Os01g0212100

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Structured Information

Gene Name	Os01g0212100
Description	ATP-dependent helicase, DEAH-box family protein
Version	NM_001048912.1 GI:115435237 GeneID:4325567
Length	12699 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0212100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:6111791..6124489
Sequence Coding Region	6111870..6111982,6112101..6112245,6112992..6113066,6113882..6113971,6114151..6114230 ,6114490..6114559,6114671..6114756,6115480..6115549,6115644..6115739 ,6116613..6116718,6116901..6116947,6117024..6117107,6117179..6117232 ,6117431..6117531,6118724..6118814,6119969..6120133,6121129..6121218 ,6121321..6121392,6121780..6121878,6122005..6122091,6122879..6122932 ,6123689..6123768,6123862..6124009
Expression	GEO Profiles:Os01g0212100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:6111791..6124489 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:6111791..6124489 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgtcgaggttctggaggccggggtcggagaagccgacggcggcgatcgtcgaggacgaggagggcggcgtcctcttcctgcccacaagcaccagctcctcctcctcatccgggtttgggtacgcgagcttggagcggcagcggcagcggctgccggtgtacaagtaccggaaggccatcctctacctggtggagcggcacgccacgaccatcgtcgtcggcgagaccggcagcggaaagtccacgcagatccctcagtaccttaaagaggctggatgggccgagggtggtcgacttataggctgcactcaaccaagacgattggccgtgcagtcagttgcatcaagagtagcggaagaagtaggtgtgagactcggagaagaagttggttacacaatccgatttgaggatcaaacaaatccaggtatgaccatgattaaatttctgacagatggggtattgatcagagaaatgatggaagatcctcttctgaccaagtatagtgtaattatggttgatgaagcccatgaacgatccatttcaactgacatgttgctgggtcttctgaaaaagattcaacgacgtcggcccgacttgcgtctaatcatatcctctgcaacaattgaagcaagatccatgtcaacttttttcaacattaggcgaaagaattctatgcttgagtctgctgatcatttgcccaacccagaacctgctattctttctgtggaaggtaaaggttacacagtggaaatccattatgttgaagaacctgtttcagactacttacaggctgctgtgaatactgtacttattattcacgaaaaggaaccaccaggggatattttggtatttttaactggccaggatgacatagacgcagctgttaagatgctaaatgaagaaattcaacaccgtggaagacattatttagacctgctgattctgcccttgtactctggccttccgcggggagatcaagacctcatttttactccaacttcaaaaggtaaaaggaaggttgtgatatcaacaaacattgctgagacgtcattaactctagagggcgtggtgtatgttgttgatagtgggttttccaagcagaagtgttacaatccgatttctgatatcgagagtttagttgtcgcaccaatatccaaggcatccgcaagacaaagagcaggccgagctggaagggtgcgaccaggaaagtgctttaggctttatacagaggaattttaccttaaagaaatgcagccagaagggattcctgaaatgcaaaggtctaaccttgtttcctgcataacacagttgaaagctctaggaatagacaacattttgggatttgattggccagcttctccatcaccagaggcaatgattcgagctcttgaagttctatattccctgggaatccttgatgaagatgccaaactaacagtaccccttggcttccaagttgctgagatccctctggaccctatgatttcaaaaatgatcctttcagccaataatttcggatgctctgatgagatattgaccatagcagcatttctatctgttcaatctgtgtgggtttccatgagaggagtgaaaaaagagtttgatgaagctaagctccgttttgctgctgctgagggagatcatgtgacgttcctgaatatctacaaaggatttcatcaatctggaaaatctagtcagtggtgttacaagaactttttgaaccaccaagcattgaagaaggttattgacatcagggagcagcttgtcaggattatcaagaggtttggcataccactaacatcatgtgatagagatatggaggcagtaagaaaagctattattgctggtgcatttgcttatgcatgccatctagaggaatacagccagaatgggatgtacaaaacaataaggacctcacaagaagtttatattcatccttcttctgtgctatttagggttaatccaaagtgggtcatctaccagtctctagtttcaactgataagcactatatgcgtaatgttattgccattgaaccatcatggcttacggaagctgcaccacatttttatcagttccggacacccaatcctgcccttcactaa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSRFWRPGSEKPTAAIVEDEEGGVLFLPTSTSSSSSSGFGYASL