Os01g0738100
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0738100 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1 family protein |
| Version |
NM_001050721.2 GI:297597579 GeneID:4327883 |
| Length |
7774 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0738100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:32544629..32552402 |
| Sequence Coding Region |
32544823..32545011,32545086..32545193,32545436..32545639 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:32544629..32552402 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcctgccgtgcacttttcctgttgttattttgtagttctaagtttcctactattaacctacttcagccttctccatgaatttcattgcagcttcctcatagcagaatggcaacatctacagaatgattcttcttatactatccccttttcagggagaatatggaatcatctatcaaaaaatataaacaaggaaaaagttcaggtgccaagtcagcgtaataagtatgactgtggtatctttatgcttcattacattgagaggtttattcaagaggcaccagagaggctgacaagagagaacctttgcatgtttggacggaaatggttcgatcccaaggaaacttctgggctgcgggacagaattcgggcactaatgtttgatgcatttgagagtgctcggatggatgatgaatcgtcgcagtccgagtcacattctgatgatcaatctggagatgaagataaagacagggatggagtcatggttgtggtgattgactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPAVHFSCCYFVVLSFLLLTYFSLLHEFHCSFLIAEWQHLQNDS SYTIPFSGRIWNHLSKNINKEKVQVPSQRNKYDCGIFMLHYIERFIQEAPERLTRENL CMFGRKWFDPKETSGLRDRIRALMFDAFESARMDDESSQSESHSDDQSGDEDKDRDGV MVVVID</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7392..7580#7210..7317#6764..6967#tcgccatcctcctcacaaaaccctcctctgttcgctcgatcgccggaagcctccgccgtgcgccgccgcgtgccggcgtcgatggccatgtccgatggggcgatccccctcggctgtaaacgggcgatggccgccaaatcccaaccggcggaggcggcggagctcgtgggctcatcctctccggccgtgacgccgccgccgcctccgacggagacgcgggcctccgacgatggcgattcggagggcgatgacgaggctgcgaccgactttgagagaatcaccgatcaccagctgcaggagtcgatcaagcggacgcgccactcgctggggctgtgcgccaggctgcgtgacggcggtgtgaagtttttgaggagaatccgccgcatggagaaggagcttgatcgccgccgggccgccgggctaaggaaggtgagtgaaatgtgggtttttagcaatcgttctgggtggagaagggaggctgaaggtttttggaactatgtgtatcgccttttttttattattatttcttctaggtttcatgacccgtggatttttttttcttgcgaggctattgctgtgtttggttcacaccaaaattagaattttgattgaaattagaaccatgtgacggaaaatttggaagtttatgtgtgtagaaaagttttgatgtgatggaaaagttggaagtatgaagaaaaatattgcagctaaacacggcctatgtgtgggttaggaattttgaggaatgaaggagcgtgcagatttatgatgtgtcataaatttatctcggattttagatttagtgaggttctgggtaaaaatgaattgttttctactactactgattactgaaaaaaaaagttctctttgtttagaatgggaagagtacggctagcacgttaataaacgtataaattgaaatcctataaatgtcgagcactatgctccgaaccatttccatgaattgttacagtctgctgctaaattaatttgctaggatatttgatcatatagaaatgggtgttgcggagcccggttattttagctgccgacccatgtttatttttcttttctgactggtacttctactggctttcagtaatgaatttctgaatttaaaaattgatagttgttaataactttatgtgatgtgcaatggaaggggttgtcaaataattgtcaaatataggatgccttatatcgtgggatggagggagattattcaatagcgttgatgagttcatgagggccactatataagttgtcaaatagttactccctccttttcacaatgtaatgacttacatcgtgaaacggaggaagtatttgttaacgacttgcagattttctctcttctcttttgtattcaattagagaaatcatataatttttggcttttgaccttgagaagccagaagcgccaagtgattaagaattagttcaatttgttccttggaaaattttgcacagcatcatttctttgtaatgtgagctattgtgtttacaacagggatggacaatacagtaacaagtaaaaaaaaggaaacatttttccacactattcttttctttcctgttgacaatatagtaacaagtaaaaaaaaagaaacatttttccacactattcttttctttcctgttccctagagtgctatcaccctaatgtatcatattcataagcatattttgtccatgtcctgggttaagttttttttcttaaattattgtagggtgtcataacttggaggccgacagtgaaatctcctagccaggatgattcccatgcctttagtaagcactacatattcatttgttgtttatgcataatcacatatcattagtcacgattcacggaatacacatcctgatctgctttcttttacttatcaatcagtttgattatttatggtcttagatgataaatgttgaaatcagcacatagcttcgtcgtgagtctgatctagatgtattgcacacagagaaattaagattcatagcagtacgtaggagttaaatggtattaaatttcaaaacgaaggtaggaattctcattgtagagctcatggaaaagctccactggacaatgtacagatgtatatcttcctactgcctcttgagggagagcataggtgtttcagactctaggcacttaattattgagacagtttctgtgcatgatcagcaagccacccactgaaccaaatgcatgaacttctggcttactttgtttggtcaatgacacgagttgcacatcactgttggagacttggatcttatctttgtgtacctgactgttaatcctcttttgtagaggatggtgacaagctcaactgggtaaatacttctagcaaacaccaccaaaatgtacctattactcctacaacgaattatggacaggtgtgccttttttatgtccctttttctaatggcacatttttttgtgattaaaatctacgtgatattgtgaatactcttccttgttatatgcaggctgaggattcagcatttttcaaagaactaagttattttggccgagaaaaacacgcaagccttaagaaagttgagcaaagctcaagaactacagtgagtcatcaaccgaaaaatcatgcagtttgtccaaagcgagctgatgataaacaattgcacatggacaataagattattgtcaacaaaaggaagttaggttcgaagagctgtctcagaaaaagaccgaaaaacaactcttttgattcaaacggcatgtatgataaactacatacaaaagatgtcactttggggagatcaactaagaggtatgcactcctttttgttgatctacttgaatttattcctttttcctttttctacttttagtatgccaccccttgtttagtaatccatttgcgttgcttttccaactgcagactttttacattgtccttgatgtacatcattacaacttatgctgcggtttagattgttgcatctttcatattgttggtcattttgcaaataacaaattttctatctgtttgctcccatggttcctgtcagctgcacaatttttgttcccatctagcaggaaattactgaaagatgttgaaaacactgttttctcaaactaactatatctctattgtctaatacacacatgaaactcttgatagaaataatttgctattctttccatgtgcatgtcttatgctttgattcagtagatgactagatgttgagactttgttttgtctgtcttcgatgggtattgtcactggagacttcaacgttacagtccatctagctacactagtaggcacattaagtgcattcatatctaataatgttttatattttgtattgtgcacggtttgtattaactgctattcgcctagtcaggcaaatagtttggcagtggtactgtaagttattaccttactttccttggtttcctcatagccagtgatttcaatcggcttgatggagtttataaaagtatgacagtaagcctgtcttatcttttctaatttttaggaagaatgaaattgcatcttgatagttctttgatctatatcttgtagtgtctgaaaccaataaatgtagttattgctaaccatctttattctcatgaagctatatcatctcaattatttaaagccaagccgcctagctactaagcacctcatgttttacattttgtcatgcaaatttcccccagttcaaaccgatttatgtttctcataccgaaaatggttctgatgtgcaggtgggagcatactaagaatcacatcactgagttcaggggcctatttgattctaaagaaagaaataaaaagaaggtgagccacggtgacggttattattacatttttttcttacattgttatggtactttcccatttgttccatgttaaatctgttatgttgacattggatgtgatgattcgttctacacgccagtccctcttccaactgttcacataaaaatgtcccatgtcaacatatgaagtcctaatcctctccttggatatctgatcccccccctcccccggcaacctacatgcacatacaaatcatatctaatttggaaatacacattgatttctcttacaacattatgtttgtaacgaaataaccatgatcacatgtaaatgctttcaaacatgaatctaacagttccaggactcatcattggtcattaatcaccaaatttgaatcttgaaatacacatgagacatataaaaatcaacagagggagtactcaacatgatccagtacaaataatcaatttcttctgcagagcctcggtacactgccagtacaaacaaaaattgcaacatgcacatttgacttaataagttgtagtcgtattattttgtgcaaacaggttctctgttattttacctaccatttttattttattgaacaagaattcaatgttcttagatccttgaggttaataaaataaaattaaaaccctagacatatcacatcttgggcaccaactcatgtacgattgattggaatttaattttctaagatgatctccaagatttccagtgatgcaacgattctacatcatcactaattttgttgatattgtctattcaaattgttgacacaaataattgctccatgcgtatttcaattatgttcttatatgtttttaggatgtggttctcttggatgatgaagatatggaacctgctaaatcaattaatgttgaaatggctcataaatggtaaggcaatagtgatgatgtcttttgcctattaaagtttctttgccattaattttttagacatgatcaattatagatattatttcattaatcaaatcacacttgtgtagggatgagtcaaagatttactatccttcaaggtgagaatcatgtattgtcattgaggtaccgggaggagagagagatttctcccttctaagctgatatctttgcttctgtcaacaggactgatctcgaaa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