Os01g0549700
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0549700 |
|---|---|
| Description |
Similar to RNA helicase (Fragment) |
| Version |
NM_001049832.1 GI:115437443 GeneID:4326192 |
| Length |
6227 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0549700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22197692..22203918 |
| Sequence Coding Region |
22197693..22198009,22198115..22198213,22199844..22200018,22200100..22200331,22200478..22200596 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>cacaccccaaattccaaatcgctacctcccccaagaaccctagctccctctccccccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctttgcagccgccgccgccgccgccgccgccgccgccgcgtccgcttcgactcccgccgccaggttctctctctccagcgcgcaggcaccatggccgaagccgaggttaaggacaacgaggtttacgaggaggatctcgtcgactacgaggaggaggtggagaacggcaccgacggtggcgccaacgccgccaacgcctccgccgatgtcgtcaagaaggggtacgtggggatccacagctcggggttcagagacttcctgctcaagccggagctgcttcgcgccatccaggactgcgggtttgagcacccttccgaagtgcaacacgaatgcatcccacaagccattcttggaatggatgtcatctgccaagcaaaatctgggatggggaagactgctgtttttgttctctcaagtcttcagcaaattgatcctgttgctggtcaagttggtgcacttgtgctatgtcacacaagggagctagcttaccagatttgccatgaatttgagaggtttagcaagtaccttcctgaggtaaaagttgcggtcttctatggtggtgttcacataaaaaaacacaaggatctgttgaagaatgactgccctcatattgtggttggaacacctggaaggatactagctctagctagagagaaggatctttccttgaagaatgtgaggcatttcattcttgatgaatgtgacaagatgctcgattcacttgacatgcgtagagatgtgcaggagatcttcaaaatgacaccccatgataagcaagtgatgatgttttcagcgacccttagcaaggagatccgcccagtttgcaagaaattcatgcaagatcctatggaaatttatgttgatgatgaggctaaactgacccttcatgggctagttcagcactatattaaactaagtgaggcggagaagaaccggaaattgaatgatctcttagatgcactggacttcaatcaagttgtgatatttgttaaaagtgttagtagagctgcagaactgaacaagctgctttgtgaatgcaactttcctgcgatctccatacattctggaatgacacaggaggagaggcttacccggtacaagaacttcaaggaaggacacaagaggattcttgtggctactgatttagttggcaggggaattgatattgaacgtgtcaacattgtcataaactatgacatgcccgattctgctgattcgtatctacacagggttggaagggctgggcgttttggaaccaaaggacttgcaataacatttgtttcctctgcctctgactctgatgttcttaatcaagtgcaagaaagattcgaggttgacataaaggagcttcctgagcagattgatacttcgacatatatgccttcttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>HTPNSKSLPPPRTLAPSPPLSLSLSLSLSLSLSLCSRRRRRRRR RRVRFDSRRQVLSLQRAGTMAEAEVKDNEVYEEDLVDYEEEVENGTDGGANAANASAD VVKKGYVGIHSSGFRDFLLKPELLRAIQDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVICQAKS GMGKTAVFVLSSLQQIDPVAGQVGALVLCHTRELAYQICHEFERFSKYLPEVKVAVFY GGVHIKKHKDLLKNDCPHIVVGTPGRILALAREKDLSLKNVRHFILDECDKMLDSLDM RRDVQEIFKMTPHDKQVMMFSATLSKEIRPVCKKFMQDPMEIYVDDEAKLTLHGLVQH YIKLSEAEKNRKLNDLLDALDFNQVVIFVKSVSRAAELNKLLCECNFPAISIHSGMTQ EERLTRYKNFKEGHKRILVATDLVGRGIDIERVNIVINYDMPDSADSYLHRVGRAGRF