Os01g0559500
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os01g0559500 |
|---|---|
| Description |
Protein prenyltransferase domain containing protein |
| Version |
NM_001049878.2 GI:297597020 GeneID:4324682 |
| Length |
8089 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0559500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:22852277..22860365 |
| Sequence Coding Region |
22852277..22852518,22852723..22852807,22852894..22853157,22853253..22853555,22854430..22854534 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:22852277..22860365 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:22852277..22860365 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggccgccgcgtcgctgccgctccccgcctcccgcttcctctcccctcctcctcatccaacgccagcggcggcggcggcggcggcgtgctgctcccgacggaacatctcctgcgcccgcgccgccccccgggcgctggaagccccgcaggcctcgaggccgccaccgcggccgtcgcctcggcgcagcgccgtcgcggaggtcaaggccgcccccgaccccgtcgccgcactcaccaggttcgaggatgtgctgcagacacaggactgcaacataatcctgcgccactacggtgaaaccaggcgctgggatgagctatctaaggtcttcgggtggatgcaggagcacgacatgctcaacattgcgtcttacagcagttacttcaagtaccttgggttgagccgcaaccctgcccgagcgctgcaagtgtacggtgctatccgagaaaacccgacaaggatccatgtctccgtttgtaactcggtcctcgggtgcttggtgaagaacgggaggttcgatagcagcttcaagctttatgatgagatgatacgagaaggtctatcacccgatctgttcacctacagtacccttctgtcagggtgcatgaagttgaagcagggttacactaaggccatggaattagttaatgagctgaattcccgtggttttcagatggatagtgtaatatatggcactctcctggctatatgcgcgtcacataactgctgcgagaaggctgaggaatattttcagaaaatgaaggacgaaggacacaagcctaatctattccattatagctctctgttgaatgcatattcagaaaatgctaattatgaaaaggctgatctgttgatgaaagatttgaggtcctcagggttaacaccgaacaaggttatactcaccactttgttaaaggtgtattctaaaggtggtctctttgagaaggcaagggaactgctaactgaactggaagcttcaggcttcgcacaggatgagatgccttactgcatattgattgatggccttgtcaaagaacggaagatatgggaagccatgattctatttaatgatatgaaagaaaaaggtgtcaaatctgatggctatgcattcagtatcatgatatcagcattacatcgaggtggctatcgtgaagagtcaaaacaacttgcaaaagaatttgaggccaagaatgcaacatatgatctggttatgcttaatacatcacttcgtgcttactgcagcaccaatgatatggaaagtgtaatgatcatgcttaggaaaatggatgaatcgaacatatcgcctgatgctatcacatttaataccttaataaggtacttctgcatggcaaaggtctatcacctagcatacaagacaattcaagatatgcatacaaagggccatcaattgaatgaggagctttgttctgagataatgatgcagctaggagaagcgggttttccttctgaagcattttctgtgtataatatgttgagatatggaaagagaacagtgtgtaaatctcttcatgagaaggttttatgtatcttagttccagctggacttctcaaggatgcatacgtagttgttaaggacaattccgagttcatatctcgacgctcgctggggaattttgctagatctttcatggcatcaggcaacataaatttgattaacgatgttatgaaagcagtacaccgttcaggatggcgtattagccaggatatctttgggaaagcaattcagcgatacattcagaaacctgataagaagcagctactgctttgcctcttggactggatgactgcagggagcatcaaggatcacaagtcaaaggcaccaaaaatagttgataaggatccaatcaagattcatcagaattacagatctggtatttcgtatgcatgtggtgtaaagcacccatgttatgttgtaatgcctgagcttgagcttgtccattttagtcaggctattcagggtgagattccacaagagctgcagatgggactagtaagtggtaggcaagtcttgctcaagactgcaaacaggcatacaatggtgacttcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAAASLPLPASRFLSPPPHPTPAAAAAAACCSRRNISCARAAP RALEAPQASRPPPRPSPRRSAVAEVKAAPDPVAALTRFEDVLQTQDCNIILRHYGETR RWDELSKVFGWMQEHDMLNIASYSSYFKYLGLSRNPARALQVYGAIRENPTRIHVSVC