Os01g0554100
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0554100 |
|---|---|
| Description |
Peptidase aspartic, catalytic domain containing protein |
| Version |
NM_001185487.1 GI:297720108 GeneID:9272351 |
| Length |
7492 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0554100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22506579..22514070 |
| Sequence Coding Region |
22508847..22508913,22510231..22510673 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:22506579..22514070 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ggcaacgtatgcagctttcaggaggtgaaggttgatcaagatcatatcaagaataagaactatcctaagcagagtattgaagagaagctaggtaggaacgccgtggatctcatcaagacaaatatggtgcttaaagtctttggtggtaatccgtctgaaaccaaaggtgttctaaatgtggaactaacggttggcagcaagactattcctaccacgatttttgtcatcgatgggaagggttcgtacaacttgttgcttggaagggattggattcatgccaattgttgcatcccttcgactatgcatcaatgcttgattcaatggcaaggcgacaagatagaggtcgtgccggccgacaggtcagttaacgttgccagtgccgatttagccctttgggagatggatggccttgattgtttatctggaaaagtctgggatggagattttctaaaagtgtccgattctgatatacagccaatcgaagatggagaacccaagctattactttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>GNVCSFQEVKVDQDHIKNKNYPKQSIEEKLGRNAVDLIKTNMVL KVFGGNPSETKGVLNVELTVGSKTIPTTIFVIDGKGSYNLLLGRDWIHANCCIPSTMH QCLIQWQGDKIEVVPADRSVNVASADLALWEMDGLDCLSGKVWDGDFLKVSDSDIQPI EDGEPKLLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2269..2335#3653..4095#gtatgcatttcatcgaacaccttgcgatcaccctctcaccaccgctacagatcaccattgtgaggctccccggccggagctggaggttggagggagtggaggaagagccgtgctgccgccgtcgccataggggaagccgggtagccgctggacatcaagaaaagccgtcaagcaccttacgtcgccgctgtctgcccctgtcctgcaccgtgtcgagctccactttgccgcgttttgccatctcgccgtctcgcggtacaccctcgtgcccgtagcgtcctccatacatctaattgctagcgccggctccaaaatcggcgattagcgcccatggccgtgccgccccggccgccgtttcgtcgccggcgagccctccgtgggtaggctatcccgggagctcccctctccatatagtttgtgaaatcgaatccccatacgccgtagatgctcccgcacccttcaattcggccggaggatgtccctagcaccgaagccccttgtagccgagctcgggcatggcgtcgcctgatggcgccgcgcgtccccgtctcctcgcgcgccggctgccatcggcgggagatcgtcggagctcctctgcgcctcaccccggccgtcgccgagccgcccgctgccgtcccggctcgggccggccacgccggctgcgccgagccgtgcctctgcctcgctcggtaacgggcgagaggaagaagaagatgaggagagagagaaaccgtgtgggacccacatgtgattagcgcacagtaatcctatccctaacggtgattatcccactcaatggcaggtggggtccctatagttaaaatctaagaaaacacaattatatattttgttcctatgacaggcgggacccaatggtaattaaacaagcaggtttgaccctaagtcaaccagggccggtcccacatgtcaaccacagtgggttttggataatgtttccgattaaaaataaatcatttatgaacagtgcatttttacaatttctcggattaactcaaatttgaatctttaaattagtataacttattcattttagctccgattcgagtgaaacttgaacctaaattcatctaaattcataagctttccaatggtatataactcactatttaataaaatatattaatatcaaatgattagattatggtcaacttaaaaatgtgctaataaataaaattgatattgtacagtagagtagatgtcaaataaatatatttaacatgttttgtcactgtagcaaccacataaactaagtataagtgatgtctcaaatgaatggatgtataggaaaatactagtgcttatttaatattcgatagccatataattaaattcatgacttaaaaattagttacataaagttactaaaatattaatactcatagatgaatcttaaacttgtttatgagaaataataacagagctagtgtgattaaatcacctatacgaaattaattacttaatgtcatgttccttggaatagtatcttttaagttggtaatcaatcttaagttgataaatagtaccaactcgccaaatccacctgcatcacatatactgtatagcttacagtaaatagctcatgcttagtaaatgatctaatattagtatgttattgcactcacaactactatacagtccatttaaatcatacacaagaacaataacctacctttttcatatattaaactgaggagtctatgataagcgtgtatagtagataaaacactaattataaatcttgacctcacacaattatagtttgaccgtgacttaggattatttatggtaaaattatgcattgagataaactttaactataatattatggaccacactaatctaacctacatagcatgtaattcgttggaaccctaatacagtaatatttgtagagccatgcttagataatccatcctgttagaacgcttgttatgattaaattatccactgagcgttggtaaatctcctgtagggtgtcaccatttaaattacgatcaaagctagtttagccatgaactccacatagcaatagttgatagataattccgtagtcctgagtattgagttctgtatgtgagcagccatagtttagacttcgtagcaccttacaatccattagcaagcacgagtgatatgaatagccctaggtatattccgaacaattatattttgtttgtgcatatttgattgttgcttgaatattggttttctcgcatattatagaaattgtatatcggttagtcgtgaggcaacgtatgcagctttcaggaggtgaaggttgatcaagatcatatcaagaataagaactatcctaagcaggcaagtcatcaccccattccttgagcatgttgatcccaattgtgaaattgttttgtttacaaataaaattgcatgcagtaatgaatatcctacttgttattatgccatgcctttgattattacttatctcattattcccttgtacccataattacgtatgagtccctagtcacttatgacaaatgcttagtaatgctaatttagattcatgcattctcatatttatcaaatgcttcatgcttgggaaactaccttggggaggtagttgagatacggcatgtggagacatgagtgccacattgccatgacattgatgagatgatttgtgaaagaaaatgaaaactaaacaaatattttcgactagggcggctggaggacttgggtggtgtccggaaaaggctagtgccgtccctggtcagttaaggaccgagccatgaagctaagcatgaaacgacccccgtacaaccgtacttctcgtatgggtatagacctagcagagtaaatagccgagcggaggcagtttccctgcatagtagttttcttgatgtgtgtgaggcagggcctacggtggggcagccattggtaggaccgcgaggggtgggtgcctacagtggtgtcgccatcggtaggactgccatgtgtaaacctaaacttaactataacttaatgcatgtgtgaatcttcccttcccgggagcgccagaactcctctcactgctagaaaccttggacgcctagagtgcatgaggactaaaattcatggagcgggtactgccaaagtgaggttgttgaaaggctttgccatggcaagtctcattcgttgggacttaggctcatgtgctgggcaagtcgcggagtacgggtaaagtgtacattcactgcagtgtgagtaaactaaatctattcgaatagccgtgctcgtggttattgagcaccgagacgtgtattatactaggctagactctaaattcttaaactggttgggtgggatgttgcatgatgattttgtactggtggatcaacttctcgagaggcgagaaggggtaaaccccagaaaaccatgacgaccagtggcgggaagctatccttgggaacacaatggatggtggacagaaccgtcgctgtttaatgaacaatggaattaaaacttgatcagtttatactaggtcttaggtttgtgaaatgatatttgaaaactcagctttacgcaaagtaaccatagccactccttgtattatcctgtacattattgcattttttgtggtggcttgctgagtacttttgtactcattgttgctctatatatatcttttagcagagtattgaagagaagctaggtaggaacgccgtggatctcatcaagacaaatatggtgcttaaagtctttggtggtaatccgtctgaaaccaaaggtgttctaaatgtggaactaacggttggcagcaagactattcctaccacgatttttgtcatcgatgggaagggttcgtacaacttgttgcttggaagggattggattcatgccaattgttgcatcccttcgactatgcatcaatgcttgattcaatggcaaggcgacaagatagaggtcgtgccggccgacaggtcagttaacgttgccagtgccgatttagccctttgggagatggatggccttgattgtttatctggaaaagtctgggatggagattttctaaaagtgtccgattctgatatacagccaatcgaagatggagaacccaagctattactttgagggcgttgtgaagggttcgaatgtctacgctaaggatacagtagatgatctcgatgacaagcaaggtccaggttttatgtcggccgatgatttggaggaaatagacataggtccaggcgatcggccaaggccgacatttattagcaaaaatttgtctccagagtttagaaccaagctgatagagctcctaaaagagtttagagattgcttcgcttgggagtactacgagattcccggactcagccgatcgattgtcgaacatcggctacctatcaagccaggggttagaccacgccagcaacctccgaggagatgcaaagctgatatgctcgagccggttaaagctgagatcaaacgattgtatgatgctggttttattcgtccctgtcgatatgccgaatgggtttctagcatagttccagttattaaaaagaatggaaggtcagggtgtgcattgattttcgagatttgaataaagctacaccaaaggacgaatatccaatgccagtggccgatcaattagttgatgctgcatcagggaacaaaattttgagttttatggatgggaatgcaggatataatcagatctttatggctgaggaagatatccataagacggcttttagatgtcctggtgcaatcggcttatttgaatgggtcgtcatgacttttggcttgaagagtgctggagcaacatatcaaagggccatgaattatatatatcatgatttaatcggctggtcggttgaagtctatattgacgatgtggttgttaaatctaaagaggtggaggaccacatagccgatttaaggaaagtttttgagagaaccagaaagtatggcttgaagatgaatccaacaaaatgtgc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