Os01g0534700

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Structured Information

Gene Name	Os01g0534700
Description	ABC transporter, transmembrane region, type 1 domain containing protein
Version	NM_001185465.1 GI:297720064 GeneID:9268765
Length	9375 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0534700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:21036727..21046101
Sequence Coding Region	21036727..21036736,21037894..21038069,21038755..21038976,21039069..21039307,21039936..21040461 ,21040536..21040809,21041259..21041922,21042339..21042567,21042659..21042925 ,21043043..21043306,21043399..21044039,21045852..21046101
Expression	GEO Profiles:Os01g0534700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:21036727..21046101 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:21036727..21046101 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggatttcgaagtatcatgctggacaatcactggagagagacaggcagcacggattagggcgttgtatctcaaagcaatactgaggcaggatattgccttttttgacaaggaaatgaacactgggcaactagttgagaggatgtcaggagatgcattcctcattcaagatgccattggagaaaaggctggcaagtgcatccaactgctttctactttctttggaggcttcattattgcgtttgtgagaggatggctgttggcacttgttatgctttcaagcattcctccagttgctgtggctggtgcaattatgtcaaggttgatggtaaaactgaccatccgcatgcaagcaaaatatggtgatgctggaatcgtggtcgaacaaaccattggggccattagaacagttgttgcattcaatggtgagaagaaagctataaacacatataacaagttcataaaaaaggcatatgaatctgctctacaacaaggtgttattaatggccttggattaggttccataatctcagtctttttttccagctatgggttggcggtttggtatggatctagattgatagtcgagcgaggctacaatggtggcattgttattaatgttataatggctataatgatcagtgcaatgtccttaggtcatgcgacatcatcaataacagcccttgcaggaggtcaaggagcagcatatagactgtttaggacaattgaaagacaaccagatattgatgcatgttgtaccacaggtgacatatttgaagatgtcaagggtgatgttgaactcaagaatgtgtactttagttatccttccagacctgaacatttggtatttgatggattctccttgcaagtaccaagtggcacaagaatggccctagttggagaaagtggcagtgggaaatcaactgttatcagtttggtggagagattctatgatccacagtctggggaagtgttaattgatggagttgatattagaagaataaatcttggatcgataagaagaaaaattggtcttgtcagccaagaaccagtgctgttcgcaggtacaatcagggaaaatatcacgtatggaaaggaggacccaactcttgaagaaatcaatagagcaatcgagcttgcaaatgcagcaaagttcattgataagttgccaaatggtcttgaaacgatggttggtgagcgtggaattcaactgtctggaggtcagaagcaaagaatagcaattgctagagtgattataaaaaaccctaggatcttactgcttgatgaagcaactagtgcattggatatggaatctgagagggtagttcaagaagccttgaataaggtaatgttagaaaggacaacaattattgttgcacatcgcctgagcacagtaaagaacgccgatatgatatctgttctacagcacgggaagctggtggagcaaggttcacatgaagaattgatgaagaagcctgaaggttcttactgtaagctgattcatctccaggagactcggcaggaagctgtggcacctaatgatgaccctgatatgataataagaaatgattttgactctaggattataaatagcaaaacaagaagccaaaatatctcatttaggaaatcaaccagtaaaagctcctcttttgggcacagtggtacccatcctttcacatctacttgtgacttatctgatcccatggaggtccacgatgatcagcacataaaggagaccacagacaaaatgtctaattgccaagagaaagcttcgatcctccgccttttctctctgaacaagccggaggcctttgttcttgcacttggttctataactgctgcaatgcatggagtcatttttcctgtattcggcatactggtttcaagtgcaataaagatgttttatgagccacgttcagaattactgaagaactccaggttattgggcagcatgtttccggtgcttggaatttccacatttcttcttattccaacagagtacttcctatttggactagcaggtgggaagcttgtggagcgcatacgatcattgacatttaaaagtgtcatgtaccaggagatcagctggtttgataaacctgaaaactctagtggatcaattggtgcaaggctatctactgatgctttgaacgtgaagcgcctcgttggggacaatttggcactaaatttccagactttgtcgaccataatatcaggttttacaatagcaatggtagcaaactggaagctggcattgattataacagtggtagttcctttggtgggtttccaggcctatgctcaaatgatgttcctgaaaggtttcaacaaaaatgcaaagtcaatgtttgaagatgcaactcaagtagcaactgaggcagttggaggcatcagaaccatcacgtcgttctgtgctgaacagaaggtgatgaacgcctatgagaagaaatgtgcatctccaataattcaaggaataagggacggagttgttggtgccttgggttttggcttctccttccttgtgttctactttgcgtatgctctctgcttttatgtcggagcaaagtttgttcaccaaggaacagcaacattcgctgaagtgtttagggtcttcttcgtgttagttttgggtattaatgaaatctcacgaacaagtgcaataggatcagaaagcagacgtgttaatgaatcggtagtttctgtcttcaaaattcttgatcgtaaatccaagattgattcgagcaatgatgagggtgtggtcattgcaagtgtcaggggtgacattgagttccagaatgtgtgttttaagtaccccttgcgcccaaatgttcagatcttcaaggatctatccttgagcattccttctggaaagactgctgcgctggttggggagagtggaagcgggaagtctacggtgatttcactgcttgagaggttctatgaacctgatgctggcaggatcctttttgacggtgtggagcttgagactctcaaagttagctggcttcgtctacagattggccttgtggcgcaggaaccggtattgttcaacgacaccatccgtgcgaacatagcttatgggaagcaaggtgatgcatctgaagaagagatcattgctgctgctgaagcagccaatgcgcaccagttcatctccgggctgcctgatgggtacaacaccattgttggcgaaagagggatccaattgtcaggtgggcagaagcagcgtgtcgccatagcgagagccgttataaaggaccccaaggtgctgctgctggatgaggcaacaagtgctctggattcagaatcagagcgcgtggttcaggaggcgctggaccgggaggtggttggtaggactaccgtggtggtggcgcatcgcctgtcgacaataaaaggagcggatatcatcggtgtcctcgaaaacgggacgatagtggagaaaggcaggcatgaagaactgatgcagataaagggtggaatatattcttcacttgttgagcttagctcaagctcaataggaggtggtgactgctcccgagacatgcatgatccaaagtggagcatgtcagcaagagtagggcagcgatggtctcgtccagaactccggcagcccaatcttaaaggaaagagtacggaagcggcctggaactccgggcacccaatctggagggacgagcagcatatcatggatcggcaacatcgaaaaagctcgagcacgagcgaacggccaatagcactggaggtgctggtgatggagctcaagtag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MDFEVSCWTITGERQAARIRALYLKAILRQDIAFFDKEMNTGQL VERMSGDAFLIQDAIGEKAGKCIQLLSTFFGGFIIAFVRGWLLALVMLSSIPPVAVAG AIMSRLMVKLTIRMQAKYGDAGIVVEQTIGAIRTVVAFNGEKKAINTYNKFIKKAYES ALQQGVINGLGLGSIISVFFSSYGLAVWYGSRLIVERGYNGGIVINVIMAIMISAMSL GHATSSITALAGGQGAAYRLFRTIERQPDIDACCTTGDIFEDVKGDVELKNVYFSYPS RPEHLVFDGFSLQVPSGTRMALVGESGSGKSTVISLVERFYDPQSGEVLIDGVDIRRI NLGSIRRKIGLVSQEPVLFAGTIRENITYGKEDPTLEEINRAIELANAAKFIDKLPNG LETMVGERGIQLSGGQKQRIAIARVIIKNPRILLLDEATSALDMESERVVQEALNKVM LERTTIIVAHRLSTVKNADMISVLQHGKLVEQGSHEELMKKPEGSYCKLIHLQETRQE AVAPNDDPDMIIRNDFDSRIINSKTRSQNISFRKSTSKSSSFGHSGTHPFTSTCDLSD PMEVHDDQHIKETTDKMSNCQEKASILRLFSLNKPEAFVLALGSITAAMHGVIFPVFG ILVSSAIKMFYEPRSELLKNSRLLGSMFPVLGISTFLLIPTEYFLFGLAGGKLVERIR SLTFKSVMYQEISWFDKPENSSGSIGARLSTDALNVKRLVGDNLALNFQTLSTIISGF TIAMVANWKLALIITVVVPLVGFQAYAQMMFLKGFNKNAKSMFEDATQVATEAVGGIR TITSFCAEQKVMNAYEKKCASPIIQGIRDGVVGALGFGFSFLVFYFAYALCFYVGAKF