Os01g0613900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0613900 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function UPF0052 and CofD family protein |
| Version |
NM_001050099.1 GI:115438537 GeneID:4325327 |
| Length |
6270 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0613900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:26011014..26017283 |
| Sequence Coding Region |
26011199..26011342,26012221..26012313,26012536..26012661,26013020..26013067,26013287..26013388 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:26011014..26017283 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcgtcgcagccatccgatggcgcaattgctcgccgccgccaccaccaccaccacgccaccctgcggcggcctcctaaccgcgcgggcctccgcgtcctctcccggctgcttcctccgcgcgctgccgagatcccgcgccatggcctccgcctccggagccgacgctgccgctgcggcggttgctcccccgtcgctgctcgtcttctcaggaggaaccgcttttaatggtgttgtagaagagctgaagaaagtgacgactcgagttgcacatgttcttcctgtttccgatgatggtggaagcacagctgagattgtgcgagtgcttggtggacctgctgtgggtgacattagatcaagatgcttgagattgtctgatgaaagcacttcagaagccctttctgttcggacattgcttgggcaccgtttgcctcttgatccttcagaagcaaagcttgagtggtaccagattgtagaaggagagcacgctttgtgggatggtgtctcacagccatacagagaaacaatacgtgcctttttagtctacttccataatgagatacttcgacggtcagctgaaatgttttgcttcaccaatggcagcattgggaatttcttttttgctggggcacgcatattcttccagtctctggatgctgcgattttcttgttctcacgtgtgtcacagatccctgctgaaagtcttgttcttccagtgatatccacaaatgacaggcttacactgggatgcgaactatgggatggaactatcatccgaggtcaaaatgaaatatcacatccaagcaatggacgtaaagaagttgttaacaaggattgtaattcatgtagtgcacttccttcaaggattaagcgtgtcttttacatgtcaagtgaaggcagcaacctgttgcatgaggtatttcctgaagctaaccgtacagttttggagcagttaagtaaggtggactgcattgtatatgctatgggatcactctttacatcagtctgtccatcattggtattgcgtggcattggtgaaactatagcatcaagatccattccgaaggtacttcttttgaatgggtcgcatgacagagaaacaactgggttgcctgcttctggctttgtgactgccattactgattctctaaaccgtacatatggatatcctgacaaaagtctaaagaatcttcccaaagactatgtgaatgctttattggtaccaaaaggaggccaaattcctttggatataaaaaacttgtcttctaaaggaatctttcatgtggttactgtggactctatacacgatggaaagacgggcattatttttgatccgcattcattgattcaagccctgaccagtctaatatcggataggcgtttcgtggaacctgatcttctaacagaaaatgtagagtctgtatgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRRSHPMAQLLAAATTTTTPPCGGLLTARASASSPGCFLRALPR SRAMASASGADAAAAAVAPPSLLVFSGGTAFNGVVEELKKVTTRVAHVLPVSDDGGST AEIVRVLGGPAVGDIRSRCLRLSDESTSEALSVRTLLGHRLPLDPSEAKLEWYQIVEG EHALWDGVSQPYRETIRAFLVYFHNEILRRSAEMFCFTNGSIGNFFFAGARIFFQSLD AAIFLFSRVSQIPAESLVLPVISTNDRLTLGCELWDGTIIRGQNEISHPSNGRKEVVN KDCNSCSALPSRIKRVFYMSSEGSNLLHEVFPEANRTVLEQLSKVDCIVYAMGSLFTS VCPSLVLRGIGETIASRSIPKVLLLNGSHDRETTGLPASGFVTAITDSLNRTYGYPDK SLKNLPKDYVNALLVPKGGQIPLDIKNLSSKGIFHVVTVDSIHDGKTGIIFDPHSLIQ ALTSLISDRRFVEPDLLTENVESVC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5942..6085#4971..5063#4623..4748#4217..4264#3896..3997#3232..3315#2724..2795#2257..2413#1986..2029#1647..1743#1386..1518#1181..1297#9..219#gctgcttgatgcgtcgcagccatccgatggcgcaattgctcgccgccgccaccaccaccaccacgccaccctgcggcggcctcctaaccgcgcgggcctccgcgtcctctcccggctgcttcctccgcgcgctgccgagatcccgcgccatggcctccgcctccggagccgacgctgccgctgcggcggttgctcccccgtcgctgctcgtcttctcaggtgcgtcttgctctctcccgctctcgccaatttggatcgcttggagcgtatgatagtgcgtgcgcgggcgccggggggtctcggtgatttgctggggattcgatgcgtgcccataccttgctgcgagtatgggcacgcgtgatggattggtcgaattggcgagaggaagttcctgtgatttgtgattggctgtgatttgggcgattctgtgcataatattttgtgtgtgactgagtatgcgagtttgggaacaaaaattgtcgaaattacatttgtgcattttttttccttactcaagccatggatccttcagtactatcttactatcttacccctccttgggatatgtattttgacgcaatgtggcaatttatgatttggtatgctcaactaggatgatggaaagtgtccagtgctttatgtgctcctttctagctcacgtttggatgttgaactaatatgacaattatggcatggatacatatgaacgctgctccgatagccctggtttatgtgttgataattggcacatcttaaattcttgtgatagccatgtctgaaatcctggatattctacctgcgaaacggaacactaaatggtgtttgtcttggtaacactaggttctgcgaaagcatatctccatgcagcgctggatgaaaataatgaaatgtcatttaatttccatgtcaaaattttttgtttcatatatcctgcttgaatgatggattgcacaaactataccatgctcctagagtagctgtttaaacagttctattttctttcttatggattatgcattttgcgactttgcgggatttcataaattgaaattcgcttggcacttgcaaccttaccctatctgtgtaatgaacaggtttccttttttccttttctggttggcacaggaagggatgcactaatgtcatttacttttgtgttctaatatttaacgctatccaggaggaaccgcttttaatggtgttgtagaagagctgaagaaagtgacgactcgagttgcacatgttcttcctgtttccgatgatggtggaagcacagctgagattgtgcgagtgcttggtaggttgaaatctcttgccacaccacctgctacctgagataacaatttgtatagtaattgaaaatccaacctgttcttaaatgttaggtggacctgctgtgggtgacattagatcaagatgcttgagattgtctgatgaaagcacttcagaagccctttctgttcggacattgcttgggcaccgtttgcctcttgatccttcagaagcaaagcttgagtggtagcaattagtctgtctattgcatatcaaaactcacctttgttcattcaaactggatcaagtaactggctgatgttttttatgtatgaaacaagatgtgtgatgttgttaggttgtgtacttgacaggtaccagattgtagaaggagagcacgctttgtgggatggtgtctcacagccatacagagaaacaatacgtgcctttttagtctacttccataatgaggtcagttcctctgtagtattttcttttcatagcatatttttaatttgcttaaagattttgctttgaaaatttcaaatgaacagttttctgactggagaacagaagagaatatgatttttcgcctcccccccttctgttttcttttttgccaagatttattttcctggtatagagggcagtctgatgatcaagcagtcgttccttgcccatgacatataattgcagtcgtttcgtttgtgcagatacttcgacggtcagctgaaatgttttgcttcaccaatggcaggtgattcttttaaggtgaaatttgcagtaaatcatattcttgtgattgcttttaacatgtcacccgttggtctcttgccacttctcaattcgatggcgtgacagggatgtcctttgtggcaatacttatttcttggtattggggcattttttgtggtcacaactcataataacaatactcccatcttgcctacatctgttattgactacagctttttattcttgcagcattgggaatttcttttttgctggggcacgcatattcttccagtctctggatgctgcgattttcttgttctcacgtgtgtcacagatccctgctgaaagtcttgttcttccagtgatatccacaaatgacaggcttacactgggatgcgaactatgggtaacatcacttatcagtattttagttgcacaataaaaaaaccagtagattcatttttcggactgctctggtgatctggtcttcttgttcttatgttggttaattttattgcttccatttatttatttatttattttgttatttcactgatagtttaattagccccccttataaactttctttaattattccaacttgcttctgaaaactggcatgattgtctttgttttacaatgttactcctattattacaaacattcccttactacaaaatcacatataatcatcttggacattattccattttcaggatggaactatcatccgaggtcaaaatgaaatatcacatccaagcaatggacgtaaagaagttgttaacaaggtactccagtctataaatcatttcagcatactcccaatagtagttaatatgatctatgtaacatcattgcgatgaaggctccaaagcatttctggggccacttcaatatgttctatggaacaacttttttatgttttatcttataaaagaagctatagaagaaaaaaaaatgttactcctacctttaaaattgtgttgccatatccttctctggtggactgatatttacaattgtgcaaactccatttcgttatgacaatatcggctatttttgcttcatttccgtttttgttcatggcatggttgtcattgattcacatgttatcttgaatctatgtttttctcctttttacctgggcatgcttgttgatttcttataatatttgtttatctgtcactgatttattttttattttgctttttatttttggaaaaggattgtaattcatgtagtgcacttccttcaaggattaagcgtgtcttttacatgtcaagtgaaggcagcaacctgttgcatgaggttagtacattcattttatcgtaaccacctagactgaacctttcattgcacatctatcatgaattcttggttgggtaagactttgatttttgttaaaacaaaagctactagtccctctaagaattgattcagcctttctactttaatttctcagcgtaaaatttttttcttgaataccacacatcttcatgttcttaataatgatcatgatataataatcagaaaatgtagtctatatttccatttatcatgcttatctaatcagtctcatggtgttacttacaacattgtgaactataccattcatcaatagtgggtttttagctcttggttaacttaattctttaaagagtacgcttactccttctaagcttagtaggcatgagaagggacaactccttcatatagtaggctgttatgttttgtgaatatcatgggcttaaaagggtgtgcacttataaccatgtaagcatattgggatgacatgtatcaaattagccacttcacaacagtatatatgtaaacaacccttttttatgttttaaaactcctaactgttcctactaaccttgcaatgcaggtatttcctgaagctaaccgtacagttttggagcagttaagtaaggtggactgcattgtatatgctatgggatcactctttacatcagtctgtccatcattggtaaccatgctgctctattttttgtttgtacataattgtattgacttgatggtcttaagtcttaacatgatatcagatatgttcatttttatactacatgcagtactaagcaaacatgggtgccgtgcacatctgattactgatactgactttaagcttttttacctgtgcctgttttccacatcagcttgtcttcttctgaaatttaaggctgtgcaggtattgcgtggcattggtgaaactatagcatcaagatccattccgaaggtagtcatgttaaaaaaatattgtcttgttttcatatgctttaatacaatgttctgtatttgtgttgattcattttttcttgattccatcatgtaaataaaagcattactaagacctgacattcttgttaaaccatattgacttgcttcatgctcttgatttcattatgctagaatgggtttaatagcaacctagaatagtggattcacctccatagtagtggactcatggggttatttgatgtgtgaagggagtttttcttcacataaaatgttgtttttcttggtttttagccccttggttgatcatgcttgtggctattggtgcttttgtctaaaattatttattctgaatctaggtacttcttttgaatgggtcgcatgacagagaaacaactgggttgcctgcttctggctttgtgactgccattactgattctctaaaccgtacatatggatatcctgacaaaagtctaaagaatcttgtaagttcggtgactgtgcctttgaacagattttcagctaatgattggaggaattatgcatcatatcatttactagctttagaggatgggaatatccca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|
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