Os01g0575000
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0575000 |
|---|---|
| Description |
Root hair defective 3 GTP-binding family protein |
| Version |
NM_001049923.1 GI:115437815 GeneID:4326314 |
| Length |
8360 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0575000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:23777165..23785524 |
| Sequence Coding Region |
23778347..23778491,23778601..23778665,23778787..23778891,23779889..23779959,23780049..23780112 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:23777165..23785524 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:23777165..23785524 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgcctgtttttcaacacagcttattgatggagatggcgttttcaatgtttctggattggagaacttcatgaaggaagttaaaatgggcgaatgtgggctttcatatgctgttgtgtcaataatgggtccacaaagtagtggaaagagtacacttttaaatcaccttttccgcaccaatttcagggaaatggatgccttcaaaggaaggtcacagactaccaaaggtatatggatggcgaaggcccataatattgaaccatgcactcttgtaatggatttggaaggcacggatggtcgagagaggggagaggatgacacagcctttgaaaagcaaagtgcactgtttgctttggctgtttcagatattgtgttgatcaatatgtggtgtcatgacattggtagagaacaggctgcgaacaaacctcttttgaagactgttttccaggttatgatgagattgttcagtccacgtaaaacgacattgttgtttgttattcgtgataaatcaaagacacctctggaaaatcttgaaccgattctaagggaagatattcagaagatatgggatggtgtccctaaaccccatgcccacaaggaaactccactgagtgaatttttcaatgtcgaagttgtggccctatctagttatgaggaaaaggaggagttattcaaagagcaggttgccagtttaagagataggttccaacagtctattgctcctggtggacttgctggagatcggcggggcgttgtccctgcatctggtttctctttcagttcacaacaattttggaaggtcattaaggagaataaagaccttgatctaccagctcataaagttatggtcgctactgtacgctgtgaggaaatcggtaatgagaaaattgccagttttacagctgatgaggagtggcaacaatttgaggaagctgttcaacatgattacgtgcctgggtttgggaagaagatcagcaaccttcttgacagatgcttatcagagtatgacatggaggctatttattttgatgaaggtgtcagaacttcgaaaaggcaccaacttgagtctaaacttttgcagcttgtcaaccctgcataccaaaatattttggatcatttacggactagaactttagaagtatttaaggagtcctttgacaagtccctagaaaaggagggttttgctgttgctgctcgtgactgtactaaggttttcttggagaagtttgacaaaggatccgaagatgctgctatccaacaagtgaaatgggacccatcaaaaattaaggataagcttaagcgtgacattgaggcgcatgtggcatcagttcgtgccaaaaaactatctgaactttgttccaaatacgagggacaacttaccaaggcactggcagaaccagttgaagctcttctagattcagccagtgaagaaacctggccagcaattaggaagcttcttcaacgcgagacaaaatctgctgtttcgggttttgaatctgccatggcatcttttgagcttgatgaggtgactcagaaagaattactttcaaagctggagagtcacggaaagagcgttgttgaatcaaaggcaaaagaggaagctgcaagggtcttgattcggatgaaggacaggttctcaacactattcagccgtgatgctgactcaatgccaagagtgtggaccggaaaggaggacataaaggccattactaaaactgctcgttcagcttctatgaagttgctttctacaatggctgcaattcgattggatgaggatggtgacaacattgagaacaccctgtcccttgctctagttgacacagcaaggccagggactacagataggagcatccaatcgttcgatccacttgcctctagctcatgggaaagggttccagaggagaaaactttaattacacctgtccagtgcaaatctttatggaggcaatttaaggctgaaactgaatatactgtcacacaggccatagctgctcaggaggcaaataagaggaacaacaactggctgccacctccatgggcacttgccgcaatggctatccttggattcaacgagttcatgacattgttaaagaatcccctttacctgggagtcatatttgttgttttccttgttggaaaagccatgtgggtacagctagacattgccaaggagttccaaaatggatttcttccagccgtcctatcactttcgacgaaattcgttcccacgataatgaacatcctgaagagattagctgatgaggggcagagacctgcagccccagagaggcaaagagagatggaactccaaccaaaatccacaaggaatggttcacacagcaacgtgacatcggcagggtcatccagcataacctcttcggagagtggacccgaatattcaagcccgattgcacactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDACFSTQLIDGDGVFNVSGLENFMKEVKMGECGLSYAVVSIMG