ERQRQRLPVYKYRKAILYLVERHATTIVVGETGSGKSTQIPQYLKEAGWAEGGRLIGC TQPRRLAVQSVASRVAEEVGVRLGEEVGYTIRFEDQTNPGMTMIKFLTDGVLIREMME DPLLTKYSVIMVDEAHERSISTDMLLGLLKKIQRRRPDLRLIISSATIEARSMSTFFN IRRKNSMLESADHLPNPEPAILSVEGKGYTVEIHYVEEPVSDYLQAAVNTVLIIHEKE PPGDILVFLTGQDDIDAAVKMLNEEIQHRGRHYLDLLILPLYSGLPRGDQDLIFTPTS KGKRKVVISTNIAETSLTLEGVVYVVDSGFSKQKCYNPISDIESLVVAPISKASARQR AGRAGRVRPGKCFRLYTEEFYLKEMQPEGIPEMQRSNLVSCITQLKALGIDNILGFDW PASPSPEAMIRALEVLYSLGILDEDAKLTVPLGFQVAEIPLDPMISKMILSANNFGCS DEILTIAAFLSVQSVWVSMRGVKKEFDEAKLRFAAAEGDHVTFLNIYKGFHQSGKSSQ WCYKNFLNHQALKKVIDIREQLVRIIKRFGIPLTSCDRDMEAVRKAIIAGAFAYACHL EEYSQNGMYKTIRTSQEVYIHPSSVLFRVNPKWVIYQSLVSTDKHYMRNVIAIEPSWL TEAAPHFYQFRTPNPALH</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>80..192#311..455#1202..1276#2092..2181#2361..2440#2700..2769#2881..2966#3690..3759#3854..3949#4823..4928#5111..5157#5234..5317#5389..5442#5641..5741#6934..7024#8179..8343#9339..9428#9531..9602#9990..10088#10215..10301#11089..11142#11899..11978#12072..12219#cactatcgctcccccatccaccacaacacggacacacggtcttccccaccggcgacgacgagaagcggcggcgcgtgccatgtcgaggttctggaggccggggtcggagaagccgacggcggcgatcgtcgaggacgaggagggcggcgtcctcttcctgcccacaagcaccagctcctcctcctcatccgggtgctcccccaaaccctaaactaaaccccccctcttccctctcgcattgtcgcgcgcgctactcgcggtttctgaaggtgtggctgctcaccgctgctctcgccgcggttggttttaggtttgggtacgcgagcttggagcggcagcggcagcggctgccggtgtacaagtaccggaaggccatcctctacctggtggagcggcacgccacgaccatcgtcgtcggcgagaccggcagcggaaagtccacgcagatccctcaggtatgtgttctaggcgtatgaatggctctcggtttcccattgcagttgccactgggacgattttcttggtgtgcggagagatctgtccgaggcatttggtcgaacacctgggtttgcttgcgtgcgaccggtgcatacgtagttgcatccgcagtttatgctgcacctgcatgcacttttgtctgggtgccttaggcagcatggtggaaggttacatttcaaaattgtgaatacttgcatgtcatgtctgactaattcgttttgattccaccgaatacctcatgtctgttccctagtaagagagactgagagtaaaaacaccttgtgtgcaagactggcctatgctatgagctctgggtgcttgactggatgagagcatgtgctatggcttggatctccagtttcattttcctgctttctgcatttaattgaatcactttggtgctattgtttgattatattcaccttctgttaatgtatgtcatattctagggacatatatcaatataaagacatatcatagtaaacatgaacaatggccttcaaatcacctagaggaatttgtttaaatgttacttactttaaaagcccatgaaaactgcaaacaacatataatctgccattgtcttctggcggatgatgttccctttccatcttcattgtatattgaatcagcactacataatttcccaccatcttactggcaaatgattttcatttctggcttcattgtattcttttatcagtaccttaaagaggctggatgggccgagggtggtcgacttataggctgcactcaaccaagacgattggccgtgcaggtatccagtgtttgcaacctttatttagttttgcagctgtctctagattctacacaaaatcatgtctttctgattgaccatctgatgatgacatgtgacattattttttcttggctacagagaactatttcactttgatctcataccatgccactgttgtgctctgttgactcatcctcattggaaatacctgcatgtgtagtccaatagttcaaataaacatggcatctgagctagaagattcttcttaagcattagagatggtatttttgcagtatgtctcacatttccacaataacttatcgaacatatgtattagactgtttgcaacagttgtccatgtggttaatgatcacaatccctatttggatttgatctttagaggtaagattatattgagttgttgtttgcattttcttaatttaaaagatgagtgtatgaagggtcaagtcaccccttctatataaggctgatgttccatctcttttcattgcccttgcggtgtcaatgcctccatgatgcagacatgccacttgggtccaggaacaccttgactaggcctatgggccaacccttaacatgcccattacagtttcactttccattctagatcatttagtggatagaatttcatgtttactgacttaaaggatgtcaactgaatgaaattttttacagtttcattcgtagatgacattcttattttcatgctccagttctgatagacctttacttttcttagattgcacctgcaaatgcttcttttttttatctgataattgccttccaactcataatgttagtaatttgaacagtcagttgcatcaagagtagcggaagaagtaggtgtgagactcggagaagaagttggttacacaatccgatttgaggatcaaacaaatccagtatgacccatttcctttttatgcctgttttttttatatggattctgcagtatgaagcattgttgtatatctacagtattccttcaccgtttgtcaatacaaattagaataaaattgttttttctctctctctctctctcctgttagtctgcttattccttacatacctggtttggcagggtatgaccatgattaaatttctgacagatggggtattgatcagagaaatgatggaagatcctcttctgaccaagtataggtatcagtttatatcaccctcaacgtcgacatgatcataagatggccattcaagtagtcaactgtccatttgtattgattattgaaccatgtttgatccaattgcacaagttttgagtgaaatactttgagtgacatattttcagtggtattaaaccctttttctagtttaagaaaatgcatgactaagctgtattatttattgtcttgcatggtttagtttctttgattcacacactaatcctctttttttttgtcagtgtaattatggttgatgaagcccatgaacgatccatttcaactgacatgttgctgggtcttctgaaaaaggttttcatctttggaatgtgctagtctgatctttccatatcttcacgtgtgaataatattttatctgtcacgatgcttgtatatttacatgaatataatcatatataccagattcaacgacgtcggcccgacttgcgtctaatcatatcctctgcaacaattgaagcaagatccatgtcaacttttttcaacattaggtcatttccttatctagtaagaattagctttgttctttcatctttgccctctgttgcttttatgtatagtactttaggaagtactaaataggtaaacacaagcaggaagttcttgataaagtgatttagttcataagactgtttggtgaataattgtgaaattcataagactgttccccaatgagacagctactatgtctgaacctcattgtaaccatagttaaggatgcagaaccaacattattaatgttccaccatcgattgctgccccttttgcagcactagatcttaccttctgtcctatgacacccatgggccaagcatccaaggggatataaaactgttacaatagtattggttggtattaaattaataccaggtatagttagcactgcagcagaatgtaaatatcagcacactggcctcaataggtttctcatgcatcatgccttcctctctcgactgtttctcatcaataacagcatgaaagtacagaaatgccttaccagggcaaatgcaccaaaatttttattcctgagaatctgagatgttttatgactgttaactttgatgcatgttcagctgtttggtgcttcattatatgcatccatcactttaataaagttcatgagatcattatatgcactctagtttgtctatcaagtttgcgtgagcagcgggtctgatatttggattttttatttcatcttctattgcatacaggcgaaagaattctatgcttgagtctgctgatcatttgcccaacccagaacctgctattctttctgtggaagtatgttctcctttcaaaatggaacacacttgagcaaaggcagcctcctttgttaccagtaaaagcataatgtaattatatttttgttttatagggtaaaggttacacagtggaaatccattatgttgaagaacctgtttcagactacttacaggctgctgtgaatactgtacttattattcacgaaaaggttagtttcttcgtgctgtctgataaataatagataattctttgtgttattattatgcttcttagtaggatttaaatgactacctagacttcaggttttacttatatcctattttagacttgattttgcctggttcattgattccttgtaacataacaatggtcattacatacttttgtaggccattttacttcccagtaaaatatttaactcgatcagattactgtctgtagtacaatgaaggtcaattgccgtaaactacaccggattaggagaagggatgcaaatgggttggcccatgggtacccatcgacccacgctagttcctttggtttataattttgcacctaatacgaactacagaactaggaaatgagagaaacacatatcttaatagagtagtgtgggtcatggggtgcccataagtgggtaaacttgcatccctaactaggagcaatatactggtacatgtagtttcatgctcagtcttgtaagcactaaaactaaaattttaccatcgcagttatcatgaagatacatgtgcccaaatcttaacaattatcctttgtagttaatagacatttgttgaaaattttaccttcactgcaagcatgatctcccccagcctctcttcaatttgaagtctttgatatcaaaatagtggtaaaagaaactcaagctgatgtgatcatagcaccacaattaaattagcatggatctccgatatttaattgcataatagtgtcaatgaaatactctgccacattcttc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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0212100, RefSeq:Os01g0212100