Os01g0185200

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Structured Information

Gene Name	Os01g0185200
Description	Glutamyl-tRNA synthetase, class Ic family protein
Version	NM_001048773.1 GI:115434959 GeneID:4325653
Length	6190 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0185200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:4513356..4519545
Sequence Coding Region	4513604..4513701,4513790..4513919,4514027..4514116,4514225..4514330,4514442..4514542 ,4514678..4514773,4514860..4514959,4515133..4515269,4515355..4515486 ,4515563..4515661,4515740..4515937,4516058..4516235,4516635..4516690 ,4516781..4516933,4517248..4517340,4517422..4517523,4517609..4517670 ,4517760..4517855,4518087..4518186,4518323..4518394,4518499..4518546 ,4519309..4519452
Expression	GEO Profiles:Os01g0185200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:4513356..4519545 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:4513356..4519545 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgggcaccggaggcggcgagggggacaagtcggccgtgctgccgctggaggcgctgctggcgctggggctcgaccagcgcacggcggagaacgctctggtcaacagcaaggtcaccgccaacctcgccgccgtcatagccgaggctggtataagtggatgtgataagacggttgggaacctcctgtacacggttgccactaaatacccaaccaatgcgcttgtccatcgtcctgtactcattgactatattgtgtcaacgaagataaagaatcctgcacaactagatgctgctctgtcattccttactaatactggccctgactctttagatactgggaagtttgaagaagcctgtggtgtaggtgtggttgtttcaattgaagagattaaatcaacagtcaatgaggtattaaagcataatatggaggctatattggagcagcgatatcatattaatgttggtaacctatgcggacaggttaggaagaggcacccctggggtgatgctaaggcgaccaaggatgaaattgacaagaagcttgcagagatattaggtccaaagacagatgctgacaatgtaaaaccagtgaaaaagaaaaaggaaaaagcagcaaaagttgaggagaaaaaagctgcagtagtcactgctgcaccgccatctgaggaggaattgaatccatactctatatttcctcagccagaggaaaattttaaggttcatacagaaatattctatagtgatgggaacatatggagagcgcataacagtaaggagattttagagaaacaccttaaggcaaccggtggaaaagtgatgacccgtttcccaccagaacctaatggatatcttcatattggtcatgccaaggctatgtttattgattttggactggcgaaagagagaaatggtcattgttaccttaggtttgatgacacaaatccagaagccgaaaagaaagagtatattgaccacattcaggaaatcgtacactggatgggatgggagccctacaaagttacatatacaagtgattatttccaggctttatatgagcatgcagttgagttaatacgaaaagggctagcctatgtggatcaccagaccgcagaagaaatcaaggaatacagggaaaagaaaatgaatagtccatggagggatagacccattgaagaatcactgaaactatttgaagacatgagacgtgggttgattgctgaaggtgcagcaacactccgaatgaaacaagatatgcagaatgataacaagaatatgtctgatttaatagcatatagaataaaattcactcctcatccacatgctggtgataagtggtgcatctatccaagctatgactatgctcactgcatggtggattctcttgagaacattacacattcgctgtgcacgctcgagtttgacatacgtcgcccgtcatactactggctacttgttgccttgggcctgtaccagccatatgtttgggagtattcgaggctaaacatatcgaatactgtgatgtctaaaagaaagttgaatcgacttgtgacagaaaagtgggtagatgggtgggatgaccctcgtttgttgacactagcaggattgcggcgacgtggagtgtcatcaactgcaattaattcgtttatttgtggaattggaataacaagaagtgacaatagcttaattcgggttgaccgtcttgaatatcatatcagagaagagcttaataaaacagcttcccgtgccatggttgtgttgaatcctctaaaggttgtaataactaacttggaggatgaaaaagtcatagaccttgatggaaaaatgtggcctgatgctcctgcagacgatgcttcatcctactacaaggttcctttctcaagaatcgtttacatcgaaaaaactgattttcgtctaaaggactcgaaagattactacgggctagctcctggtaaatctgccctgctaagatatgcattccccattaaatgtaccgaggttgtttatggtgacaatccagatgacatcattgaaattcgagctgaatatgacccttcaaagactactaaacctaagggtgttctgcactgggttgctcagccagcacctggagttgaaccacttaaggtggaagtaagattatttgataaattattcctctctgagaatcctgctgaactggaggattggctgggtgatcttaacccgaactcaaaagaggtgatcaagggtgcctacgccgtgccatcgcttgcgactgcggttcttggtgacaagttccagttcgagcggctaggctacttcgcagtggacacagactcgacacctgagaacattgtgttcaacaggacggttaccctgcgtgattcgtatgggaaagctgggccaaagtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MGTGGGEGDKSAVLPLEALLALGLDQRTAENALVNSKVTANLAA VIAEAGISGCDKTVGNLLYTVATKYPTNALVHRPVLIDYIVSTKIKNPAQLDAALSFL TNTGPDSLDTGKFEEACGVGVVVSIEEIKSTVNEVLKHNMEAILEQRYHINVGNLCGQ VRKRHPWGDAKATKDEIDKKLAEILGPKTDADNVKPVKKKKEKAAKVEEKKAAVVTAA PPSEEELNPYSIFPQPEENFKVHTEIFYSDGNIWRAHNSKEILEKHLKATGGKVMTRF PPEPNGYLHIGHAKAMFIDFGLAKERNGHCYLRFDDTNPEAEKKEYIDHIQEIVHWMG WEPYKVTYTSDYFQALYEHAVELIRKGLAYVDHQTAEEIKEYREKKMNSPWRDRPIEE SLKLFEDMRRGLIAEGAATLRMKQDMQNDNKNMSDLIAYRIKFTPHPHAGDKWCIYPS YDYAHCMVDSLENITHSLCTLEFDIRRPSYYWLLVALGLYQPYVWEYSRLNISNTVMS KRKLNRLVTEKWVDGWDDPRLLTLAGLRRRGVSSTAINSFICGIGITRSDNSLIRVDR LEYHIREELNKTASRAMVVLNPLKVVITNLEDEKVIDLDGKMWPDAPADDASSYYKVP FSRIVYIEKTDFRLKDSKDYYGLAPGKSALLRYAFPIKCTEVVYGDNPDDIIEIRAEY DPSKTTKPKGVLHWVAQPAPGVEPLKVEVRLFDKLFLSENPAELEDWLGDLNPNSKEV IKGAYAVPSLATAVLGDKFQFERLGYFAVDTDSTPENIVFNRTVTLRDSYGKAGPK</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>5845..5942#5627..5756#5430..5519#5216..5321#5004..5104#4773..4868#4587..4686#4277..4413#4060..4191#3885..3983#3609..3806#3311..3488#2856..2911#2613..2765#2206..2298#2023..2124#1876..1937#1691..1786#1360..1459#1152..1223#1000..1047#94..237#acctgtcgcctaaaccctagctcgcatctcgaggcatctcgcttcacctcgtcgtcgcggtcgccggagccggagccggaggcggcggaggagatgggcaccggaggcggcgagggggacaagtcggccgtgctgccgctggaggcgctgctggcgctggggctcgaccagcgcacggcggagaacgctctggtcaacagcaaggtcaccgccaacctcgccgccgtcatagccgaggtgacgcgctgacgcttgctaccatcgctcgtgcgcttccaattcgattcgatgatgtgtggggtttttttcgcgtttgatatggcgtctatgagtatgggagtgggatttaagtgacttgatggttggaattatgctgaagcctgaagagatgtgcacaatctcgactaaaattatcttaaaagcacagttgtttagtcaatttccattccaattgggacattttgaggttaattttgttctggaggcgcccaaatctagtaatctactttctacaacattataatttgtttgcgctgacaaaatttaactgtctatatttacaccaaagagctgaagttccctggttccattctcatcgatgagtttacctgtgggcatcatttccatgatctcctatgttgctgaaagcctgaaaatttgtcctgcgttggtgcaccgagcggcgagcgtcagagcgcttcaattttagttcccttttttcacctgaaaaatatgcttggatgatgttgcactagttgcaatcttttatcatgtgatgctttgcatggcattgaatttcaagtttgacggaagggtaactgcccatgtcagaattgtgtttacttgccttcttatcgagatcttcaaacctcgatgtcattgtgcttttttttttgcatctgtaatattggcattgtggcacagcttgcattggcttatagtgcccaagctgtggcatgctatgttcttctttcaactaatggacttgccaatgaacaggctggtataagtggatgtgataagacggttgggaacctcctgtacacggtaagcacttacatgaacgagtgaatgatccacgaaaaatcagtggattgtgtttattttatatgcgtgttttataaggctggacttgctcgtggatgtaacaggttgccactaaatacccaaccaatgcgcttgtccatcgtcctgtactcattgactatattgtgtcaacgaaggtatgctcactacctttttcattatgtgttattcttcttgagagtgcacagtacaaaagaaggggtatctttcttctctgccaccaccatcatagttctgtgaacctaaagtattccttgctatgccacttttcagataaagaatcctgcacaactagatgctgctctgtcattccttactaatactggccctgactctttagatactgggaagtttgaagaagcctgtggtgtaggtatgctctctgatcaagtgtactaacatgatactctggtttatgaaccttttaacatagtcacatacagcaccctgaaaattttctggtatgttttggatagtgtggttgtttggatgctaagaaacattagcttaggccttagtgcatgttctcaatgaattagattattcaaggttcaacatctcaatatattaccattttaactggacttcaatgttgtacctgcaggtgtggttgtttcaattgaagagattaaatcaacagtcaatgaggtattaaagcataatatggaggctatattggagcagcgatatcatattaatggtttggcttcttcctcacatttatttgactcgatcattctgtttttatgacatgatgtatctgaccctaccttcttttccttttatcagttggtaacctatgcggacaggttaggaagaggcacccctggggtgatgctaaggcgaccaaggtgccaaaatggtcctatagattattcgccttagatgttattgatttatcgcccctaattttgtcctcacattcttctcatgcaggatgaaattgacaagaagcttgcagagatattaggtccaaagacagatgctgacaatgtaaaaccagtgaaaaagaaaaaggaaaaagcagcaaaagttgaggttggtgagctgtggtcgctcttcatgttcaaaataggatgatgtagtcattacttcacctatgacttctatgatatgcaggagaaaaaagctgcagtagtcactgctgcaccgccatctgaggaggaattgaatccatactctatatttcctcagccagaggaaaattttaaggtaccataactgtgtaaatgtctattagtgttgtgatcatattcttcacagtggcgagctacatgcaagctgtggggttagctgatcagcctttcgaaatcaccatttgaatttgtccaattctcatgaaattcgtttgaacttaatgggattgaccccatgggttctagctgctagctctgccactgattcttcacgctatactgttatttgatacttagtaattatggttattgttcttgtaagtacctcgatcaattgttcttttttatgcatttatgagaaattaacttaggtggtcttgaaatgatcaggttcatacagaaatattctatagtgatgggaacatatggagagcgcataacagtaaggagattttagagaaacaccttaaggcaaccggtggaaaagtgatgacccgtttcccaccagaacctaatggatatcttcatattggtcatgccaaggtttcaatatttgctttcgttaattgtattttcgcacataccacttaaatcatttttgaagattatgcttatatgcttcatcttatgcaggctatgtttattgattttggactggcgaaagagagaaatggtcattgttaccttaggtaataagattttgacttggaaatcttgaacagttttgtcctgataacttaccatttttatattctttcatggcctgtttgatgctgctttaagggcagttttgtgccaatgttctaagcattagaagagttttattccattttgcaaattttattttgtatactcattctgtatagaccatgtactaaaatatggcagacctataaatctatactgcatgtatcaggttatgctggatctatataattctgctctgcatttccattattaattgagatttcgtgatttttgcttgatcttaatttgttcagagaactttaaaatccttagctgcttcagttcatttgctttcatgggaacatgtgtactgataatgtctatatatatcttaacaacaggtttgatgacacaaatccagaagccgaaaagaaagagtatattgaccacattcaggaaatcgtacactggatgggatgggagccctacaaagttacatatacaagtgattatttccaggctttatatgagcatgcagttgagttaatacgaaaagggctagcctatgtggatcaccaggtttcctccagctctcttttttattatttcgatccaacagtaattgaagttgtgtggagctgttacatcatgcccttgagaaataaaatgtgcacatgctgactggtatatgcttgccagaccgcagaagaaatcaaggaatacagggaaaagaaaatgaatagtccatggagggatagacccattgaagaatcactgaaactatttgaagacatgagacgtgggttgattgctgaaggtgcagcaacactccgaatgaaacaagatatgcagaatgataacaagaatatgtctgatttaatagcatatagaataaaagtaagcaatgcaactgaattgtgttttgcttgtctatttcctgataaatacacaactcacactctgatgaccatacagttcactcctcatccacatgctggtgataagtggtgcatctatccaagctatgactatgctcactgcatggtggattctcttgagaacattacacattcggtactttgccttttctcaattagattgagttagttgcattatggcatgatgtggactaagtgtggttattcattagctgtgcacgctcgagtttgacatacgtcgcccgtcatactactggctacttgttgccttgggcctgtaccagccatatgtttgggagtattcgaggctaaacatatcgaatactgtgatgtctaaaagaaaggtggttactgaatcttttgacaagataaatgttacactgcttcatctatggtttaagaacactcatggtttttgttctgttgcagttgaatcgacttgtgacagaaaagtgggtagatgggtgggatgaccctcgtttgttgacactagcaggattgcggcgacgtggagtgtcatcaactgcaattaattcgtttatttgtggaattggaataacaagaaggtagggatacttgaattgtttgttgttcttttgatgtaaattgaattgtttgttctttaggtcttaaggaatgagtttcataaagtatgctttggtctatgcgaaatcactttttttttttgtggacatcattattctgctactgatttgacttgccattttcttacatgcagtgacaatagcttaattcgggttgaccgtcttgaatatcatatcagagaagagcttaataaaacagcttcccgtgccatggttgtgttgaatcctctaaaggtttggtcttcagtccctgctccaaaaccacatcaactcagtaaagttctta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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0185200, RefSeq:Os01g0185200