PQSSGKSTLLNHLFRTNFREMDAFKGRSQTTKGIWMAKAHNIEPCTLVMDLEGTDGRE RGEDDTAFEKQSALFALAVSDIVLINMWCHDIGREQAANKPLLKTVFQVMMRLFSPRK TTLLFVIRDKSKTPLENLEPILREDIQKIWDGVPKPHAHKETPLSEFFNVEVVALSSY EEKEELFKEQVASLRDRFQQSIAPGGLAGDRRGVVPASGFSFSSQQFWKVIKENKDLD LPAHKVMVATVRCEEIGNEKIASFTADEEWQQFEEAVQHDYVPGFGKKISNLLDRCLS EYDMEAIYFDEGVRTSKRHQLESKLLQLVNPAYQNILDHLRTRTLEVFKESFDKSLEK EGFAVAARDCTKVFLEKFDKGSEDAAIQQVKWDPSKIKDKLKRDIEAHVASVRAKKLS ELCSKYEGQLTKALAEPVEALLDSASEETWPAIRKLLQRETKSAVSGFESAMASFELD EVTQKELLSKLESHGKSVVESKAKEEAARVLIRMKDRFSTLFSRDADSMPRVWTGKED IKAITKTARSASMKLLSTMAAIRLDEDGDNIENTLSLALVDTARPGTTDRSIQSFDPL ASSSWERVPEEKTLITPVQCKSLWRQFKAETEYTVTQAIAAQEANKRNNNWLPPPWAL AAMAILGFNEFMTLLKNPLYLGVIFVVFLVGKAMWVQLDIAKEFQNGFLPAVLSLSTK FVPTIMNILKRLADEGQRPAAPERQREMELQPKSTRNGSHSNVTSAGSSSITSSESGP EYSSPIAH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1183..1327#1437..1501#1623..1727#2725..2795#2885..2948#3052..3117#3244..3291#3376..3438#3516..3572#3661..3819#3895..3963#4048..4139#4700..4778#5327..5489#6095..6219#6304..6566#6638..6734#6825..6986#7122..7226#7353..7447#7534..7630#7725..7955#cacttctcaataaagagccacccatcaccaccaccaacacgcacgcacgcacgcctttccttccttcctccctcccctccctccttcccccacccgcttcccttgccgtcgccgccgccgccgaccgccgcgggaggggaggtccccggcgccatctcccaggtgcgccccctctctcgctctaaatctcccccctccccctccctgatccgatcgacgccccggatcgctctcctgcttcctcctccgggggctccgatttggatttctccgttggtacttcccccccgtccttctcgtgtttcgctgcggcggcggggatggtcggatcgacggcggtgggggggggggcacgctgtgcggttcgtggcggcgacctcggtggggccgggccgattcaagcctgggtgccctcccccccggtgcgggggtttagggttgggggtggggggattggagctcgattcgacgcggagctcgccgcgctcgcttggatcgcccgctagatcggccggaaaagctcgagctgttttatttttattttttttgaagcttgctccctctcgattccgtgatctcgcccgccgtacgatttggctaggctaggctaggctagggttaatgatgctttgggggggggggtggcactatcgccctaagtggccgtagaaaatccagttcatgcgattaccattgagtgattcgtgttttacggtaacgagtagtatcacttggggtggctggatgcgagattgtacagtgtgcgatctgtagtaataattaagtagagcacccgaccaaagggaagctcgcacccatcaatttgcttcgccttagtaagtacattaaagtaaaattggacttcatacagctctgagctctctccccatttaatgcttgtggtttcatcaatatttcagtcggtttcttacaatgctagtatgctttatgacggtaattttggatggtattgtgtagaagcactattttttttattattattgatatcccaccagccaagcaatttgcttaacctgtgtttattttctagtatcatttggttcttacaataatctttcaggggttgtgcattggaaaacatgttctactcatttgcttttggttatatcattttctctaaagagcttactagtgattttttttattacttgtcttgcagaaatggacgcctgtttttcaacacagcttattgatggagatggcgttttcaatgtttctggattggagaacttcatgaaggaagttaaaatgggcgaatgtgggctttcatatgctgttgtgtcaataatgggtccacaaagtagtggtatggtgttttttttttcctttcatcatttgctctatctgttttcaatgaataatatattttatcccagcgccattgttcatcaattcctttttacatttttttccaggaaagagtacacttttaaatcaccttttccgcaccaatttcagggaaatggatgccttcaaaggaaggcatgttgttattcctttctagcctttagttcatgccttttctcatcagaaactttattggctttgatggaattggttcttattctaaatcaagttcactgccattttctgaattcttcaggtcacagactaccaaaggtatatggatggcgaaggcccataatattgaaccatgcactcttgtaatggatttggaaggcacggatggtcgagagaggggagaggtaataaaaaaacaattgtttttcctgatctgtagttgattggattagatgccagtattagtgtgacgggtacatacttaagtttgctttaccaattgtttgttgaaatggagatttttgtgtatctgatagtacagagttaaggagtgtcctgtactagcaaggcaccatccaaattagctaagctaataaacttaaccctcccattgatttcatatttgcatatttctgacatgtagttaaactagatatgtagtggcatagcttgtgaaacaatcttagtaccatccattgcattttggcttcatcatataagcccacaagattaagctaaaatttcctcatgtgatcctttcaactgctaatgggcatcagggttatgtgatgtttgttatttgttgagtaacttgctcttgttctcccaccacctttttcctctcttaatgaaatgatatgcagatttcctgcatattctaaaaaaaacttgctcatgctgggtattttgatctaagtttcataaaacacttgtatttacttaataccatctttgggaaaatttgtcataaagcactgcatctgtgatttttctaccttcctgccattggccttgacttatttgtaaacaacaaatgacacattgtaataatgatacgtggacttttggtccgtggagttaaaatatcagtgaactgccttacatatctactatatgttttttcctccctcatactttgagattctttcctaactgctggagacgtccattggagaaggcgtgggtcttagatgcctttgctatttagtagagtcttaatcaagaacatgctttggagagctggtgttttgtgctacaatatcttaagtgaaattatgtgataaatttggtgttcttgggtcaaattacatgatgaaaaggcactgtattgtttgttactttttgtttttggtttgaccttttgcctcacaataactctttaatttacttgtgatgtttcaggatgacacagcctttgaaaagcaaagtgcactgtttgctttggctgtttcagatattgtgttgatcaatatgtaagttctgctgaatgatgtgcgttggacctattgtttcctaaattggacagtgcaatgagtgaacttttaattattttcttccataggtggtgtcatgacattggtagagaacaggctgcgaacaaacctcttttgaagactgttttccaggtcagtttgttagtgctacaatgtgggcttattttctttgattcctgattcttcagtggtggaagatactataatatcattgtgtctttgtcaacctgaataggttatgatgagattgttcagtccacgtaaaacgacattgttgtttgttattcgtgataaatcaaaggtgagggcttgctagggtgcaatttaggctgttagtttcctgagaaactaccagcagtcctactatgaactccaaatccaaatctatgtactgcaactaacatgtgcccatttcggtttacaacagacacctctggaaaatcttgaaccgattctaagggaagatattcagaaggtatgcatttacttgagagcccttttcctgtctgcctgacctttcttccattttaaatacactaatcttttcgtcttgctgcagatatgggatggtgtccctaaaccccatgcccacaaggaaactccactgagtgaatttttcaatgtaaaatccacaattcaatatttctagttaatgttatattctatattttctcactgccaagtctgttctccatgcaggtcgaagttgtggccctatctagttatgaggaaaaggaggagttattcaaagagcaggttggcatcgttaagcattagttatgaatctgtgcttgttactgatcttctggaaattgtatgactgataataaattaatttatttaggttgccagtttaagagataggttccaacagtctattgctcctggtggacttgctggagatcggcggggcgttgtccctgcatctggtttctctttcagttcacaacaattttggaaggtcattaaggagaataaagaccttgatctaccagctcataaagtaagcatccttgcccctttcagtagcgagttatcaaaattatgcatgctgacatcttttgcgcatttaattcaggttatggtcgctactgtacgctgtgaggaaatcggtaatgagaaaattgccagttttacagctgatgaggtgattgcaatacatgttgtgcttgacctacactaatttgatcgaagaaatcagctgatactttatatgttttgtatttaaaaggagtggcaacaatttgaggaagctgttcaacatgattacgtgcctgggtttgggaagaagatcagcaaccttcttgacagatgcttatcagagtgagttcatcagtaccttttgaccaatactattttttttaattcgggctatgatattcccaagatttgcataactcatgggggactggtcggttactgctctttactattcatactttatggtgtaggctaggtcagtttgttcccccgcgatgttgattctcaccaactttatctaagccaaaagcataataacatgtttttggtatagttcttggaaccagcccattactctaaaccagtggaagcaggcccttatttagactcgttcctttttgctctgtgagaatcaaacttttcttgtcaagatggattaagtgcttgcccaaaatgactaagcagtcttgagcttggaaaccaaacaactttctttacaaaaaataatttgtacaaagcacatcaagttcaaatggaacatcgagaaaacatattaaatttgaattgaggttgtagaatgcacaccagattcaaacaaaatttgtatataaagcacatattgcaattttacctggtttgctaggcaagaacaagctatgatggtttttttctttaaattgtaggtatgacatggaggctatttattttgatgaaggtgtcagaacttc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