Os06g0612150

From RiceWiki
Revision as of 09:26, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os06g0612150| Description = RNA polymerase, alpha subunit domain containing protein| Version = NM_001187970.1 GI:297725070 GeneID:9270399| Lengt...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os06g0612150

Description

RNA polymerase, alpha subunit domain containing protein

Version

NM_001187970.1 GI:297725070 GeneID:9270399

Length

9728 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0612150, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:25288910..25298637

Sequence Coding Region

25296105..25296332

Expression

GEO Profiles:Os06g0612150

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:25288910..25298637 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008399:25288910..25298637 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>tcaaacactgtatttctttttagcacatacaatgctgattttgatggagatgaaatgaatgtgcactttccacaagatgaaatatctcgtgctgaggccatcaacattgttgatgcaaataagcagtacattggtccaaggagtggggatgctgtcagaggcctcattcaggtaacactgtgcatatgcagttgggatgtttcggttcttccacactgttgctgttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SNTVFLFSTYNADFDGDEMNVHFPQDEISRAEAINIVDANKQYI GPRSGDAVRGLIQVTLCICSWDVSVLPHCCC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7196..7423#agcgccgcttgaaacccctcctcctcccttctccctccacactgcgcggcggtggcccaaggccggcgaatccccacctcctcctcccccctctcgcctccgccgcgcggggggcggccgccgcctcctctcctcgcccgccgccacctccccccacttgtttctgggcagagcgcgcgctcgcgagctcgaggatggccgacgtgcggcccgacgaggtttggttgccggatcattcccagtgattttgcaagtcgtagcatatattccctttgcttctcagtgctagaaatttcatctcgttgcgcttgttttggtgtgttagaacgcgtaccgatatgcttacgattaaggttggggcgcttcagtcctgaaaggttttcaggaaaagcatggcctatttgtgtcttgtcacttttcactgactgtcttattttttttcttttggtttcgagttagtgggggataaatcgcatgattctaattggacttttagtgtacatatgtatattgcagtttgagccttattcctaggtgatcatttacggtctgctgttaaatggttttgcttcttgcgcaggccgcatcagaggaagtgaattctatccacttcagcttctacaatgatgatgaaattaagaggatcagtgttaaacagataacaaagtcggatcgtgtcgatgccaagaactgtcctgtgccaggtggattacttgacccagcaatgggacccacgaatgatactgacacgtgagtacctatccaactattgaaatcgcgcttcgagtgaacacttgttaattacacttaatcctagagatcagctcacatggaactgatacaatctttgacttcagaacaatcatgggtagcatgtgttttattttgcaacattagggtcatcaagatttagcagatttccggttcttttggatatcaatttgtacctcaatagtcagcctagaaaatttagattaagggtctgtttggcagagctctaactcctaaatttagctccaagagttgagtttggagtggagttgattaaacccagctccacctctccagttcgttttgtgagagcgctccacccagctctgctcccattttaggtggagctaaaactgtttggctaggctccagctccagcagaggtggagctggagctgtgccaaactgaccctaacatactaaacagatctttaatttattttttaaaagttagtttaatttgtccggcactttcaatcaaattacagtattgaccattcatgcattggatgtcttatcatagcatttcaaatagattttatgcatgatagaatcaattctaagaggtcatttgaaaatggattatcactgatcaaggattaacttttgtcagtgcttacaacgtgaggattacctcatgtctgtctgcttttttttttgggatcattataaaagataagttttattaggtactaagtttatttgaatctataatgctacatgttttgagggactatttttgttttcatttactttaactcgggggtatatttgatgcaacccttgaagtttctttttgcatgtatcttttttttttgggaaaattagaattttcagtttttgaccatgtctaaattttatgtacagctgcaagagttgtggtcagcagtccattcgctgccccggccattttggccatatcgaattggcgaaaccactatttaatccattgctttttatgagtcttaaaaaccttctccaggttacgtgcttccattgtcacaagttccggttgaacaaggaacaggtgtgcccatgttcatcttatttattttgtttttcaattttctttatcttggagcattcaaggttctgtcgcatcactaaaatatttgattttctgtttactttattaggcagacagatacacaaatgagcttgaactattagtaagaggtgatattgctcatgctaaaaatttggaagacttgggtggcaaagtactttcgaaagaagatgatgaaactgaggccacttcaggtgataaatcggctcgttcggagagggagaataaaacttggacatcgatccaactgaaggaggctctttcgattttctcaaagctaatgaagaaaagacagaagaaatgtgcacattgtgaaaaaaagaatccaattatcaaaaatcctatatatggttggttgatcaaggtacccgtgatgattttaatggcttaaatcttttaggcagtaccatctaacccacaggttacattgattttttaaagatgaacacgtgtcttcctaaaccatggatagggtgctggttgacgtcagccttacgatacacgcttctcaggcagtgcaatgtagaggcacttctgtaaaaggattttttttttttgggggggggtgtaattcctttttaatgatgggtgggaagtatcccaacaaaattccaatctagtggcatgacagcaattagcctaacaggagtgatagaacggtgccgttaaaccatagtggcagaaatgcaattggcccatgttatcacccggtggtgtaaatatgaacatcaaatataatctagcaaattttggatgttgtagtatgttataattccacacaatattttatgattagattcagtggcatattagagtaaacaacagagataaagtttggtataggttgcgattttgtactgtccaccagtactctttatatatatatatatatatatatatatatttaaaaattgcttctcagtcgattttagcctttttttggtaaggttttataacatctctttccttgcattaagcttatccttctcttttccattcaccctctggaaaggggagggtaagctatgggtaggggggggggggtggatgccactctgtgggaacctgtttatcaactaaatgaatataaaattcatagtatgcattagaaaaagcaaagtgatttccccttattttattgcactacactaggtcaaatggtactgacagagtgaccggtgtgtttgcaattttttacggtatatttatgggtaggtcaggttggttgagtaagtaggcatgctctttgccgaggtcgtgtacctttgcatggcatgatttagcatccgtcagcagcattagcaatttcgctttttccttgatgatatcttatacttcttggaactgatatgtctgttgcattatagttcttcactattcactacatgtggtttgtaggatacaacttcttcctctgtaagagcaaatgcgattgccaatgctaaactgagtggagatggtcatgttaatgactcaagagaaactggtgtttccggtcttgatgaagaactaacttcacctggtactttgtccagaagatcaaccaatgaaacaagacgcatttctgatgatacaatcaaagaaatggtggcatcatcaggaaagaaacatctcttgactacagaggttataatactgctatctgtttgagtttaaaggaagccttcatcaatgcagtaccttatgcaagtttttgttccacactactgagcacgtcctttctcaaatgcttcaggttgaatctattctgaaagatttgtggaaaaaggaagcaaggttctgcatgttactatgtgatttccaacagaatacattgagtgtatcagaaaagagaaggggctatgagatgtttttcttgaagaatctgctagtggcaccgaacagattccgcccctcaattagctctagtcttggagtaagtacatcctgctggtataactgactaaatcctgttctgaagtaactaaccgcttctgttatgtgacagatcatggaacatccacaaaatgttctgctcagcaaagtgcaagagtccaatcttgcgcttcagcagagtattgctgcttctaatcatatggaagttcttagaagatggatggatctgcaaagaaatgtaaatgtgctgtatgatagtagtaaaggcctttgtaagtatatctccttctaatgtagaccactcccctttattttcgttgctaacacataaaaagctaaggtgcatcttttcacataactacctggtttccctgcaaaaaaaaagacataactacctggttaacttcttgaaatttgacctcagagcagcgaagtcttatgtgcttttgttgcataaaattgttgttggacataattgtaaacaacttacgctcttataagacggaattcatctcagaagaatatattcaattcaaaccaatgaacttcctggatcattggcccatgtgctagttggagcaagatcatgattcatgaatgcatgttacgttctctcttttgtagatgcattcatgcatcccttaaaagaaggtagtggtggtggcagtgaatctgccaccctacctattttcattgcaaattacccccttgaacttctttatattaagaaacaatcagatctaaatggatatacacatataaatcaaatcgatactccttttaaaagaaaaagtagtggtggtggcagtgaatctgccatcccacctacttccattgcaaattaccccttgaacttctttatattaagaaacaatcaaatctaaatggatagccacatgtaaaatcgaattaaggtgaacattccctatagagaaaaatgtggaacacaatattataataaattttcttttagtaaaagattgtctcactcttttacattttcgaaagtgagagacaatcttgactctgaccgtgcttgtatatatgggttctagtggtttctctgtagatgttgttgagtcgattatctactttatcatttcagtttctgggttacatatgtttttccagacgagaagggattgttaaaaaaaaaaaaacctcaccaacaatgaattatgctccctttttatgaattgtgatttaatctaaaaatgtgcctagttctatttggtagtgttgagatgaactattaatttattaggtaatgcttaggaacgatcttttgtgtgcattttgttttgattaatgaagtttgtgttccattttggaaataaagaacaggtgagatataatattatcttcactactggcttggtgttacaagcataaatgtgccactatttgctttcccataactaaaaagttaagagtggtctctaatgtttatgcctgacagcaaaaaatgagaagaatgcaaatggtataaggcagttgttggaaaagaaagaagggattcttcgacagaagatgatgggtaaaagagttaattatgcatgccggtccgttatatctccagatccatatttggctgttaatgaaattggaattcctcccgtttttgccacacgattgacatatcccgaggtacctgcattgacctataattgttcattactatcaatttttaagcattgacctataattgttcgttactatcaattgttaaagtaacaatgtatatgtttatgcttgttatatgattatttcaaatgtattatacgtcaattatcacctttttgttcattgctgtagattcttgttatgttactttactattactatgatgatagattgatactatacactgaagtcctaaaaatgtccaaactccttacagtccaaactactttactatgatgttatctttgttctttgaagctcaaattatatttaagctggttacatatgaaaatacatgcaccatcttttacatgagtgaacttacagttgcatatgactgtttcttaatgatctatatttttatattgagtcatctgtaacaattgattggttatacttcctagcttctctatttccatttagagatcttgtaatatataggggtaggtgcctgagatatgtgtatgaaagtcatctaactgaaaactacatatctactttggaaaccagatttcttatacccataaactataggggatggaaccatttgaaccgtgaattaattacttttccttcttggagcagcttttacatcatttctatattgtttcacgtgcagaaagtgacaccctggaatgccagaaagctacaagaagctataaataatggtgctgacattcatcctggcgcaacccattacagggataacaacaacatgtacaagctacaagctgcccctcccaaacgccgtgcgattgctaagatgctacctgcttctagaggatccatttctcaaccagggaaagatcccaagtgtgaatttgagagcaaagtggtatatcgacaccttcaagatggtgatgttgtactagtcaatcggcaggtataactatttgctagttagtaagcttgtgttttcttcagcagtaatacatgaaaacaatactagtctcatttaatagttattttctgcttggtaatcttggtatttcaaggcgatttccctccaaattagtattgtaaaggtgtctacctatcccaattccccccctctctctcccccctagggtgccaccttgatctgtctaattgatggtatggcgctggtctaccacttgaatagcacctagagccttgttgagcacttctccaaatacccatacttgttacttgatgcacaatagttcagtagacaggctcacaggcagcatttgtgaaattgtactaacatcctacatccttatattattctatttgacaaccaaaataggccatgggaataacatgtgaaataaggatttttaactcttatgactggatttgaattttgagatgacataaataattagactagatctactacataaatccatttgtgtaggtccatcagttgtaacaactagcaatactggtcagatcagtcagaatggtgcacatgtctcagtttgattaagtacttcactttgtttctagaaaggatacccagttctaagagcaaattggaagtttgatttacaaccaccaactactacactacaagcatactttactaagatgtcgtgcagcgaggttatgagagtatatcgctatcacccgttttatctgtctgcaatgttgtatctctgcaatgtctctaatttcatttttcttgtgatgtgaagcctactcttcacaagcccagcatgatggcacatgttgttcgtgtgctacctggagagaagacaattcgaatgcactatgctaattgcaggtattacaacatatcttcagcaacactgcctatttgtctacttctgttgatcaaacactgtatttctttttagcacatacaatgctgattttgatggagatgaaatgaatgtgcactttccacaagatgaaatatctcgtgctgaggccatcaacattgttgatgcaaataagcagtacattggtccaaggagtggggatgctgtcagaggcctcattcaggtaacactgtgcatatgcagttgggatgtttcggttcttccacactgttgctgttgagcacattcagtggtgtataatcaggcttcccctttcctgtgcatctatctatttaaatcagtgaactcatcctgtcagtaatatattaaaaatcacactatttttattaatgctgtaacggttatttttatattataagctcgttatattccacctttttgtaggaccacattattggtgctgtactcctgacaaagctggacacctttctaagccgtgaggaatataatcagcttgtatatgggtctgtgctctcttcaactcgtagatctggtcagtttggtaaaaagatatctattattatggatgatgatgcactcgaacctgtacctcctgctatttggaagccaaagcccctatggacaggaaaacaggttggatgttttgaagttaccattggcttcaatctccagttcttcacaatttctttaattttaggtgcgcacctcttctgtttatacaggttataacaaccatcttgaaccatgtaacaaaaggtcgccctccatttactgtggagaagaaggggagaatcgaaaaagaatatctaatccctgaagaacgcaatggtgataaagttaaaactataaatccttcagagcaagttttgtatgttcatgacaatgagctcataaaaggcatgatagataaggcccagtttgggaactatgggatagttcatacggttcatgaactatatggtccagagacagctggagtactactctcatcattcagtcgcttgtttacgatggtcctgcaggtgagtttcaactcgttatttccatattttcattgttcatggctcgtcagaatcaactgaaaagctcgtatctggtcaattacttgtaacgaaaaatgttattcctcatcactccttgaatttattgagacagctaaaacatcgtttgcatttgatttgttggcagcagagccaaactattcttccttggaattttgcatttcatttgttggctgaaacatggttatacaatatcacacttttgaacatgtagagggactaaggatgctaaatgaaggaaaataaaatactgggttgaaccagtagttaagactctttgaacaggctaatccactttgttgagctgactttttatttttattttgggctaaagggctgtttgtttcattgccattttttttgggggctaaggggctttttggttctttgccatagcttgcaatgccctttttttttttttggcaacggtaagatttagccattgccaaaattttggcaatttgtttagatcgcttccaaagtattacccatagcctatgccaaactaataatttggcaatgacaaatatttggcatggtcgagtttgactaagaaccaaacaaaccctaaatgactcaatgaaactggctgaactttgggccatatctcccttgtcaagtggcaagcacagaaagtttagttctatggtaatgcgtacccaatatctatgggcagtggatgatgtgagaagtactcagctgctgagtaactggatagaacttttgttttgcccatggaaacactttctatttcatttacatgtagtggctgctttctatattttttttcgcacattaacaatatagtgtaagagaactcaatggacaagcaaaataccctctcaaagtttttaaaaccaattttttggactagtgaaccttagccttccgaacttgtttgggactaaagagcagtgttgattgggtcccatccagatagttgtgatctacactgaaatagtatgttgatccacctttttcacttaaagttattctttagttggcatatgaaagttcagttgtaatcaagtcttttgtcttaaataccaccgaattgatctttgctgagtagtgtcatcatattttatgaattgtactgggcttaatgaatcaatatatccaaatatagttgtggatttcattgtaattgtctggccccactattgtggctgacattgttatgttagttttgaatttgaatctgactaaacttgctctgatcaacaaccataagctgctatgccatataagatccaatgtctcaaaatatagtctacttattatcacctttttttttcaagctgttctattgttttgcatttgactttcttttattttataattttattttcttgttattttgggtgtgattattcttatttgtgatattgtaattgtaaaattaagaacatttattttctttcagttgcatggatttacatgtggagtagatgatctgttactatcccaagagtcagatatgacgagagaggaaattcttgg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0612150, RefSeq:Os06g0612150