Os01g0711000
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0711000 |
|---|---|
| Description |
Similar to Vacuolar ATP synthase subunit B isoform 2 (EC 3.6.3.14) (V-ATPase B subunit 2) (Vacuolar proton pump B subunit 2) |
| Version |
NM_001050578.1 GI:115439526 GeneID:4327833 |
| Length |
5684 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0711000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:31292571..31298254 |
| Sequence Coding Region |
31293657..31293714,31293835..31293890,31293995..31294093,31294577..31294636,31294873..31294984 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:31292571..31298254 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggttgttgcaaatggtaatgtcgacacggaggaaggaactcttgagattgggatggagtacaggacagtctctggagttgctggtcctctagtcattcttgataaagtgaagggtcctaaataccaagaaattgtcaatatacgattaggagatggcacaactaggcgtggtcaagtgcttgaagtcgatggggagaaagctgttgttcaggttttcgaaggaacatctggtattgacaacaaatacacaactgtacaattcaccggtgaggttctaaaaactccagtgtcactggatatgcttggacgtgtcttcaatggttctgggaaacctatagataatggcccaccgattttaccagaggcttacttggatatttctggaagttctatcaatcccagtgaacgaacataccctgaagaaatgattcagactgggatatctacaattgatgttatgaattctattgcccgtggtcagaagatccctctgttttccgctgctggtctcccacacaatgaaattgctgctcagatttgccgtcaggctggtctggtaaagcgtttagagaagagtgacaatatcttggagagttccgaggatgaaaattttgcgattgtctttgctgctatgggagtaaacatggagacagcacaatttttcaagcgtgattttgaggaaaatggttcaatggagagagttaccttatttcttaatctggcaaatgatccaactatcgagcgtattatcaccccaagaattgctctcaccacagcagaatacttggcatatgagtgcgggaagcatgttcttgtcatcctgactgacatgagctcatatgccgatgcacttcgtgaagtttctgcagctcgagaggaagtacctggacggcgtggttatcctggttatatgtatactgatttggcaactatctatgagcgtgctggtcgcatagaaggaagaaaaggatcaattacgcagatacccattttaaccatgcctaatgatgatattacacatccaactcctgatcttactggttatatcactgagggacagatctacattgacaggcaactacataatcgacagatctatccaccgattaatgtccttccttcactctcccggctcatgaagagtgctattggtgaaggcatgactcgcagggatcattctgatgtctcgaaccagctgtatgccaattacgccataggcaaggacgtacaggcgatgaaggcagtggttggagaggaagcgctgtcatcagaggacctgctgtacctcgagtttcttgacaagttcgagcggaagttcgtgacacaaggagcatatgacacacgcaacatcttccagtcgcttgacctcgcctggtcactactgcgcatctttccccgagagctgcttcaccgtataccagcgaaaacccttgaccagtattatagccgtgatgcctcccactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVVANGNVDTEEGTLEIGMEYRTVSGVAGPLVILDKVKGPKYQE IVNIRLGDGTTRRGQVLEVDGEKAVVQVFEGTSGIDNKYTTVQFTGEVLKTPVSLDML GRVFNGSGKPIDNGPPILPEAYLDISGSSINPSERTYPEEMIQTGISTIDVMNSIARG QKIPLFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKRLEKSDNILESSEDENFAIVFAAMGVNMET AQFFKRDFEENGSMERVTLFLNLANDPTIERIITPRIALTTAEYLAYECGKHVLVILT DMSSYADALREVSAAREEVPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGRIEGRKGSITQIPILTM PNDDITHPTPDLTGYITEGQIYIDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRRD HSDVSNQLYANYAIGKDVQAMKAVVGEEALSSEDLLYLEFLDKFERKFVTQGAYDTRN IFQSLDLAWSLLRIFPRELLHRIPAKTLDQYYSRDASH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1087..1144#1265..1320#1425..1523#2007..2066#2303..2414#2504..2712#3110..3238#3343..3480#4061..4211#4412..4494#4676..4723#4846..4899#4989..5072#5170..5355#gccttcttcgctgggggtggggcgacgaaacttgcgcgatctcccctctcctctcctccgctcgaatctgcggtacgcacgcctccctcctcctcctcctcctcctcctcactccttccggccccgatcctatagctcctccgctcgccgcggggatctgcttacgacgaggcccggcacccccgccgccgccggatcgtggtttggcgcttcagacccgtgcgtagcgtgtaggatcaattggcgctccacgttccccgatgttgccgaattttcagagtttgttgggtagattgacccccgctacctccactgtggaggtatgcagagctgcccgtgcgaggagatggggtttgtcgattagtgttctgtcgagagcgctaggactaggatcttcgtagtgttgttgtttaagaagtgagatacagtacaaagctcgtttctgcctcagttcttctagggagcttacatgtaatgatcaatgtgtctgaaacatgattttttttttcagagatgtagggttggtttttggactagaaagggttctggtgaagtacatatgattcgattggcgatgttctatcactgccttttatgtttttactgcttactagaatagtagctcatggagctagatccttctagtatttccagaaaattggaacaacataatctttctagagttaatcttttgctaattcgaatagcaggatagtgtttgcctatttggcatatctactaactatacatttcaccttgtagttgatatcagctttagctttgtcagcatctgattgattttagattggcaaagtatctggcctttgttgctggtaatttaggaaatatagaagtgacagttaatgccatgaatttgttgttttaatttctaatctaaatcgcaaaactaaaagagaagataagtatgcggccagtgaagaaagggtttaatggtgatgcataccccatttatctagggaacttgagaaaacagatacacgacagattgtccatagaatattcttctgagtatattttattgactcaaatacttacctacagcaggcttcttctacaatctcaaacatggttgttgcaaatggtaatgtcgacacggaggaaggaactcttgagattgggatgggtacggatcttctgcttgattcacaataaccatatatggactgagtctagcttgtaagtagcctagtattgatattgttgaactactcacactttgtaagtttttcttttaaaaatgcagagtacaggacagtctctggagttgctggtcctctagtcattcttgataaagtgaaggtaatcatatcttgtgatggctatttcatattgttttacatgcaaatataattttgattatttcagatcacattcacattccatataatgtgttggtatttcagggtcctaaataccaagaaattgtcaatatacgattaggagatggcacaactaggcgtggtcaagtgcttgaagtcgatggggagaaagctgttgttcaggtatgtacatatttgtttcacagtggcaataaataattaagatagcatgcattcttttaacatgttgccaattcattcgtgtggttatattgttattaaaaaaagttgattccttcttcatcacttattaatataactgtttttcaaaattctattagtatattatgacaatttgattggaaagcagatggtgtacattgtttatgcaatcttttaagcattttacagataattagctgaattgcctgtattttgtcagaaccatcttagatggcagtgatacaagtatgactaacacaaatattaagtttacaatttttatatttcttatggtagtataagcatcaccgagcagtggtctttacttttgtcttcaggttgcctcaaacttttgagagtaatgtgaacgtcagtctagatgttattgtgcagttgttacctacctgtctctttcactcatgaaacttttgaaatcactggcaggttttcgaaggaacatctggtattgacaacaaatacacaactgtacaattcaccggtgaggtaatattctttttccccgtgaatttgtgctaatatgtagtggcactgtttaaaatagtgacccggatctctggcattcactaaataaagttgtcaatccttggattagaaaccggctggcccccccaccattagccattggcttgttcccacatacagtgttttagtcattgaaattttcgaagtggttcactcttaattttgttcattctactttcctcgtgaacttttttcaggttctaaaaactccagtgtcactggatatgcttggacgtgtcttcaatggttctgggaaacctatagataatggcccaccgattttaccagaggcttacttggatatttctggtaggtgctagctgcttttgattattcataagatttgattatggtgtaaatcaaatgcttagattttgacatcgggtttgctggtgcaggaagttctatcaatcccagtgaacgaacataccctgaagaaatgattcagactgggatatctacaattgatgttatgaattctattgcccgtggtcagaagatccctctgttttccgctgctggtctcccacacaatgaaattgctgctcagatttgccgtcaggctggtctggtaaagcgtttagagaagagtgacaatatcttggaggtatttttgtctaaactacataatattcatcatacctaactggagtaccatttccatgttgcattctgggtactgtagcaagctataggcattacttcttacttagttcttgcagtaagtagccatagataattgacaataagcttgtgatctttgtttctaatttataagaagtgactaaatatatttgatgcatacttagtttgtcctacatggtgaagctaaccgtgttatggataagtagtcataaatatgtaacactagctacaaaaagattgttatcagtcattgcaatttagtgcagttttctattctgttattgctgtatgctgaataacattttgacattcacacttcttccttaatattatctatctaatataacaatttattatagagttccgaggatgaaaattttgcgattgtctttgctgctatgggagtaaacatggagacagcacaatttttcaagcgtgattttgaggaaaatggttcaatggagagagttaccttatttcttaatctggtatatctgcattacctttgttctttcttttccttcactatgctgctctaaggaatttgcaagatctataacttactccttgattttgtattttttgttcataggcaaatgatccaactatcgagcgtattatcaccccaagaattgctctcaccacagcagaatacttggcatatgagtgcgggaagcatgttcttgtcatcctgactgacatgagctcatatgccgatgcacttcgtgaagtaagggcctttatcttgctatatgttatttcctagtgtttacattagaaacatggtgggaattctctgctatcactttgagctaaaatggacgttttgaaagatgataattctgaaaaatgttgtcttgccttacctgtttgaagggggaaaacgagcacaacataggtttatacagagaacctagatggttagatctaaagcaagttatgatctgttgtttgttgtgctctagactattttgtctgtcatcgatgagacgatgatcggtagctaggtatcgtataattacattaacacagatacagagttattctattcactattgcaggtctgcagctatactagttatatgcttctcgttgtaaatttagattcagaaatattggtttgagctaatttgaataactaaataatattgtatcgaataaatgctttaatattgtttttctacatatgcttgctccttttttttttttgaaatctagtccttttaataccacggtttatgctgatttcttaagtattatatcattcaagtcacctctacttaccttttctctgtctttcctcacatcaggtttctgcagctcgagaggaagtacctggacggcgtggttatcctggttatatgtatactgatttggcaactatctatgagcgtgctggtcgcatagaaggaagaaaaggatcaattacgcagatacccattttaaccatgcctaatgatggttagttatttaaatgtgcttacattttatgataaatctttttgcgaaattgcacttttcctttttttaatttgaagtatgtatgttaattgcacagaaaaacatagtgaatcagttttattaatagaataaatgttacatggataactgatattagatgctgccggcaactttctgactcataagtcgtgctgttgtagatattacacatccaactcctgatcttactggttatatcactgagggacagatctacattgacaggcaactacataatcgacaggtattccacatttccacagtttcctgctaaactttgtttgatgacttctaaaccgaaaatttggattcctgattacgacaaaagaataagataagacttaattagctatttatagtaaaagcataaatagttggcatataaaaagttctctctgatcttattgctgatttcaatttggcagatctatccaccgattaatgtccttccttcactctcccggctcatgaaggtaaggtttttggcaataaagaaagctgccgcactctacatcctactttagagttttgcagggactgacatcgtcaatataaggttgataatttgcttataacttgacc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