BGIOSGA037821

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA037821

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037821, complete gene.

LocusTag

OsI_39167

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA037821-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA037821-PA

Length

4291

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:22184083..22188373

Sequence Coding Region

22184083..22184482,22184561..22184649,22184711..22184761,22185230..22185323,22185492..22185553
,22185630..22185712,22185834..22185942,22186051..22186092,22186193..22186357
,22187206..22187382,22187861..22188025,22188110..22188373

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:22184083..22188373 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCGCTGCGCCCGCCGCCCCCGCCTCAGGGATTCCTCACCGCGTATCCATCCGCAGCTTTCCCTCCGGTGAAGCGGCCGCATGAGGACGACCTCGGCGCCGGTGACGTGCTGACCTTCAGGTTCCACTCCCTCGCCGTCTTGAAATTATTCGACCGCATCCGCGAGTACCGTCTGCACGATTACCGGTACCAGGCAACGCGAGGCTGGTACAGCTCCGGGACGGCGCCGGAGGATGCTCTTCTTCCCTGTGCGGTTGCTCGACCACCGAGGATGTATGGGTGCGTGATCGGGGTGCAGCGCGGTCGGACGGTGGAGGTCGTCGACACCTCCGACATCTTGCTCGACACCGACCCCGGAACCCTCGACCGCGACTTGTTGAAGAAGAAGCTCGAGACCTACAAGAAGGCGTTCCCTGGCTTGGCCATTCTTGGGTGGTACTCCATTGACACTCATGTGACGAACACCGATATGGAAACCAACCAGGCTACTGTCATTTGGCTTAGTGTTTGGTCATATTATGAAGAAATGTTGCTGTTGTTGATGGATGCTAGTGGAACAACCTTTTATCTTCTATTCAATCCTGCAATGAACCTTTCCCTGAAGGATCTCCCAGTGACTATTTATGAAAAAGTGCACTCTACCAATAGGAGTCCCACTCCGTTAATCTTTGTCCAAGGCAAATATAAAACTGAGACTGTAGAGGCAGAGAGGATATCTTTAGACCATACGTGTCCTGTAGTTTCTGATGTTAGTGTGCCACCTCTTGTTGGAAAAGGGCAACATGCAAATATTATGCAGACTTCTGGATTTAAGCTGATGCTGTTTGAAATTCCTTCTGGTTTCGCGATGTTTGAAGTTTCACAGGAACTGATTGCACGCCCTAAGGACATATGGGCACGATTTGCTTATCAGGATGACATTACAAATGTTATTGTTACCCTGGGTTCTATTCAGATCCATAACAAATCTGTTGCTAGGGATATTATTGTTGGTCCTGGTGACGAACTGAAAGAATTTATCCTAAGCTTTTGCACTCACAACTACTTAATTGTTCAAGATGTAGAGCTTAAAGATGTTATCGAGAAGAAACTTAATATCTATTGTTACTGTAATCCAACTGTTGTCGGTGAATTGACATGGGGACTGAACTATGTCCTACATAAGTTGTTACCTCAAGAGCAAAGTTTAACTCATGAGCCTTATCTTCCACTAAGCAAGGCAATGTCTAAGCAGATAAAAGAATATGGATTCAAAATCTCGCCACGAGAGATTGACAGAGAGTTCCTAAGAGCTATGAGTTTTTTAAATTATTTGGGGTATATGTCAGAGCGTTATTCACTGCTGCTAGATCATTTGTTTGGACAATATCGTAAGAATAATATGTCCGACATTGAATTTGCTAAATCAATTGCATCTCATCTTCATTCCTCTGAGGGAATTGTACCAAGAGATGAGAGATACACTAGAGCAGAGATTATGGAGTTCATTGACTTCATAATTGCAGCTCCTGAAAACAGAAGCCGGACGCTATCGTTCCTGCGGCGCATCGAGGCAGCTTCTATTGATGATTCTCCTCCACCGCCTTCACTGCCAGGAGGGATGGGTGTTTCGTTGTTGAAGCGTCTTCGTTTGGATTGGATAACTGTTTGTTGTCTAGGATGTGCAGTTGCTCTTTACCCTTTCTACCGCAGAGTATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPLRPPPPPQGFLTAYPSAAFPPVKRPHEDDLGAGDVLTFRFHSLAVLKLFDRIREYRLHDYRYQATRGWYSSGTAPEDALLPCAVARPPRMYGCVIGVQRGRTVEVVDTSDILLDTDPGTLDRDLLKKKLETYKKAFPGLAILGWYSIDTHVTNTDMETNQATVIWLSVWSYYEEMLLLLMDASGTTFYLLFNPAMNLSLKDLPVTIYEKVHSTNRSPTPLIFVQGKYKTETVEAERISLDHTCPVVSDVSVPPLVGKGQHANIMQTSGFKLMLFEIPSGFAMFEVSQELIARPKDIWARFAYQDDITNVIVTLGSIQIHNKSVARDIIVGPGDELKEFILSFCTHNYLIVQDVELKDVIEKKLNIYCYCNPTVVGELTWGLNYVLHKLLPQEQSLTHEPYLPLSKAMSKQIKEYGFKISPREIDREFLRAMSFLNYLGYMSERYSLLLDHLFGQYRKNNMSDIEFAKSIASHLHSSEGIVPRDERYTRAEIMEFIDFIIAAPENRSRTLSFLRRIEAASIDDSPPPPSLPGGMGVSLLKRLRLDWITVCCLGCAVALYPFYRRV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..400#479..567#629..679#1148..1241#1410..1471#1548..1630#1752..1860#1969..2010#2111..2275#3124..3300#3779..3943#4028..4291#ATGCCGCTGCGCCCGCCGCCCCCGCCTCAGGGATTCCTCACCGCGTATCCATCCGCAGCTTTCCCTCCGGTGAAGCGGCCGCATGAGGACGACCTCGGCGCCGGTGACGTGCTGACCTTCAGGTTCCACTCCCTCGCCGTCTTGAAATTATTCGACCGCATCCGCGAGTACCGTCTGCACGATTACCGGTACCAGGCAACGCGAGGCTGGTACAGCTCCGGGACGGCGCCGGAGGATGCTCTTCTTCCCTGTGCGGTTGCTCGACCACCGAGGATGTATGGGTGCGTGATCGGGGTGCAGCGCGGTCGGACGGTGGAGGTCGTCGACACCTCCGACATCTTGCTCGACACCGACCCCGGAACCCTCGACCGCGACTTGTTGAAGAAGAAGCTCGAGACCTGTAAGTTGTTAAACCCTAGCTAGGACTTTGCCGGTGCTTAATTGTTTGTGTTGTGATGTACATTGTTTGGTTATGCAGACAAGAAGGCGTTCCCTGGCTTGGCCATTCTTGGGTGGTACTCCATTGACACTCATGTGACGAACACCGATATGGAAACCAACCAGGCTGTGAGTATTTACAGCCATTCATTTAATTCAACTATATTTGTTCAACTGCTTAATCTGTCAGACTGTCATTTGGCTTAGTGTTTGGTCATATTATGAAGAAATGTTGCTGTTGGTATGTGAGACGTTGGTCATATTATGAAGAAATGCAAACAATTTTTTTCCCCTAAGGTTGCATTCAAAGTTTAACATTGGGGATAAAATGTTCACTGACTGCTGTACGAATGAAAACTCAAAAATGTTGATGAGGTTACAGGACATTGGGATATAGTTTTAGCATTTGCTTGAGCTCTTATAGAATCTGAGTAATATTTGGTTTTAAACTTGTACACGGAATGATTATGGCTGGTGTAACAGCCAGCAATAATAGACAATTAGATATGCTATGCTGGGATGTGCACTGTTCTTAAACTTTATGTAAAGCTCTAGCTTGTTTGTGTGGATGGATGGAATGGTTGAAATTTGGTTTTAGCTTGAGAATGTATTGGAAATATTTATCAAATGTATGTCTGTGTGATCTGTGCTATACATTTTGATTTTACTCCTTGCATGACATTTCTTCCCTTGTACTATTTTTATCCAGTTGATGGATGCTAGTGGAACAACCTTTTATCTTCTATTCAATCCTGCAATGAACCTTTCCCTGAAGGATCTCCCAGTGACTATTTATGAAAAAGGTAAGTGAAGTTTGAAATCGTTGAATATTTCCTACCGTGTAAACCACCAAGTTTAGCACTCAGCTTCTTATTTAATTGCTATGTTCATTAACTTAACTGTTTAGAGCAATAAATGGTTGTTGTTTAGTGATATGAAGATTAACTTTTTTGTCTCTGCAATTTTTCAAGTGCACTCTACCAATAGGAGTCCCACTCCGTTAATCTTTGTCCAAGGCAAATATAAAACTGAGGTTGGTTTTCTCCCTTTTGTTTGTTTTGTTACAAATGTTATGTACTTATGTACTAAATTACAACCTTCTTTGACAGACTGTAGAGGCAGAGAGGATATCTTTAGACCATACGTGTCCTGTAGTTTCTGATGTTAGTGTGCCACCTCTTGTTGGAAAAGGGTAAGTAAAAAAATCTTTTTCCTTTTTCTGAGATGACTTGAATCACTTAGAGATAAATGTGGGGTATACAAAATCACAAACAAAAAAAATAAATGCTGTAACTTTGGTTTTGCACTTGCAGGCAACATGCAAATATTATGCAGACTTCTGGATTTAAGCTGATGCTGTTTGAAATTCCTTCTGGTTTCGCGATGTTTGAAGTTTCACAGGAACTGATTGCACGCCCTAAGGTACTAAACTTGTCCTCCACCACCCTAATTTGATGTAACCTTAACTTGTCCTCCACCACCCTAATTTGATGTAACCTTATTTCTCATAATCAATTTTTTTTTTTGCAGGACATATGGGCACGATTTGCTTATCAGGATGACATTACAAATGTACATTTTACTTTTTTCAATGCTAATGTGTTTATTTCTGTTCTCGATCTCTTAGTTTTTAGGCCATATTTTGATGTGTTTCTTGCCATCCTATTTGCAGGTTATTGTTACCCTGGGTTCTATTCAGATCCATAACAAATCTGTTGCTAGGGATATTATTGTTGGTCCTGGTGACGAACTGAAAGAATTTATCCTAAGCTTTTGCACTCACAACTACTTAATTGTTCAAGATGTAGAGCTTAAAGATGTTATCGAGAAGAAACTTGTGAGTTTATTTCTATCGATTTTGCTAAATCTTTGTCGACAAAATTCTCCTTTGAAATCACTTGATTTTTCCACCTCCAACTGGTGTTGAGATTCGTGCTAATAATGCTCCAAAAAATTAAAGGTAGCTTACCCACCAACATCGGGGCAGTAGGATTCGATTCGATATAATTACAATGTAACTTCTATAGATATGTTGATAAGTTACTAGTTCAGCGTTCTTTTAGTAGTGTCATGGTTTCGAGTTTTTGGCTGTCCACGTAGGGTGCCTGTTAATCTGAACCTGGACGTTGCTTGGTAGCGTCAAGTAGTTTGTAGATATATAATTCATCTATTTTAGTCTGAACAGTACGCTGCTTGTTGCATGTTTGGTGGTTACAAAAATCCGGGTGATTTGATTGGAAAAAATTGTCGAGTGCTATATAGCTAGTCCCATTTCTATAACTAGTTGATACCCTTGTGCTTTGCTGCGGGATATGGGATATGTGGATGAATGCATATTATATATTATAAAAATGGTAGATAATGAATTGACATTGCTTCATATTGAGTTCTGAAAATACAATAAAATTGTAAATGATATGTCATGTTTGCATGATATTTATAATAATTGCTAGTAGGTCATAATGTGGCATACTTACATATGATTTAAATACTTTAAATAATGATTGCTAATGGGTGATGATGTGGCATACATGTTTAGCTTTAGGAGTTAGTAAGCATCAACTTTATAATCAGATACTTATGGGTGGATGTGATGATGTTTTGGGATGGAGGGAGTAGGATTCTTTTGTTTTTTGTGGAATAATCATTGTTTACCTAATATATCATATTCTTATAATTTTTCAGAATATCTATTGTTACTGTAATCCAACTGTTGTCGGTGAATTGACATGGGGACTGAACTATGTCCTACATAAGTTGTTACCTCAAGAGCAAAGTTTAACTCATGAGCCTTATCTTCCACTAAGCAAGGCAATGTCTAAGCAGATAAAAGAATATGGATTCAAAATCTCGCCACGAGAGGTAATTCTCTTTTCTACGATAGTTTCATTTTGATTGGTGTGACTTGAGGTCTAGCAAATATCTAAATATCTAAATATTTCAGTGGCGGATCCACAGGTGGGTGGGGCTTGGTGCGCAAGCCAGCTCCATCCCTTTCCTCTAATTAGCGACTAACGACTCTAATTAATTAGCCATTAGATGTATACCAGTACGGCAAAGAAACTAGCTGAAGCGCTCATTGTCTAAATTACGTTGCAAGTGTGAAATATGCTCACCATACAAATTGTTCATAGGTATGTGTGAATATAATGTATAGCTGCAAATTAAAACGAAGAAATTATAAGCAATAGGTTGTCTTTTGATCTAATGTGTTTTGGGTTTCATCTAATAATATTTGTTTGGTATATGTTAGTTTGTTTCAATCACATAACTATTTCTATACACGAGCTCCTCAATCACACAACTATTATATATATTAATTGATGTCTCATTATTTCAGATTGACAGAGAGTTCCTAAGAGCTATGAGTTTTTTAAATTATTTGGGGTATATGTCAGAGCGTTATTCACTGCTGCTAGATCATTTGTTTGGACAATATCGTAAGAATAATATGTCCGACATTGAATTTGCTAAATCAATTGCATCTCATCTTCATTCCTCTGAGGTCAGTGGGCAATAAACTGATAGTTAACTGAAGATTTAATTTGGTTATTGGCTAATATGATTTATTTTCTTTGATTTAATACAGGGAATTGTACCAAGAGATGAGAGATACACTAGAGCAGAGATTATGGAGTTCATTGACTTCATAATTGCAGCTCCTGAAAACAGAAGCCGGACGCTATCGTTCCTGCGGCGCATCGAGGCAGCTTCTATTGATGATTCTCCTCCACCGCCTTCACTGCCAGGAGGGATGGGTGTTTCGTTGTTGAAGCGTCTTCGTTTGGATTGGATAACTGTTTGTTGTCTAGGATGTGCAGTTGCTCTTTACCCTTTCTACCGCAGAGTATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA037821