GTKGLAITFVSSASDSDVLNQVQERFEVDIKELPEQIDTSTYMPS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2..318#424..522#2153..2327#2409..2640#2787..2905#3524..3580#3659..3843#5296..5440#5507..5590#5678..5741#5843..5853#ccacaccccaaattccaaatcgctacctcccccaagaaccctagctccctctccccccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctttgcagccgccgccgccgccgccgccgccgccgccgcgtccgcttcgactcccgccgccaggttctctctctccagcgcgcaggcaccatggccgaagccgaggttaaggacaacgaggtttacgaggaggatctcgtcgactacgaggaggaggtggagaacggcaccgacggtggcgccaacgccgccaacgcctccgccgatgtcgtcaagaagtgcgtaccccccaagggtttgctttgttttctctcgctagggttagggtttcgtggttgagtcggttggagggccctgatctgaacttcttctctgttggacagggggtacgtggggatccacagctcggggttcagagacttcctgctcaagccggagctgcttcgcgccatccaggactgcgggtttgagcacccttccgaaggcaagctcatatgctcttttctttttttccccttgttgatgctactgctgctagcgttccatccttttggaggcctttaaattgaaatctaaataaatgatgtgtggagtggcaatcattttattctgaattcgatatagtccgagtagtcacttaaaaaccaacactaacccaggtgtatattaatttggttcaaggactttatagatctataaatgggctaaaactactaggatggcgttatctaagtggtaactgaaaattcgaaagtcacttgtgtcacgtgcgtgcccctctgtttctttcatgttaatttcttattaatcttatttatttcctataatagcttcttacacttatttatttcctgtaataccttaatcaaccttcatgcttgctactgcctcgttacgttatctgaacgagccttcaaattttgagcccatatgatgaataaaaaggcttgattggaattctttaagtagcatagttaactgagttcgaattgttctgaccagacacaatacatagttgacaagcttgactaaactgatggttttactggaaaaaaaagggggaagtagtgcttagattggtctcgctgtgagctaagactgtcaatacatttagacttatttaattggaaaaaacagcatgctgagattggtatcactctggttgtgcactaggatcatccttgcatttagactgcttttggtggggagaagggaaccggtgctaagctgcttgtgcgttaggacggtccatgcatttagaccgcttttgaacttggtggactaggtggttttatggtcaactggtgtcaaaccagcactggttgaactggctgagccagtgattcaccaagaaggaagacccaatgtctcctcaagggctccaacttcattttactgtaaaaaatagtgaaaatagcttgcgggtggaggattcgctctacgacggtggatgccaggtcctgttgccatcccaccacctcgtcatgtgtgtttgtattgaaacatacatgcaacataaactttattgagctgtggaccactggactggtgaaccaagaatttggccgggtcactgaccagttcaacctttcatactatgatactgtactatatttagatgcctcggagtgaatgcaatatataattactgcaaaggcaagcaattggttgtttttaaggtgctattttctccattagctaacatgggcatatgccatatatatttaaactttgaatgcattccctaggcattgatgcacttgcccactccacttttgcagccagctctcctgtttctgggacagttcatctagaagtaactaagtattaactcaaacagaaaacaataaatgaattgattgtgcatgaacatttgctcgtcctagtgcttatttctagtaccaaataagattatatacactctagcattcattatttttccattctttccaagcgtgttaatgaaaacgtcattttgctaatgtgcaggtacaattttatctgacaattttagttgggaggagaatgtggtaaaaactttcaattaacggcgacaggaggttaaatagtttctcactggggtactgctccaattttgtttggctctacaccagtgcaacacgaatgcatcccacaagccattcttggaatggatgtcatctgccaagcaaaatctgggatggggaagactgctgtttttgttctctcaagtcttcagcaaattgatcctgttgctggtcaagttggtgcacttgtgctatgtcacacaagggagctagcttaccaggtatatatttatgtcttagtttaattatgtccaatatgtctgcatatactaactgtctctttacttaatataatgttgtagatttgccatgaatttgagaggtttagcaagtaccttcctgaggtaaaagttgcggtcttctatggtggtgttcacataaaaaaacacaaggatctgttgaagaatgactgccctcatattgtggttggaacacctggaaggatactagctctagctagagagaaggatctttccttgaagaatgtgaggcatttcattcttgatgaatgtgacaagatgctcgattcacttggtaggctgctgttccttgttcaagtgaccatcattctacacccagaatatgtttactttgcgataacttttctacccctatttgtatcatatcaatatatcatacattgctctgttatattcttattaatgcatttgtttcttcagacatgcgtagagatgtgcaggagatcttcaaaatgacaccccatgataagcaagtgatgatgttttcagcgacccttagcaaggagatccgcccagtttgcaagaaattcatgcaagatgtaatgtcatgtggcctatctcatttcaatagcgcttcttcttactctggcatactaccatgatatgagtggtggcagttctgttgtcagtagatcaaagggatttctgatttttgtacacttctccattggtcgtagttcatcaattactacctgagtgttcctattggctgcaagtgaagtcttctgtcaatgtgaaccatctggggagaatgcgggtgttggggttgggagggcaccgttattgtagattgtacaaggccagtgcggcttttctccaattgtctgcatgcttgaactggactccgctttatcagagtaaactgcttctgtttctcctacccttctcatggtcagtgtggacaaagcagcttcctcttgatgctagttcttgtagcaagcactgccccagaacttcttctctatgatttggtcaaatgtcagtgtccattgtcatagctgaagttcaaataccagtgcccaattcatagctgaagttcccttaggaggctcaaaattttgatgcaagaagaattgatatgctattcttattggtgtggctagaacattggcacacagaaattctaatacctttatctaccatttgttatcttacagcctatggaaatttatgttgatgatgaggctaaactgacccttcatgggctagttcaggtactatttaattatcaatttgtcatttgaaccacttttctgtttattttgtaccaaccccccgttttctgattccagcactatattaaactaagtgaggcggagaagaaccggaaattgaatgatctcttagatgcactggacttcaatcaagttgtgatatttgttaaaagtgttagtagagctgcagaactgaacaagctgctttgtgaatgcaactttcctgcgatctccatacattctggaatgacacaggaggagaggtttgttctcttgaattccttcgtggcctggtcttttaggttcttgtgttttgtgcttgttttatctgttattaaaataacaataatctatgctgatggtggtggttgtcttattttatttatctttttctttgttgtcatgctttagatgatgtcagatatttcatcaacctaattcaaatctatatttctaaagctggcgggtctctcggccagctgattggtcgagctggtggctctatattttgttgacacgtgtaaagcaaccggcgaacactcgcgtacatccagagtcggaactcgagagagatcaggagaggggaaaaaatcgaagctagtgagccacatacgcacatacacctgggcctagcgccacatacgcctgttccagtttgctcaatggtgctacaagcttacgcctgtcctcgcctcctcgtgtttgtcaacctgtcagcctgagggtgtacagtagtagaaactagcaagcaaacatggttgactcaggttctaatgctttgtcttagcccaacaacaatcaatccatctatccttagctaaaagtatgtggtaaaacttgattatattggaccaaataaccatcaggcccaactttactgaaatgaaaataaacaagtcatttatatacctcacaagtaaaaaaattttaaatgcaattctgagcattaaaatcacatttataactaattcgttatacaagtacttcgtttcaattaaagtataacatattcaaatatatcttcacaaaaaaatatcgtagtttaatttgaggttttttggaataatatgatttgcttcacaataaaacgaagctgaaaattcatcagaaagtttttatcataatctatattgaaaataacacataaatagtataacatgggctataaagtaaacgcgcgaatcggcgtgttaatttcctagtgtattctataatctgtacatttttctggtgcctataattgctttgtgggtcaaccatagtgcattatccatgtgagtgttatgatgta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|
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