Os01g0556600
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0556600 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF889, eukaryote family protein |
| Version |
NM_001049860.1 GI:115437563 GeneID:4324567 |
| Length |
12132 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0556600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22667408..22679539 |
| Sequence Coding Region |
22667408..22667510,22668095..22668181,22668605..22668979,22669459..22669605,22669702..22669815 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:22667408..22679539 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgttcgccccctcctcgcccccttttttccctcttccttatgcgcgcattcgacgggaacgggcagctcggtcgctgatgggtggccctgccgctgtgtacgggagggcttctttccgtccgaaccggctgaggtcctttctttcctctggttttcttcctccttgtggcgggtgctgtgacagttccgcttctcattgccggttgcccttggtgtcatacctttgggagcttgatgggcatggtacgctgttagctggtgtagagcttatccttccgcctgaagaccctgccagtggtcaggctcacccatccaacaatctggctaggaagttcttttgggttgctgcaacagatccgctaattgtttcacacgagatggttgctcagcaggttgttaggttcatgcaagcaaagtaccggttcgctgttcatgactacaattttcacatgctgctttcctatagaaagattgcatcctctgcagtggatgctgctctcacagcggcttcatgtcttgctaggctccagtcacgctatggggcgctagatctgccgtgtgagggttctagctcctcacagtcagtcaaccattccatgtgttctgtcctggttcaatctgtacatgttgggcagcagggtaccagtgctggtgcaggaccatccatggaacagcccattgacagtgagcctttggtaggaaatgccaaaaggaaaagttcattgctagatataccacgaagtgctgctgccgttaatagggaaaggcggcgtatgaaaatatctggtggtcagacaaaccattctctcgatggtattcttaacggtcccacgcccagtgctgatgacatcttgcctttgccaaaagactatattgcgtccttgaaagctttgtaccctcatcagtcctactatggtggtccatctcatgaatgtccacactgcggtgccgttttctggtaccaggagagggtaaagaaaggatctgtagtctcgcagcgcaagattctgtacaacctatgctgtagaggtggagccaacattgataagacgataaacaatgggaccgcaccttgtgtgttcaagattaatggggttgtccaccaaggtattggcagcctgctgccacagcaaggctcacgacctaaatttgcacaactttacatatatgacactgaaaatgaaactgcaaacagaatgaatatttacgaaaaagacaatccttctgatgaaccagacccagacattgttaatgggcttagttctatgcttgatgagcataatgatttggttaaggcattccgctttgctagagatcggctaaaagataatggtgatcaaaagattgcacttagattgcttggttgtgattcaagagatgaaatccagtacaatttgccaacgagtggtgatattgctggaaatattgagtttagtgctcctattgtcgatggttttatttccgctgaaatacctgatgtgctaaccgaccctttaggctatgccttggttgatgaatttatgatccatggcccttgtggcgatgtgaacaaaacatgctcctgtatgaagaagggagagtgctctaagcatttccctaaatcttttcaagaagagaccatcatggatgaatttgtattcactgtttacaaacgtagcaatgatggtcggtatgttctcaaaaatggtattaaacttgacaacagatgggttgttccctacaacatggaacttctgaaaaaataccaggctcagattaatgtagaatggtgcaataaatctaatatgattaaatatctcttcaaatatgtcactaaaggggcggatagaacaaaagcattctttgagatttctggaaatgcaccgaacaaaccagctgaaaactgtactgctccacgaaatgaaatacaagaatatatcgatgcaagatttctgtccacctgtgagtccctttggcatgcatttgaatttgacattcactacagagtgccttctgtagaacgcctagctgtgcaccttccaaacatgaactttgtccgatacaaaaaaggttctgacctaaagtccttgctatccagccctgtagccaaaaaaacgatgctaaccgagtggttcgaggctaacagaaaacataacagtgcacgaacgcttacttactgtgattttccgagagagtggacatgggacagcatctcacgtagttggcgtcctagaacaccatgtgaaaaaataggcaggatatactatgtcagcccagttagcggtgagctctactacctacgaatgctattaatgatagtgaaaggtgcaacgtgctatgctgatgttaggacctatgatggtatcgtttatccgacctttaggcaagcatgcgaggcaagaggcctacttgaaagcgataacgaatggcacttgctatttgatgaggctatagtatctgcgtcttcgggccaattgagacagttgtttgctcccgttgtaatgttttgttctgttggatatgtgcgctcgctctttgaaaaatattggacatattttaccgatgacattcagcgacgtgtcagaactgctttatcgaatccttcgtacgtaatacctcctgataggctcctgtctctattaatgaaagaacttcacattgtgttttcaaacagtggtggtagcattgatgattacgacttaccgcagccggcaatttattcagatgacattacaggaaataggatggttgacgaagaacttgctcttgatgttgcggccctaactgcagaagctaatttgaatatacctaggctaaatactgatcaaagaaatgttttcaacacaatcatgcaacgggtgaacgaaaacaggcctgggttattctttgtctatggccatggtgggacaggcaaaacatttttgtggaatacactgatttctaaaataagatccgagaaaaaaattgttctagcggttgcctcctcaggggttgcctctctactcctacctagagggcgcactgctcattctagatttaaaatcccgatcgacatagatgaaaacaacatttgcaccattaaaagaggaactatgcttgcagatttgattcagaaaacgtctcttataatctgggatgaggctcccatgactcatagacgatgctttgaggccttagatcgaacgttacgtgatttgctttctgagcacacgccttctaacagcattgttccgttcggtggtaaagttgttgttcttggaggtgatttccgtcaaatattgccggtcataagaaaaggttcacgtgcttctatagtcgatgcatccatcacgaactctcctctttggcggcatgttgttcttcttagactgacaataaacatgagacttcttcatggtaacgttactgaccaaaaccgtgtcgatcttagcaactttggcgattgggtcctagcacttggtgacgcttgtgctcaaaaaaggtgtgacgattatgctactacgaaacctaaatcaatctatgggtctatgcaatgggacaagattcctaaccttgagctcggtgatgggaatccaactctattggtacgtgtatcaaggttatgggaatatcatgaccaggacgatgaaggcgacttacgccatattggtcttgttttggttggtgagaagggatatgccattgctgctatgatttatcctccatggggcaagaaattcaaaccactgatcagcgaaggcaaggtctacttgcttacctactatcgggtcaagccatgcaccaaacattacaggccagttgacaacaagatgatgatcaatttcaccagatggactggtatagaagaatatgttgacgtacaagctggctttggtcactatgcttatactctcacaccttaccaagagctccgctctcgtgtcgacaggaaagactctttcacagatgtgattggagtgatcactgacatatcatctgtgacaactgttcggacacgtgttagagacagtgacagtttaaaaaggaatgtctacatgcgcaatgctgaaaatgagacaacaaatattgtgttatggggagaaagagctacaagctttcctgcagatgaaattctcagtgctggcaaggagaagccacagatagttatctttgttggcacacttgtcaggggacatggatctgttgttctcatagcgtgggacactgttgttatagggaatgtttcgttgtcgggtaactctgcttgcaaatgtgttgaagggaattacgaggcaatcaaatggattgatctcccagctgcacctattcttcagaacaactgtgaacagaagacaatcgctgagataagagacccgcacccttttaagttcaagaaacatgaattctcagtgactgtcgtgataaagaaacttaacatggagtattcttggtggtatactgcatgcgatatatgcaagaagacagcaaagccatatggaaatctatataggtgtggaaacagcacatgccccccaactggctcagcttcacctaggttcaaactcagtgtgatagcaggagatgacacaggagatactacatttattatctttgggcatttagcgcagaggctgattggtcgttcagttgaggcactgatgctggaaaatccaactggcaagggctgcatatccagagagatcactgatctgcttgagaaagaatttgtgtggaatgtgagtttcacagagaacacggtctctagcggcattgttgcttttcaagtgaacagagttgttaagggtgctcagagtcattcccttgctctcttgcaatctccatctggatcccagacatcttctctgatgccttgcatggctctatcgccggttgcatctcaggatacttccattggccagcccatagcagccagcccatcagctgggttcagtgatgctcaacgcactctgagtagcccaccaatcaatacagaaaaggataagaacacaggaaatgaatatgcatccaagag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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MFAPSSPPFFPLPYARIRRERAARSLMGGPAAVYGRASFRPNRL RSFLSSGFLPPCGGCCDSSASHCRLPLVSYLWELDGHGTLLAGVELILPPEDPASGQA HPSNNLARKFFWVAATDPLIVSHEMVAQQVVRFMQAKYRFAVHDYNFHMLLSYRKIAS SAVDAALTAASCLARLQSRYGALDLPCEGSSSSQSVNHSMCSVLVQSVHVGQQGTSAG AGPSMEQPIDSEPLVGNAKRKSSLLDIPRSAAAVNRERRRMKISGGQTNHSLDGILNG PTPSADDILPLPKDYIASLKALYPHQSYYGGPSHECPHCGAVFWYQERVKKGSVVSQR KILYNLCCRGGANIDKTINNGTAPCVFKINGVVHQGIGSLLPQQGSRPKFAQLYIYDT ENETANRMNIYEKDNPSDEPDPDIVNGLSSMLDEHNDLVKAFRFARDRLKDNGDQKIA LRLLGCDSRDEIQYNLPTSGDIAGNIEFSAPIVDGFISAEIPDVLTDPLGYALVDEFM IHGPCGDVNKTCSCMKKGECSKHFPKSFQEETIMDEFVFTVYKRSNDGRYVLKNGIKL DNRWVVPYNMELLKKYQAQINVEWCNKSNMIKYLFKYVTKGADRTKAFFEISGNAPNK PAENCTAPRNEIQEYIDARFLSTCESLWHAFEFDIHYRVPSVERLAVHLPNMNFVRYK KGSDLKSLLSSPVAKKTMLTEWFEANRKHNSARTLTYCDFPREWTWDSISRSWRPRTP CEKIGRIYYVSPVSGELYYLRMLLMIVKGATCYADVRTYDGIVYPTFRQACEARGLLE SDNEWHLLFDEAIVSASSGQLRQLFAPVVMFCSVGYVRSLFEKYWTYFTDDIQRRVRT ALSNPSYVIPPDRLLSLLMKELHIVFSNSGGSIDDYDLPQPAIYSDDITGNRMVDEEL ALDVAALTAEANLNIPRLNTDQRNVFNTIMQRVNENRPGLFFVYGHGGTGKTFLWNTL ISKIRSEKKIVLAVASSGVASLLLPRGRTAHSRFKIPIDIDENNICTIKRGTMLADLI QKTSLIIWDEAPMTHRRCFEALDRTLRDLLSEHTPSNSIVPFGGKVVVLGGDFRQILP VIRKGSRASIVDASITNSPLWRHVVLLRLTINMRLLHGNVTDQNRVDLSNFGDWVLAL GDACAQKRCDDYATTKPKSIYGSMQWDKIPNLELGDGNPTLLVRVSRLWEYHDQDDEG DLRHIGLVLVGEKGYAIAAMIYPPWGKKFKPLISEGKVYLLTYYRVKPCTKHYRPVDN KMMINFTRWTGIEEYVDVQAGFGHYAYTLTPYQELRSRVDRKDSFTDVIGVITDISSV TTVRTRVRDSDSLKRNVYMRNAENETTNIVLWGERATSFPADEILSAGKEKPQIVIFV GTLVRGHGSVVLIAWDTVVIGNVSLSGNSACKCVEGNYEAIKWIDLPAAPILQNNCEQ KTIAEIRDPHPFKFKKHEFSVTVVIKKLNMEYSWWYTACDICKKTAKPYGNLYRCGNS TCPPTGSASPRFKLSVIAGDDTGDTTFIIFGHLAQRLIGRSVEALMLENPTGKGCISR EITDLLEKEFVWNVSFTENTVSSGIVAFQVNRVVKGAQSHSLALLQSPSGSQTSSLMP CMALSPVASQDTSIGQPIAASPSAGFSDAQRTLSSPPINTEKDKNTGNEYASKSPAQD AGDNEDCYEDDEAVSLTQVASAPATKNSTSKAYKKRPRPSPGTGAAKKLFKDDAADDT DGATGGSNMEPDSNRQITMPVTQPSSYARKRPLAAAKFSDRKETSQLLVDIIYRDSVV VKVLGAGNPSTTQISAMVGEHHIQDLSVFRLAAWTTNCDLIPKIIEWNIETNQEGEQC TDLKWKPNGDLSIILIHIEKLFDYSNENNTTEDNQGDLTEYEKTKQRLPIMKTFQWTP GQIDSDYGPIEGGSPLVPPLDLDKKNWFDPDQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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