Os01g0572700
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0572700 |
|---|---|
| Description |
Calcium-binding EF-hand domain containing protein |
| Version |
NM_001049918.1 GI:115437795 GeneID:4326305 |
| Length |
5421 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0572700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:23678694..23684114 |
| Sequence Coding Region |
23679314..23679433,23680283..23680379,23680479..23680643,23683009..23683074,23683176..23683275 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:23678694..23684114 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggaggagttcctcagggaggacgaggacttcatcaacgacgacgagcgctcaccaggtggaacctcgagcagtccagagccgaccagctccaccgctccgctcgggagatggagctctacgacaagaatggcgacggggttgtctcctacggggacttccgggctcagcacaacgaatcgagtggagaggttaattcgctggggttcccatggtggaaagaggagcatttcaatgcttcggatgcagatggccatggtttccttaataaaaccgagtttaatgacttccttaatcccagcgattcagagaatccccaaattatcaatttgctctgcaaacaagaaataagacagagagacaaggatggtgatggaaagctaaactttgaagaatattttcatgggctacatgaccatatacatggttatgattacgagaacgcagatatttcccatattgggaacaatacagtagctaaggagcggttttccaaacttgacaaagacagtgatgggtttatttcagagcacgaactagaacctgttcttgataagctccatctttcagaacgttattatgctagacaacaagctgcccatgctatttcagaggctgacaaagatcatgatggaagactaactttggatgagatgattgagaacccgtatgcattttatggcagcgtcttccttagcgacgacgaagactattttcatgatgaattccgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGVPQGGRGLHQRRRALTRWNLEQSRADQLHRSAREMELYDKN GDGVVSYGDFRAQHNESSGEVNSLGFPWWKEEHFNASDADGHGFLNKTEFNDFLNPSD SENPQIINLLCKQEIRQRDKDGDGKLNFEEYFHGLHDHIHGYDYENADISHIGNNTVA KERFSKLDKDSDGFISEHELEPVLDKLHLSERYYARQQAAHAISEADKDHDGRLTLDE MIENPYAFYGSVFLSDDEDYFHDEFR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4682..4801#3736..3832#3472..3636#1041..1106#840..939#583..718#450..500#gacccacacaacccgcaaccccacatctctcagcccccgaccccacttccgatctccacccccatctcgccggcgatgccgccgccgccgtcggccacggcggggcggaggtccccattctccgccctcctcctctacgtcaccttcgcgctcgtcatcctgctcctcctcacctcctactcacccagcatcccgcaccggggccgcagcctccaccgccgcctcaagctccaccccaggaacccctccctctccggggccggcgcgggggcacccaccggaggaaacggggctccgcagaagcagcagaaccaccaccacgcggcgcccttcgacccggagatcgcggagctggagcggcggctggaggacaaggagtgggagcgcgagcactaccgcatcctgcacggcgacggcggcggaggggaggcggacgagcacatgagggaatgggaggagttcctcagggaggacgaggacttcatcaacgacgacgagcggttcaacctcggcgaccgcatccgcgcgctcttccccaagatcgacctcgccccgcgcgacggcttcgcctccctcgacgagctcaccaggtggaacctcgagcagtccagagccgaccagctccaccgctccgctcgggagatggagctctacgacaagaatggcgacggggttgtctcctacggggacttccgggctcagcacaacgaatcgagtggtaatgtggcaatttttgttttggtttttttatctgtccaggagttcaaaacgagttcaataaggctggaagcgaatccatgagacaatttggagtaagtgttttaattaatgatttgcaggagaggttaattcgctggggttcccatggtggaaagaggagcatttcaatgcttcggatgcagatggccatggtttccttaataaaaccgagtttaatgagtatgcattcatttgaattctatttgaagatcattttttttattttgattatttagtgtgccattaatgctaatgtttgaatggttgtgctccaacttcagcttccttaatcccagcgattcagagaatccccaaattatcaatttgctctgcaaacaagaaataaggtgcttaattcttcaacccgatgaccgtttcttttcgtagtactgtttgcttggataacattccagaaactcagtaacgtacataacctcaatttgaagcccttttgtttgaggtctgagtatctgatcagaaatccttacttccttagtgttcaaaacactataattgctctctgattctaagaacagttccagagctgttcacatttaaaacttggaagctactattgacaggtagaactttccactttgttagtatacccttgactccttactgttccactgtaaggatccttagatcatgatgaagtaaacaccaggatacatacaaagcaggtggagctggtttcgctaaagaagggaatagagtagagactagataatgggacggacaaagggggttgggacttagatttgctccatcttttattacataagaaaggtccgtgtatttagagcttgtcttaacaaattaacaattggagatagacattctcaaccagataatatcatatccctccaggttgctaaataagatttgcaaataggagattagatgacaaccaacaaagctgctgctatagtttcatggttgctgctcagtgctcacacacatgacagctgcattttaatacaaggtagaacttgccactttgcaagtaatcctgaattcctgatgtatgacacctaacagaattaagggtggtaaagggcccaacattttagcctagaaaattgggctgtgaaaggacccatgggccaagcccattaccacccgtaaacataatgctcactctgttccatattattagtcattttgggtttgttctaagtaaaacttcttcaagtttaatcaagcttatagaaaaatgcagcaacattttcagcacaaaacaaatatacttaaaagtatattcgatggtggatttaatgaaactagtttggtgttgtagatgttatgcttttctataaacttggtcaaacttgaagaaattgacttaggacaaactcaaaacgtcttataatatgaaaaggagggaataaaaaactgaaggaactaaaatttaacatgatcatgtttatgtagatgatataacacttcaaaatgaagtggttaatttggttcattgaacaagtgaatgctggcatcaaggcctttaatattattgttaataataataacactcgatccaagtggagagacgttccgaaagcattgctttaaggtcaagaaaaggcccagaaagccagctatcgctttagtgaatagtgacctgccacgaccatggggcatacacagcaaggggcctttctttgcgtgatcccaggtttgagccctggttggcagcctcatacctggaggtcttaccattgtgctatgagcatgttctcctcaaggccttcaataaagctatttatcgttggtcagggctcatgtaaatccttatagcatttattcttttcttgagttgtcccatatcataaaattggataatctcttgtgtgtctgttagaatgaactaatcaatcaattattactaacagaataaccctgctcacaaataaagctcaactcttgctccgcatcatagtactacaatggccttttgattaacaagtgaacaaagcagggaaatagtgggtttgggtgggataagctggtagggtctattcctagttggttagtcctaggatgggcctaggacaagattaagttgacctggactgcacttggttcaacaggtcaagttagttttggcttaggtcattgctcagatggacttgctttggttcctggctgtgtgattaaacatttatctctagatcgttacctagtggtagtaaatacacatttgtaatttaatcctttctagaaagcaattgatcttatacttttgtaatatcatattcttttaagcaaccatgttagatattggtacccattattcttggccttgaagtgttagcaaagttaagtctaatgtttttgtagctttaaaatctgcttcctccttcatatttcatttgaagaaaaaaatcatggcacgttaaccatattttcactatcttaaattcattgcaatgaacatgctaggttctagtaaactattaattagagaatctattcctcttcaagccagggctactccaagtaacactcctgggcaaggcatgttgctatggacttccaaacgcacataaatatattttgccttttctgtaaagttggcaatattatatcactatatgtttcgtggaaggaacagattcctatcattatttccttatttgtgtggattgtaggataacaccgcagttccttgagctgacattttaaattccttacatatcgtgccatacccagacagagagacaaggatggtgatggaaagctaaactttgaagaatattttcatgggctacatgaccatatacatggttatgattacgagaacgcagatatttcccatattgggaacaatacagtagctaaggagcggttttccaaacttgacaaagacagtgatgggtatggaagtggagctttaattaatgacttcctctgatataattatttactgaagtattttcattttatatttttaagataaactctttgcctatgtaggtttatttcagagcacgaactagaacctgttcttgataagctccatctttcagaacgttattatgctagacaacaagctgcccatgctatttcagaggtttgattctcattgttttcctggaatttctacattttttctattgttctttgatatcttgaaatctattttccctttgtcatgcatgtctacagctttctatagttttcctgaacatagcagtagatgaacttttagtctttaataggtttgacatgtcctgatttgatattgtcaaaacctaatacaggctgtaactatctaatctcagtatagtgggacataagaataccctattaaataggtgtataagttgcccgtccaccgcaaatcatttgcttttcattttatagtatcatccagaattcaataaatctagttttttatgcatagaaaaaatcacagataatctgagatttttttttattttgagccttcttatttaaaatttcaaaaacaacctattttgaaaaatacaccttttgtcacacgtggagggcaaatgttgctactccatgaatagtggagatatataaggtactgtaccgactcttttcatgccatatcaaccctgatttaccacatcagtatgactctatgagcggcatgaccaaatctttgccacaccaaggtttttaacccatgcttcagcattgtgctgccacactaatgagaatgaagaagctaaaggtttagatatgtaaataatgtttcggtagagttcaattgtcaaatatattaaaaagttaaaaaaaaactcgataatctgtcgtggttcctgtttgcacaaggttgtccaaaagtttgcctgtgaaaaatctcaatgtattatgtgctttcctctgatgcatgatgtgtctcttgttccccgaggatgacatgttcaattggctaatccaaaaattgcaggctgacaaagatcatgatggaagactaactttggatgagatgattgagaacccgtatgcattttatggcagcgtcttccttagcgacgacgaagactattttcatgatgaattccgctgaggtgtctgcaggtgacttgcatgcatctgatgcacaccataccgaaaattgttttgcagctagtattcattcaaatattctgtccacagattgttggtgttgcaagtatggttt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|
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