VHQGTATFAEVFRVFFVLVLGINEISRTSAIGSESRRVNESVVSVFKILDRKSKIDSS NDEGVVIASVRGDIEFQNVCFKYPLRPNVQIFKDLSLSIPSGKTAALVGESGSGKSTV ISLLERFYEPDAGRILFDGVELETLKVSWLRLQIGLVAQEPVLFNDTIRANIAYGKQG DASEEEIIAAAEAANAHQFISGLPDGYNTIVGERGIQLSGGQKQRVAIARAVIKDPKV LLLDEATSALDSESERVVQEALDREVVGRTTVVVAHRLSTIKGADIIGVLENGTIVEK GRHEELMQIKGGIYSSLVELSSSSIGGGDCSRDMHDPKWSMSARVGQRWSRPELRQPN LKGKSTEAAWNSGHPIWRDEQHIMDRQHRKSSSTSERPIALEVLVMELK</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>1..10#1168..1343#2029..2250#2343..2581#3210..3735#3810..4083#4533..5196#5613..5841#5933..6199#6317..6580#6673..7313#9126..9375#atggatttcggtatttccagataaaaccctcaactcactgttttctctgtgcaacgagcatctcttgaggggaaaaaagaaggcgataatatcgtgaaattgggcgtctttttctgcgtgtgctccgaataggatgaattaggcaaccgctggtcgctttggctgctgtgctggctatatttggtttacttgtaatatttttgttccacttctttatcatttgggtatatgctgttcttgtgatgggcatatatgggcccaaaaccaaggttgcctcagatatgattcagtaatctactccgtagaatgtattccaggaaactattcactcgcaatgcaggagattgattgaatttttagcttaactctgattattcgtttgctcgtactgtcaagccaatagagtttctgttaagattatttgtccttcgtattttatcctgcacactatcatacatattttatggtgaccaaatttacaattctcatctagtactagtaatctgctcagttatgttttaggctggcaagtcacatctgaactctagaaattcaaaaggtattactaaatgttggaaatgaaccttcctcttcttttttaaggggaacaaagtgtatgagtttcctgtgatgggtgcctaaactaattagggtatgccatttacgtagagctgtatattgagccccttgtaagttgcataatgatgtaatgtgtttctttatgagtatttgcaaatgagcagctcccaatttaaatatggactaagtggcaactattctttcagaagaatacgtcttcatgtagagcagtagcctgtatgacaggggtaaaattatctgtgcttgttttttcattgatttttaaatttcttaatcgctaattaaatcactctttttttttaattttcaggtgatcatgaattttatctatcttggtgttggagcaggacttgtttcagcacttcgtaagtgtctatcttatgcaagaaaataggctatcttaaacatctatgtttgcatagaaatttattttatcttttgatatagaaattggagaataaaaatgtacaacgtgctactagtacttgcagttcttttgtcaggagctttttattggaaatattattagaaacaatgcttacttgattcattatgacaatttggtagaagtatcatgctggacaatcactggagagagacaggcagcacggattagggcgttgtatctcaaagcaatactgaggcaggatattgccttttttgacaaggaaatgaacactgggcaactagttgagaggatgtcaggagatgcattcctcattcaagatgccattggagaaaaggtaggcttgttttcagtgtgtaatctaattgattaaccaaaagtagttcttttgagaagttcagttacaatatttcctatacaattgatttggttttgtacaaatatttagtaactgaagaaagaagacccaacgaatcccttttaattgaaatttatgtagtcaattttctgtagcccatacccaattgcatgcatcatacatggtctatttaggagtttacagagccctaaaaagaatctaggagttcagagaaataacttggtttcatgtgtcacagtcaactgtgtgaatcgcacatacattgttctaactacataatatgagtttgtgcttgactcaagtaactctttggtcatgcatcatatatgttctatgtaggagtaaaaaatagtcaagatgcataatctttgcctgtatgcaagtggagacaaaaagacatattatatgtatcagcattataagttcaatgaatctttctttttttaaaaaaaaaatcccagttgatggattttccagaccataaatgcagttgggttcagtcaatgggaaatgcatatgtttaacttgccaagtactgcattatatttcattatcctgcttcaatgagaaatatgtacatgtactaattctctattagcatataataacatgtaaattttgttatacatgcgttgtctattaggctggcaagtgcatccaactgctttctactttctttggaggcttcattattgcgtttgtgagaggatggctgttggcacttgttatgctttcaagcattcctccagttgctgtggctggtgcaattatgtcaaggttgatggtaaaactgaccatccgcatgcaagcaaaatatggtgatgctggaatcgtggtcgaacaaaccattggggccattagaacagtgagtgatggccgactcttatatttggctataaaatctttgctatcgcgtgtatattgatcctgttctttttatcttcttttgctttgaaggttgttgcattcaatggtgagaagaaagctataaacacatataacaagttcataaaaaaggcatatgaatctgctctacaacaaggtgttattaatggccttggattaggttccataatctcagtctttttttccagctatgggttggcggtttggtatggatctagattgatagtcgagcgaggctacaatggtggcattgttattaatgttataatggctataatgatcagtgcaatgtaagttcatacttaatcttggttaccgctgtatgcttgaatgaattatataacatgtggcccaaatatgatatatacatgaaggattcagattatggtaatgtatgatcaagtttacattttgtttgaagttctttattgggtgcacttttttcttctagcgttatagtccctcaggttacaaatactttgggagcttggaatatcaatatctctttaaatatttagtttgggtacatgaaaatcatatttgtagtgtctcaaaatttacctttctagattatagttacatttggttttagaaacatattacatttaggaaacaacaagtatttgtgattcgagagaatatttggttaagaagtgaaacatctgataaatcgtaatttacaaaaaaaaagataaatatttgatgattactgatcattatttctccatggatgtacatatttgtgtcttccattgataaattcaaaatattgttggttaacactccccaaggcaactctcacagtgacaaagctaaactttccagcggagttaaaatcactaaaaatatgcaatatggtatttatatatctgtttcacattgtgcggtttatggtttgagttatattttgttctgcaggtccttaggtcatgcgacatcatcaataacagcccttgcaggaggtcaaggagcagcatatagactgtttaggacaattgaaagacaaccagatattgatgcatgttgtaccacaggtgacatatttgaagatgtcaagggtgatgttgaactcaagaatgtgtactttagttatccttccagacctgaacatttggtatttgatggattctccttgcaagtaccaagtggcacaagaatggccctagttggagaaagtggcagtgggaaatcaactgttatcagtttggtggagagattctatgatccacagtctggggaagtgttaattgatggagttgatattagaagaataaatcttggatcgataagaagaaaaattggtcttgtcagccaagaaccagtgctgttcgcaggtacaatcagggaaaatatcacgtatggaaaggaggacccaactcttgaagaaatcaatagagcaatcgagcttgcaaatgcagcaaagttcattgataagttgccaaatgtacaatgccaaagtaaaatgttctaattgttaactccatttcagttgttagttgacatcatgaaatatcgcagggtcttgaaacgatggttggtgagcgtggaattcaactgtctggaggtcagaagcaaagaatagcaattgctagagtgattataaaaaaccctaggatcttactgcttgatgaagcaactagtgcattggatatggaatctgagagggtagttcaagaagccttgaataaggtaatgttagaaaggacaacaattattgttgcacatcgcctgagcacagtaaagaacgccgatatgatatctgttctacagcacgggaagctggtggagcaaggtataccatacaaaaacctcttcagagattcacttttttctttgaagagatttaacttgaaatctgatttctagagtgtacatactacatatgtctgcgtatcactattgagatattgtgactatgcacaaggcattttcaggtccacattgatggtctggtgtgtatgtttcagaaaactttaaaatgaatttatattcgacatttacaatattttaaattcagctcactggataatttcaatttgatatgaagatagtaaatagaagttctttctgacccctaataaacagataggtaatagttcacttgtgtagcactgcttttgtaccatattagctgtaatattcctttgggctttaacaaaatgttacacctttttgttcaagagctacttaatgcacaaattttggtacataacttaccagttgtttatgaattatgaaaaggttcacatgaagaattgatgaagaagcctgaaggttcttactgtaagctgattcatctccaggagactcggcaggaagctgtggcacctaatgatgaccctgatatgataataagaaatgattttgactctaggattataaatagcaaaacaagaagccaaaatatctcatttaggaaatcaaccagtaaaagctcctcttttgggcacagtggtacccatcctttcacatctacttgtgacttatctgatcccatggaggtccacgatgatcagcacataaaggagaccacagacaaaatgtctaattgccaagaga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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0534700, RefSeq:Os01g0534700