Os01g0254100

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Structured Information

Gene Name	Os01g0254100
Description	Similar to CTV.2
Version	NM_001049151.1 GI:115435715 GeneID:4327709
Length	9286 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0254100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:8419975..8429260
Sequence Coding Region	8420434..8420650,8421252..8421427,8421536..8421718,8421865..8421960,8422044..8422172 ,8422246..8422425,8422504..8422614,8422694..8422849,8422963..8423058 ,8423140..8423307,8423382..8423622,8423704..8423831,8424022..8424114 ,8424194..8424289,8424411..8424484,8424564..8424630,8424721..8424830 ,8424979..8425114,8425195..8425295,8426009..8426132,8426217..8426391 ,8426503..8426661,8427403..8427516,8427649..8427828,8428906..8428985
Expression	GEO Profiles:Os01g0254100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:8419975..8429260 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:8419975..8429260 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgtcgtcgctcagccgggagctcgtgttcctcatcctccagttcctcgacgaggagaagttcaaggagaccgtgcacaagcttgagcaagagtcaggattcttcttcaacatgaagtactttgaagagaaggtccatgctggggagtgggatgaagtggagaaatatctttcaggtttcaccaaggtggatgacaataggtattctatgaagatattctttgagatcagaaagcagaagtatttggaagcacttgacaggcatgatagagcaaaggcagtagatattcttgttaaagatcttaaagtcttctcgacattcaacgaggagttatataaagagataacacagcttctaactcttgagaatttcagggaaaatgaacagctgtctaagtacggggataccaaatctgctcgcagtataatgctgattgagctcaaaaaacttattgaagcgaacccccttttccgggaaaagcttgttttcccaactctcaaggcatcacgccttcggactttaatcaaccaaagcttgaactggcagcatcagctttgtaagaatcctcggccaaatccagatatcaagactttgttcactgatcatacctgcactccgccaaatggagctcgtgcttcaccagtttctgtaccactggcagcggttccaaaggccggtggcacatacccaccacttacagctcatactccatttcaacctcctcctgctggtccatctttagcgggttggatggcaaatgctgctgctgctacatcatctgttccatctgctgttgtggcggcatcatcactacctgttccgccaaatcaagctgtcccaatcatgaaacgaccaactataacagactatcaaagtgcagaatctgagcaactaatgaagcgattgaggccaagtggacatggtgttgatgaggccacctatcctgcaccaattccccaacctttatggtcagtggaggatcttcccaggacagtagcttgtacattgtcacagggatctagtgtaaccagcatggattttcatccaactcggcatacactattactagttggatctaccaatggtgaaattacactttgggaggttggtatgcgtgagagactgttttcaaagcccttcaaaatttgggacattcaagcttgttcaccacaatttcagagtgtggctaaagagtcttccatatccattaaccgggttacctggagtcctgatggagacttgataggtgtcgcatttgcaaaacatttgattcatctgcatgcatatcagcaaccaaatgagacgcggcaagttctagagattgacgctcattctggagcagttaatgacatagcattctcccggccaaataagcaactttgtgttgtcacttgtggagatgataggctgataaaggtctgggatatgcatggacagaaactgttttcatttgaagggcatgaggcaccagtgtattccatctgccctcaccacaaagagagtattcagtttatcttctcaacctccctcgacgggaaaattaaggcatggctttatgatcatatgggatccagggtagattatgatgctccaggaaaatggtgtactactatgctttatagcgctgatggaactaggttgttctcatgtggaacaagtaaagatggagattcatatttagttgagtggaatgaaagtgaaggatctatcaagaggacatattctgggtttcgtaaaaagtcagctggtgttggtgtggtgcagtttgacacagctcagaatcacattttggctgctggtgaagataatcagattaagttctgggatgttgataatacaaccatgcttagctctactgaagctgacggaggcttaccgggtcttccacggttgaggttcaataaagaaggcaatcttcttgctgttactacagtggacaatgggtttaagatacttgcaaatgctgatggactcagaactttacgagcatttggaaaccgacctttcgaagcatttagatcgcaatatgaagcttcttctatgaaggtctctggtgctcctgttgttgcgggcatttctcctaatattggtcggatggatcacatcgacaggaattctcctgcaaagccatctcctataatgaatggtggtgatccagcatctagaagcatcgatataaagcctagaatttcagaagaaaggcccgataaagcaaaaccctgggagctgatggaagtcctaaatgctcagcaatgccgtgtagctacaatgccagaaactccagaccaagccagcaaggttgtcagacttctgtacacaaattctggtgttggcttgctagcacttggttccaatgccattcaaaggctgtggaaatgggctcggaatgatcaaaatccaagtgggaaggccacagccaatgtagtgccacaacattggcaaccaaacagtggtcttgtcatgcaaaatgatacagcagataccaatcctgaggatgcagttccatgcattgctctctccaagaatgattcttatgtgatgtctgcatgtggtgggaaggtttcactgtttaacatgatgacatttaaggtgatgacaacattcatgccaccacctccagcatcaacctttttagcatttcaccctcaagacaataatatcatagcaattggaatggaagattcaaccatccatatatacaatgtcagggtagatgaggtcaaaactagattgaaagggcatcaaaggaggataactggtttggccttctcaaacaacctacaaatacttgtgtcttcaggggctgatgcacagctttgtgtgtgggccaccgatacttgggaaaagaaaaaatctgttgctattcaaatgccagctgggaaaactccatcaggggatacttgggtccagtttaactctgactggagtcgtttgttagtagtacatgagactcagctagctatatatgatgcatcaaaaatggaaagaatctaccagtggatacctcaggacgctttgtcagctcccatttcacatgcatcatactcacgcaacagccagttggtttttgctgcctttaccgatggtaacataggaatttttgatgtggagaacttgagattaagatgccgaattgcacctccagcatacttatcttctgcagccataaacagcaatccatcggtctaccctcttgtcgtcgctgcacatccacaggagtcgaatcaatttgcggttgggctttcagatggatctgttaaagtgattgaacccttggagtccgaagggaagtggggaacgacgcctcccacggaaaacggggtgcccaatggcaggacgtcaacatcatcagcaactagcaacccagctgcagaccaaatccaaagatag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSSLSRELVFLILQFLDEEKFKETVHKLEQESGFFFNMKYFEEK VHAGEWDEVEKYLSGFTKVDDNRYSMKIFFEIRKQKYLEALDRHDRAKAVDILVKDLK VFSTFNEELYKEITQLLTLENFRENEQLSKYGDTKSARSIMLIELKKLIEANPLFREK LVFPTLKASRLRTLINQSLNWQHQLCKNPRPNPDIKTLFTDHTCTPPNGARASPVSVP LAAVPKAGGTYPPLTAHTPFQPPPAGPSLAGWMANAAAATSSVPSAVVAASSLPVPPN QAVPIMKRPTITDYQSAESEQLMKRLRPSGHGVDEATYPAPIPQPLWSVEDLPRTVAC TLSQGSSVTSMDFHPTRHTLLLVGSTNGEITLWEVGMRERLFSKPFKIWDIQACSPQF QSVAKESSISINRVTWSPDGDLIGVAFAKHLIHLHAYQQPNETRQVLEIDAHSGAVND IAFSRPNKQLCVVTCGDDRLIKVWDMHGQKLFSFEGHEAPVYSICPHHKESIQFIFST SLDGKIKAWLYDHMGSRVDYDAPGKWCTTMLYSADGTRLFSCGTSKDGDSYLVEWNES EGSIKRTYSGFRKKSAGVGVVQFDTAQNHILAAGEDNQIKFWDVDNTTMLSSTEADGG LPGLPRLRFNKEGNLLAVTTVDNGFKILANADGLRTLRAFGNRPFEAFRSQYEASSMK VSGAPVVAGISPNIGRMDHIDRNSPAKPSPIMNGGDPASRSIDIKPRISEERPDKAKP WELMEVLNAQQCRVATMPETPDQASKVVRLLYTNSGVGLLALGSNAIQRLWKWARNDQ NPSGKATANVVPQHWQPNSGLVMQNDTADTNPEDAVPCIALSKNDSYVMSACGGKVSL FNMMTFKVMTTFMPPPPASTFLAFHPQDNNIIAIGMEDSTIHIYNVRVDEVKTRLKGH QRRITGLAFSNNLQILVSSGADAQLCVWATDTWEKKKSVAIQMPAGKTPSGDTWVQFN SDWSRLLVVHETQLAIYDASKMERIYQWIPQDALSAPISHASYSRNSQLVFAAFTDGN IGIFDVENLRLRCRIAPPAYLSSAAINSNPSVYPLVVAAHPQESNQFAVGLSDGSVKV IEPLESEGKWGTTPPTENGVPNGRTSTSSATSNPAADQIQR</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0254100, RefSeq:Os01g0254100