACATCGTTGGGTTCCAATGCCATCTGTTGGCTTTGTAGCGAATGGAGTTGTGGATGAGACTTCTGATGATGTGACGCCGCCTTCTGTTTTAATGGAGCATCCACCTCTTGCAGTCTTTGTCAATGGTAAGTTTTGTTGATCTCTCTCTCCCTCTCATTCCCCTGCACATGGGAATTCTACACTTAAATGAAATATTGAATTTATACACCATCATGTTGAATCTAATGGTCATGTGTTGTGATGGCTGTATAAAAGTTGATATGTCATTTGTTTTAACTTTCTGTGCAGGTGTTTCAGCGGCAATGAATGAGCTAAGACCGTGCGCACCATTGAGCTTGAAAAATGTACTTGCCGAGGAGGTGGTGAAGGGATTACAAGCCGTTTCTGACTCCCTAGTCAGATACAATGCCATGCGGATGCTGCGTGGAAATGAGTCCTCTCTTTTCCTTTCACTTTGCCAGGCATTTATTGAGGTAAGGGGCCTCTGGAAAAAGGAGTATTTTTGTCCAATTCCTCAAACAAATAATATTCCAAATTATGACCAGGTGGTGTTTCTATACACCTAGAGAAGGATTACATATTAATTTATCCTCGCAGGTCGCATATCCTTACTGCTCTGCATGTTTTGGCCGATGCTACCCCAATGGAGCAATATTGATCACAGAGCGACGAAGCACATTCGACGCAGTCAGCCAGCTGCTGACTGTACCTGCAAGGTCCAACAGCTCAGGGATCAGCATCGAACGGAGGCAATCAGGCAGCATTGAGAGAAAACAGTCTGGAGCCATTGAACGTAAGCAATCGGAAGGCATCGAAAGAAAGCAGTCGATCGACGAGAGCGCGGGGACAACAGCCACCGACAATGGGACCCCAGCTAACGGACCACCTCCAGTGGCGAACGATGATTCTGGGACCTCCTCAGCACCAGCTCAGCCTGATGGGCAAACCACTGCAGCAGCAAGTACGTAG</dnaseqindica> 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