Os01g0180900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0180900 |
|---|---|
| Description |
Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain containing protein |
| Version |
NM_001185276.1 GI:297719686 GeneID:9271331 |
| Length |
5954 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0180900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:4263181..4269134 |
| Sequence Coding Region |
4263181..4263615,4263945..4263992,4264338..4264514,4264670..4264826,4264958..4265041 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:4263181..4269134 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcctcttccccgccgcgccgccaccgtgaggatccgccgcggccagatccaccgcgtcaccgccatgccaccgccgccgcagcaagccccggagccggccgggctgcaactgctgctgcagccggaggtggtggcgccgaaccacccgccgcccgctccaccggcgccggcggcggtgcccgcgccgccgcagccgcagggggaggcgaggtaccgtaggccgctggtgcggctgcaggccgtccccaacgaggaccacgtccccgacaactacggcgacggccccgacgagctcgggatcacgccggcggtgtaccaggcgctggagcgccacctgccgccggatctcgccggcgcccccgccgaggtgaagcgctacttcatgcgcagcgtcctccgcaactacgtcccctcgccgtcgcagcggatcaggacgcagaatcagagggagtacagggaaaggatcttgtccgcataccagccattacatccggagctgtacacaaatgatccatcaactttcatcctaccggcatttcttcaagccataaatggcaacaccgaagaaagcatcacaagcataatgatggagccagcaccgggagtgtttgcatttcctatgctgaagccctcattctgccagatgttaatgtcagaggtgaacaattttttgaggtgggcacaatcagcgaatcaaaggataatgagaccaacatccttagataggcatgggagaggtgctgccctctctgattttggcttgcaagagatgttagacaatctgatgaaggatttcatctcaccaatgtctacagttcttttccctgaagttggcggcaatacactggactcccaccatacattcgttcttgagtatggtgaggctgatggtgctagaggtttccatgtggatgatagtgaggtaacactaaatatctgccttggcaaacacttcactggcgctgacatgtacttccgtggtatacgttgtggaaatcatgttaattcaggaacacatgatgaggagtattttgtacatcccaacgtgcccggacaagtcctgctgcatcatggtagtcacaggcatggtgtcttctcagtaacatctggacggagggttaacatggtcatgtggtgcaaaagctcagtgttcagggagatgaagaaattcatgactgatttttctgggttttgttgcgagtgccagtttcagaggacggcaagacaggtgcaacatcttcaggaattgacggctcgtatctctatcagcggacaggagtcagaagacgaaactccttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPLPRRAATVRIRRGQIHRVTAMPPPPQQAPEPAGLQLLLQPEV VAPNHPPPAPPAPAAVPAPPQPQGEARYRRPLVRLQAVPNEDHVPDNYGDGPDELGIT PAVYQALERHLPPDLAGAPAEVKRYFMRSVLRNYVPSPSQRIRTQNQREYRERILSAY QPLHPELYTNDPSTFILPAFLQAINGNTEESITSIMMEPAPGVFAFPMLKPSFCQMLM SEVNNFLRWAQSANQRIMRPTSLDRHGRGAALSDFGLQEMLDNLMKDFISPMSTVLFP EVGGNTLDSHHTFVLEYGEADGARGFHVDDSEVTLNICLGKHFTGADMYFRGIRCGNH VNSGTHDEEYFVHPNVPGQVLLHHGSHRHGVFSVTSGRRVNMVMWCKSSVFREMKKFM TDFSGFCCECQFQRTARQVQHLQELTARISISGQESEDETP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..435#765..812#1158..1334#1490..1646#1778..1861#2605..2729#4920..5038#5355..5463#5907..5954#atgcctcttccccgccgcgccgccaccgtgaggatccgccgcggccagatccaccgcgtcaccgccatgccaccgccgccgcagcaagccccggagccggccgggctgcaactgctgctgcagccggaggtggtggcgccgaaccacccgccgcccgctccaccggcgccggcggcggtgcccgcgccgccgcagccgcagggggaggcgaggtaccgtaggccgctggtgcggctgcaggccgtccccaacgaggaccacgtccccgacaactacggcgacggccccgacgagctcgggatcacgccggcggtgtaccaggcgctggagcgccacctgccgccggatctcgccggcgcccccgccgaggtgaagcgctacttcatgcgcagcgtcctccgcaactacgtcccctcgccgtcgcagcggatcagggtaagtgtagctagtatacgcgcttttactatttaggcgtctcattaattaattcatttcatcaaatcaagcttcattaatttttgattctctagcagctatagtcataaatgcagtttaatttggcttcatgtacgtagtagtcagttttgcttatttacaactgttttaagtttaattaaccatgagtagtgtgtcttgctattgcatgcatatgatgagttggatatatagtgttagtgtaagtacatacgtagtgtgtgttgttaattaattaagatgaattaatcacgtcgtaacttatgtataatctggaaactcgtttgcagacgcagaatcagagggagtacagggaaaggatcttgtccgcataccaggtacgtattttcttaagcattcatttttttttaaaaaatgcactcttgcactataatcaaaatgtatacacgtattagataatatattatgaatatgtagataggaactcttttttttttgtacatgtaaaaatgctactccttaattacatgctatttgcctagctagctagctaagaaagtattattgcttgaaatgtgccatagacacatttgaattaaaaagtgtgagccacactatttgcacattttatatataggtgaacacacaaactcataggtatatcatttaccctataatatgtacacttacagattttttttttcttattggatattttcaagccattacatccggagctgtacacaaatgatccatcaactttcatcctaccggcatttcttcaagccataaatggcaacaccgaagaaagcatcacaagcataatgatggagccagcaccgggagtgtttgcatttcctatgctgaagccctcattctgccagatgttaatgtcagaggtatgtgattatattgcagcatggaatatcattttggatatatcatgtagtattattttgctgctaattgtggacactaattaattagctttgtaaacgtatatatataaggttaagcaatatcggtaatgctcgtgtggtgtttattctcgcaggtgaacaattttttgaggtgggcacaatcagcgaatcaaaggataatgagaccaacatccttagataggcatgggagaggtgctgccctctctgattttggcttgcaagagatgttagacaatctgatgaaggatttcatctcaccaatgtctacaggtcaattacttgtctcacaacttgattttcttgtaggataggaaagtagattaagattatgatattcatgtatcaaaattttcctttctttaaaatgaaacgattaatgacttaactccttgatcatgcagttcttttccctgaagttggcggcaatacactggactcccaccatacattcgttcttgagtatggtgaggctgatggtgctagaggtatgctataaacatgtaaccacgcatctatgaattaatgactagaactatatataattgtgctacataactcccttagttcattttacatttaagttttagaatatgtgttgccatactttgatcatcatatctacgctctacactatatatctagctagattgatgatataaaaactatatcaatagatttaaagtgtgaaataaccttaataatattttaaatttttaattagggagtaccctaaatatgtacttatagagatatatattacatgtcgacactcaaaccatttgtgtacatgacatattacacacacttttgatgcaagcgcatatatagctaggaagtaatgttttaccatcattttcacagtagctatgtactctctctgtttttattttttgaaaaaaccaactacttctgccacatccaagtactatggaaaaaaaaaaactagtgcagtactacgtgataaaaatacatcaataattaattctatatctgtgtctcctgtagctatcggaaactgtgccgcacacacgatcgaggacattttggtcttttgttgttagcactaaatttgcatcgggcttttggaaatcttttttttttctgggacatatataggggaagctatcaagctatgcatgtagaaattaaaattgctgtcctgaggtaacatattaacatgatcagctttttcttatatattctaaacaacaattgatggagattgcaggtttccatgtggatgatagtgaggtaacactaaatatctgccttggcaaacacttcactggcgctgacatgtacttccgtggtatacgttgtggaaatcatgttaattcaggaacacatgatgaggtactgattgatgtataatttgtaaattaaattaattatgcacccattttatttagatgcccattaattgccatggagcaatgcaagtttttagtaaataaaaaaactattttcttttagtgttaatgctgatcatatcatccaaacctttttattcctttgagcatttctcctttagccttaacttttctattgcttcaggggttgaaccccacaagtcatctacatcctcaccttccttgaacttagctttgtttctttttctaatccatcagtcaaacaataacatttgaatgagaggatgcatgcatggctatgaatatcgacaaaggtgttgactaaagcttgactgtattgacggccatgatgatccagtaatggttggctggaagacatttagagcgagtagaaatgtcaacactatcacaaatacagagatctctaacagctccatgaaaaagaaatccatttgagatggttctaactagatgtcaaatcactaaaaattaatctggaatgggtcgcccaatattgaacccgccacaaacgatctttaatatctcctaatttgcaaatcattacagatcagtgaataatgaatgcaaagaagaggttgttcggagctaatctttatgatctaatgcttaacctataacatgatcatgtaattcataatttcttgtgcggaatttggtatacgagaaaggcggtggctgtctcgcagaagagggatggatgagacagaatcacgagagagcgtgagggagggatgatgacagtgggcacgcatgctagggtttgggtttggggaaggagaggtcaaggagggagtaggaggtagcgggcaccaagtgcatgagaggtgacccaatcgagctatcgtttccagttgatacgacgaccaatagctgatgcgtgctcggaatcctgcctccgtgcatggggcaatgttgatagcgcaagaggcgagcacaccttctcaaaatgccatgtcagcactagcttggggaggggggggggtaatcttcaaagccattagaacctctgtgtagtcaattgcctcttttggttttgccattgaagtagaagcagtctctcgcaaatatggttgctagcttgatgaccatcgtcgctagtggcagtgataattaatcttgtaggtgtcaatgtccctccagggcatcacctacattgcttgaaatggctgtttgggtctcctccagtgctagtgaggatagggtttcattaggttttccgaaagtgggcttgccgtgtgagagattgtcgcttcacgcacagggccggtttcccccatttaaaaaggccttgcggggcttgagggcatattcacaaagaatgaaacttgactccgatcatggggcgtacgtaagggaagtgatcatacggctttggttattcatgcaagatcttgttagggaagtgcacataatcgtggggtgggccacttcccaaacgtgattctcgggttagccaagatcaaccaatagggaacatggttttccccttcgttcattggtttaagcaataaatggatttcggactttcttactattattattgttttttaaatggagagcattatactttactttatcttatcactaaaatagtagacaaacataataagaacatactgcatcccacattccaaattaacacatgcgtacgaatcaaccgatttctacaacacaaagacaattgttaaacactttgttctttgtctactggtgtatagtgggggccatataaaccgatgaacaaattagcaaaaaatgtacatagctagaattgtatagaaattctagctatgtgtgatatttatccctggctagaggattgaatgtctactatttaattcttttagcacttgtatagcagatttttatcagattaattaacacatggaatttggatgtctgaaaaatttctgtaaatctgaaagtaggtttttatttatctataagtaggaaatatttccgtaaatcttctgtaggaaaagtcatgttaaaagagatcatatctacatctaataggtttcaaaattgcattattctagtttgcagatgtgtttttgtgctcatttcctttaattttgttactgttaatgcatgattatgcaaattaacatttgacatcttatttt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|
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