NSVLGCLVKNGRFDSSFKLYDEMIREGLSPDLFTYSTLLSGCMKLKQGYTKAMELVNE LNSRGFQMDSVIYGTLLAICASHNCCEKAEEYFQKMKDEGHKPNLFHYSSLLNAYSEN ANYEKADLLMKDLRSSGLTPNKVILTTLLKVYSKGGLFEKARELLTELEASGFAQDEM PYCILIDGLVKERKIWEAMILFNDMKEKGVKSDGYAFSIMISALHRGGYREESKQLAK EFEAKNATYDLVMLNTSLRAYCSTNDMESVMIMLRKMDESNISPDAITFNTLIRYFCM AKVYHLAYKTIQDMHTKGHQLNEELCSEIMMQLGEAGFPSEAFSVYNMLRYGKRTVCK SLHEKVLCILVPAGLLKDAYVVVKDNSEFISRRSLGNFARSFMASGNINLINDVMKAV HRSGWRISQDIFGKAIQRYIQKPDKKQLLLCLLDWMTAGSIKDHKSKAPKIVDKDPIK IHQNYRSGISYACGVKHPCYVVMPELELVHFSQAIQGEIPQELQMGLVSGRQVLLKTA NRHTMVTS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..242#447..531#618..881#977..1279#2154..2258#2375..2474#4073..4392#4642..4818#4891..5019#5310..5394#5496..5545#5692..5890#8076..8089#atggaggccgccgcgtcgctgccgctccccgcctcccgcttcctctcccctcctcctcatccaacgccagcggcggcggcggcggcggcgtgctgctcccgacggaacatctcctgcgcccgcgccgccccccgggcgctggaagccccgcaggcctcgaggccgccaccgcggccgtcgcctcggcgcagcgccgtcgcggaggtcaaggccgcccccgaccccgtcgccgcactcaccaggtgcgccgcccactatatgcttctccgtagctctatcggagcattctacattttcgtcttcgtagtagtaattcgcgcgaattggatatatcgaaacgtggattcagagggaggaacaagagaaactgaggtgttggggtaggattattgttgctcgatttggagttgttagttctgcgaattctgacctttgatgctgtacaggttcgaggatgtgctgcagacacaggactgcaacataatcctgcgccactacggtgaaaccaggcgctgggatgagctatctaaggtagtcttcagtggttgtcaagttcaatcaggcgagtggagattgatgggactagtgaggcatgagtagtctgaactttgtttcaggtcttcgggtggatgcaggagcacgacatgctcaacattgcgtcttacagcagttacttcaagtaccttgggttgagccgcaaccctgcccgagcgctgcaagtgtacggtgctatccgagaaaacccgacaaggatccatgtctccgtttgtaactcggtcctcgggtgcttggtgaagaacgggaggttcgatagcagcttcaagctttatgatgagatgatacgagaaggtctatcacccgatctgttcacctacagtaccgtatgggactatgaccttttctttttctctgattagcatttagtttggtactttggttggtgtagcatttcaattgtttctcttgtcacttctagcttctgtcagggtgcatgaagttgaagcagggttacactaaggccatggaattagttaatgagctgaattcccgtggttttcagatggatagtgtaatatatggcactctcctggctatatgcgcgtcacataactgctgcgagaaggctgaggaatattttcagaaaatgaaggacgaaggacacaagcctaatctattccattatagctctctgttgaatgcatattcagaaaatgctaattatgaaaaggctgatctgttgatgaaagatttgaggtcctcagggttaacaccgaacaaggtttgcttcttattcttgttatttacttcctctgtttcacattataagacattttgttttctaatagatttatgcatggattcatatatgtacttcatatgtgtctaaatgcatatggatgttagtgaatctagacgaagaatggagaggccaaaacgtcttataatgtagaacagagggagtattaattaactctgttgctgagttttatgatttgcaggagaccccagtcttgttatttcactttttggttatggcagtagaattgatttctcattagatataatgcatacctacaccacaggttggatagtttgttgctatggatgacttgaaatgctagatagcacatacaggttgtagcttgcatagtatatggtgttggtgttttggtgcaaaagttggtttctccagctgcataatttatttggtactagtgcggtagtgccttctaacttcaccgcgtaatgtctgtgaatgatgcctgtcgatgtatatgaaaaacaaatactgccctatgatagccatcaataagcactaaacaaatgccatggttggaaagaacattctcacactaagtagagaaagcttgcacatcaaattccatcaaagttgtggtaccatgtttacttgccgcttggcacgtgatgtattgaatagagctttcgatagcttgggttaaggtggaatgtagtgctccaggataaattttttttttaaaaagcctcttaagtctccacatatcaactataactacatgttatcttgattggttgtttctttactgaacttgcatatattgctctttggttgttcaccgaaaatgttctgctactgttgccattctaatttgtaaattaaattaaatttgcaggttatactcaccactttgttaaaggtgtattctaaaggtggtctctttgagaaggcaagggaactgctaactgaactggaagcttcaggcttcgcacaggatgaggtaaaatatttggtctcacacaaaacagctgcttcatatgcatgtatgaatggctcctttaattgaactttattctgtcttgtcataatcccttaatcctttaatactatgcccagatgccttactgcatattgattgatggccttgtcaaagaacggaagatatgggaagccatgattctatttaatgatatgaaagaaaaaggtgtcaaatctggtaaggtatctaacaatgtaacaaattgatgtgcctctattgatactattctgattttttgttgtaattgggaaagttcatggagctaattccacgattttccattgacatagcacatcttccgttgatgctactgacaaaccagcttcattccatccatgccattgccattaggttgcaaaatgaccaattttaccttgctcaccattccgatttttggaatataaattactgtaattaaaatgaatacctgaaaacttgaaaattaaaattaccaaaccttataattcgaaatttaaaatgttagaatacacaaatataaaagtttattttcaaaatttttaatatttgttcaggttcaacctgattttaaaatttggattgtaggatttaaaatttgagttctattttaaaaagattggattgcaataaaatttgaattctgaaagggaatattagtgtttctgctgctactagcatgattttacaatgttgagcagggcaagttgatcttttccaccaatgtcactctaatgggaggaacacggaggcaatggtgtggaaggaatgaagttggcttgtcaatgattggaatagaaatgtgttttgtcgatggaaaatcatggaattggcttcctattgatggcatataatgatgttcaatatctggttcctaacaacacattatctgtttactgtatgcaaattagtgtgcaaaatctattgtgtgctttgtaacagaagatttattttatggttacatttatttctaattttgttatgtagccttttagtaaacaaagaatcttttgtagcatgctcattccagtctaaaaaatgatttgtgttaggcttttcaaagtcaacattacacaactttgagcacctagctctttagcataaattaaaaaagagtaaatatcaattaaaaaagagtaaatttcacaaaactacatgttttgtggttcaagttgcagaaaaccacacacattttgacacttggcacttaagtacatatattttggttgtgtagtttcacaaaaccacactatcgataaatggattcacctgcgagatgacgtggctgtttcacctaggacgaggacatgacatcctattaccagccatcgcacgaaattaatagtatgccacgtcgatggaacaaccatgtcatctcaccggtgaatccattcatcgatagtgtggttttgtgaaactaaactaccaaaatatatgtacttaagtgctaagtgtcaaaatgtgtgtggttttctgcaatttgaaccataaaacatgtagttttgtgaaatttactcattaaaaaaagaagttacataagtgaaatataatgaaatctctagttttgaaaaacttgattatgctattttcatatacctaacatttatttttttaatgatttttatgctcaaaattaacttgtgttgactggcatgataaaacaacctgtttatgaaactggtgggagtagtatgttgattttttttccctggagtattttctagtgctgctgcctgctattacccagaatttgtgtcttgttgtccttgcctaaggagcttatcttcttatttctgcagatggctatgcattcagtatcatgatatcagcattacatcgaggtggctatcgtgaagagtcaaaacaacttgcaaaagaatttgaggccaagaatgcaacatatgatctggttatgcttaatacatcacttcgtgcttactgcagcaccaatgatatggaaagtgtaatgatcatgcttaggaaaatggatgaatcgaacatatcgcctgatgctatcacatttaataccttaataaggtacttctgcatggcaaaggtctatcacctagcatacaagacaattcaagatatgcatacaaagggccatcaattgaatgaggtatgttgcttgttgtgtatttgaccgatttaatatatcgctgcttaactctatgctagattaaaccatggttactacatatttacatccttggtaatttccgctgattggaatttggactacctattattacatatgtgcagaatagagtgggtgagagttgcacatttccttgcaacatgctttgcatcaactttcagtaatagacagtttatatcagtaaccaaaattgctatacatcttctccaggagctttgttctgagataatgatgcagctaggagaagcgggttttccttctgaagcattttctgtgtataatatgttgagatatggaaagagaacagtgtgtaaatctcttcatgagaaggttttatgtatcttagttccagctggacttctcaaggatgcatacgtagttgttaaggtactatacttatgcaattcagtgttgacatctctgttgttaccttgttcactatgaatgctatttgaacaggacaattccgagttcatatctcgacgctcgctggggaattttgctagatctttcatggcatcaggcaacataaatttgattaacgatgttatgaaagcagtacaccgttcaggatggcgtattagccaggtgactgttctttgcttgcactttgttatagtttggagttgaagttgaaaccccagatttctggatgttcaaactggtaattttgtttttagagctgactaggacagagggatgcaaaaaaaaaagtgattgccataagctagctaaaagagttcatttgcacaccacatatttttagttcatgatattttcctttctttgttctttgtccttttccattttttgctggatggtgtgctaacttacgtacttaccccttcaaatggtggacacaaccattacacacgcaggatatctttgggaaagcaattcagcgatacattcagaaacctgataagaagcagctactgctttgcctcttggactggatgactggtcaaggctattctgtggactcatcatcaaggaacttgcttttgagaaatgcccaactctttggccaaaagcaacttatagctgaaatcctttccaagcagcagggagcatcaaggatcacaagtcaaaggcaccaaaaatagttgataaggtagaattcaatatatgtaaattgttcagattcatccaagaatattctttagtaaaccattgttgatgatcagtgttaacatgttcgtagggatcggttagatcatcaggtaacaagttattcaccctcatcctcatgtgtcccaggatccaatcaagattcatcagaattacagatctggtatttcgtatgcatgtggtgtaaagcacccatgttatgttgtaatgcctgagcttgagcttgtccattttagtcaggctattcagggtgagattccacaagagctgcagatgggactagtaagtggtaggcaagtcttgctcaagactgcaaacaggcatacaagtaagttctcattgcatttctttacagcaacatcagagaaagtgtatattgagtttggtgttttgtgcagttaacactatgaaccttcttgaaggaactagtatgctacatagatctggaaacctgagcagatttcaaattttgttggttgtacatacttgtttttacgtgccttgaaacatgaaaggaacaatttgctaaggcgctgaataagatggattggcaaatattcaatggaactcagagtcagaggtagaacttcagtttggacaaatatggtcgcagtttgttttcttcggtttggtgtcatcatgaaaccaagtcttggttcagaacaaggaccatgggttcacaaatactgttttggtatatggcccatgcaaaccttctactatttaataaaaatgttttcaaatgtttgtataacctgctatgaaaagtatacacttcaagtgttgaagcattttttaacaatatgcaatgcatgccacataaaatccataaagggtcagggagaatcacattctgttgtaaaaccaacatatatgattaacagtaaacatatttacattattacacgtccttttggcattgccttaattaaaaactaactcatctataatagcatgtcatgggatgctacacccaacaattagataatgagtgtggccattgtctagctagcagttttacttagaatgcaaggtgttgctttgaaggttcaacaatccatacaggcagactaaggtatggaaagggtgtacggtgagaaatcttgagtttggagcagaataagtccagttactgctattttttcctattttcattttatgatcaggaatgagtcaattgatcaataagctgatatccttttctttagaaaattatgttcataacatgctgttttctccttgctttgctgaaagaaccctaagcttcatctggagtccagcaatgcatgtgatactgaacctatttagaaccagaggattctagttacaattagattagctatgcaaattaaattttggaacaccttctagttaaaagcactgctattgtaggggattgccatgtgaaatgatccttttattgtgtgtgaccttataacttctaatagtactgtaaaatgtattatggagagttttaaactaaaattacttcatgggtgtggatcattgggtatcattgtcgaggtaaacttggatgtcaatttgttcttttgcttgaaaaaactcagttttggccaattcatacattaagacatcattttcgtagatgcgtctaaggcaagaattggcaggcagcgatgtaaaataatagctgattttttttttgtcagatgaaatactggaccagagtatctgctaattcacacgtccctttcaatgtgagatattcttttcatgctgctaagctgaacgacagaggctactctatgattgtcctcacactaactgccagttacaagatcttttgattaaaattatcctatcaatttgagtccacatatatttcgatacatgtacattagattcctgcatatatgtattagtagtattttagcttgttagtacaatcttgttgtctacggagtacctaggtaacctataaaattttgtgctgtgtatttgtcctctatctgattctctgtgctatgatcatctggtaatcagtggctgttccaagttgttctactcagcttccttccagttctttgcacccagccatcaacagataagttcgtttcatcaggacgaattctctgtgtagaaaattatcggcatatttatttgagtgggccatcatttctgtgtcagcaggcaagaatagcttccaataatcatgttgggtttctaatgctgcaggcattatcttgtcctctagtagtagttttttttccccctaaacaatctatttcatgctgtttggactttgtacggatgggggaaaataaacttaagttgcactatgcccctacgcaatcaggaacattttttttgtgattatggttttgacaaaagtcatactcccaaataaaagggctagccatactgcagatacttttttggtattttttatttgagaagattgttccatctgctcccccattagtgaattcctcagctttgaaataatcaaaagaaaagaaatcaaagaatccatccatttttcaattggtcagtggtgacttcctga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
