Os01g0148400
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0148400 |
|---|---|
| Description |
Brix domain containing protein |
| Version |
NM_001048555.1 GI:115434523 GeneID:4325215 |
| Length |
5212 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0148400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:2631618..2636829 |
| Sequence Coding Region |
2631637..2631882,2632715..2632788,2632874..2633006,2633091..2633172,2633471..2633580 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:2631618..2636829 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:2631618..2636829 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacggcggcggcgggggcgatccgggcggccgggtcggagaggccaaggcggatgccacacgcgctgcgaacaagcgaagggccccatcgccagccgggggtgggggagtcgaggccaagaggaggaggaaggacgccatgggctcgtcggtctccggcagcagatctggtggcggtgggggcaggaggctgcgacatggtcgaggtagaagagctcgtgccttcagacgcaagcttgaggaggaaaataagaattcaaataatagaccccgtgcctcaaatgtggttattgcttatacgcctaacctcattcggcggtatgggactctcttgagaaacatctcatttctgcttccttatgatggtcaaggaaaggcatatgcttgtccttcggacaaaatcaatgtgtttcttaaatggagcagatgcaacttttgtctcttctttgagtgggcagaaggtgatcagatgatgatttgtcatatgttcaatacattgaaagagattcacatatcgtttcttataaatccagcattcctagatgaaagtatggaagtgaaagtaacaaatcctttactttcattttcatccaattttgttgaagatgaaacttgggctcttgtgaaggagatgctaatgatgatgttttctccagttcaagaagatgagcgtgcagcttcagatctatatgtcttcacaaagagtagagattctgtttacttcaggattttcaagatcactagtatccctgcaggcgagagtgaaaattcactggttcttgatgaggttgggctaaatttttgcctcaagcttttagatgtccacggtgcttttgttggctcagactgtgatcaagctctggatggtcttcaaagtcagacaagaaatgagttgaaattatccccagatatatattactgtgtgccaaatgataaacttggatgctgcactctccactcagttgctttgaataatcagaactatttattttttttggagaatggcttggatttatcacattttgaaggtttctgtttgactttggaagaatttctcgagaggaattcttttctgaagataaagcatattgttgggtcaaggaatgatgaggaatgtaattttgttcgaaatattgctaaggcaattattcgttccatgctgtcacaccttgttaacttgttctctttggggaaatgtttgaggatgggaacagaccttctgagaaggaggaaaattcttttaaaaggatctgatgtcaagttctttcaacttgaagtgattgcatatgaggaggatgaagcaataaataatgtgctgcaggttgttgagttggttaaaagttgttttgttggggaaatgataccggctgatctgcaaggtgatctacatgatttaaaggaaaatcctttgaagagacttgaatcagtgatagacagcagctcattaatgtcagctaaagagaagaaaggattattggtcaatttgcacactgaatataaaaccaatattagtccagctattagcgaagatgatcgtgatagtttatttaagcacatcccgtatttggactgctggatgaacagaacggaagacaatgagtatctaaagctcgttgctaatttggattcaaaaaaagtggctttgaaagttaacaaggttggaacggataagagaaaaccatctaaaaatggtatcttacagtttgattttatgaggaattccgatgttcatatacctgaaaaggcattaaaggatggtatcaccccctttcgtttgtcatggacagattatattttaacttcccgctacccaacgtacttgcgtgccattcaaaaaagtttggaaccatacatgaagtcaagaaagaagttaaaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDGGGGGDPGGRVGEAKADATRAANKRRAPSPAGGGGVEAKRRR KDAMGSSVSGSRSGGGGGRRLRHGRGRRARAFRRKLEEENKNSNNRPRASNVVIAYTP NLIRRYGTLLRNISFLLPYDGQGKAYACPSDKINVFLKWSRCNFCLFFEWAEGDQMMI CHMFNTLKEIHISFLINPAFLDESMEVKVTNPLLSFSSNFVEDETWALVKEMLMMMFS PVQEDERAASDLYVFTKSRDSVYFRIFKITSIPAGESENSLVLDEVGLNFCLKLLDVH GAFVGSDCDQALDGLQSQTRNELKLSPDIYYCVPNDKLGCCTLHSVALNNQNYLFFLE NGLDLSHFEGFCLTLEEFLERNSFLKIKHIVGSRNDEECNFVRNIAKAIIRSMLSHLV NLFSLGKCLRMGTDLLRRRKILLKGSDVKFFQLEVIAYEEDEAINNVLQVVELVKSCF VGEMIPADLQGDLHDLKENPLKRLESVIDSSSLMSAKEKKGLLVNLHTEYKTNISPAI SEDDRDSLFKHIPYLDCWMNRTEDNEYLKLVANLDSKKVALKVNKVGTDKRKPSKNGI LQFDFMRNSDVHIPEKALKDGITPFRLSWTDYILTSRYPTYLRAIQKSLEPYMKSRKK LK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>20..265#1098..1171#1257..1389#1474..1555#1854..1963#2042..2134#2237..2287#2396..2488#3640..4512#4587..4699#4819..4831#ggcggggcggggcgccgacatggacggcggcggcgggggcgatccgggcggccgggtcggagaggccaaggcggatgccacacgcgctgcgaacaagcgaagggccccatcgccagccgggggtgggggagtcgaggccaagaggaggaggaaggacgccatgggctcgtcggtctccggcagcagatctggtggcggtgggggcaggaggctgcgacatggtcgaggtagaagagctcgtgccttcagacgcaagcttgaggaggtaattcctgtcacggcccgagctcgaaatggatgcacatattcagacttctcacataatattcagaaaactcagattggacatggataaatttagggatctagggttctattgttaggaataaacttgggcgcgtgaatgaattggtcgtgcgccgttgggttcgacgtgcgcgaacgggagcgccgctacgggatcgtacacatagcgtccacattctctgttttgcaagaaaggaaaaaaaaaagaaggaaagaatgcagaaaacgctgcaagttttatacgaaagcaccaaaacacgtgtgctcatcgttttgtcgattcttctctctctcgcacgtgtttgctacatcctctgttgcagctaacaagtggtataagggtgaggctacacccctggcatgatgtcactccccataagagctgaagacctatgcaaccggtggctctccgtcttgcccctaccttgccacgtgcgccggagtaagggaggtcatcgtcgatcgcctgatcaagtggagctcaggttctgtcgtctaccccacgttgacaaggaccaactacactgagtggtacatggtgatgcgtgttatcctgcaggcgcaaggattgtgggaggcaacctgctggctaagggatgacttgaccctatgacttgtagtctaagacttgactccctaaggaaactgattccctaaggaaaagactttattgactgcagcagcaaggattatactactacctcgaacttttctgtatttgaattcattgcagtacttcattgcagactttgttggcacatttctctgaacttttctgtacttcattgcaggaaaataagaattcaaataatagaccccgtgcctcaaatgtggttattgcttatacgcctaacctcattcggcggtaaattctttcggaacacatacacacaaatatatatgtatgaaatgcaattttagttgatatctaaaatgatatttgttaataggtatgggactctcttgagaaacatctcatttctgcttccttatgatggtcaaggaaaggcatatgcttgtccttcggacaaaatcaatgtgtttcttaaatggagcagatgcaacttttgtctcttctttgaggtataatgaataatctgctttttttttacacgcataacattattttcattcatttaaggtaatctttttttttccttatgtcagtgggcagaaggtgatcagatgatgatttgtcatatgttcaatacattgaaagagattcacatatcgtttcttataaatccaggtaatttcaatgttttttacaattttaaataagagtaaaattttcaaaacccttgttttggggttttcttaacgcaaaatcctaggttttataatttgtttcaaagaacggtagattttgttacaaaatgtttcatgaaaccagggcagatttggataaaaccaattttctggatctgccactgcataaaacccagatacacttatataatccgattggcaacagtaattaattataatattgataactatgatgatttctacatgatgatattgataacaattaaaatttcttgcagcattcctagatgaaagtatggaagtgaaagtaacaaatcctttactttcattttcatccaattttgttgaagatgaaacttgggctcttgtgaaggagatgctaatgatggtaagaactcattttattcaattttttggttcagtttttagcgtgtatataaatgccatatctgatattgttaaacagatgttttctccagttcaagaagatgagcgtgcagcttcagatctatatgtcttcacaaagagtagagattctgtttacttcaggattttcaaggtattcaactaacttatttgttaagaagttgctggttattttcaataaatttcataattcatgtataatcttgtcctgagattttttttttgtattacccagatcactagtatccctgcaggcgagagtgaaaattcactggttcttgatgaggtataaacttctcgtccattcctgatcttgattagtttattgattcatccctaaacataaagcatgtgtggtccattcctaaacttagaacatgtgaactgcttttaggttgggctaaatttttgcctcaagcttttagatgtccacggtgcttttgttggctcagactgtgatcaagctctggatggtcttcaaagtcaggtaactgttaatttcttatgcattaaatgaatgattgtcccggtacttaaaaatggatggtacctagcatggcgtagtggattgacatgtcaacatattgttgtaaaaactataaattgtttattgttgtaaaatcagacagtaagggactgagtttacctgataatttctcaagactgagggagggaaggatagatgatagtagtagaggataataacaatgggtactgtctgcttgcctactcaaccatgacttctcgcattaatgatcaattgagcataggaattacaagaatcttatagagaggcagagaggataaatgggattaaccatggatggtgtcagtttctattttacaattgcacttagtgaaggaaaagaaatggttgtgagtcgagtcacatgagtgtagttgacgggggtagtagagtgtggagtctgctggctgggcctagccgtaaatatgggcctaatttatgtgcgtatacagatgctgaacttattatcgaacggttgatgtggctgcatcagaaggctgctttatggccataatttcctacataggttatacttgtataggaatgtaggaattaggataggatatagaatgcagtaacaaccaatatgtgccagtccactgtatcttatttctgttcaatcgtggcttctatctcatttgttagagagttaaggagtattctgaatcacctgtttggattgcacatttcaattcctagtcctatggtcacaatactttacctgatcattggtggcagtgcatagttgcacttctatttatatttcccagtacgataagtgcattgacacagcaatagttaacataaaaacaatttagcgataaattgtggtctatcatgcatctgcaccatggagattctctgaatttagagaaaatttaagtccttttgtaggatatctgaataatactagcaatacaaattataatatacatttaatttttttttcgtcttgaacacaaatttaaacacggttattcataaaataggtatatcctgtttctttatcgttatattttgttttggcattaaagcattgatgttagttgcatttatggcatttattttttattcttaatataaactaacaatatatggaattgtattttcagacaagaaatgagttgaaattatccccagatatatattactgtgtgccaaatgataaacttggatgctgcactctccactcagttgctttgaataatcagaactatttattttttttggagaatggcttggatttatcacattttgaaggtttctgtttgactttggaagaatttctcgagaggaattcttttctgaagataaagcatattgttgggtcaaggaatgatgaggaatgtaattttgttcgaaatattgctaaggcaattattcgttccatgctgtcacaccttgttaacttgttctctttggggaaatgtttgaggatgggaacagaccttctgagaaggaggaaaattcttttaaaaggatctgatgtcaagttctttcaacttgaagtgattgcatatgaggaggatgaagcaataaataatgtgctgcaggttgttgagttggttaaaagttgttttgttggggaaatgataccggctgatctgcaaggtgatctacatgatttaaaggaaaatcctttgaagagacttgaatcagtgatagacagcagctcattaatgtcagctaaagagaagaaaggattattggtcaatttgcacactgaatataaaaccaatattagtccagctattagcgaagatgatcgtgatagtttatttaagcacatcccgtatttggactgctggatgaacagaacggaagacaatgagtatctaaagctcgttgctaatttggattcaaaaaaagtggctttgaaagttaacaaggttggaacggataagagaaaaccatctaaaaatggtatcttacagtttgattttatgaggaattccgatgttcatatacctgaaaaggcattaaaggtaaaaggatagaatttgatactcttttatgtgttataatatcttcctattctaattatatctactctctgcaggatggtatcaccccctttcgtttgtcatggacagattatattttaacttcccgctacccaacgtacttgcgtgccattcaaaaaagtttggaaccatacatgaagtcaagaaagtaagttttgtctttacacttccgtttctggtattaaatatttgatgatatcaacagttctattgctttctatcccgcaaatgccaatctctgaattatcctttccttgtttggttcaggaagttaaaatgatgttacctcacacacaaagagggcgggctggattttc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